基因總覽
TLK2（tousled like kinase 2）是蛋白質編碼基因，其產物屬於蛋白激酶超家族中的 Ser/Thr protein kinase family。蛋白質長 772 個胺基酸，具有蛋白激酶結構域；另有數段被註記為無序區域。這些資訊界定了 TLK2 的基本分子性質與家族歸屬；其具體生物學作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000346027 ★ | 62,478,825–62,615,481 | 22 |
| ENST00000582809 | 62,458,658–62,615,481 | 23 |
| ENST00000684213 | 62,470,917–62,553,727 | 11 |
| ENST00000583843 | 62,470,933–62,552,339 | 8 |
| ENST00000579450 | 62,470,942–62,522,268 | 5 |
| ENST00000682085 | 62,477,839–62,615,481 | 22 |
| ENST00000902349 | 62,477,839–62,615,481 | 21 |
| ENST00000931871 | 62,477,839–62,615,481 | 21 |
| ENST00000931873 | 62,477,839–62,615,481 | 20 |
| ENST00000931874 | 62,477,839–62,615,481 | 19 |
| ENST00000963456 | 62,477,839–62,615,481 | 22 |
| ENST00000580705 | 62,478,066–62,560,034 | 7 |
顯示 12/53 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLK2 是絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶，參與染色質組裝。來源也指出它可能參與 DNA 複製、轉錄、修復及染色體分離，但對這些過程的描述帶有不確定性。
TLK2 可磷酸化染色質組裝因子 ASF1A 與 ASF1B。對 ASF1A 而言，磷酸化可防止其經由蛋白酶體途徑降解，進而增強染色質組裝。這提供了 TLK2 連結蛋白質修飾與染色質組裝的具體機制；來源未說明 ASF1B 磷酸化後的效果。
TLK2 的酵素反應包括將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基，反應產物為磷酸化蛋白質、ADP 與 H⁺。此外，TLK2 是胺基酸飢餓誘發自噬的負向調節因子；來源未進一步交代此調節作用的分子機制。
Promoter 與基因調控
>TLK2 ENST00000346027 GRCh38 chr17:62477825-62478925 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTTCTCATTCCTCAGGAGATACTCTGTGAGGGGCCGGCGTGTTTTCTCCATCTTGGCACTTACCCTCAG ACCCTCCTAAGTACCCGGGAGGGCCGTGTTTTTCATCGGAGGTTGAAATGGAACCTCCCCCTGGGTGCCC GGGGAGAGTACCTTGGGGGCAGCGCCCCTCCTTCCGGAGGGCAGCATCCCCGCGGGGGCGGGGGCTCGGC TTTGATCCCAGGGCACCTTTTGTCCCTGGAGACGCTCTGCCAGCCAGGTACGTGGAGGGAGTGCAGCCCG CCCTCCCGGGCGACGCGCGGGGCTGGGGCGGGCCGGCGGCTCCGGGGAGTGGCGGCCGGGAGCCCGCGAA CGCGGGTGGGCGCCGTCGCCTCACTAACCGGGCGCCTCCGGGAAGTCCGGGCGGGGTCCGCCGCTCACAC ATAGGATTAGCGTCCTCTAAACTCCATCCCTGGGAAAAGCCGCCGCACTTCTCACCCAAACTCGCGGAGC CGAGGGGCTGGGCAGGGGTTGGGCGGGCGCGGGGGCCGGCGAGGCGGATCCGGGAACGGGTGGACCCGGG CGGCCAAGCCCCTTCAGCGCCGGCCCAACCGCCCCGGCCCGGGCCAGTCCAGCGGGGCGGGGGCCGGCGA CACAAAGGCGGCGGCGGGTCCTCCGGGCCTCCGGCCTCGGGCAGTCGCAGGGCGCCCCGGGCCGCCGGAC CTCCCCTCGCGTTGCGGCCCGTCAGCCGGCGCCGCCCGTCGCCCGCCCTCAGCCGTCCGGCGAGGCGCGG CTTCCTCCGCCGGCGCGGGGTCCCCTGGTTAACCCCTGCCCGGCAGCGCGGCCGCTGATTGGAGAAGGCG GGGCGCCGGGGCAGCGGGGACCCCCCCCCACCTTCCTCGTCCCCTCCCCCTGCTCCCCCACTGTCGGCGC TTCCCCCACCCCCCCAGGACCCCCCCCGCCTCCCAGCCGTGCAAATCTCGCGAGGAAACACGCGGTTTCA CTAGTGTGTTTACACCGATCACTACTAATCCGGACCGAACCGATCCGGATTAAGGGGCCGGAGGCGGGTC CTGGGCACCAGCGGTTCCGACCCCCCCGCCCTCCGCGCCGCACCCGAGTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TLK2_3 ↗ | 17:62,458,662 | 正股 | 62,458,613–62,458,672 |
| TLK2_1 ↗ | 17:62,478,829 | 正股 | 62,478,780–62,478,839 |
| TLK2_2 ↗ | 17:62,479,118 | 正股 | 62,479,069–62,479,128 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_BGDQD · enhancer · 62473091–62473839 · regulatory
ENSR17_9WRK2 · promoter · 62477349–62477849 · regulatory
ENSR17_83SL57 · enhancer · 62477850–62478007 · regulatory
ENSR17_C87DK · promoter · 62478008–62479454 · regulatory
ENSR17_5JNR67 · CTCF_binding_site · 62479110–62479131 · regulatory
ENSR17_C87DN · enhancer · 62479455–62480749 · regulatory
· motif · 62477619–62477632 · motif
· motif · 62477619–62477632 · motif
· motif · 62477679–62477690 · motif
· motif · 62478013–62478026 · motif
· motif · 62478030–62478044 · motif
· motif · 62478055–62478068 · motif
· motif · 62478055–62478068 · motif
· motif · 62479112–62479128 · motif
· motif · 62479609–62479618 · motif
· motif · 62479673–62479687 · motif
· motif · 62479867–62479880 · motif
· motif · 62479873–62479888 · motif
· motif · 62480067–62480080 · motif
· motif · 62482765–62482779 · motif
· motif · 62482765–62482779 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：772 aa
TLK2 蛋白長 772 個胺基酸，屬於蛋白激酶超家族的 Ser/Thr protein kinase family。其蛋白激酶結構域位於第 462–741 個胺基酸；第 24–126、180–208 與 342–385 個胺基酸區段被註記為無序區域。第 225–276 個胺基酸區域則是與 TLK1 及 DYNLL1/LC8 互作所需。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TLK2 的定位會隨細胞週期改變：G1 期與細胞質中的中間絲系統共定位，S 期出現在核周區域，至 G2 期後段則位於細胞核。 來源亦記載其位於核質及細胞骨架相關細胞質區域。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- ASF1AQ9Y294 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMAP1Q9NPF5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMD6Q96NE9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GMCL1Q96IK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IRF4Q15306 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IRF7Q92985 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PAX5Q02548 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAX6P26367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMARCC2Q8TAQ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2IQ7KZS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TLK2 可呈單體形式，也可能形成同源二聚體；同源二聚化可能增強自體磷酸化與酵素活性。它可與 TLK1 形成異源二聚體，並與 YWHAZ、CHD7、CHD8 及 DYNLL1/LC8 互作；與 FEZ1/LZTS1 和 FEZ2 的互作則仍屬可能。YWHAZ 等 14-3-3 蛋白的結合與 TLK2 的亞細胞定位調節有關。
疾病與遺傳關聯
TLK2 基因變異與常染色體顯性智力發展障礙 57（MRD57）相關。此疾病可在嬰兒期或幼兒期出現精神動作發展遲緩及行為異常；患者也可能有嚴重腸胃問題與面部特徵異常。來源將此病描述為由影響 TLK2 的變異所致。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TLK2 是參與染色質組裝的絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶，也可能參與 DNA 複製、轉錄、修復與染色體分離。它磷酸化染色質組裝因子 ASF1A、ASF1B；ASF1A 的磷酸化可避免其經蛋白酶體降解，並增強染色質組裝。TLK2 亦負向調節胺基酸飢餓誘發的自噬。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase involved in the process of chromatin assembly and probably also DNA replication, transcription, repair, and chromosome segregation. Phosphorylates the chromatin assembly factors ASF1A and ASF1B. Phosphorylation of ASF1A prevents its proteasome-mediated degradation, thereby enhancing chromatin assembly. Negative regulator of amino acid starvation-induced autophagy PMID 10523312 ↗ · PMID 11470414 ↗ · PMID 12660173 ↗ · PMID 12955071 ↗ · PMID 20016786 ↗ · PMID 22354037 ↗ · PMID 29955062 ↗ · PMID 33323470 ↗ · PMID 35136069 ↗ · PMID 9427565 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) PMID 10523312 ↗ · PMID 12660173 ↗ · PMID 9427565 ↗ |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 10523312 ↗ · PMID 12660173 ↗ · PMID 9427565 ↗ |
| 交互作用 | TLK2 可呈單體形式，也可能形成同源二聚體；二聚化可能增強自體磷酸化與酵素活性。它與 TLK1 形成異源二聚體，並與 YWHAZ、CHD7、CHD8、DYNLL1/LC8 互作；與 FEZ1/LZTS1、FEZ2 的互作則屬可能。YWHAZ 等 14-3-3 蛋白的結合與 TLK2 亞細胞定位調節有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. May form homodimers; homodimerization may enhance autophosphoylation and enzymatic activity. Heterodimer with TLK1. Interacts with YWHAZ; association with 14-3-3 proteins such as YWHAZ regulates subcellular location. May also interact with FEZ1/LZTS1 and FEZ2. Interacts with CHD7 and CHD8. Interacts with DYNLL1/LC8 PMID 10455159 ↗ · PMID 10523312 ↗ · PMID 16484223 ↗ · PMID 29955062 ↗ · PMID 33323470 ↗ |
| 細胞定位 | TLK2 的定位隨細胞週期階段改變：G1 期與細胞質中間絲系統共定位，S 期位於核周區域，G2 期後段則出現在細胞核。來源亦記載 TLK2 位於細胞核核質，以及細胞質核周區域與細胞骨架相關區域。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Nucleus, nucleoplasm; Cytoplasm, perinuclear region; Cytoplasm, cytoskeleton; Colocalizes with the cytoplasmic intermediate filament system during the G1 phase of the cell cycle. Present in the perinuclear region at S phase and in the nucleus at late G2 PMID 10455159 ↗ · PMID 29955062 ↗ · PMID 33323470 ↗ · PMID 9427565 ↗ · PMID 10523312 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 TLK2 的基因變異與常染色體顯性智力發展障礙 57（MRD57）相關。患者可在嬰兒期或幼兒期出現精神動作發展遲緩與多種行為異常，也可能有嚴重腸胃問題及面部特徵異常；此疾病屬發展期出現的智力功能與適應行為障礙。 | 含實驗來源 | 證據與來源Intellectual developmental disorder, autosomal dominant 57 MRD57 A disorder characterized by significantly below average general intellectual functioning associated with impairments in adaptive behavior and manifested during the developmental period. MRD57 is characterized by delayed psychomotor development apparent in infancy or early childhood, and a variety of behavioral abnormalities. Affected individuals may have severe gastro-intestinal problems, and facial dysmorphism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618050 PMID 21572417 ↗ · PMID 27479843 ↗ · PMID 29861108 ↗ · PMID 29955062 ↗ · PMID 33323470 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTACTAATCCGGACCGAACCGATCCGGATTAAGGGGCCG40GAGGCGGGTCCTGGGCACCAGCGGTTCCGACCCCCCCGCC80CTCCGCGCCGCACCCGAGTGGCCCCCAGCCGAGCGGGCCC120CCACCTCCTGGCCCGGCCTGGGCCCTCCTGCGCCTCCCTT160GGCCTTTGTCCGGCGCCAGGAGGCCGGTCCCGCGCCCCCC200GCGGCCGCCCGGGCCCGGGCCCGCGTCGGGCGCCTGGCTC240TGTACGCGAGCCCGGGGATCTGCGGCCTTCGTGCCCCCCC280TCCCCCGCCCGCCCTCTCGTGGAGCCCGGCGCCGGCGGCG320GCTGCCCGGGCGGGGGGTTGCGGCGCTCAGGAGAGGCCCC360GGCTCCGCCCCGGGCCTGCCCAGGGGGAGAGCGGAGCGGT400CCGCAGCCGGGTCGGGTCGGGGCCCCTCCCGGGAGGAGCG440TGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGAAATGATGGAA480GAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGG520AGGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACT560TAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGA600TCCTTGAGTGATAAAGAAGTAGAGACTCCCGAGAAAAAGC640AGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCTGAACCATA680TGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAA720ATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGCGCCAG760GAACCAGCCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATC800CTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGACGA840GTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAA880AGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCAT920GTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。