基因總覽
TLE3（TLE family member 3, transcriptional corepressor）是位於人類第 15 號染色體的蛋白質編碼基因，產物屬於 WD repeat Groucho/TLE 家族。其蛋白質可與多種轉錄因子結合，並在不同轉錄調控情境中擔任輔助因子。資料指出，TLE3兼具轉錄共抑制因子與共活化因子的角色；其功能方向依相關訊號與作用對象而異。這些特性使 TLE3 能參與脂肪細胞生成相關的轉錄調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000451782 ★ | 70,047,790–70,097,917 | 20 |
| ENST00000558939 | 70,047,774–70,098,176 | 20 |
| ENST00000317509 | 70,047,774–70,098,176 | 20 |
| ENST00000560589 | 70,047,774–70,095,950 | 18 |
| ENST00000559929 | 70,047,774–70,098,176 | 20 |
| ENST00000559048 | 70,047,774–70,096,604 | 19 |
| ENST00000560939 | 70,047,774–70,096,701 | 19 |
| ENST00000557997 | 70,047,774–70,098,176 | 20 |
| ENST00000558201 | 70,047,774–70,096,437 | 19 |
| ENST00000440567 | 70,047,774–70,096,752 | 20 |
| ENST00000559191 | 70,047,774–70,097,866 | 9 |
| ENST00000918356 | 70,047,774–70,098,176 | 18 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLE3是轉錄共調節因子，可與多種轉錄因子結合。其作用並非固定為抑制轉錄：在 Wnt 訊號中，TLE3作為共抑制因子，抑制由 CTNNB1 與 TCF 家族成員介導的轉錄活化；在 PPARG 相關調控中，則可作為共活化因子。這兩種作用共同使 TLE3 能參與脂肪生成的調節。
在白色脂肪細胞分化方面，TLE3透過協助 PPARG，促進白色脂肪細胞的分化。資料亦指出，TLE3會阻止 PRDM16 與 PPARG 形成關聯；此作用可避免白色脂肪細胞轉向棕化。換言之，TLE3對脂肪細胞生成的影響，涉及促進白色脂肪細胞分化，以及限制其棕化，而不是單純促進或抑制所有轉錄活動。
Promoter 與基因調控
>TLE3 ENST00000451782 GRCh38 chr15:70097817-70098917 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGAGCAGGCTGAGCAAACCAGGTGGGAACTCGGAGTTCCCGGGCCTCGGCCGAGCAGGGTCCCGACCCC ATCCCCAACCCCCTCAGCCTGGGGATGCAGTGAGGAGCCCGCGCGGCGAGGCTGCGTCGAGGGTGAAGTT GTGCCCACGGGGAAGGCGCCCCGAATGGGGCCAGCCGTGGCTGAGCCTGTTGTCCACGGGCAGCCGGGCC CTTCCATCTGCGCTGCCCGCCTAGCCAGAGTCCCTCAGACTTCTCCTCGCAGGCAGCCGCCGCACATCAA AGGAGCTGTTTATTTGGCTTTCTGAAAAGAAGGGCGAGTGAACAAAGGAGAGCTGGGGGCTAATGTGGGG GAGGCGGGCAGAAGAAGGGGTGAAGAAAAGGGGACATCCTGAGTTCCGAGCAAATTTTTAAAGGTCGGAG GCAACTTTAGGAGCCACCGTTTTATCAGTCCTAAATCTTTTGAAGTGAAAACATTAAAGTGACAAAGTGA TTGTTTGTTTTATAGTATCTAATTGGGCTGCTTTGCAGACCTAATGAGATTAGAGGGAGGAATCGTTCGC CGCCGCTGCAGAATAAACTGATACATTACTACCAGCCACAGGTTTTGAAGATTGTACAGCTTGTCTTATT TTCTTTTGTTGTTATTCCTCTGTCTTCCCTCTTTCCTCCTCCCGCTAAATAATTATTTGCTAGTAGACCG TGGGAAAAAAAAGGAGGAAAAAAACTCGAGCAGCCCAGGACTATAATATATATCTATTTATTATATGTCT TTCGGTTAATTCCTGATCTGAGGAGCGCTGTTTTTCACTCCCATGCGAAAGTCACCAGCGGGTAGGGCCT GATTGCTACTTTTCATGCATAGTTTTAGACACAAGAGGGCATTGTGACGTCGCGCCCAGCGGCACCCAGT CGTAGGCCGAGTCCCGCAGCCCCACGTGGGGGCCCCGCGCTCCCATTGGCCAGCGCCGGACGAAGCTGCC ACATTATTTTGTTACTTTTCAGTCCCTATTTGGAACTGCTCTCGCGGCAGTTCAGACCTCGTGCTCGTCC CCTTCGCCTGTCTGTGTGTGGTATCCGTAGGTCCGGGGCACTTTTTTTTTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TLE3_1 ↗ | 15:70,097,917 | 負股 | 70,097,907–70,097,966 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_C8XRF · enhancer · 70093136–70094451 · regulatory
ENSR15_C8XRJ · enhancer · 70094621–70095939 · regulatory
ENSR15_932S7G · promoter · 70095940–70096391 · regulatory
ENSR15_BHWLB · promoter · 70096427–70097341 · regulatory
ENSR15_5LH6G3 · CTCF_binding_site · 70097401–70097422 · regulatory
ENSR15_843MFX · promoter · 70097856–70098088 · regulatory
ENSR15_5LH6JZ · CTCF_binding_site · 70098033–70098054 · regulatory
ENSR15_932S84 · promoter · 70098166–70098666 · regulatory
ENSR15_843MGZ · promoter · 70099637–70099853 · regulatory
ENSR15_5LH728 · CTCF_binding_site · 70100681–70100702 · regulatory
· motif · 70093244–70093253 · motif
· motif · 70095585–70095595 · motif
· motif · 70096015–70096035 · motif
· motif · 70096285–70096298 · motif
· motif · 70096291–70096304 · motif
· motif · 70096489–70096502 · motif
· motif · 70096531–70096544 · motif
· motif · 70096646–70096661 · motif
· motif · 70096646–70096661 · motif
· motif · 70096648–70096663 · motif
· motif · 70097313–70097327 · motif
· motif · 70097403–70097419 · motif
· motif · 70097444–70097458 · motif
· motif · 70097969–70097985 · motif
· motif · 70097969–70097985 · motif
· motif · 70098035–70098051 · motif
· motif · 70098098–70098111 · motif
· motif · 70099223–70099239 · motif
· motif · 70099223–70099239 · motif
· motif · 70099345–70099354 · motif
· motif · 70099345–70099354 · motif
· motif · 70099480–70099490 · motif
· motif · 70099569–70099579 · motif
· motif · 70099593–70099606 · motif
· motif · 70099593–70099606 · motif
· motif · 70099599–70099615 · motif
· motif · 70099630–70099640 · motif
· motif · 70099672–70099682 · motif
· motif · 70100683–70100699 · motif
· motif · 70100695–70100712 · motif
· motif · 70101346–70101356 · motif
· motif · 70101348–70101358 · motif
· motif · 70101350–70101360 · motif
· motif · 70101359–70101369 · motif
· motif · 70101518–70101532 · motif
· motif · 70101753–70101763 · motif
· motif · 70101760–70101770 · motif
· motif · 70101962–70101972 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：772 aa
TLE3蛋白質長 772 個胺基酸，屬於 WD repeat Groucho/TLE 家族。序列註解包含 Q domain、GP domain、CcN domain、SP domain，以及 C 端的七個 WD repeats；另有多段區域被註記為無序區。蛋白質序列中亦標示一段核定位訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TLE3定位於細胞核，並與染色體及染色質相關。 現有資料未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CHERPQ8IWX8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSTF2P33240 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP15-1Q3LI76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SIX1Q15475 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SIX2Q9NPC8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TLE3可形成同源四聚體，也可與其他家族成員形成異源寡聚體。其結合對象包括 LEF1、TCF7、TCF7L1、FOXA2及 TCF7L2/TCF4。TLE3亦與 TBX18互作；此互作透過 engrailed homology 1 repressor motif，並使 TBX18的轉錄活性降低。TLE3與 PRDM16互作，並可阻止 PRDM16與 PPARG的關聯及白色脂肪細胞棕化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TLE3可與多種轉錄因子結合，並以不同方式調節脂肪生成：在 Wnt 訊號中作為共抑制因子，抑制 CTNNB1 與 TCF 家族成員介導的轉錄活化；另可作為 PPARG 的共活化因子，促進白色脂肪細胞分化。TLE3也會阻止 PRDM16 與 PPARG 關聯，因而抑制白色脂肪細胞棕化；後述證據標示為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional coregulator that binds to a number of transcription factors. Acts as a regulator of adipogenesis both by acting as a corepressor of Wnt signaling and coactivator for PPARG. Inhibits the transcriptional activation mediated by CTNNB1 and TCF family members in Wnt signaling. Promotes diffentiation of white adipocytes by acting as a coactivator for PPARG and preventing the association between PRDM16 and PPARG, thereby preventing browning of white adipocytes (By similarity) PMID 28689657 ↗ |
| 交互作用 | TLE3可形成同源四聚體，亦可與其他家族成員形成異源寡聚體；它與 LEF1、TCF7、TCF7L1、FOXA2及 TCF7L2/TCF4互作。TLE3透過 engrailed homology 1 repressor motif 與 TBX18互作，並降低 TBX18轉錄活性。它也與 PRDM16互作，阻止 PRDM16與 PPARG關聯及白色脂肪細胞棕化；這項作用標示為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer and heterooligomer with other family members. Binds LEF1, TCF7 and TCF7L1 (By similarity). Binds FOXA2. Interacts with TCF7L2/TCF4. Interacts with TBX18 (via engrailed homology 1 repressor motif), leading to decreased of TBX18 transcriptional activity. Interacts with PRDM16; preventing association between PRDM16 and PPARG and browning of adipocytes (By similarity) PMID 10748198 ↗ · PMID 22304967 ↗ · PMID 26235987 ↗ |
| 細胞定位 | TLE3位於細胞核，並定位於染色體及染色質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCCCTATTTGGAACTGCTCTCGCGGCAGTTCAGACCTC40GTGCTCGTCCCCTTCGCCTGTCTGTGTGTGGTATCCGTAG80GTCCGGGGCACTTTTTTTTTTGGTGTGTGTGTGTGTGCGT120GCGCGCGTGTGTGTGTGTTGGGTGTGTGTGTTTTGGGGGT160TTGCCGGGGCGCGGAGAGGAGAGCCGGGCCGAGGGGAAGG200AAGGAAGCCGTAGAGCTCCCCGGTCTCGGGCTGCGTCTCC240CCTCCAGCGCTCTCCTGCCTGTGCGCTCCGACGCGGCAGC280GGCGGTGGCGCTGAGCGCTCCTCGGTGGGGACGCGGTGCT320CAAGCTGGGAGCAGCGAGAACCCTTTGCGGAGGCTTCCCG360TGCCCGCTGGACTTAGGATGCCAGGGCGTTTGATTTGCAC400CTACTGAGCCCGGAGTTCCTCCCCGGCCCTGGGAAGGGCT440TGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCAGTAGCAGAC480GGAACAGCAGGCTCTCCTCTCCGAGGGGGGGCGTCGAAGC520GCCCGCGCCGGGCTCCCGCCCTCACCCTCCGGCGCTCCTG560CGGCCCCAAGCCACCACCTCGTAGCCCGCCTCCTTCCTCT600TCTCGCCGCGAGCCCCAGGCCCGGACGCCTCTAGGATCGG640ACCCGCGCGCCCCGGATGCTTGGGGCTGCCCCGGCGCGCC680CCCCTACAGGCGCGACCCGCTGAGTGACCCGGAGGGGGCC720CGAGCTCGCCCCAGGAGGGGCCCCCGGCCTCGGGACCCCG760CGCCGGACCTGCTGGGGAGCCGACGATGTCCGCGCAGTCC800CAGGCATTGACGCGCTCGACGCAGCCCAGGGAAGGCGGCC840GGCCGCTGCCCGCCGAGCCCTAGGCGCACAAAGCCCGCGC880CCGCCGCCCGGCCCCGGCGCCCGCCGACGACTTTGCCGCC920TGCTCCGCGGCTCTTTGTCTCCACTTGGGGCGGGCGCCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。