基因總覽
toll like receptor 1（TLR1）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 Toll-like receptor 家族，為單次穿膜的第一型膜蛋白。蛋白質包含細胞外區、跨膜螺旋與細胞質區；細胞外區具有多個 LRR 重複序列及 LRRCT，細胞質區則含 TIR 結構域。這些區域構成其膜受體的基本架構。TLR1 的主要角色是參與對微生物成分的先天免疫反應，並與 TLR2 協同作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000308979 ★ | 38,796,255–38,804,791 | 4 |
| ENST00000502213 | 38,787,555–38,804,835 | 4 |
| ENST00000862584 | 38,787,555–38,805,397 | 4 |
| ENST00000862585 | 38,787,555–38,805,172 | 3 |
| ENST00000862586 | 38,787,555–38,804,835 | 3 |
| ENST00000862587 | 38,787,555–38,805,397 | 5 |
| ENST00001137135 | 38,787,555–38,804,835 | 4 |
| ENST00000505940 | 38,798,349–38,804,851 | 2 |
| ENST00000515861 | 38,798,561–38,804,916 | 3 |
| ENST00000506146 | 38,798,686–38,856,817 | 6 |
| ENST00000508364 | 38,798,761–38,805,578 | 2 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLR1 參與對微生物的先天免疫反應，能辨識雙醯化與三醯化脂肽；對細菌脂蛋白或脂肽的反應則與 TLR2 協同進行。這種辨識使 TLR1 不僅是受體組成的一員，也參與將微生物來源訊號導入細胞反應的過程。
遇到三醯化脂肽時，TLR1 與 TLR2、CD14 形成活化群集。此群集會先在細胞表面啟動訊號，之後依賴脂筏的途徑轉移至 Golgi apparatus。受體群集的形成與後續定位變化，是該配體刺激下訊號傳遞過程的一部分。
下游反應經由 MYD88 與 TRAF6 傳遞，導致 NF-kappa-B 活化，並促進細胞激素分泌及發炎反應。這些結果連結了對細菌脂蛋白或脂肽的辨識與先天免疫輸出；來源未進一步限定此處的細胞種類或各下游反應的具體差異。
Promoter 與基因調控
>TLR1 ENST00000308979 GRCh38 chr4:38804691-38805791 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGAGAGAGACAGTCAGAACATTATAAGTCGAAAAGAATCTCAGCATTCTTAGTTTAGGGAAGTTGGCCT TGCTCGCTGTGTGGTAGAAAAGCTGATTACGGGAGAGAACCGTGGAGGGAAGGAAGGGAGGCAGTTTTGT CATCCCCACATCCGGTTTTGACTGGACACCATGCAGGCTGAGATCAACTTCAGAGGCAGTCAGCTGGAAT CCCATAGCTTTATTTGCCCATTTATTGTGTTGTTATTTTGTTGTTGTCATTACTGGAAAAGGCAAGAGTA GAGCTATCAGAATGTCTTCCTTGAACATGCTGTCAACAAACCCCAGGATTTTTATAAACCCTATGTGAAA AACACGCTAAGAATCTCTTTTCTTCTTAGCATATTTTTCACTTAGGGTTTACAAAAATATGTTTTGAAGA AAGCTTGAAAAGATCAGTGGAAAAAAATTCAGCACCAAATTTTCTCTGAAAATCAACTTGTCAAAAAAGA CGTGATTAACATCCATCCTGTAACCAGCACATGAATGATCTTCCCTCTTTACGAGTGTGCTTCAGCAAAA CTTTAATCTCGACCCCTCCCTCTTTCCACTTTTAATAGTGGATGGATGAAAAGGCAAGAGGAAAAACAAA GCAGCCGAAACACACCCAGACGCACACTTCTGCCAAGCATAGCCACCACGGTAAGCATTTTGAATTCAGC CAATTATGATCTGTGGATTATTAACATTACCTCATTTACTTCATCAGTGTAGACAATAGTAAACTGACTG TAGTGAAATTTGGAACCATAGAAACGTGATTCTATTTTAATACAGGCCTATCAGGTAACCCACAGACTAT GCTACATATGAATAAGAGAAAATAAGTTTATTCTTAACTATGTAATGTAATTCCAGTGGAATTCGGTAGG TGGCATAAAACAGCCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTCAACACCAAATGTGGTTAACAGTGAAATAAATTCA AGGAAGTGCTTGAATTTCTTACAGACTGCCAAATGGAACAGACAAGCAGGTTGTCTTGGTAAGCAACACA TTCTTTTCTTTTGTAAAAGAAAATAATTGTATAGCTAGTTATTAAGTACAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TLR1_1 ↗ | 4:38,804,791 | 負股 | 38,804,781–38,804,840 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_B9NX3 · enhancer · 38803992–38804778 · regulatory
ENSR4_9KDTB · promoter · 38804779–38805281 · regulatory
ENSR4_5C5FR8 · CTCF_binding_site · 38804873–38804894 · regulatory
· motif · 38800161–38800172 · motif
· motif · 38802764–38802772 · motif
· motif · 38802768–38802779 · motif
· motif · 38803747–38803760 · motif
· motif · 38804099–38804116 · motif
· motif · 38804108–38804116 · motif
· motif · 38804289–38804303 · motif
· motif · 38804307–38804324 · motif
· motif · 38804543–38804556 · motif
· motif · 38804543–38804556 · motif
· motif · 38804804–38804815 · motif
· motif · 38804875–38804891 · motif
· motif · 38805632–38805645 · motif
· motif · 38805634–38805645 · motif
· motif · 38805636–38805645 · motif
· motif · 38805851–38805865 · motif
· motif · 38805874–38805883 · motif
· motif · 38805992–38806005 · motif
· motif · 38806045–38806058 · motif
· motif · 38806130–38806145 · motif
· motif · 38806130–38806145 · motif
· motif · 38806442–38806453 · motif
· motif · 38808652–38808663 · motif
· motif · 38809180–38809191 · motif
· motif · 38809501–38809523 · motif
· motif · 38809501–38809523 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：786 aa
TLR1 蛋白質長 786 個胺基酸。其 N 端具有訊號胜肽，細胞外區域包含 19 個 LRR 重複序列及 LRRCT；跨膜區為螺旋結構，細胞質區含 TIR 結構域。另有一段標註為與細菌脂肽互作的區域，位於第 313–316 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TLR1 是單次穿膜的第一型膜蛋白，可見於細胞膜、胞內囊泡與吞噬體膜，也與 Golgi apparatus 及膜脂筏相關。 未受刺激時，TLR1 不位於脂筏；有微生物配體時則逐漸累積於脂筏。 三醯化脂蛋白刺激下，TLR2:TLR1 異二聚體被招募至脂筏，並與其後續轉往 Golgi apparatus 有關。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane raft。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- TLR10Q9BXR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLR2O60603 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLR6Q9Y2C9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TLR1 透過細胞外區與 TLR2 互作；配體刺激前，TLR2 似乎可分別與 TLR1 或 TLR6 形成異二聚體，刺激後則可因應相應配體組成較大的寡聚體，並與 CD14 或 CD36 等受體形成其他異型關聯。三醯化脂肽會促成 TLR2:TLR1:CD14 活化群集。TLR1 亦透過 TIR 結構域結合 MYD88，並與 CNPY3 互作（依序列相似性推定）。另有研究指出，Aedes aegypti 唾液中的嗜中性球招募蛋白與 TLR1 互作；此互作可能促進皮膚駐留巨噬細胞的典型 NF-kappa-B 訊號及嗜中性球趨化因子表現。
疾病與遺傳關聯
TLR1 與常染色體隱性遺傳的發炎性腸道疾病 32（IBD32）相關。此疾病可在幼年早期出現慢性腹瀉與間歇性直腸出血；來源指出，影響 TLR1 所代表基因的變異可能導致此病，並未將此關聯描述為已確立的必然因果。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TLR1 參與對微生物的先天免疫反應，特別辨識雙醯化及三醯化脂肽，並與 TLR2 協同回應細菌脂蛋白或脂肽。三醯化脂肽刺激時，TLR2、TLR1 與 CD14 形成活化群集，先在細胞表面啟動訊號，再經依賴脂筏的途徑移至 Golgi apparatus。其訊號經由 MYD88、TRAF6 傳遞，導致 NF-kappa-B 活化、細胞激素分泌與發炎反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Participates in the innate immune response to microbial agents. Specifically recognizes diacylated and triacylated lipopeptides. Cooperates with TLR2 to mediate the innate immune response to bacterial lipoproteins or lipopeptides. Forms the activation cluster TLR2:TLR1:CD14 in response to triacylated lipopeptides, this cluster triggers signaling from the cell surface and subsequently is targeted to the Golgi in a lipid-raft dependent pathway. Acts via MYD88 and TRAF6, leading to NF-kappa-B activation, cytokine secretion and the inflammatory response PMID 16880211 ↗ · PMID 21078852 ↗ |
| 交互作用 | TLR1 透過細胞外區與 TLR2 互作；刺激前，TLR2 似乎與 TLR1 或 TLR6 形成異二聚體，受相應配體刺激後可形成較大寡聚體，並與 CD14 或 CD36 等受體產生異型關聯。三醯化脂肽促成 TLR2:TLR1:CD14 活化群集。TLR1 透過 TIR 結構域結合 MYD88，並與 CNPY3 互作（依序列相似性推定）。它也與 Aedes aegypti 唾液中的嗜中性球招募蛋白互作；此作用可能促進皮膚駐留巨噬細胞的典型 NF-kappa-B 訊號及嗜中性球趨化因子表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via extracellular domain) with TLR2. TLR2 seems to exist in heterodimers with either TLR1 or TLR6 before stimulation by the ligand. The heterodimers form bigger oligomers in response to their corresponding ligands as well as further heterotypic associations with other receptors such as CD14 and/or CD36. The activation cluster TLR2:TLR1:CD14 forms in response to triacylated lipopeptides. Binds MYD88 (via TIR domain). Interacts with CNPY3 (By similarity). Interacts with neutrophil recruitment protein from Aedes aegypti saliva; the interaction probably promotes activation of canonical NF-kappa-B signaling in skin-resident macrophages and subsequent expression of neutrophil chemoattractants PMID 16880211 ↗ · PMID 17889651 ↗ · PMID 38378891 ↗ |
| 細胞定位 | TLR1 是單次穿膜的第一型膜蛋白，定位資料包括細胞膜、胞內囊泡、吞噬體膜、膜脂筏及 Golgi apparatus。未受刺激時不位於脂筏；微生物配體存在時，TLR1 會逐漸累積於脂筏。三醯化脂蛋白刺激時，TLR2:TLR1 異二聚體被招募至脂筏，而此招募與其後續轉往 Golgi apparatus 有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Cytoplasmic vesicle, phagosome membrane / Single-pass type I membrane protein; Membrane raft; Golgi apparatus; Does not reside in lipid rafts before stimulation but accumulates increasingly in the raft upon the presence of the microbial ligand. In response to triacylated lipoproteins, TLR2:TLR1 heterodimers are recruited in lipid rafts, this recruitment determine the intracellular targeting to the Golgi apparatus PMID 16880211 ↗ |
| 疾病關聯 | 發炎性腸道疾病 32（IBD32）為常染色體隱性疾病，屬慢性、反覆發作且病因複雜的胃腸道發炎，包含 Crohn disease 與 ulcerative colitis 表型。IBD32 可於幼年早期以慢性腹瀉及間歇性直腸出血發病。來源稱影響此條目所代表基因的變異可能導致疾病；此為可能的變異關聯，並非必然因果陳述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Inflammatory bowel disease 32, autosomal recessive IBD32 A form of inflammatory bowel disease, a chronic, relapsing inflammation of the gastrointestinal tract with a complex etiology and a multifactorial inheritance pattern. It is subdivided into Crohn disease and ulcerative colitis phenotypes. Crohn disease may affect any part of the gastrointestinal tract from the mouth to the anus, but most frequently it involves the terminal ileum and colon. Bowel inflammation is transmural and discontinuous; it may contain granulomas or be associated with intestinal or perianal fistulas. In contrast, in ulcerative colitis, the inflammation is continuous and limited to rectal and colonic mucosal layers; fistulas and granulomas are not observed. Both diseases include extraintestinal inflammation of the skin, eyes, or joints. IBD32 is characterized by the onset of chronic diarrhea and intermittent rectal bleeding in early childhood. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 621601 PMID 42048460 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACAGACTGCCAAATGGAACAGACAAGCAGGTTGTCTTGTG40TTAAAGAAAATGAGATATAAGTCAGTTACTCCCGGAGGCA80ATGCTGCTGTTCAGCTCTTCTGTTTTTGTGGCCAGGGTCT120TCATGAACACTAATAGGGGTACCAGGCCCTCTTCCTCGTT160AGAAGAAATCAGGATAACAAAGGCATATTGGGCACCCCTA200CAAAAGGAATCTGTATCTGTATCAAGATGATCTGAAGAAC240AGCTTCTACCTTTAGGAATGTCTAGTGTTCCAAAATGACT280AGCATCTTCCATTTTGCCATTATCTTCATGTTAATACTTC320AGATCAGAATACAATTATCTGAAGAAAGTGAATTTTTAGT360TGATAGGTCAAAAAACGGTCTCATCCACGTTCCTAAAGAC400CTATCCCAGAAAACAACAATCTTAAATATATCGCAAAATT440ATATATCTGAGCTTTGGACTTCTGACATCTTATCACTGTC480AAAACTGAGGATTTTGATAATTTCTCATAATAGAATCCAG520TATCTTGATATCAGTGTTTTCAAATTCAACCAGGAATTGG560AATACTTGGATTTGTCCCACAACAAGTTGGTGAAGATTTC600TTGCCACCCTACTGTGAACCTCAAGCACTTGGACCTGTCA640TTTAATGCATTTGATGCCCTGCCTATATGCAAAGAGTTTG680GCAATATGTCTCAACTAAAATTTCTGGGGTTGAGCACCAC720ACACTTAGAAAAATCTAGTGTGCTGCCAATTGCTCATTTG760AATATCAGCAAGGTCTTGCTGGTCTTAGGAGAGACTTATG800GGGAAAAAGAAGACCCTGAGGGCCTTCAAGACTTTAACAC840TGAGAGTCTGCACATTGTGTTCCCCACAAACAAAGAATTC880CATTTTATTTTGGATGTGTCAGTCAAGACTGTAGCAAATC920TGGAACTATCTAATATCAAATGTGTGCTAGAAGATAACAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。