基因總覽
TIMP2（TIMP metallopeptidase inhibitor 2）是人類的蛋白質編碼基因。其產物屬於 metalloproteinase inhibitor，可作用於多種 metalloproteinases，包括 collagenases。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000262768 ★ | 78,852,977–78,925,387 | 5 |
| ENST00000585421 | 78,852,977–78,874,150 | 5 |
| ENST00000536189 | 78,852,977–78,922,401 | 5 |
| ENST00000586057 | 78,852,977–78,874,089 | 4 |
| ENST00000586713 | 78,852,977–78,903,215 | 7 |
| ENST00000970519 | 78,852,977–78,925,396 | 3 |
| ENST00001135713 | 78,852,977–78,925,396 | 5 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TIMP2 的產物可與 metalloproteinases（包括 collagenases）形成複合體，並藉由結合其催化鋅輔因子，使這些酵素不可逆地失活。這項抑制作用涉及酵素的催化部位，來源列出的作用標的包括 MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7、MMP-8、MMP-9、MMP-10、MMP-13、MMP-14、MMP-15、MMP-16 與 MMP-19。
因此，TIMP2 能直接限制多種 metalloproteinases 的活性；來源支持的功能重點，是透過結合催化鋅輔因子造成不可逆失活，而非僅描述兩者有關聯。對 MMP-2 的作用也有交互作用資料補充：TIMP2 與 MMP2 結合後，MMP2 活性受到抑制。
Promoter 與基因調控
>TIMP2 ENST00000262768 GRCh38 chr17:78925287-78926387 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTTCCCTCTCCCTAGCTGGACTGCAAACACTCTGGAATGCTGACCTGAGGGCTGGAGTGCTGACCTGAG TGCAGCAGTGTCCATGGAGCCCCACGGGGCACACACCAAATGTACAGGGTGGGTGCCCACAGCCGGGCAC AGGCAGGTTCACAGCCAGGAAGCCCGCCTCACCACCCTACACATGTTCATCCCTTCATATGCCTGGGTCT TTCCTGGAACACAAAACTGTTTTGGGAAAAGTCCTTCGGCTCCCACATTTGTGGACTAAGAGAGGAAACT GTGAGCGGAACCCAGCCAATGCCTCTGCTGCGATCCTACTGGCTCCTGGGCGCCTGGGCCCACCCCCGTC TCTTGTTGGCTGGTCAAAAATATGGCCAGTTTATATAAAATCCTGTTTTGTTCACAGTAACCACACCCCC CACCCCCCAACTAAACTGGCCAGGCGCACTTAAAATTCTAAGGCCTCCATTTGAAAAAGGGATCCTGTCA GTTTCTCAATAGGCCACCCGCCCACAGAAACGGGGAGGTGGCGACAGGGAACGGCCCCTGCTCCAAAGGA CACCCCTTGGCTCGCCCCGAGGCTGGGCTCGAAGGGACCCCGGGGTGGCGGGGGACGGAGCAGCGTAGCC CTCCAGAGTCGAGCTGAAGGGGAAAGGGTAGCGGGTGGGTCGCCTGGTGTCCTGGAAGAACGGGGCGCGA GTCCCCCGCGCTGAGTCAGGGACCCCGGGCGCAGAAGGCCACGCAGCGGGGACCGGGGTCGGGGGGCTGG GGGCGTCCGGGGACCCCCGCGCGGGTGCGGGTCGCGGGCGCCAGGTGGTGCGGGAAGCCCCCGACGTGCC AGGCCGGGCACAACAAAAGCGCGGGCTGGGGGGAGGCGCGGGCGGAGGGGGAGGAGGGGGCTGCTGGGAG CGCCCAGAGCCTGCATTGGCCGCCAGCCACCGGGAGGAGGAGCAGAAAATCCTCCGAGCGCAATAAAACT GCGGCCCGGCCCAAGCCCGCAGCAAACACATCCGTAGAAGGCAGCGCGGCCGCCGAGAACCGCAGCGCCG CTCGCCCGCCGCCCCCCACCCCGCCGCCCCGCCCGGCGAATTGCGCCCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TIMP2_1 ↗ | 17:78,925,387 | 負股 | 78,925,377–78,925,436 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_BKMW3 · enhancer · 78921393–78921973 · regulatory
ENSR17_936BS9 · promoter · 78925377–78925877 · regulatory
ENSR17_5NK86K · CTCF_binding_site · 78925432–78925453 · regulatory
ENSR17_5NK876 · CTCF_binding_site · 78925564–78925585 · regulatory
ENSR17_84BMQ5 · enhancer · 78930009–78930137 · regulatory
· motif · 78923127–78923138 · motif
· motif · 78925434–78925450 · motif
· motif · 78925566–78925582 · motif
TIMP2 受到 TGFB1 的下調調控；來源未提供此調控的條件或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：220 aa
TIMP2 產物長 220 個胺基酸，N 端具有第 1–26 位的訊號序列；第 27–152 位為 NTR domain。第 27–30 位及第 95–96 位另標註為參與 metalloproteinase 結合的區域。此蛋白質屬於 protease inhibitor I35（TIMP）家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TIMP2 被標註為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- FECHP22830 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MMP14P50281 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MMP2P08253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TIMP2 透過 C-terminal 與 MMP2 的 C-terminal PEX domain 交互作用；此結合會抑制 MMP2 活性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TIMP2 可與 metalloproteinases（例如 collagenases）形成複合體，並藉由結合其催化鋅輔因子，使酵素不可逆地失活。已知作用標的包括 MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7、MMP-8、MMP-9、MMP-10、MMP-13、MMP-14、MMP-15、MMP-16 與 MMP-19。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complexes with metalloproteinases (such as collagenases) and irreversibly inactivates them by binding to their catalytic zinc cofactor. Known to act on MMP-1, MMP-2, MMP-3, MMP-7, MMP-8, MMP-9, MMP-10, MMP-13, MMP-14, MMP-15, MMP-16 and MMP-19 PMID 11710594 ↗ · PMID 2554304 ↗ · PMID 2793861 ↗ |
| 交互作用 | TIMP2 透過其 C-terminal 與 MMP2 的 C-terminal PEX domain 交互作用；此交互作用會抑制 MMP2 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via the C-terminal) with MMP2 (via the C-terminal PEX domain); the interaction inhibits the MMP2 activity PMID 11710594 ↗ · PMID 12032297 ↗ · PMID 1655733 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | TIMP2 受到 TGFB1 下調；來源未進一步說明此調控發生的條件或作用機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGCAAACACATCCGTAGAAGGCAGCGCGGCCGCCGAGAAC40CGCAGCGCCGCTCGCCCGCCGCCCCCCACCCCGCCGCCCC80GCCCGGCGAATTGCGCCCCGCGCCCCTCCCCTCGCGCCCC120CGAGACAAAGAGGAGAGAAAGTTTGCGCGGCCGAGCGGGG160CAGGTGAGGAGGGTGAGCCGCGCGGGAGGGGCCCGCCTCG200GCCCCGGCTCAGCCCCCGCCCGCGCCCCCAGCCCGCCGCC240GCGAGCAGCGCCCGGACCCCCCAGCGGCGGCCCCCGCCCG280CCCAGCCCCCCGGCCCGCCATGGGCGCCGCGGCCCGCACC320CTGCGGCTGGCGCTCGGCCTCCTGCTGCTGGCGACGCTGC360TTCGCCCGGCCGACGCCTGCAGCTGCTCCCCGGTGCACCC400GCAACAGGCGTTTTGCAATGCAGATGTAGTGATCAGGGCC440AAAGCGGTCAGTGAGAAGGAAGTGGACTCTGGAAACGACA480TTTATGGCAACCCTATCAAGAGGATCCAGTATGAGATCAA520GCAGATAAAGATGTTCAAAGGGCCTGAGAAGGATATAGAG560TTTATCTACACGGCCCCCTCCTCGGCAGTGTGTGGGGTCT600CGCTGGACGTTGGAGGAAAGAAGGAATATCTCATTGCAGG640AAAGGCCGAGGGGGACGGCAAGATGCACATCACCCTCTGT680GACTTCATCGTGCCCTGGGACACCCTGAGCACCACCCAGA720AGAAGAGCCTGAACCACAGGTACCAGATGGGCTGCGAGTG760CAAGATCACGCGCTGCCCCATGATCCCGTGCTACATCTCC800TCCCCGGACGAGTGCCTCTGGATGGACTGGGTCACAGAGA840AGAACATCAACGGGCACCAGGCCAAGTTCTTCGCCTGCAT880CAAGAGAAGTGACGGCTCCTGTGCGTGGTACCGCGGCGCG920GCGCCCCCCAAGCAGGAGTTTCTCGACATCGAGGACCCAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。