基因總覽
TLE1 的正式名稱為 TLE family member 1, transcriptional corepressor，屬於蛋白質編碼基因，產物為 WD repeat Groucho/TLE 家族成員。它是轉錄共抑制因子，能與多種轉錄因子作用；其蛋白質包含多個不同區域，並在 C 端具有六個 WD 重複序列。現有註解亦指出，完整長度的 TLE 家族成員之作用可能受到 dominant-negative AES 結合的調節。這些特徵概括了 TLE1 的家族歸屬與分子性質；其對特定轉錄調控路徑的影響則見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376499 ★ | 81,583,683–81,689,547 | 20 |
| ENST00000879079 | 81,582,313–81,689,681 | 16 |
| ENST00000879080 | 81,582,313–81,689,681 | 19 |
| ENST00000879081 | 81,582,313–81,689,681 | 19 |
| ENST00000879082 | 81,582,313–81,689,681 | 18 |
| ENST00000879083 | 81,582,313–81,689,681 | 18 |
| ENST00000879084 | 81,582,313–81,689,681 | 19 |
| ENST00000879085 | 81,582,313–81,689,681 | 18 |
| ENST00000879086 | 81,582,313–81,689,681 | 19 |
| ENST00000879087 | 81,582,313–81,689,681 | 19 |
| ENST00000879088 | 81,582,313–81,689,681 | 19 |
| ENST00000879089 | 81,582,313–81,689,681 | 17 |
顯示 12/65 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TLE1 是轉錄共抑制因子，能與多種轉錄因子結合，並影響其所調控的基因表現。對 NF-kappa-B 調控的基因表現，TLE1 具有抑制作用；它也會抑制 FOXA2 所介導的轉錄活化，以及 Wnt 訊息傳遞中由 CTNNB1 和 TCF 家族成員介導的轉錄活化。
在其他轉錄調控情境中，TLE1 可增強 FOXG1/BF-1 與 HES1 介導的轉錄抑制。這些作用顯示，TLE1 能依其作用對象及所處的調控情境，參與不同方向的轉錄調節；其中相關功能註解標示為相似性推論，應保留此證據限制。
TLE1 並非在所有情境下都表現為共抑制因子；來源另指出，它對 ESRRG 具有不尋常的共活化因子功能。完整長度 TLE 家族成員的作用，則可能因與 dominant-negative AES 結合而受到調節。現有資料支持 TLE1 參與多類轉錄因子相關的基因調控，但未提供這些作用的更細緻分子步驟或具體生物學結果。
Promoter 與基因調控
>TLE1 ENST00000376499 GRCh38 chr9:81689447-81690547 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCAGCACCCTGGGAATCCTTCCCGCCAAACGGGACAGGACGATCTTTTTGAAAAGTGGCTTGAAATCCTG CAATAAAAATCAAATCCTACCACTTTGGGTGCAAAGGGGGTGGGTGGGGTGGGAGGACATCACAGTCGTC TTTGCTGGTGTACCTACGCCAACCGTGGCGTTGCTCATTTACGCATTTCCAACTAAGTGCACAGTCCACT CCCTCTCGTACATCCGTAAAAAGGCAGCTCAAGGAAAAACAAACCTCAGATAAATTTTTGAATGTGGCCT CACTTTTAGAGTAGCATCAAACAAGGGGTCCAGCACTGAAAAACACATTTGCTCGAATTACCAAAAGCCC CCCTCCGCCTCCAATAAGAAACTCCGCAGCTAGTCTTTGAGTTACTTTCACTTAGATCTGAGGATTTTCA TTAAAGGGAAAAGTGAGCAAGTGGCAGGATTTTTGCTAACTCGAGCCCTCAGCTTCCCCGGCTGCACGCT CGCCAGTCCCTCCCGCTAGCGCGCGCCCGCGCGCTCTCTAGCCAGCCCCACGTTACTTTGATTGACAGCC CAGCCCCGCCGCTCTCCTTCCCACCGACCTTCCCATCATCAGTGCCAATCTCCGCGAATCGCCGCTTCCC ATTGGCTGGTTTTGGCGTCCCGCGGCTCCTCCAGGAACAGTTCCTCACCAAGCCCGGGAGGACGCGGCTG GCGGAGGAGGGGCCGGGATGGGAAGGGAGACCGAGGAGACGGCGGAGATGGAAGCGAGAGGAGGGGGGGA GGGAGAACGCCCCGTCCGGCGCTGCGCTGCCATACGCTCCGGGGAGGAGCGCGTCAGCGCCCCACGTTGG TTGCAGCGCACGCGATTGGCTGATGCGGGCCTTCTGCCCCCCCCCCACCCCCCAACCTCCCGGGCTCACG TCCCCCGCCGGCTCCGCGCTCGCGCCCCCCGCCCGAACGGGGCTGGGCGGGGCCGGCGCTGGTTAGCTCC GGAGTGTGAAACCGCGTGTTAATGTAAGCGGCGCGAGAGGCGCGGGCGGCGGCGGCGGTGGGAGCGGCGG CTGCAGAAGCAGCAGCAGCAGAAACAGCGGCGGGTACTCTGTGCCCCGCGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TLE1_1 ↗ | 9:81,689,547 | 負股 | 81,689,537–81,689,596 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_5P7QXB · CTCF_binding_site · 81688453–81688474 · regulatory
ENSR9_937FG3 · promoter · 81689537–81689839 · regulatory
ENSR9_CB4TB · enhancer · 81689840–81691110 · regulatory
ENSR9_BL7Q5 · enhancer · 81693621–81694248 · regulatory
· motif · 81684806–81684817 · motif
· motif · 81685921–81685931 · motif
· motif · 81686238–81686247 · motif
· motif · 81686484–81686498 · motif
· motif · 81686902–81686917 · motif
· motif · 81686902–81686917 · motif
· motif · 81687198–81687211 · motif
· motif · 81687221–81687231 · motif
· motif · 81687276–81687289 · motif
· motif · 81687276–81687290 · motif
· motif · 81687276–81687291 · motif
· motif · 81687914–81687924 · motif
· motif · 81688455–81688471 · motif
· motif · 81689585–81689595 · motif
· motif · 81689656–81689666 · motif
· motif · 81689660–81689670 · motif
· motif · 81689662–81689672 · motif
· motif · 81689773–81689783 · motif
· motif · 81689835–81689845 · motif
· motif · 81690773–81690783 · motif
· motif · 81690775–81690785 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：770 aa
TLE1 蛋白長 770 個胺基酸，屬於 WD repeat Groucho/TLE 家族。其區域註解包括 N 端 Q domain、GP domain、CcN domain 與 SP domain；C 端另有六個 WD 重複序列。序列中亦註記一段核定位訊號，以及兩段無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TLE1 位於細胞核，並可與染色質相關；核內及染色質相關的狀態會依異構型與磷酸化狀態而異。 高度磷酸化會降低 TLE1 對核內成分的親和力。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- ATXN10Q9UBB4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAZAP2Q15038 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOXG1P55316 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- H4C9P62805 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- HES6Q96HZ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HEXBP07686 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOD2Q9HC29 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PRKNO60260-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RUNX1Q01196-1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- RUNX3Q13761 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SIRT1Q96EB6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SYT-SSX2A4PIW0 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
TLE1 可與其他家族成員形成同寡聚體或異寡聚體。資料列出的結合對象包括 RUNX1、RUNX3、FOXA2、KDM6A、UTY、histone H3、HESX1、ESRRG 與 RELA；也包括 SIX3、EFNB1、TLE4，以及 TCF7、LEF1、TCF7L1 和 TCF7L2，後一組標示為相似性推論。TLE1 透過 WRPW motif 與 HES1 作用。它也與 FOXG1/BF-1 互作，而此互作會受到 TLE6/GRG6 抑制；這些相關註解標示為相似性推論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TLE1 是可結合多種轉錄因子的轉錄共抑制因子，能抑制 NF-kappa-B 調控的基因表現、FOXA2 介導的轉錄活化，以及 Wnt 訊息傳遞中由 CTNNB1 和 TCF 家族成員介導的轉錄活化。它可增強 FOXG1/BF-1 與 HES1 介導的轉錄抑制，此項註解依相似性推論；完整長度 TLE 家族成員的作用可能受 dominant-negative AES 結合調節。另有資料指出 TLE1 對 ESRRG 具有共活化因子功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional corepressor that binds to a number of transcription factors. Inhibits NF-kappa-B-regulated gene expression. Inhibits the transcriptional activation mediated by FOXA2, and by CTNNB1 and TCF family members in Wnt signaling. Enhances FOXG1/BF-1- and HES1-mediated transcriptional repression (By similarity). The effects of full-length TLE family members may be modulated by association with dominant-negative AES. Unusual function as coactivator for ESRRG PMID 10660609 ↗ |
| 交互作用 | TLE1 可與其他家族成員形成同寡聚體或異寡聚體，並結合 RUNX1、RUNX3、FOXA2、KDM6A、UTY、histone H3、HESX1、ESRRG 和 NF-kappa-B 次單元 RELA。它透過 WRPW motif 與 HES1 互作，也與 SIX3、EFNB1、TLE4 及 FOXG1/BF-1 互作；TLE6/GRG6 會抑制後者的互作。與 TCF7、LEF1、TCF7L1、TCF7L2 及 TLE4 的互作，以及 FOXG1/BF-1 相關註解，標示為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer and heterooligomer with other family members. Binds RUNX1, RUNX3, FOXA2, KDM6A, UTY, histone H3, HESX1, ESRRG and the NF-kappa-B subunit RELA. Interacts with HES1 (via WRPW motif). Binds TCF7, LEF1, TCF7L1 and TCF7L2 (By similarity). Interacts with SIX3. Interacts with EFNB1. Interacts with TLE4 (By similarity). Interacts with FOXG1/BF-1; the interaction is inhibited by TLE6/GRG6 (By similarity) PMID 10660609 ↗ · PMID 10748198 ↗ · PMID 11731482 ↗ · PMID 12441302 ↗ · PMID 14651967 ↗ · PMID 21429299 ↗ · PMID 8649374 ↗ · PMID 8687460 ↗ · PMID 9334241 ↗ · PMID 9751710 ↗ · PMID 9854018 ↗ · PMID 9874198 ↗ |
| 細胞定位 | TLE1 位於細胞核，並與染色質相關；其核內及染色質相關狀態會依異構型和磷酸化狀態而異。高度磷酸化會降低 TLE1 對核內成分的親和力。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Nuclear and chromatin-associated, depending on isoforms and phosphorylation status. Hyperphosphorylation decreases the affinity for nuclear components PMID 12397081 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AATGTAAGCGGCGCGAGAGGCGCGGGCGGCGGCGGCGGTG40GGAGCGGCGGCTGCAGAAGCAGCAGCAGCAGAAACAGCGG80CGGGTACTCTGTGCCCCGCGTCCCGGAGGCAGCCGACTGC120GCCACCCCACCCTCGCACGGCCGGGCGGGACCCGCGCCAC160CAGCCCGGACCTCCGTCGTCCCGCGGCGACCAAAACCCCC200GCTGGCCCCACCGCTGTGACTACTCTGGACTCGCCCGCAG240AGTTTGCCCGCCGGGGAGGGTGGCCGATTGGCGGAGCGCA280CTCCTGCTGTTTTCCCCACCATCTCGTGGATGTCGTCCCT320CGGGTGGTGAGAGAACTTTGCAGTGGGCTGGAGCGCCCTT360TGCGGAGAAGCACACGAAGGTGAAGGAAGGAAAGAAAGAA400GACCGAGGAAGAAGGAGCTCGGAAGAAGGGTCCGGAGCGG440CCGGTCCGGCCGTGCAGGGCGAGTGCGCCCGAGGCGCGGC480GCCCTGATGCTCCCCGGGCTCGAGGAGCATTGGGCACTTG520CGGGACTGCTCTCGGTGGAGTAGCCCCGTCGGGCCCGGAG560GGTTTGTGCAACCGCGGAGAACACCGAGTGCTGGTCGCAC600GGGGCGTGCCGAGCCGCCTCCCGGCGCGCCCTCCGCACTT640TCCCCGCCTCGTCATCCGTCGCTCCCCGGCCAGGAGCCTC680CGCTGCGTCTTCAACCTCGCTCCCCTTTGCGTCCCGGGAG720CCTGCGAGCACCCGGCCGAAGGCGCAGCCGAATCTTGCGG760GAGTCGCCCCGAAAGCGTCGGGTTTGTGTGGGGTTAGCGG800GGGCCGCCGCGCCACCTGCACCTCGCCCGCCGCCGCCTCG840GGGAAAGCCCGAAGAGGAGGCGGACCAGGAGAAGAGCAAA880GAAAAGCAGTCCGTCTGGATTTGTTTGCCCAGGACTGGCG920CCGCGCACGCGGATCGCCGAGGGGAGTGCGGTCGGAGTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。