基因總覽
TLNRD1（talin rod domain containing 1）是位於人類第 15 號染色體的蛋白質編碼基因，其產物為 talin rod domain-containing protein 1，長 362 個胺基酸。現有資料將此蛋白描述為肌動蛋白結合蛋白，並指出它在癌細胞中可能具有促癌功能；不過，來源未提供其家族分類或完整結構資訊，因此不宜據此推定更多結構或分類特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000267984 ★ | 81,000,923–81,005,788 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLNRD1 的產物是一種可結合肌動蛋白的蛋白質。現有資料指出，它在癌細胞中可能具有促癌功能，並參與調節細胞增殖、遷移與侵襲；「可能」表示促癌角色仍帶有不確定性，不應視為已確立的普遍作用。
在癌細胞的脈絡下，TLNRD1 與三類細胞行為有關：增殖涉及細胞數量增加，遷移涉及細胞移動，侵襲則涉及細胞進入周遭環境。來源支持 TLNRD1 會調節這些過程，但未說明調節方向、作用所需條件，或各過程之間的先後與因果關係，因此不能進一步判定它會促進或抑制其中任何一項。
肌動蛋白結合是來源所列的分子特性，提供理解其細胞功能的一項線索；然而，現有資料沒有交代結合方式、相關下游反應，或這項結合如何連結到增殖、遷移及侵襲。因而可確認的是 TLNRD1 具有肌動蛋白結合能力，並與癌細胞上述行為的調節相關，至於兩者之間的具體機制仍未由這些資料界定。
Promoter 與基因調控
>TLNRD1 ENST00000267984 GRCh38 chr15:80999923-81001023 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGCCATATGCTGTCTTCCTGATCTTCGGAAGTCACTTCAAGCACCTGATCATCAGTTTCCTTATCTGTA AAACTGGAGTAGTAATGTTTCCCTCCAAACGCCGTCGTATTTAATTCATTTAACAGCAGCCACTATTATT CCATTATACAGACGAATAAATAGACGTTATGAGAGGGCAAAGTGCGCTGATCAGGGCTCATAATAATTCT AACAGCTACTGTTTAGGAACCAAGTACTCAAGCAGCCTGTGCACAATCTCTAATTTCTAGAAGAGAAGAC GGATACTTGGAAAGAGAACTTGAACAATGTCATGGAACTCATAAATGGCTTGAGAAAGGCTGATCCTAGG AAATCTGCTTCAGAACCCGCGCTCTCACTGCATAAGGCGTATTTCAAGGGAGGAACGGGCAGGCATCTAG CACCACTCTTCGGACTCCCCATCCAGTGCTCTTTTCCTCTTTTCGTTACACTGCACTGCTGGTCGGAAAC CCATCGTGGAAGTGGATCAAACACAACAAAGGGCAGGGGGCGTTGGAAAACCGGGCGAAGTCGCGCAGAC CGAGACGACCCACCGGCCCCAGCAAATCACCAGGGGCCGAAATCCAGTGTCCTCCTCCCTTCAGCCCAGA AGCCAGGTCACCTTTTAGACTTGCTCTCTTGGCGGGGAGGAAGCGTGGAGCCCCCTGGTCCGGCTAAGAG CTTACGTAAGGCCCGCGGGCGGCTGCGCCCCGGTCTCCCATGGGTGTGCGCAGAGCCCCCGGGCCGGAGC AGGCCTTCCCCTGTCCGCTCCCCCAGTCTCTCGGCCCAGGACCACGGGGGAGTTCAGGACCACCGGCCCC ACGCCGGCAGCGTCCGCGTTGGGCGGCGGCGTCCCCCGCAGCCACCCAGCTTCCCGGGGGAGGAGCAGCG CATCGCGCAAGCATCCGGGAGCGGCGGAGGGGGCGGGAGGAAGGGCGAGAGGAGGAAGCGGGATTTAAAC GAAAGGCGGTGACGCCACACAAAAGATTTCTATAGGCTCCAGGGAGGTTACGGCCGAGGCGGCGGCGGCG GCGAGCCCGGGGGCGAGGCGCGGACGGGAACAGGAAAAGCCTCCGGCAGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_84DB2X · open_chromatin_region · 80996316–80996542 · regulatory
ENSR15_5P3D9G · CTCF_binding_site · 80996415–80996436 · regulatory
ENSR15_84DB45 · enhancer · 80998353–80998583 · regulatory
ENSR15_CB32D · enhancer · 80999483–81000755 · regulatory
ENSR15_5P3DZD · CTCF_binding_site · 81000505–81000526 · regulatory
ENSR15_84DB5H · promoter · 81000756–81000933 · regulatory
ENSR15_937643 · promoter · 81001652–81002152 · regulatory
ENSR15_5P3F6R · CTCF_binding_site · 81001674–81001695 · regulatory
ENSR15_5P3FCP · CTCF_binding_site · 81002738–81002759 · regulatory
· motif · 80996417–80996433 · motif
· motif · 80999847–80999856 · motif
· motif · 80999892–80999905 · motif
· motif · 80999898–80999911 · motif
· motif · 81000507–81000523 · motif
· motif · 81000733–81000746 · motif
· motif · 81000782–81000795 · motif
· motif · 81000856–81000869 · motif
· motif · 81000909–81000922 · motif
· motif · 81000909–81000922 · motif
· motif · 81000958–81000971 · motif
· motif · 81000976–81000989 · motif
· motif · 81000997–81001011 · motif
· motif · 81001107–81001120 · motif
· motif · 81001245–81001258 · motif
· motif · 81001676–81001692 · motif
· motif · 81001689–81001696 · motif
· motif · 81001699–81001715 · motif
· motif · 81001699–81001715 · motif
· motif · 81002049–81002060 · motif
· motif · 81002049–81002060 · motif
· motif · 81002115–81002128 · motif
· motif · 81002213–81002230 · motif
· motif · 81002222–81002239 · motif
· motif · 81002740–81002756 · motif
microRNA MIR574-3p 會下調 TLNRD1。現有資料未進一步說明此調控發生的條件或具體分子機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：362 aa
talin rod domain-containing protein 1 長 362 個胺基酸。序列註解指出，其第 1 至第 26 位胺基酸區域為無序區；來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CCM2Q9BSQ5 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH2B2O14492-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TLNRD1 可能形成同源二聚體，並可與 F-actin 互作。前者屬於可能的自我結合形式，後者則是與 F-actin 的互作；現有資料未提供其複合體組成或互作後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TLNRD1 產物是一種可結合肌動蛋白的蛋白質，在癌細胞中可能具有促癌功能，並參與調節細胞增殖、遷移與侵襲。來源未說明這些細胞行為的調節方向或具體作用機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Actin-binding protein which may have an oncogenic function and regulates cell proliferation, migration and invasion in cancer cells PMID 22179486 ↗ |
| 交互作用 | TLNRD1 可能形成同源二聚體，並與 F-actin 互作；來源未提供這些互作的其他條件或功能後果。 | 推論支持 | |
| 調控 | microRNA MIR574-3p 會下調 TLNRD1；來源未提供此調控發生的條件或具體機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AAAAGATTTCTATAGGCTCCAGGGAGGTTACGGCCGAGGC40GGCGGCGGCGGCGAGCCCGGGGGCGAGGCGCGGACGGGAA80CAGGAAAAGCCTCCGGCAGCCCCTGCGGGCGGCGGCGCAG120CCACGGCCGCGCTCCGAGGTGAAGCCGCGCGCGGAGAGGA160AGCGGGTGTTTTCCCCTCTGCCTTTCGGCCCCCGCCCTTC200CTTTCAGTTTCTGCCCGCTCGCTCGGAAGTTGGCGGTTGA240CAAAAATGGCAGGAGCCGGGGCCCGGGCCGGTTGCCGCAG280CGCCGCGGGGACCTTCTGAGTTGGCCCGGTGGCAGGGAGA320CTCGTGCAGGGGCGTCCGATGCGCGGGGCCCGGGGCCTCG360GGAGAGCTCAGCTGCTGCGGGCCCCAGACGAGGCGACAGG400GATGGACTTGCGTAGACAGCCAGCGCCGGGCCGCCGGGCG440CGCGGTCTGGGAGGGCGTGCCGCCGCGGCGCCGGGCCGCG480CTCTGTGAACCGGCGAGGCGGGAAGGGGCCGCCGTGGTGC520TCGGCACGCCCGGGCGTGTGGCGGGCGGGCGAGAGCTTGA560GCGCGATCCGGGCGGCCGCTGTGCGCAATCAGTGCAGGCT600CCCGCCCGACTCTGACTCGGCGCGGCCGCGACAGTGCCGG640CCACACCCTCTGCCCCGCTGCCGCCGGCGCCGCTTCCCAA680GAGCTGGAGGCAGGAGATGCGCCCGGGGCGGCCGCGCGTC720CCAGAGAGCCAGCCCCGGCCGCCGTCGCGGGGAAGTGCCG760CCTGGTGGGGTCACGGCGCCTGAAGCCCACGTGCGCCGCC800GAGCCCGAGGTGGCCTCGAGCGCGGCGGCTGACAGCACAG840CCCGCCTGAGCTGCCTCCCGCGCTCCTCCCCGAGGAAAGG880ATTTTGATTTCAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGACAACTCC920CAGCTTCCCCGTCCCGCCCTCCCCGCTCCGAGGGCCGCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。