基因總覽
TINF2（TERF1 interacting nuclear factor 2）是蛋白質編碼基因，產物為 shelterin（telosome）複合體的成員。此蛋白質與端粒維護相關，並參與 shelterin 的組裝。資料將其列為單體，同時指出它是由多種蛋白質組成的 shelterin 複合體之一員。TINF2 的異構型 1 另有與核基質連結的相關描述；其蛋白質序列包含一段無序區域、TBM 基序及核定位訊號。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000267415 ★ | 24,239,643–24,242,623 | 9 |
| ENST00001115353 | 24,234,009–24,242,666 | 10 |
| ENST00001115354 | 24,234,021–24,242,666 | 10 |
| ENST00000399423 | 24,239,643–24,242,666 | 6 |
| ENST00000995789 | 24,239,643–24,242,666 | 3 |
| ENST00001012158 | 24,239,643–24,242,666 | 6 |
| ENST00001012161 | 24,239,643–24,242,666 | 8 |
| ENST00001012162 | 24,239,646–24,242,666 | 5 |
| ENST00001115355 | 24,239,646–24,242,666 | 5 |
| ENST00000646753 | 24,239,647–24,242,666 | 8 |
| ENST00000943625 | 24,239,647–24,242,666 | 9 |
| ENST00000995790 | 24,239,647–24,242,666 | 5 |
顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TINF2 是 shelterin（telosome）複合體的組成成分，參與端粒長度調節與染色體末端保護。端粒包含端粒酶所添加的雙股 TTAGGG 重複序列；shelterin 與這些序列相連，協助維持端粒及染色體末端的保護狀態。
這種保護可使染色體末端不被 DNA 損傷監測系統當作一般損傷處理。若缺少 shelterin 的保護作用，端粒便不再能避開這類監測，染色體末端也可能被 DNA 修復途徑不適當地處理。因此，TINF2 所參與的複合體有助於維持端粒末端的正常狀態，避免其受到不合宜的損傷反應與修復處理。
除了端粒保護與長度調節，TINF2 也參與 shelterin 複合體的組裝。此複合體由多個蛋白質共同構成，TINF2 的組裝角色使其與複合體的形成及端粒相關功能相連。資料另指出，異構型 1 可能具有額外作用，可將端粒錨定至核基質；此項描述限於異構型 1，且原文以可能性表述。
Promoter 與基因調控
>TINF2 ENST00000267415 GRCh38 chr14:24242523-24243623 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCCCAACTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGCCACTACGCCCGGCTAGTTTTTTTGATTT TCAGTAGAGACAGGTTATCGCCATGTGATCCAGTCTGGTCTGGAACTCCTGGGCTCAAGCGGATCGATCC TCCCCTCTCGGCCTCTCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGTCACCGTGCCCCCAGCCTGTATTCTATT TCTTCTTCTTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTGAGAGAGATTCTCCCTCTGTCGCCCAGGCTGGA ATGCAGAGGCAAGATCGCGGCTCACTGCCACCTCCCGTCTACTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCGGC CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTACTTTTAGCAGAGAAG GGGTTTCACCATGTCGCCCAGGCTTGTCTGGAGCTCCTGGGCTCAAGTGACCCTCCTGCCTCGGCCTCTC AAAGCGCTGGGATTAGACACAAGCCACCACGCCCAGCCTGTATTTTATTTTTTAAGGGCGGGCGCCCTCT TCTGTTTTATAAAAGGAACAGTCGAATTCCTACTGGAAGCGACGCGCGCAGAGGGGAAGGCTTTGTAGAC GCCGGCTCGGGTCTGGAATTTAAAGAACTAAATTTCGATGGGTGAAGACAGTGGGAAAGGGCGGTGGCAT GATCCTCGTTTTACAGACTAGGAAGTCGAGCCTCACGGGAGTGACGGGGCTTCTCCGCAGGCTCCGCGAA GAAAGCAAGGCTGGGAGGACCCAGACGAACGGCCACAACAGCCTCAGCGGCCACGACAGCCTCAGCCGCC AACTCATGTCAGCCGGCAGAGAGTGCAGGAAGCGGGCAGCTACAGCTCCGCTGGGGCGTGGCCTTCTGAC GCACCGTCACGGTTCCCTCTGTGGCCGCCCATTGGCTCCCTCTTACCGCCCTTTTCCGGGGCAAGGGAAG CTAGTAGCGGAGCCGGAAGTGAGGCACCCTCGGGCTCGAGACAGCGGCGACGTTTAAAGCTGAGCGACCC AGTGCCACTGGAGACGGTCAGCTTCTCCACTCAGGCTCCTCCAGCCCGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TINF2_1 ↗ | 14:24,242,618 | 負股 | 24,242,608–24,242,667 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_57NXN7 · CTCF_binding_site · 24241713–24241734 · regulatory
ENSR14_57NXR4 · CTCF_binding_site · 24242341–24242362 · regulatory
ENSR14_B6RWC · promoter · 24242349–24243153 · regulatory
ENSR14_57NXWF · CTCF_binding_site · 24243055–24243076 · regulatory
ENSR14_57NXXK · CTCF_binding_site · 24243302–24243323 · regulatory
ENSR14_9CLSX · enhancer · 24246897–24247240 · regulatory
· motif · 24239067–24239078 · motif
· motif · 24239962–24239972 · motif
· motif · 24241715–24241731 · motif
· motif · 24242285–24242301 · motif
· motif · 24242343–24242359 · motif
· motif · 24242505–24242515 · motif
· motif · 24242623–24242632 · motif
· motif · 24242623–24242634 · motif
· motif · 24242623–24242634 · motif
· motif · 24242721–24242737 · motif
· motif · 24242722–24242732 · motif
· motif · 24242789–24242806 · motif
· motif · 24242807–24242824 · motif
· motif · 24243057–24243073 · motif
· motif · 24243098–24243108 · motif
· motif · 24243304–24243320 · motif
· motif · 24244207–24244218 · motif
· motif · 24244247–24244258 · motif
· motif · 24244453–24244464 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：451 aa
TINF2 蛋白質長 451 個胺基酸。序列註解標示第 229–257 位為無序區域；第 256–278 位含 TBM 基序；第 262–268 位則有核定位訊號。這些特徵依序列註解標示，不代表來源另有描述其作用機制。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TINF2 位於細胞核，並與端粒相關。 另有資料指出，異構型 1 位於核基質；此定位描述限於該異構型，不應延伸至其他異構型。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome, telomere。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 49 個夥伴
- ACDQ96AP0 · UniProt INTERACTION · 18 experiments · 2 筆來源紀錄
- ACTBP60709 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- AIPL1Q9NZN9 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ANKMY2Q8IV38 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ANXA4P09525 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ANXA5P08758 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARHGDIAP52565 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARID3BQ8IVW6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BAG3O95817 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CALD1Q05682 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCDC43Q96MW1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCDC9Q9Y3X0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CLK3P49761 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CPNE3O75131 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DBN1Q16643 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DCXO43602 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- EIF4BP23588 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ENO2P09104 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FAM131BQ86XD5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GAPDHP04406 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- KCTD17Q8N5Z5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LGALSLQ3ZCW2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LTA4HP09960 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAP2K3P46734 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NCDNQ9UBB6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TINF2 被記載為單體，也存在於 shelterin（telosome）複合體中；該複合體包含 TERF1、TERF2、TINF2、TERF2IP、ACD 與 POT1。另有資料記載 TINF2 與 POT1、TERF1、TNKS1 同處複合體，並與 TERF1、TERF2 及 ACD 互作。來源未將所有同處複合體的關係都界定為直接結合。
疾病與遺傳關聯
TINF2 相關變異被列為常染色體顯性先天性角化不良第 3 型與第 5 型的致病變異。第 3 型是罕見多系統疾病，常見表現包括進行性骨髓衰竭，以及網狀皮膚色素沉著、指甲營養不良與黏膜白斑三聯徵；其他表現可包括早發性白髮、再生不良性貧血、血小板偏低、骨質疏鬆、肺纖維化或肝纖維化。第 5 型則可見骨髓發育不全、指甲營養不良、稀疏細髮、細網狀皮膚色素沉著、口腔白斑、雙側滲出性視網膜病變、小腦發育不全與生長遲緩。這些疾病關聯依來源所述為影響 TINF2 的變異所致。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TINF2 是 shelterin（telosome）複合體的組成成分，參與端粒長度調節與保護。Shelterin 連結端粒酶添加的雙股 TTAGGG 重複序列，保護染色體末端，使其不被 DNA 損傷監測系統辨識；缺少此保護時，染色體末端可能遭 DNA 修復途徑不適當處理。TINF2 也參與 shelterin 組裝；異構型 1 可能另有將端粒錨定至核基質的作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the shelterin complex (telosome) that is involved in the regulation of telomere length and protection. Shelterin associates with arrays of double-stranded TTAGGG repeats added by telomerase and protects chromosome ends; without its protective activity, telomeres are no longer hidden from the DNA damage surveillance and chromosome ends are inappropriately processed by DNA repair pathways. Plays a role in shelterin complex assembly. Isoform 1 may have additional role in tethering telomeres to the nuclear matrix PMID 16166375 ↗ · PMID 16880378 ↗ |
| 交互作用 | TINF2 被記載為單體，並與 POT1、TERF1 及 TNKS1 同處複合體。它也是 shelterin（telosome）複合體的成員；該複合體由 TERF1、TERF2、TINF2、TERF2IP、ACD 與 POT1 組成。另記載 TINF2 與 TERF1、TERF2 及 ACD 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Found in a complex with POT1; TERF1 and TNKS1. Component of the shelterin complex (telosome) composed of TERF1, TERF2, TINF2, TERF2IP ACD and POT1. Interacts with TERF1, TERF2 and ACD PMID 12768206 ↗ · PMID 15231715 ↗ · PMID 15316005 ↗ · PMID 15383534 ↗ · PMID 18202258 ↗ |
| 細胞定位 | TINF2 位於細胞核，並與染色體端粒相關。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | 異構型 1 被記載位於核基質。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 常染色體顯性先天性角化不良第 3 型是罕見多系統疾病，與端粒維護缺陷相關，並由影響 TINF2 的變異所致。其特徵包括進行性骨髓衰竭，以及網狀皮膚色素沉著、指甲營養不良和黏膜白斑三聯徵；表現不一的其他特徵可包括早發性白髮、再生不良性貧血、血小板偏低、骨質疏鬆、肺纖維化與肝纖維化。早期死亡常與骨髓衰竭、感染、致命肺部併發症或惡性腫瘤有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Dyskeratosis congenita, autosomal dominant, 3 DKCA3 A rare multisystem disorder caused by defective telomere maintenance. It is characterized by progressive bone marrow failure, and the clinical triad of reticulated skin hyperpigmentation, nail dystrophy, and mucosal leukoplakia. Common but variable features include premature graying, aplastic anemia, low platelets, osteoporosis, pulmonary fibrosis, and liver fibrosis among others. Early mortality is often associated with bone marrow failure, infections, fatal pulmonary complications, or malignancy. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613990 PMID 18252230 ↗ |
| 疾病關聯 | 常染色體顯性先天性角化不良第 5 型是由影響 TINF2 的變異所致。其特徵包括骨髓發育不全、指甲營養不良、稀疏細髮、細網狀皮膚色素沉著、口腔白斑、雙側滲出性視網膜病變、小腦發育不全與生長遲緩。 | 含實驗來源 | 證據與來源Dyskeratosis congenita, autosomal dominant, 5 DKCA5 A disease characterized by bone marrow hypoplasia, nail dystrophy, fine sparse hair, fine reticulate skin pigmentation, oral leukoplakia, bilateral exudative retinopathy, cerebellar hypoplasia, and growth retardation. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 268130 PMID 18252230 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGGCACCCTCGGGCTCGAGACAGCGGCGACGTTTAAAGC40TGAGCGACCCAGTGCCACTGGAGACGGTCAGCTTCTCCAC80TCAGGCTCCTCCAGCCCGAGCCAGAAGACCCCCTCCCCCA120GAATTCTGGGGGCCGATGGAAGGGAGCCGAGTCAGATCGC160GAGGTACCCAGAGCCGACAGACCGGAGCGACAGGGAGTTG200CCAGAAGCCCCGCCCCTAGGAGTGATCGGAAAGCCTCACC240CATCCGGGTGAGGAACCCGGAGGGACCGCCTCCGGGCGGA280GCCCGCCGACCATGGCTACGCCCCTGGTGGCGGGTCCCGC320AGCTCTACGCTTCGCCGCCGCGGCTAGCTGGCAGGTTGTG360CGCGGACGCTGCGTGGAACATTTTCCGCGAGTACTGGAGT400TTCTGCGATCTCTGCGCGCTGTTGCCCCTGGCTTGGTTCG440CTACCGGCACCACGAACGCCTTTGTATGGGCCTAAAGGCC480AAGGTGGTGGTGGAGCTGATCCTGCAGGGCCGGCCTTGGG520CCCAAGTCCTGAAAGCCCTGAATCACCACTTTCCAGAATC560TGGACCTATAGTGCGGGATCCCAAGGCTACAAAGCAGGAT600CTGAGGAAGATTTTGGAGGCACAGGAAACTTTTTACCAGC640AGGTGAAGCAGCTGTCAGAGGCTCCTGTGGATTTGGCCTC680GAAGCTGCAGGAACTTGAACAAGAGTATGGGGAACCCTTT720CTGGCTGCCATGGAAAAGCTGCTTTTTGAGTACTTGTGTC760AGCTGGAGAAAGCACTGCCTACACCGCAGGCACAGCAGCT800TCAGGATGTGCTGAGTTGGATGCAGCCTGGAGTCTCTATC840ACCTCTTCTCTTGCCTGGAGACAATATGGTGTGGACATGG880GGTGGCTGCTTCCAGAGTGCTCTGTTACTGACTCAGTGAA920CCTGGCTGAGCCCATGGAACAGAATCCTCCTCAGCAACAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。