基因總覽
TLE4（TLE family member 4, transcriptional corepressor）是蛋白質編碼基因，產物屬於 WD repeat Groucho/TLE 家族。其蛋白質長 773 個胺基酸，具有多個不同區域，整體定位為轉錄共抑制因子。TLE4 與多種轉錄因子有關，涉及轉錄活性的調節；其家族身分及區域組成是辨識此蛋白質的基本特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376552 ★ | 79,571,965–79,726,882 | 20 |
| ENST00000376544 | 79,571,773–79,726,882 | 18 |
| ENST00000376537 | 79,571,773–79,726,882 | 21 |
| ENST00000265284 | 79,571,773–79,726,882 | 19 |
| ENST00000965887 | 79,571,773–79,726,882 | 20 |
| ENST00000965888 | 79,571,773–79,726,882 | 19 |
| ENST00000965889 | 79,571,773–79,726,882 | 21 |
| ENST00001138819 | 79,571,773–79,726,882 | 20 |
| ENST00000435650 | 79,572,592–79,704,801 | 10 |
| ENST00000414465 | 79,572,611–79,652,629 | 6 |
| ENST00000706431 | 79,573,173–79,726,882 | 20 |
| ENST00000425506 | 79,573,262–79,652,794 | 7 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLE4 是轉錄共抑制因子，可與多種轉錄因子結合並抑制其介導的轉錄活化。來源指出，在 Wnt 訊號中，TLE4 可抑制由 CTNNB1 與 TCF 家族成員介導的轉錄活化；此外，也能抑制 PAX5 所介導的轉錄活化。這些描述顯示 TLE4 參與不同轉錄因子相關的轉錄調控，但來源未進一步交代其作用的分子細節。
全長 TLE 家族蛋白質的效應可能受到 dominant-negative AES 結合的調節。此處描述的是家族成員效應可能被互作改變，並未指出調節的方向或程度，因此不能據此推定 AES 對 TLE4 的影響必然增強或減弱。
在發育相關功能方面，依相似性推定，TLE4 是 SIX3 在視網膜與晶狀體發育期間發揮轉錄抑制活性所必需，也參與 SIX3 對自身轉錄的抑制。這些發育與自我調控功能帶有 By similarity 的證據限定，應視為依相似性提出的功能註解，而非無條件確立的結論。
來源亦指出，TLE4 參與 GNRHR 的轉錄抑制，並可增強 MSX1 介導的 CGA／alpha-GSU 轉錄抑制；這兩項功能同樣標示為依相似性推定。綜合而言，TLE4 的註解涵蓋轉錄活化抑制、特定轉錄因子的抑制作用，以及若干發育或基因轉錄調控情境，但各項功能的證據限定與適用情境並不相同。
Promoter 與基因調控
>TLE4 ENST00000376552 GRCh38 chr9:79570965-79572065 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGAGGGACGAGCTCCCCGCCCACCCCGCGGCCCCGGCCCCAGCCAGCATCTCGCGACTCCATTTCTGGC TCTAAACAAGAACGGGGACCGAGTCGCGTTCACACGGAAAATTATGCCGGCTCCAGCGGCGCGTAAAATT GATGTGAACCGAACGAAGTAAGATCAGCGTGATCCTCCCCCTCTTGTCTCAACAGGGGTTTCGGCGCGTT ACACAAGGCCGAGCTTGTCTCTTTAAGGAGACATTGGACCCTAATTAGTCCGCATTCCTGGCGCGGCTGC GGAGCGAGGGGCCGAAGGTGTCTGGGTTGGGAGACGGGTGGGCGGGAGGACGAGACTCGGAAGAAGATCT TTTGACCAGCCCCCAGGCTCACCGCTCCCTCCACCCTCTTTATTTTGCCGCCACCACCACCACCACCACC AACACCTAATTCTGAAGATGCAGCCAGGGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCGCCGATTCTCCCAGCCCCACG TTACTTTGATTGACAGCTGAACAAATGTTTTCCCGGTTCGAACGCTCGCGCTAAGGAACGTCAGCCAAGG CGAAGCTCCGCCTTGGGCGGGCCATCTCCGCCCCGCCTCCGCCAACCTCATTCCTCTTCGTTAATTGGTC GGAGCTACAGGCGACGCCCGGCCCCCACGTGGGTTTCAGCTGGGTTGGCTCCTCCCCGCTGGCTTGCCAT TTGTCAGCAGTGAAATGATGGGCACTAACACAGAACGGCGATTAATGTTCAGCCACCTCTGATTGGTTGG TGGAGACGCCTACCGCAACGGGGGTGGGCGGGGCGCTTGGAGAGCTCGCCAGAGCGCTCGCATGGCGGGC CGGTGATTGTAGTCAATCTGGCCGTATTCTCAGGCAGGGTCGCCCGGGGCGGACTACATCTCCCGGGATG CTGCGCGGCCGCCCCGCGGAAGATTGTGAATATGTATCAGAATGTTAATGATTAGCTGCTGCTAAATTTG GTCAAAGAAGTCACCTACACAGAGCGTGTTGTTAGAGCTGTGCTGAGCGGGTGTTTGGGTTGTTGGCTGC TTTCTTCCCCCTTTCTCACACACTTGTATATTATTTTGAGGTGGTGTTCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TLE4_3 ↗ | 9:79,571,730 | 正股 | 79,571,681–79,571,740 |
| TLE4_1 ↗ | 9:79,571,965 | 正股 | 79,571,916–79,571,975 |
| TLE4_2 ↗ | 9:79,572,686 | 正股 | 79,572,637–79,572,696 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_936KP5 · promoter · 79567763–79568087 · regulatory
ENSR9_5NPBCH · CTCF_binding_site · 79568020–79568041 · regulatory
ENSR9_936KPB · enhancer · 79568303–79568739 · regulatory
ENSR9_936KPQ · enhancer · 79569860–79570282 · regulatory
ENSR9_5NPBR9 · CTCF_binding_site · 79570561–79570582 · regulatory
ENSR9_BKRD4 · promoter · 79571283–79571975 · regulatory
ENSR9_C9W75 · promoter · 79572125–79573183 · regulatory
ENSR9_BKRDJ · enhancer · 79574276–79575165 · regulatory
· motif · 79568022–79568038 · motif
· motif · 79570480–79570493 · motif
· motif · 79570480–79570493 · motif
· motif · 79570562–79570572 · motif
· motif · 79570563–79570579 · motif
· motif · 79571135–79571145 · motif
· motif · 79571225–79571234 · motif
· motif · 79571231–79571253 · motif
· motif · 79571231–79571253 · motif
· motif · 79571282–79571292 · motif
· motif · 79571318–79571328 · motif
· motif · 79571554–79571564 · motif
· motif · 79571609–79571625 · motif
· motif · 79571609–79571625 · motif
· motif · 79571610–79571620 · motif
· motif · 79571620–79571636 · motif
· motif · 79571620–79571636 · motif
· motif · 79571665–79571678 · motif
· motif · 79571754–79571764 · motif
· motif · 79571758–79571768 · motif
· motif · 79571899–79571912 · motif
· motif · 79571899–79571912 · motif
· motif · 79572016–79572029 · motif
· motif · 79572118–79572129 · motif
· motif · 79572163–79572176 · motif
· motif · 79572182–79572193 · motif
· motif · 79572275–79572292 · motif
· motif · 79572729–79572736 · motif
· motif · 79572815–79572830 · motif
· motif · 79572975–79572985 · motif
· motif · 79573088–79573103 · motif
· motif · 79573196–79573213 · motif
· motif · 79573198–79573213 · motif
· motif · 79573205–79573213 · motif
· motif · 79573314–79573329 · motif
· motif · 79573356–79573366 · motif
· motif · 79573356–79573370 · motif
· motif · 79573504–79573514 · motif
· motif · 79573590–79573603 · motif
· motif · 79573600–79573617 · motif
· motif · 79573780–79573793 · motif
· motif · 79573793–79573803 · motif
· motif · 79574409–79574420 · motif
· motif · 79575112–79575125 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：773 aa
TLE4 蛋白質長 773 個胺基酸，屬於 WD repeat Groucho/TLE 家族。其註解包含 N 端 Q domain、GP domain、CcN domain 與 SP domain；C 端則列有七個 WD 重複區。部分區段另標註為無序區，包括 N 端短區段及蛋白質中段的多個區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位改變的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- NUP62P37198 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TLE4 可與其他家族成員形成同寡聚體或異寡聚體，並與 TLE1 互作。另有互作註解列出 PAX5、LEF1、TCF7、TCF7L1、TCF7L2、ZNF703、SIX3、SIX6 與 PAX2；其中多項標示為依相似性推定，PAX2 的互作則有文獻註記。來源另指出 TLE4 可能介導 ZNF703 的轉錄抑制，這是功能關係的描述，不等同於單純的結合註解。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TLE4 是可結合多種轉錄因子的轉錄共抑制因子，能抑制 PAX5，以及 Wnt 訊號中 CTNNB1 與 TCF 家族成員介導的轉錄活化。全長 TLE 家族蛋白質的效應可能受 dominant-negative AES 結合調節；依相似性推定，TLE4 亦參與 SIX3 在視網膜與晶狀體發育時的轉錄抑制及其自我抑制，並抑制 GNRHR 轉錄、增強 MSX1 對 CGA／alpha-GSU 的轉錄抑制。 | 推論支持 | 證據與來源Transcriptional corepressor that binds to a number of transcription factors. Inhibits the transcriptional activation mediated by PAX5, and by CTNNB1 and TCF family members in Wnt signaling. The effects of full-length TLE family members may be modulated by association with dominant-negative AES. Essential for the transcriptional repressor activity of SIX3 during retina and lens development and for SIX3 transcriptional auto-repression (By similarity). Involved in transcriptional repression of GNRHR and enhances MSX1-mediated transcriptional repression of CGA/alpha-GSU (By similarity) |
| 交互作用 | TLE4 可與其他家族成員形成同寡聚體或異寡聚體，並與 PAX5、LEF1、TCF7、TCF7L1、TCF7L2、ZNF703、SIX3、SIX6、PAX2 及 TLE1 互作；多項互作註記依相似性推定，PAX2 互作另有文獻註記。TLE4 可能介導 ZNF703 的轉錄抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer and heterooligomer with other family members. Interacts with PAX5 (By similarity). Interacts with LEF1, TCF7, TCF7L1 and TCF7L2 (By similarity). Interacts with ZNF703; TLE4 may mediate ZNF703 transcriptional repression (By similarity). Interacts with SIX3 and SIX6 (By similarity). Interacts with PAX2. Interacts with TLE1 (By similarity) PMID 24676634 ↗ |
| 細胞定位 | TLE4 位於細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGAGCGTGTTGTTAGAGCTGTGCTGAGCGGGTGTTTGGGT40TGTTGGCTGCTTTCTTCCCCCTTTCTCACACACTTGTATA80TTATTTTGAGGTGGTGTTCGCAGAGTTTGAAAGGAGAGAG120AATTAAAAAAAAAAGCCGCAAGCGTTTCACTCTTTTATTT160TTATAATCCCCTTCAATTTGGGGTTAAAAAAAAGACAAGA200AAACAGGAAGGAAGAGAAATAAGGAAATGAGATGTGGTAA240AAGAAGCTAAAAGGTGCCTTTTAAAAGATCGTTGCTGTGA280AGTGAAAAAAATCTCCAGAGAAACCAAAAAGCACCGCCGA320GACCTCTTCCGAACCAAAGGAGTTTGTGTTTGCTTTTAGG360GAAGAAGAAAGATCATTCATTCGGAGGAATAACAACCAAT400TAAAAGACAAATAAAAAAAGTTTGGAGTGGGACGCAGAGC440GAGCGAGAGGAGCTGCCGGCGGGCGGTGGGGCGCGGAGCC480CGCACTTTCCCGGCCGGGTGAGCGGCGGCCGCGGCGCCGG520GCTCGGCGGGTGCGCCTCGGCGGAGCGAACGTCGGAGCGT560TGCCTTGGGAGACGCGCGCCGGACAATGCCCGCGGCGGGC600CAGTGACGCCCGCGGGGAATGCGGAGCGGCCCGGCAGCCG640GCACCCAGCCGCCGCCGCGCGTTCCTGCCGCCCGTGTCAC680GCGAGACCCGGCGGGGGCCGGGACCGCCCGAGCCGCCCCT720CAGACCGAGCCGGCCGCCTCCGCTGCCGCGGCCGCCTCCT760CTTCGGGGTCATTAAAGCCAATGAGCCGCGCGCCTCTGCC800GAGCGCAGCCAACTAAATCGGCTTGGATGATTCGCGACCT840GAGCAAGATGTACCCGCAGACCAGACACCCAGCACCGCAT880CAGCCTGCTCAACCCTTTAAATTTACAATTTCCGAATCCT920GTGATCGGATTAAGGAAGAGTTTCAGTTTTTACAGGCTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。