基因總覽
TJP3 的正式名稱為 tight junction protein 3，屬於蛋白質編碼基因，產物為 MAGUK 家族成員。其蛋白質全長 919 個胺基酸，具有三個 PDZ 結構域、SH3 結構域與 guanylate kinase-like 區域，並含有數段預測為無序的區域。這些結構特色符合其支架蛋白性質，使它能參與緊密連接相關組件的組織與穩定。TJP3 與 TJP1、TJP2 是彼此關係密切的支架蛋白；其主要角色與細胞連接及細胞週期調節相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000541714 ★ | 3,708,384–3,750,813 | 21 |
| ENST00000872695 | 3,708,356–3,750,813 | 20 |
| ENST00000590545 | 3,708,362–3,730,434 | 5 |
| ENST00000956532 | 3,708,362–3,750,813 | 20 |
| ENST00000956533 | 3,708,384–3,750,813 | 22 |
| ENST00000539908 | 3,708,503–3,750,813 | 20 |
| ENST00000872696 | 3,708,811–3,750,813 | 21 |
| ENST00000956534 | 3,710,511–3,750,813 | 21 |
| ENST00000872697 | 3,720,717–3,750,813 | 21 |
| ENST00000956535 | 3,720,902–3,750,813 | 21 |
| ENST00000872698 | 3,721,090–3,750,813 | 21 |
| ENST00000589378 | 3,721,737–3,750,813 | 21 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TJP3 是緊密連接的支架蛋白，與 TJP1、TJP2 一同協助將 claudins、junctional adhesion molecules 和 occludin 等跨膜蛋白連接至 actin cytoskeleton。緊密連接限制物質經細胞旁空間移動，並維持上皮與內皮細胞頂端和基底外側質膜區域的組成差異；TJP3 透過組織這些連接組件，參與維持此屏障與細胞表面區域的分隔。
TJP3 也會結合並招募 PATJ 至緊密連接，協助連結及穩定連接處的頂端與側向組件。這項作用將不同區域的連接結構維持在同一組織架構中，是其支架功能的一部分。
在細胞週期方面，TJP3 可於有絲分裂期間將 cyclin D1（CCND1）滯留在緊密連接處，使 CCND1 不易在 M 期遭到降解，並促進細胞進入 S 期。因此，TJP3 不僅參與細胞間連接，也與細胞週期進程相關。
TJP3 與 TJP1、TJP2 共同參與轉錄因子 DBPA 在連接處的滯留與穩定；但依相似性推定，TJP3 不參與 DBPA 往細胞核的穿梭。這表示其作用限於連接處的保留與穩定，不能據此推論它負責 DBPA 的核內運輸。
依相似性證據，與 TJP2 不同，TJP3 在實驗室環境下對個體存活、胚胎發育、上皮分化及緊密連接形成並非必要。這些結果界定了目前資料所支持的功能限制，並不表示 TJP3 在其他條件下沒有作用。
Promoter 與基因調控
>TJP3 ENST00000541714 GRCh38 chr19:3707384-3708484 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAACAAAAAACAAAACAAAACCAACAACAGCCAGCAGCAACAACAAAAAAACTTTTCTAGGCCAGGCTC GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTT GAGACCAGCCTGGCCAACATAGGAAAACCCCGTCTCTACTGAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTGGGCGTG GTGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGG AGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACTCCATCTCAAAA CAAACAACAAACAAAAGATATATAAAAATTTTTCTAGAGATGGGTTTCACCGTGTTACCCAGGCTGGTCT CAAATTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGTGTGAGCCAC CACACCTGACCCTTTCTTGTTTTTTAGATGAGGACAGCAAGAAGCCCCTGTAATTTGCCCAAAGCCACAC AGCGGGGAAGTGGCAGAAGCTTCTGTACGTAGGAACCCAGTCACTTCGTAGCAGAGAGGCAGACTGCGCA CAGATCTGCGTGGGGAAGGGAGTGCGCCAAGCCACAGCCTGATGGGCCGGCGTGCCTGGCAGGAGGCTCA GCAAGCACAGAGACTGGGCAGCTCCAGATGCAAGAAGCAGGAGGGAGGGGGACTCCGGGAGTGCGGTCCA TTCATGTCTGAATGTAGCCAACGAGGGTTTCCTAAGCACCTACCATGTGCGGACGCTTGATACCAGGGCC TCGGCGGTGAGGGCACAGGCAGGAGCAAGCTCACCTCTGGGCAAGCAGGGGTTAAGGCCAGTTGCTCCCA CGTGAGGGCACCTTGCGACAGAGCCACACACCCAGTCCTCCTGCTGGCCCGCCCCTCACCCTGGTCCGTC TCCCTGTGTCTGTGGTCGTCAGTTCCACTGGCAGGGGACCTGCCTCCCTGTTGCCACCACAAGAGAGGAA AAGTTGGTCAAACAGGTGGGGAGGCCAGAGCTACAAGCCTCGGGTTCCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_93GPD · enhancer · 3706015–3706453 · regulatory
ENSR19_5TJHJ · CTCF_binding_site · 3706236–3706257 · regulatory
ENSR19_93GPZ · promoter · 3708046–3708513 · regulatory
ENSR19_BPTK · enhancer · 3708514–3709031 · regulatory
ENSR19_BPTS · enhancer · 3710254–3710866 · regulatory
ENSR19_BPW7 · enhancer · 3712934–3713612 · regulatory
· motif · 3706238–3706254 · motif
· motif · 3706247–3706264 · motif
· motif · 3710370–3710384 · motif
· motif · 3710532–3710547 · motif
TJP3 在成熟的上皮細胞層中表現增加。在腸細胞中，頂端側的 leptin、Staphylococcus aureus alpha-toxin 與 Pseudomonas aeruginosa acyl-homoserine lactone 3O-C12-HSl 均會降低其表現；這些變化伴隨連接完整性改變。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：919 aa
TJP3 是 919 個胺基酸的 MAGUK 家族蛋白，含有三個 PDZ 結構域、SH3 結構域及 guanylate kinase-like 區域。另有四段區域被註記為無序區：第 92–173、279–377、791–886 及 899–919 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TJP3 在增殖中的細胞主要呈核內表現；細胞達到匯合後，則僅見於細胞連接處。 其上皮細胞緊密連接定位依賴 TJP1 與 TJP2。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction, tight junction。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 51 個夥伴
- ABCC4O15439 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARHGEF16Q5VV41 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASIC3Q9UHC3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ATP2B4P23634 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CREBBPQ92793 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CYSLTR2Q9NS75 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DGKKQ5KSL6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DGKZQ13574 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DOCK4Q8N1I0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD1Q5SYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD4Q14CM0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FZD7O75084 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCNA5P22460 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIR3DL3Q8N743 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TJP3 與 occludin（OCLN）、claudins、TJP1 及 PATJ 的互作依相似性推定；另有資料記載它與 UBN1、FASLG 及 CCND1 互作。這些資料支持其與多種分子的互作，但未一概界定各互作是否構成同一複合體或具有相同功能。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TJP1、TJP2 與 TJP3 是密切相關的支架蛋白，可將 claudins、junctional adhesion molecules、occludin 等緊密連接跨膜蛋白連至 actin cytoskeleton。緊密連接限制物質通過細胞旁空間，並區隔上皮與內皮細胞頂端及基底外側膜域。TJP3 會招募 PATJ、穩定連接組件，也可於有絲分裂時滯留 CCND1、促進進入 S 期；其對 DBPA 的作用限於連接處滯留與穩定，不包括核穿梭。依相似性推定，在實驗室環境下，TJP3 對個體存活、胚胎發育、上皮分化及緊密連接建立並非必要。 | 含實驗來源 | 證據與來源TJP1, TJP2, and TJP3 are closely related scaffolding proteins that link tight junction (TJ) transmembrane proteins such as claudins, junctional adhesion molecules, and occludin to the actin cytoskeleton. The tight junction acts to limit movement of substances through the paracellular space and as a boundary between the compositionally distinct apical and basolateral plasma membrane domains of epithelial and endothelial cells. Binds and recruits PATJ to tight junctions where it connects and stabilizes apical and lateral components of tight junctions. Promotes cell-cycle progression through the sequestration of cyclin D1 (CCND1) at tight junctions during mitosis which prevents CCND1 degradation during M-phase and enables S-phase transition. With TJP1 and TJP2, participates in the junctional retention and stability of the transcription factor DBPA, but is not involved in its shuttling to the nucleus (By similarity). Contrary to TJP2, TJP3 is dispensable for individual viability, embryonic development, epithelial differentiation, and the establishment of TJs, at least in the laboratory environment (By similarity) PMID 16129888 ↗ · PMID 21411630 ↗ |
| 交互作用 | TJP3 與 occludin（OCLN）、claudins、TPJ1 及 PATJ 的互作依相似性推定；另有資料記載其與 UBN1、FASLG 及 CCND1 互作。來源未進一步說明這些互作各自形成的複合體或功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with occludin OCLN, claudins and TPJ1 (By similarity). Interacts with PATJ (By similarity). Interacts with UBN1. Interacts with FASLG. Interacts with CCND1 PMID 18823282 ↗ · PMID 19807924 ↗ · PMID 21411630 ↗ |
| 細胞定位 | TJP3 可位於細胞膜胞質側、緊密連接及細胞核。增殖細胞中以核內表現為主，細胞達到匯合後則僅見於連接處。其上皮特異性的緊密連接定位依賴 TJP1 與 TJP2，該依賴關係為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Cell junction, tight junction; Nucleus; Exhibits predominant nuclear expression in proliferating cells but is exclusively junctionally expressed after confluence is reached. Shows an epithelial-specific tight junction localization in a TJP1/TJP2-dependent fashion (By similarity) PMID 21411630 ↗ · PMID 23608536 ↗ |
| 調控 | TJP3 在成熟上皮細胞層中的表現較高。在腸細胞中，頂端側 leptin、Staphylococcus aureus alpha-toxin 與 Pseudomonas aeruginosa acyl-homoserine lactone 3O-C12-HSl 會降低 TJP3 表現，並改變連接完整性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Exhibits enhanced expression in matured epithelial layers. Apical leptin, Staphylococcus aureus alpha-toxin and Pseudomonas aeruginosa acyl-homoserine lactone 3O-C12-HSl lower expression levels, altering junctional integrity in intestinal cells PMID 20434232 ↗ · PMID 22354024 ↗ · PMID 23608536 ↗ · PMID 24314862 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTCCACTGGCAGGGGACCTGCCTCCCTGTTGCCACCAC40AAGAGAGGAAAAGTTGGTCAAACAGGTGGGGAGGCCAGAG80CTACAAGCCTCGGGTTCCCTCCCCACCACCCGTGCCAGGC120AGGCACCCGGGCCCTGGCACCTGCTGCCTGCCCAGAGGCC160ACCCAGCCTCCTAGACAGGTGGCTGACATGGAGGAGCTGA200CCATCTGGGAACAGCACACGGCCACACTGTCCAAGGACCC240CCGCCGGGGCTTTGGCATTGCGATCTCTGGAGGCCGAGAC280CGGCCCGGTGGATCCATGGTTGTATCTGACGTGGTACCTG320GAGGGCCGGCGGAGGGCAGGCTACAGACAGGCGACCACAT360CGTCATGGTGAACGGGGTTTCCATGGAGAATGCCACCTCC400GCGTTTGCCATTCAGATACTCAAGACCTGCACCAAGATGG440CCAACATCACAGTGAAACGTCCCCGGAGGATCCACCTGCC480CGCCACCAAAGCCAGCCCCTCCAGCCCAGGGCGCCAGGAC520TCGGATGAAGACGATGGGCCCCAGCGGGTGGAGGAGGTGG560ACCAGGGCCGGGGCTATGACGGCGACTCATCCAGTGGCTC600CGGCCGCTCCTGGGACGAGCGCTCCCGCCGGCCGAGGCCT640GGTCGCCGGGGCCGGGCCGGCAGCCATGGGCGTAGGAGCC680CAGGTGGTGGCTCTGAGGCCAACGGGCTGGCCCTGGTGTC720CGGCTTTAAGCGGCTGCCACGGCAGGACGTGCAGATGAAG760CCTGTGAAGTCAGTGCTGGTGAAGAGGAGAGACAGCGAAG800AGTTTGGCGTCAAGCTGGGCAGTCAGATCTTCATCAAGCA840CATTACAGATTCGGGCCTGGCTGCCCGGCACCGTGGGCTG880CAGGAAGGAGATCTCATTCTACAGATCAACGGGGTGTCTA920GCCAGAACCTGTCACTGAACGACACCCGGCGACTGATTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。