演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TLE2ESG2

TLE family member 2, transcriptional corepressor

TLE2(TLE family member 2, transcriptional corepressor)是 TLE 家族的轉錄共抑制因子,可與多種轉錄因子結合,並抑制 Wnt 訊號相關的轉錄活化。

Homo sapiens19p13.3UniProt Q04725
OFFICIAL SYMBOL
TLE2
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q04725
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TLE2(TLE family member 2, transcriptional corepressor)是蛋白質編碼基因,產物屬於 WD repeat Groucho/TLE 家族。這類蛋白質作為轉錄共抑制因子,與轉錄因子協同調節轉錄;TLE2 的基本特徵是由多個不同區域組成,包含 N 端的 Q domain、GP domain、CcN domain 與 SP domain,以及 C 端的 WD 重複序列。蛋白質註解亦指出部分區段為無序區,並標示一段核定位訊號。這些結構註解描繪了 TLE2 的區域組成;其與特定轉錄因子及訊號路徑的關係見功能說明。

Official symbol
TLE2
Gene name
TLE family member 2, transcriptional corepressor
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11838
UniProt
Q04725
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ESG2GRG2ESGFLJ41188

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25TLE2pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:2,997,632–3,047,635
Gene span
50,004 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262953 ★2,997,644–3,029,28020
ENST000010528112,997,632–3,029,32519
ENST000010044352,997,638–3,029,27720
ENST000010528162,997,638–3,029,30019
ENST000010528512,997,638–3,029,26820
ENST000010528652,997,638–3,029,09718
ENST000004269482,997,639–3,045,78819
ENST000010044332,997,639–3,029,30020
ENST000010528132,997,639–3,029,32518
ENST000010528172,997,639–3,029,30020
ENST000010528192,997,639–3,029,29920
ENST000010528262,997,639–3,029,29220

顯示 12/48 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TLE2 是轉錄共抑制因子,能與多種轉錄因子結合,抑制由這些因子介導的轉錄活化。它在 Wnt 訊號中的明確作用包括抑制 CTNNB1 與 TCF 家族成員所介導的轉錄活化;因此,來源支持的功能重點是調節轉錄輸出,而非啟動該類轉錄反應。

TLE2 的抑制作用涉及與轉錄因子的結合,並非單獨描述為直接作用於 DNA。它可與 LEF1、TCF7、TCF7L1、TCF7L2、UTY、HES1 及 HES5 結合;其中對 Wnt 訊號的功能敘述特別指出 CTNNB1 與 TCF 家族成員所介導的活化受到抑制。來源未進一步說明這些結合在各情境中的具體分子步驟,因此不宜將不同互作對象一概視為具有相同的下游效果。

TLE 家族成員亦可彼此形成同源或異源寡聚體,提供家族成員共同組成複合體的依據。不過,來源並未將每一種寡聚體形式與特定轉錄因子或轉錄結果逐一連結,故其功能意義應限於家族成員間的組裝關係。

此外,TLE 家族全長蛋白質的作用可能受到 dominant-negative AES 結合所調節。這項描述標示為相似性推論(By similarity),並未在來源中界定調節方向或具體條件;因此只能指出 AES 可能影響全長 TLE 家族蛋白質的作用,不能進一步推定其對 TLE2 的確切效果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3029280 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TLE2 ENST00000262953 GRCh38 chr19:3029180-3030280 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTGTGGTTCTTCCAGTTCTGAGTGGGACACGGCTCCTGCCTTCAAGAAACCCAGTCTGAGAGGGGAGAC
AGCCCAGTCCACTGGTGATGGCAGTAGGAACACAATTCCCATCTGTGGAAGTTTGCTCTGTGTAGGGAGA
GGCTGACAGCGTTCATGCACTATCTCATTTAAGTGCAGTGCCCAGTGCGGTGGCTCCCGCCCGTAATCCC
AGCACTTTGGAAGGCCGAAGAGAGAGGCTTGAGTCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG
ACGCCCCCCTACTCCATCTCTGCAAAAAATTAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCACACCTGTAGTCC
CAGCTACTGGAGAAGCTGAGGGGGAAGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCGAGGCTGCAGTGAGCCATGAT
TGCCCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACACAGGGAGACCCTATCTCTGCAAAAAATTAAACCCTAAAGAT
AGCGCACCACCCCTGACCTTTTGCAGAGACTACTGAGGCCCCCAGAGGGCGAGGGCCCGGCATGATCTGG
GAAGCAGTGTTTGCTGTGAGATTCCCTTTCTGGCAGGGTTCCCTGCCAGCGCTTGGCAAGGCTGCGTCCT
GCTGACCCTTCAATCTCAACCCAATGTCACTTGCTCAGAAAAGCCATTTCCGACTCCAGACTGGTCCCCG
CTCCCCGCAAGCCCCCCCCCCCGCTCCCACGGTGGGTAACACGGTGTGAATTTCTTCACTGGTTTTTCTT
CTCCCGCCCCTCCGGGAGGGGGTGGGGACCCTGTTTTAAGGCACTGGGCGCCTCCCCACCCGGCCTCAGT
TTCCCCAACGGCCCAGGGACTGAAGGAAGGGGGCGGGTGCCCGGGGGCCGGGGGGGGCGCGGGCGCGGGG
AGGGGCGGTGCGCGGGGGTGGGCGCGGGGCGGGCCGCGGGCGCGTGGGGGCGGCGGCGCCACCTTAAGGC
GGCTCAGCCCGCGGCTCCCGGCCGAGCCCCGCCGGAGGGAGGCGGCTCCGCGCGGGGCCCGCCGCCCGCG
CCGCCGCCACCGAAACCCGGCCGCGGCGCGCCCGACCTTCTGCGCCGGCTG
TLE2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TLE2_1 ↗19:3,029,257負股3,029,247–3,029,306
TLE2_2 ↗19:3,047,812負股3,047,802–3,047,861

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_CB4S · enhancer · 3024642–3025758 · regulatory

ENSR19_937G7 · enhancer · 3027998–3028345 · regulatory

ENSR19_937GB · promoter · 3028346–3028846 · regulatory

ENSR19_BL89 · promoter · 3029003–3029801 · regulatory

ENSR19_5P8FK · CTCF_binding_site · 3029298–3029319 · regulatory

ENSR19_84DZ4 · enhancer · 3030981–3031156 · regulatory

· motif · 3024597–3024611 · motif

· motif · 3024597–3024611 · motif

· motif · 3029300–3029316 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:743 aa

1 aa743 aa功能區域基序重複區
依 Q04725 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TLE2 蛋白質長 743 個胺基酸,屬於 WD repeat Groucho/TLE 家族。其區域註解包括 Q domain、GP domain、CcN domain 和 SP domain,並有六段 WD 重複序列。另有數段被註解為無序區,且在 214–217 位標示核定位訊號。

重複區WD 1455–493 aa
重複區WD 2501–540 aa
重複區WD 3545–584 aa
重複區WD 4587–626 aa
重複區WD 5669–708 aa
重複區WD 6710–742 aa
功能區域Q domain1–127 aa
功能區域GP domain128–191 aa
功能區域Disordered179–232 aa
功能區域CcN domain192–254 aa
功能區域Disordered239–258 aa
功能區域SP domain255–423 aa
功能區域Disordered296–322 aa
基序Nuclear localization signal214–217 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q04725…

AlphaFold · Q04725

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

來源未提供定位變動條件、不同異構型的定位差異,亦未提及需與其他蛋白質區分的定位資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ESG2TLE2DDB1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TLE2 可與其他 TLE 家族成員形成同源寡聚體或異源寡聚體,並與 LEF1、TCF7、TCF7L1、TCF7L2、UTY、HES1 及 HES5 結合。來源列出這些結合與組裝關係,但未說明各互作的具體條件或是否構成同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TLE2 是轉錄共抑制因子,可與多種轉錄因子結合;在 Wnt 訊號中,它會抑制 CTNNB1 與 TCF 家族成員所介導的轉錄活化。TLE 家族全長蛋白質的作用可能受 dominant-negative AES 結合調節,但此項描述屬相似性推論。推論支持
證據與來源

Transcriptional corepressor that binds to a number of transcription factors. Inhibits the transcriptional activation mediated by CTNNB1 and TCF family members in Wnt signaling. The effects of full-length TLE family members may be modulated by association with dominant-negative AES (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TLE2 可與其他家族成員形成同源寡聚體或異源寡聚體,並與 LEF1、TCF7、TCF7L1、TCF7L2、UTY、HES1 及 HES5 結合。來源未進一步描述這些互作的條件或功能後果。資料庫紀錄
證據與來源

Homooligomer and heterooligomer with other family members. Binds LEF1, TCF7, TCF7L1, TCF7L2, UTY, HES1 and HES5

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TLE2 定位於細胞核。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262953 · 2,812 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCGAGCCCCGCCGGAGGGAGGCGGCTCCGCGCGGGGCCC40
41GCCGCCCGCGCCGCCGCCACCGAAACCCGGCCGCGGCGCG80
81CCCGACCTTCTGCGCCGGCTGCCGCGGCCGCCCTCGCCGC120
121GCTCCCGCCCCGGCCGCTGCCCCTGCCCGCCCCGCTCGCC160
161CCGCGCACCCCAACCCGGGGAGGGGCTCCCACGACCCCGG200
201GCGCGCGCGCTTGGGGGCGCGCCAGGGACTCCAGGGTCCC240
241TTGCCCCGCGCCGCTTCTCCCTCCTCCCTCTTTCTTCGGG280
281CAGCCTCCCCACCACCCCACTTCAGCCTCCCCCACTCTTG320
321CCGCCTCCATATCATCAAGCTCTGGTGGCGCCTGGGGGGC360
361TTTTCGGATCGGCAGGATGTACCCCCAGGGAAGGCACCCG400
401ACCCCGCTCCAGTCCGGCCAGCCCTTCAAGTTCTCGATCT440
441TGGAGATCTGCGACCGCATCAAAGAAGAATTCCAGTTTCT480
481TCAGGCTCAATACCACAGCCTCAAGCTAGAATGTGAGAAG520
521CTGGCCAGCGAGAAGACGGAAATGCAGCGACATTATGTCA560
561TGTATTATGAGATGTCGTACGGGCTCAACATTGAAATGCA600
601TAAGCAGGCGGAGATTGTGAAGCGTCTGAGCGGTATCTGC640
641GCTCAGATTATCCCCTTCCTGACCCAGGAGCATCAGCAGC680
681AGGTGCTCCAGGCCGTAGAACGCGCCAAGCAGGTCACCGT720
721GGGGGAGCTGAACAGCCTCATCGGGCAGCAGCTCCAGCCG760
761CTGTCCCACCACGCACCCCCTGTGCCCCTCACCCCCCGCC800
801CAGCCGGGCTGGTGGGCGGCAGTGCTACGGGGCTGCTTGC840
841TCTGTCTGGAGCCCTGGCTGCCCAGGCTCAGCTGGCGGCG880
881GCTGTCAAGGAGGACCGTGCGGGCGTGGAGGCCGAGGGGT920
921CCAGAGTGGAGAGAGCCCCGAGCAGGAGTGCATCTCCCTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。