基因總覽
TJP2 是蛋白質編碼基因，其產物 tight junction protein 2 屬於 MAGUK 家族。這種蛋白質具有多個 PDZ 結構域，並含有 SH3 與 Guanylate kinase-like 結構域；序列中另有數段預測為無序的區域。這些結構特色構成其分子架構。資料將它與細胞間的緊密連結及黏著連結相關聯，並指出它可能參與 RANKL 誘導的破骨細胞分化；具體作用內容見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377245 ★ | 69,174,277–69,255,208 | 23 |
| ENST00000643713 | 69,121,264–69,212,572 | 4 |
| ENST00000606364 | 69,121,308–69,221,016 | 6 |
| ENST00000423935 | 69,121,470–69,221,096 | 6 |
| ENST00000647986 | 69,123,048–69,246,746 | 20 |
| ENST00000636438 | 69,145,590–69,255,199 | 24 |
| ENST00000896723 | 69,174,002–69,255,204 | 22 |
| ENST00000965864 | 69,174,163–69,255,200 | 20 |
| ENST00000896724 | 69,174,176–69,255,204 | 22 |
| ENST00001046893 | 69,174,224–69,255,202 | 24 |
| ENST00000348208 | 69,174,277–69,255,201 | 21 |
| ENST00000649943 | 69,174,282–69,255,185 | 21 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TJP2 的產物 tight junction protein 2 與兩類細胞連結相關：緊密連結和黏著連結。這表示來源將它列為連結結構中的相關蛋白，但沒有進一步說明它在這些結構中的具體分子作用，也沒有提供其對連結形成或維持的直接實驗描述。
此外，tight junction protein 2 被描述為 RANKL 誘導之破骨細胞分化的正向調節因子。這項功能的提出帶有相似性推論的限制；來源指出其可能透過調節下游轉錄活性來發揮作用，但並未將此機制表述為已確立的直接作用。因此，較合適的理解是它可能有助於 RANKL 訊號下的分化調節，並可能涉及轉錄層級，而非據此推定特定轉錄因子或下游基因。
這些資料呈現 tight junction protein 2 與細胞連結及破骨細胞分化兩方面的關聯，但未提供兩者之間的連結，也未說明其在不同細胞或生理條件下如何協調。破骨細胞分化相關描述同樣標示為依相似性推論，故其調節方向與可能的轉錄介入方式應保留這項證據限制。
Promoter 與基因調控
>TJP2 ENST00000377245 GRCh38 chr9:69173277-69174377 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGATTTCAAACCCAAGGTTATATTTTTAATCGGTACCTGTTTGGATTCTCCAAATTAATTTATATGCTCT TAAAATAAAGACACTTAACGTCACTGCACAATTCTTTGCACATGGAGGACTTCGAAAGGAATAAGCACAC TGAATTGCATTAGATGAATCCTGTCAGATAAGCACTTGTGACCTACTGGCAACCTTTTATAAGCTGATGA TGGGAGAGGAGTTTCAATCTCTTTATTGGAGTTGTTGGAAATGTGCCAAAGAGATAACCTGGAATATATT GTCCTGAAAAGTCCTGTTTTAATATTTAATACGAACATCTTATAACCCTCGGAATTCGGGTAGGCAGTTG TTGGGCTGAGAAATGTGGGGTACAAGGCCGTGTATGTGTTGGTTAGCCGGGCAGGCCTCTAGACAGGACC TAAAACTTTGAGGTTTTCCCAGTTCGACTCTTCGTAGGAGAACTGAAGCTGCCTGTGTGAGGCCCTGCGA ACCTCGCCAAAAAGTCTTCCTACAGGATGCCCCCGCGACCTCACCGGGGAAACACCGCGGACAGTCGGGC CAGCAGCGCCCGGAGCTCACTCCAGGTCTCCAAACTTGCAGCACTTCCCAGAGCGCGCGCGCTCGGAGCG GGACCTGCTTGCTCCAGTGCACGCCGCGGAGCGAACCATCGGGCTGGCGGGGGTGGAGGGGTGCAGGCGT GGGGGCTGCGGGCCGCTCGGGCCTTGGGCTTCTCCTGCCGCCGCCGCCGCCTCCCGCCCCCGGCCAGGAG TCGCGCGTGACGCGGTTCGCCGCAGGAGCCTCGAAGGCGCGGCGCCGGCGAGCCCTTCCCCGGCAGGCGC GTGGGTGGTAGCGGCCAATTTGACAGTTTCCCGGGCCGGGCGGCCAGCGCGGAGGCGCCACGCTCGGGTC GGGGGCGGGCTGACGCCGCCGCCGCCGCGGGAGGAGGGACAAAGGGGTGGGTCCCCGCGGGTCGGCACCC CGGCGGTTGGGCTGCGGGTCAGAGCACTGTCCGGTGGTGCCCAGGAGGAGTAGGAGCAGGAGCAGAAGCA GAAGCGGGGTCCGGAGCTGCGCGCCTACGCGGGACCTGTGTCCGAAATGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 12 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TJP2_3 ↗ | 9:69,121,276 | 正股 | 69,121,227–69,121,286 |
| TJP2_6 ↗ | 9:69,121,626 | 正股 | 69,121,577–69,121,636 |
| TJP2_8 ↗ | 9:69,123,015 | 正股 | 69,122,966–69,123,025 |
| TJP2_12 ↗ | 9:69,174,141 | 正股 | 69,174,092–69,174,151 |
| TJP2_1 ↗ | 9:69,174,282 | 正股 | 69,174,233–69,174,292 |
| TJP2_2 ↗ | 9:69,205,155 | 正股 | 69,205,106–69,205,165 |
| TJP2_7 ↗ | 9:69,225,325 | 正股 | 69,225,276–69,225,335 |
| TJP2_4 ↗ | 9:69,237,040 | 正股 | 69,236,991–69,237,050 |
| TJP2_5 ↗ | 9:69,250,680 | 正股 | 69,250,631–69,250,690 |
| TJP2_11 ↗ | 9:69,251,247 | 正股 | 69,251,198–69,251,257 |
| TJP2_10 ↗ | 9:69,252,902 | 正股 | 69,252,853–69,252,912 |
| TJP2_9 ↗ | 9:69,254,837 | 正股 | 69,254,788–69,254,847 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BHPM4 · enhancer · 69168726–69169308 · regulatory
ENSR9_BHPMF · enhancer · 69170951–69171717 · regulatory
ENSR9_BHPMS · promoter · 69173787–69174387 · regulatory
ENSR9_C8TBZ · enhancer · 69174388–69175907 · regulatory
ENSR9_5L9B73 · CTCF_binding_site · 69174434–69174455 · regulatory
ENSR9_BHPN8 · enhancer · 69176561–69177164 · regulatory
ENSR9_BHPNH · enhancer · 69178381–69179204 · regulatory
· motif · 69170611–69170617 · motif
· motif · 69173793–69173808 · motif
· motif · 69173950–69173963 · motif
· motif · 69174016–69174029 · motif
· motif · 69174029–69174042 · motif
· motif · 69174042–69174058 · motif
· motif · 69174063–69174080 · motif
· motif · 69174112–69174125 · motif
· motif · 69174162–69174175 · motif
· motif · 69174182–69174195 · motif
· motif · 69174198–69174211 · motif
· motif · 69174204–69174217 · motif
· motif · 69174244–69174257 · motif
· motif · 69174346–69174359 · motif
· motif · 69174436–69174452 · motif
· motif · 69174786–69174794 · motif
· motif · 69175073–69175084 · motif
· motif · 69175248–69175256 · motif
· motif · 69175474–69175483 · motif
· motif · 69175618–69175631 · motif
· motif · 69175646–69175668 · motif
· motif · 69175779–69175796 · motif
· motif · 69176456–69176468 · motif
· motif · 69176646–69176659 · motif
· motif · 69176646–69176659 · motif
· motif · 69176904–69176915 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1190 aa
tight junction protein 2 長 1190 個胺基酸，屬於 MAGUK 家族。其結構包含 PDZ 1、PDZ 2、PDZ 3、SH3 與 Guanylate kinase-like 結構域；另有多段序列被註記為無序區域。C 端末端區段與 SCRIB 的互作有實驗註記。
蛋白質三維結構
細胞內定位
tight junction protein 2 位於細胞膜的細胞質側，並與緊密連結及黏著連結相關。 它也可見於細胞核；在環境壓力、遷移中的內皮細胞，以及未達融合的上皮細胞培養物中，亦有核內定位的描述。 依相似性推論，它在緊密連結形成初期會定位至該處。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction, adherens junction；Cell junction, tight junction。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 73 個夥伴
- ABCC4O15439 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA3O96018 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARHGEF16Q5VV41 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASIC3Q9UHC3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ATP2B4P23634 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- CYSLTR2Q9NS75 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYTIPO60759 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DGKKQ5KSL6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DGKZQ13574 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG5Q8TDM6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DOCK4Q8N1I0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EZH1Q92800 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD1Q5SYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD4Q14CM0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FZD7O75084 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KCNA5P22460 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIR3DL3Q8N743 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
tight junction protein 2 可形成同源二聚體，並透過 PDZ 2 與 TJP1/ZO1 的 PDZ 2 互作。另有報告指出它與 UBN1、SCRIB，以及包括 CLDN1、CLDN2、CLDN3、CLDN5、CLDN7 在內的 claudins 互作；與 OCLN、CLDN18、USP53、CTNNA1 的互作則帶有相似性推論，其中 USP53 涉及 C 端區域，CTNNA1 涉及 N 端。它也被描述為在細胞核中與 SAFB 互作。
疾病與遺傳關聯
TJP2 與家族性高膽酸血症 1（FHCA1）及家族性進行性肝內膽汁鬱積 4（PFIC4）相關。FHCA1 的特徵包括血清膽酸濃度升高、搔癢與脂肪吸收不良；相關疾病可能由不同基因座的變異造成，其中包括 TJP2。PFIC4 可於早期發病，膽汁鬱積逐漸進展至肝纖維化、肝硬化及成年前末期肝病，遺傳方式為體染色體隱性；來源指出該病由影響 TJP2 的變異造成。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TJP2 產物與緊密連結和黏著連結有關，這項描述依相似性推論。它也被列為 RANKL 誘導之破骨細胞分化的正向調節因子，可能透過調節下游轉錄活性參與其中；此作用方式同樣是推論，不能視為已確立的直接機制。 | 推論支持 | 證據與來源Plays a role in tight junctions and adherens junctions (By similarity). Acts as a positive regulator of RANKL-induced osteoclast differentiation, potentially via mediating downstream transcriptional activity (By similarity) |
| 交互作用 | TJP2 可形成同源二聚體，並透過 PDZ2 與 TJP1/ZO1 的 PDZ2 互作；也與 OCLN、UBN1、核內的 SAFB、SCRIB、USP53、claudins（包括 CLDN1、CLDN2、CLDN3、CLDN5、CLDN7）、CLDN18 及 CTNNA1 有互作描述。USP53 互作涉及 C 端區域，CTNNA1 互作涉及 N 端；部分互作依相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts (via PDZ2 domain) with TJP1/ZO1 (via PDZ2 domain). Interacts with OCLN (By similarity). Interacts with UBN1. Interacts with SAFB in the nucleus (By similarity). Interacts with SCRIB. Interacts with USP53 (via the C-terminal region) (By similarity). Interacts with claudins, including CLDN1, CLDN2, CLDN3, CLDN5 and CLDN7. Interacts with CLDN18 (By similarity). Interacts (via N-terminus) with CTNNA1 (By similarity) PMID 12704386 ↗ · PMID 15975580 ↗ · PMID 17897942 ↗ · PMID 18823282 ↗ |
| 細胞定位 | TJP2 位於黏著連結、緊密連結及細胞膜細胞質側，也可見於細胞核。在環境壓力下、遷移中的內皮細胞及未達融合的上皮細胞培養物中有核內定位描述；依相似性推論，它在緊密連結形成初期定位至該處。 | 推論支持 | 證據與來源Cell junction, adherens junction; Cell membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Cell junction, tight junction; Nucleus; Also nuclear under environmental stress conditions and in migratory endothelial cells and subconfluent epithelial cell cultures. Localizes to tight junctions during initial stages of their formation (By similarity) |
| 疾病關聯 | 家族性高膽酸血症 1（FHCA1）以血清膽酸濃度升高、搔癢及脂肪吸收不良為特徵。此病可能由不同基因座的變異造成，其中包括 TJP2；資料未將 TJP2 描述為唯一病因。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hypercholanemia, familial, 1 FHCA1 A disorder characterized by elevated serum bile acid concentrations, itching, and fat malabsorption. The disease may be caused by variants affecting distinct genetic loci, including the gene represented in this entry MIM: 607748 PMID 12704386 ↗ |
| 疾病關聯 | 家族性進行性肝內膽汁鬱積 4（PFIC4）可於早期發病，並進展至肝纖維化、肝硬化及成年前末期肝病，遺傳方式為體染色體隱性。來源指出，影響 TJP2 的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cholestasis, progressive familial intrahepatic, 4 PFIC4 A disorder characterized by early onset of cholestasis that progresses to hepatic fibrosis, cirrhosis, and end-stage liver disease before adulthood. PFIC4 inheritance is autosomal recessive. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615878 PMID 24614073 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGCACTGTCCGGTGGTGCCCAGGAGGAGTAGGAGCAGG40AGCAGAAGCAGAAGCGGGGTCCGGAGCTGCGCGCCTACGC80GGGACCTGTGTCCGAAATGCCGGTGCGAGGAGACCGCGGG120TTTCCACCCCGGCGGGAGCTGTCAGGTTGGCTCCGCGCCC160CAGGCATGGAAGAGCTGATATGGGAACAGTACACTGTGAC200CCTACAAAAGGATTCCAAAAGAGGATTTGGAATTGCAGTG240TCCGGAGGCAGAGACAACCCCCACTTTGAAAATGGAGAAA280CGTCAATTGTCATTTCTGATGTGCTCCCGGGTGGGCCTGC320TGATGGGCTGCTCCAAGAAAATGACAGAGTGGTCATGGTC360AATGGCACCCCCATGGAGGATGTGCTTCATTCGTTTGCAG400TTCAGCAGCTCAGAAAAAGTGGGAAGGTCGCTGCTATTGT440GGTCAAGAGGCCCCGGAAGGTCCAGGTGGCCGCACTTCAG480GCCAGCCCTCCCCTGGATCAGGATGACCGGGCTTTTGAGG520TGATGGACGAGTTTGATGGCAGAAGTTTCCGGAGTGGCTA560CAGCGAGAGGAGCCGGCTGAACAGCCATGGGGGGCGCAGC600CGCAGCTGGGAGGACAGCCCGGAAAGGGGGCGTCCCCATG640AGCGGGCCCGGAGCCGGGAGCGGGACCTCAGCCGGGACCG680GAGCCGTGGCCGGAGCCTGGAGCGGGGCCTGGACCAAGAC720CATGCGCGCACCCGAGACCGCAGCCGTGGCCGGAGCCTGG760AGCGGGGCCTGGACCACGACTTTGGGCCATCCCGGGACCG800GGACCGTGACCGCAGCCGCGGCCGGAGCATTGACCAGGAC840TACGAGCGAGCCTATCACCGGGCCTACGACCCAGACTACG880AGCGGGCCTACAGCCCGGAGTACAGGCGCGGGGCCCGCCA920CGATGCCCGCTCTCGGGGACCCCGAAGCCGCAGCCGCGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。