基因總覽
TLK1（tousled like kinase 1）是人類的蛋白質編碼基因，產物為 Serine/threonine-protein kinase tousled-like 1，屬於 protein kinase 超家族中的 Ser/Thr protein kinase 家族。其蛋白質長 766 個胺基酸，具有一段蛋白質激酶結構域；序列另有兩段被註記為無序區域。這些資訊界定了 TLK1 蛋白質的家族歸屬與基本結構特徵。來源所述的生物學角色包括染色質組裝相關過程，以及特定異構型參與的蛋白質磷酸化作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000431350 ★ | 170,990,823–171,160,893 | 21 |
| ENST00000360843 | 170,990,823–171,161,191 | 22 |
| ENST00000521943 | 170,990,823–171,231,314 | 21 |
| ENST00000434911 | 170,990,823–171,066,973 | 19 |
| ENST00000879063 | 170,990,823–171,161,191 | 20 |
| ENST00000928546 | 170,990,823–171,161,191 | 20 |
| ENST00000967137 | 170,990,823–171,161,191 | 22 |
| ENST00001054494 | 170,990,823–171,161,191 | 19 |
| ENST00001141893 | 170,990,823–171,161,191 | 21 |
| ENST00001054495 | 170,992,175–171,161,191 | 21 |
| ENST00001054498 | 171,021,153–171,161,191 | 13 |
| ENST00001111890 | 171,027,625–171,161,191 | 13 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLK1 的活性會隨細胞週期與 DNA 損傷狀態改變。S 期發生 DNA 雙股斷裂後，TLK1 會因磷酸化而快速、短暫受到抑制；此反應依賴細胞週期檢查點及 ATM 路徑。資料指出，TLK1 似乎調節染色質組裝相關過程，但並未進一步界定其完整作用機制。
TLK1 的酵素反應包括將磷酸基團由 ATP 轉移至蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基，分別形成磷酸化的絲胺酸或蘇胺酸蛋白質產物，並產生 ADP 與 H⁺。這項活性說明 TLK1 能進行蛋白質磷酸化；來源並未將所有受質或細胞內反應都逐一列出。
異構型 3 具有來源特別描述的作用：它可磷酸化 t-SNARE SNAP23，提升 SNAP23 的穩定性，並增強其與 syntaxin 的組裝。此異構型也被描述為可促進 DNA 雙股斷裂修復，進而保護細胞免受游離輻射影響。這些結論限於異構型 3，不能直接推及所有 TLK1 異構型。
此外，體外實驗顯示 TLK1 可磷酸化 histone H3 的 Ser-10。這項結果是體外觀察，與前述細胞內作用的證據情境不同；來源未據此說明其在細胞中的具體效應。
Promoter 與基因調控
>TLK1 ENST00000431350 GRCh38 chr2:171160793-171161893 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTTGTACTTTTCCTGAACTAGAGTGCTCTTTTATGTACAAGAAGCCCAATCCCTGGTGTGAGTATACTT GTGTGGGTCTGTAGAAAGCTACACTCTATCTATAAATTTTAGCAAATGCTGTTATTTATTTTGGGATTTT TGTAGTCGGGACTCAGCGGAGACACTAGAAACAAATTATAAGTTTCTAGAAACCATACCTTCTGCAAGAT GAACGCTGTATAGTTTTCCTAAATATGTGATTCAGTAATCACATTTTTCATTTAGATTTTCCACTTACTG TTTTAAAACAAAGAATTGCTATACCATACAGTCTACAAAACTGGTAATTTTCAATTTCCTCATTAAAGAT TCTTCACTCTTTTTTAGAAAACACGAGAAAGTTTTATTTCCCAACTCTCCCACTACCCATGTTTATTTTC ATAGCTCTTTTATTCGGTCATTATTCCCATTCTGCAGACGGGGAGGCGCACATACGTTTTTCTGCACAGT ACAGAGGGGCAAGAAAGAAGGAACTCTCAACTTTTCAGTTCCATTTTGAGAAACGATCACATTGAACTCC CGAGAAGCGGCAGCTGAGCGAGAGCAGCAGCATTTCTCCCCGTGTTGGGTGTGGGTCAGGAGAGAGGCGC GCTTCCGCGGGAGACAGGGGGAGTCAGGTGGCAGCGGCGCTGGAGCCCGAGCGGCGCGGCGGGGGCGCGC CTCCCTCCGGCCGGCGCGGGGACGCTGCCCCCGCGCACGCGAGTCCGGCAACCCCGGGCTCCCGCGCCGC GCGGCGATCCGCGGGTGCGGCAGGGGCGCCCCGGCGCTCTAGTCTCTTCCCTCGCGCGCTCGCTCCTTCC CCATGCCCCCACCCCCCAGCCCCTGGCAGGTCCCTCCCCCAAGCCTGCTCCCGCGGCCGCCGCTGCCGCC GCCGCCGCCGCCGCCGCTACCGGAGGCGCAGGAGCCTCGCGATAGTGTTTGCACAGGCGGCGCGTGACGC CGCCGCCGCCTGTAACTGATGCAGAGGTTACCCCACCGCCTCAGCCGCCACCCACAGCCCGCCGCCGCCG CCTCCCGGGCGACGCCGGGGGCCGACGCACTGCAGAGGTGCCGGCAGGTTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TLK1_2 ↗ | 2:171,160,535 | 負股 | 171,160,525–171,160,584 |
| TLK1_1 ↗ | 2:171,160,893 | 負股 | 171,160,883–171,160,942 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_872THT · enhancer · 171158060–171158302 · regulatory
ENSR2_94HX9C · promoter · 171159401–171159901 · regulatory
ENSR2_53H8ZBT · CTCF_binding_site · 171159438–171159459 · regulatory
ENSR2_B38Z5W · promoter · 171160823–171161383 · regulatory
ENSR2_53H8ZLW · CTCF_binding_site · 171161180–171161201 · regulatory
ENSR2_94HXBH · enhancer · 171163368–171163680 · regulatory
· motif · 171158033–171158045 · motif
· motif · 171158249–171158264 · motif
· motif · 171158988–171159000 · motif
· motif · 171159068–171159081 · motif
· motif · 171159348–171159359 · motif
· motif · 171159440–171159456 · motif
· motif · 171159543–171159560 · motif
· motif · 171159757–171159768 · motif
· motif · 171159850–171159861 · motif
· motif · 171159919–171159934 · motif
· motif · 171160089–171160104 · motif
· motif · 171160337–171160350 · motif
· motif · 171160384–171160394 · motif
· motif · 171160492–171160505 · motif
· motif · 171160502–171160512 · motif
· motif · 171160504–171160517 · motif
· motif · 171160696–171160709 · motif
· motif · 171160702–171160715 · motif
· motif · 171160779–171160788 · motif
· motif · 171160779–171160790 · motif
· motif · 171160779–171160790 · motif
· motif · 171160840–171160853 · motif
· motif · 171160843–171160856 · motif
· motif · 171160850–171160865 · motif
· motif · 171160864–171160881 · motif
· motif · 171160902–171160915 · motif
· motif · 171160905–171160918 · motif
· motif · 171160915–171160931 · motif
· motif · 171161157–171161170 · motif
· motif · 171161182–171161198 · motif
· motif · 171161195–171161208 · motif
· motif · 171161250–171161261 · motif
· motif · 171162230–171162252 · motif
· motif · 171162230–171162252 · motif
· motif · 171163450–171163464 · motif
· motif · 171163450–171163464 · motif
· motif · 171163457–171163468 · motif
· motif · 171164331–171164343 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：766 aa
TLK1 蛋白質長 766 個胺基酸，屬於 protein kinase 超家族的 Ser/Thr protein kinase 家族。其蛋白質激酶結構域位於第 456–734 個胺基酸；第 1–197 位及第 346–383 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TLK1 的定位資料列於細胞核。 來源未提供定位變化的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- ASF1AQ9Y294 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEND7Q8N7W2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DPPA4Q7L190 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DYNLL2Q96FJ2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- GPRASP3Q6PI77 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHX2P50458 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LUZP4Q9P127 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAX6P26367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PINX1Q96BK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPN11Q06124-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFCP2Q12800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TPM3Q5VU62 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YAF2Q8IY57-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF655Q8N720 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF773Q6PK81 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF829Q3KNS6-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN22P10073 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TLK1 與 TLK2 形成異源二聚體。來源支持的是兩者組成此二聚體，未提供其他互作或此複合體功能的細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | S 期產生 DNA 雙股斷裂後，TLK1 會因磷酸化而快速且短暫受抑，此反應依賴細胞週期檢查點及 ATM 路徑，並似乎調節染色質組裝相關過程。異構型 3 可磷酸化並穩定 t-SNARE SNAP23，增強其與 syntaxin 組裝；也可促進雙股斷裂修復，保護細胞免受游離輻射。在體外，TLK1 可磷酸化 histone H3 的 Ser-10。 | 含實驗來源 | 證據與來源Rapidly and transiently inhibited by phosphorylation following the generation of DNA double-stranded breaks during S-phase. This is cell cycle checkpoint and ATM-pathway dependent and appears to regulate processes involved in chromatin assembly. Isoform 3 phosphorylates and enhances the stability of the t-SNARE SNAP23, augmenting its assembly with syntaxin. Isoform 3 protects the cells from the ionizing radiation by facilitating the repair of DSBs. In vitro, phosphorylates histone H3 at 'Ser-10' PMID 10523312 ↗ · PMID 10588641 ↗ · PMID 11314006 ↗ · PMID 11470414 ↗ · PMID 12660173 ↗ · PMID 9427565 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) PMID 10523312 ↗ · PMID 10588641 ↗ · PMID 9427565 ↗ |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 10523312 ↗ · PMID 10588641 ↗ · PMID 9427565 ↗ |
| 交互作用 | TLK1 與 TLK2 形成異源二聚體。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TLK1 定位於細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCAGAGGTTACCCCACCGCCTCAGCCGCCACCCACAGCCC40GCCGCCGCCGCCTCCCGGGCGACGCCGGGGGCCGACGCAC80TGCAGAGGTGCCGGCAGGTTCCGCCCGCGGAAGTGTCCTC120GGCCGGCGCAGCCCGCGCTCCGCCCGCGCTCCGACCCCGG160CCCGGCTGGCACCCCCTCGACGCCTCCGCCGCCGCGCTCC200TTTCCTCCTCCTCTCCTCTGGCGCGCCCGCTCGCTCCCTC240GCTTCTCCCCCTTTCCCTCCTCCCTGTCCCCTCTCCTTCC280CTCACCTCTTTCCTCCCCACCTCCCCTCTTCTCGGTTTCC320TCCCCCATCCCCTTGACTCTCCCCTCCCAGCCCTCGCTCT360CTCGCTCGCCCTCAGCGCGGCCCCCGCCATGACGGAGGCG400GGTGCCGGTGCCGTTGCCGCCGCTGCCGTCGCAGGGGGGG440AGTCGGGTTCCCAGAAAGTAGCTTGATGAGTGTCCAAAGT480AGCAGTGGAAGTTTGGAGGGGCCGCCATCTTGGTCCCAGC520TCTCCACGTCTCCAACCCCGGGCTCGGCGGCGGCGGCCAG560GTCCCTGCTGAATCACACGCCGCCATCCGGGAGGCCCAGG600GAAGGTGCAATGGATGAGCTTCATAGTCTGGATCCAAGAA640GGCAAGAGTTATTGGAAGCTAGATTTACTGGAGTTGCAAG680TGGGAGCACTGGAAGTACGGGCAGTTGCAGTGTTGGAGCT720AAAGCCTCAACAAATAACGAAAGCTCTAATCACAGTTTTG760GAAGCTTGGGATCTTTAAGTGACAAAGAATCAGAGACACC800GGAGAAGAAACAATCGGAATCATCCAGGGGAAGAAAGAGA840AAAGCAGAAAACCAGAATGAAAGTAGTCAGGGAAAAAGTA880TTGGGGGACGTGGCCACAAAATTAGCGACTATTTTGAATA920CCAGGGTGGAAATGGCTCAAGTCCAGTAAGAGGCATACCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。