基因總覽
TIMP4（TIMP metallopeptidase inhibitor 4）是由蛋白質編碼基因產生的金屬蛋白酶抑制因子。其已知作用對象包括 MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7 與 MMP-9；與這些酵素的作用方式及失活機制詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000287814 ★ | 12,153,068–12,158,912 | 5 |
| ENST00000946698 | 12,153,221–12,158,912 | 5 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TIMP4 可與金屬蛋白酶（包括 collagenases）形成複合體，並使這些酵素失活。其作用方式是結合金屬蛋白酶的催化性鋅輔因子；來源指出，這種結合會造成不可逆的失活。
已知 TIMP4 可作用於 MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7 與 MMP-9。來源未提供其他作用對象、細胞或生理條件，也未說明此抑制作用在特定生物學過程中的結果，因此不宜據此延伸描述其生理效應。
Promoter 與基因調控
>TIMP4 ENST00000287814 GRCh38 chr3:12158812-12159912 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCACCACGCCCGGCTAACTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGAGTTTCATCATGATGGCTAGGGTGATC TCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCAACCCGCCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGAGCCA CCACGCCCAGCCTGCTTCTTTGTTTTCTAAGCTGTCCCACCTTCTAGAACATGACAGAGTCTCCAGTGAG AAGGGACATGCAATAAAAATCAATGTAGTCTAGGGCCTCGAGAGGGCTTTGAGGTCCAAGGTTTGCCCTA AGTGATGGGACACTTTGTGTTTTGTACACCAAGAGCGCTGTCTCCAGCTATCTGGAGAGTCTGAGGCTCT GGGAGTGAGAAAGGGTTTCTAAAGCACTGGCTGCTTCTTTGACATCTCTCCCCACCCCCCAGGCAACAGA GCCAAGACACACACACCCCAACTTTCTCTGTCCTGTTCTATTACTGTTTGCTGTTGCTTTGGAGCCTCAT AAATAGGGCATTGAAAGCACTTCCTGCAGCTGAAAGAAGCCCTGAGTAGCTCGTCTCATTCCCAGCGTGC AGCTCAGCAAGGGGTCCGTCCTTCTCTGTCACTGTCTCTTTTGCCTGTTGTAATTCTGTCTGCCTCTCTG GGACTCTGCCTGTCTCACTCTTTCTGTCTGTGCCTCTCCTCACTCTTGTTCTTTCTGCCTGAATCACAGC CCTCAGTTTTTCTGTCCTCATGCATTTGTCTTTGTGGCTCTTTCCGTCTTTCTGCCCTTGACACCATCCC CTCTCCCAGTGCTTCCCCTCTGCTTCCAGATCGCTTCATGACTTAGGCAGGGAAACAGAGGTCAGGGCCT CCTTCCAGGCTTCCCTCTGCATCTTACTGAGTATGCAGGTCGGAAGAGCCTCGGGTCCTGCCTCCGCGGG TGGCCTAGAGCCAAAGGAAGGCGGAGCCCGTCGGGGCGGGATTGGCCCTTAGGGCCACCTCATAAAGCCT GGGGCGAGGGGCACAACGGCCTTGGGAAGGAGCCCTGCTGGGGCCGTCCAGTCCCCCAGACCTCACAGGC TCAGTCGCGGATCTGCAGTGTCATGCCTGGGAGCCCTCGGCCCGCGCCAAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TIMP4_2 ↗ | 3:12,158,912 | 負股 | 12,158,902–12,158,961 |
| TIMP4_1 ↗ | 3:12,159,365 | 負股 | 12,159,355–12,159,414 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_96S9D · enhancer · 12155852–12156264 · regulatory
ENSR3_96SB9 · promoter · 12158902–12159402 · regulatory
· motif · 12159035–12159049 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：224 aa
TIMP4 長 224 個胺基酸，屬於 protease inhibitor I35（TIMP）家族。蛋白質含有 NTR 結構域，標註範圍為第 30 至 156 個胺基酸；第 1 至 29 個胺基酸為訊號序列。第 30–33 與第 99–100 個胺基酸區段則被標註為參與金屬蛋白酶結合。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TIMP4 被標註為分泌型蛋白質。 來源未提供其在其他細胞區室的定位資訊，也未描述定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TIMP4 可與金屬蛋白酶（例如 collagenases）形成複合體，並藉由結合其催化性鋅輔因子而不可逆地使酵素失活；已知作用對象包括 MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7 與 MMP-9。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Complexes with metalloproteinases (such as collagenases) and irreversibly inactivates them by binding to their catalytic zinc cofactor. Known to act on MMP-1, MMP-2, MMP-3, MMP-7 and MMP-9 |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTTGGGAAGGAGCCCTGCTGGGGCCGTCCAGTCCCCCAGA40CCTCACAGGCTCAGTCGCGGATCTGCAGTGTCATGCCTGG80GAGCCCTCGGCCCGCGCCAAGCTGGGTGCTGTTGCTGCGG120CTGCTGGCGTTGCTGCGGCCCCCGGGGCTGGGTGAGGCAT160GCAGCTGCGCCCCGGCGCACCCTCAGCAGCACATCTGCCA200CTCGGCACTTGTGATTCGGGCCAAAATCTCCAGTGAGAAG240GTAGTTCCGGCCAGTGCAGACCCTGCTGACACTGAAAAAA280TGCTCCGGTATGAAATCAAACAGATAAAGATGTTCAAAGG320GTTTGAGAAAGTCAAGGATGTTCAGTATATCTATACGCCT360TTTGACTCTTCCCTCTGTGGTGTGAAACTAGAAGCCAACA400GCCAGAAGCAGTATCTCTTGACTGGTCAGGTCCTCAGTGA440TGGAAAAGTCTTCATCCATCTGTGCAACTACATCGAGCCC480TGGGAGGACCTGTCCTTGGTGCAGAGGGAAAGTCTGAATC520ATCACTACCATCTGAACTGTGGCTGCCAAATCACCACCTG560CTACACAGTACCCTGTACCATCTCGGCCCCTAACGAGTGC600CTCTGGACAGACTGGCTGTTGGAACGAAAGCTCTATGGTT640ACCAGGCTCAGCATTATGTCTGTATGAAGCATGTTGACGG680CACCTGCAGCTGGTACCGGGGCCACCTGCCTCTCAGGAAG720GAGTTTGTTGACATCGTTCAGCCCTAGTAGGGACCAGTGA760CCATCACATCCCTTCAAGAGTCCTGAAGATCAAGCCAGTT800CTCCTTCCCTGCAGAGCTTTGGCCATTACCACCTGACCTC840TTGCTGCCAGCTAATAAGAAGTGCCAAGTGGACAGTCTGG880CCACTGTCAAGGCAGGGAAGGGGCCATGACTTTTCTGCCC920TGCCCTCAGCCTGTTGCCCCTGCCTCCCAAACCCCATTAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。