演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TIMM8ADDP

translocase of inner mitochondrial membrane 8A

TIMM8A 編碼粒線體膜間腔伴護蛋白,參與特定膜蛋白前驅物的運送,並與 TIMM13 組成可溶性複合體。

Homo sapiensXq22.1UniProt O60220
OFFICIAL SYMBOL
TIMM8A
CHROMOSOME
X
UNIPROT
O60220
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

translocase of inner mitochondrial membrane 8A 是蛋白質編碼基因,其產物 TIMM8A 屬於 small Tim 家族,是粒線體膜間腔中的伴護蛋白。蛋白質全長 97 個胺基酸,具有位於第 43 至 66 個胺基酸的 Twin CX3C motif。TIMM8A 可與 TIMM13 組成可溶性複合體,參與粒線體膜蛋白前驅物的運送。

Official symbol
TIMM8A
Gene name
translocase of inner mitochondrial membrane 8A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11817
UniProt
O60220
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DDPMTSDFN1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq22.1
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegTIMM8Apq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:101,320,050–101,349,001
Gene span
28,952 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000372902 ★101,345,661–101,348,7422
ENST00001006678101,320,050–101,349,0013
ENST00001104699101,341,052–101,349,0013
ENST00001128242101,341,052–101,349,0012
ENST00000894322101,345,652–101,348,7462
ENST00000644112101,345,661–101,348,7422
ENST00000940411101,345,661–101,349,0012
ENST00001104700101,345,661–101,349,0012
ENST00000940410101,345,663–101,349,0012
ENST00001104701101,345,669–101,349,0012
ENST00001104703101,346,160–101,348,7422
ENST00001104704101,346,249–101,348,7462

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TIMM8A 是粒線體膜間腔伴護蛋白,參與部分多次跨膜蛋白輸入並嵌入粒線體內膜的過程。它也有助於將 β 桶狀蛋白前驅物從 TOM complex 傳遞至粒線體外膜的 sorting and assembly machinery(SAM complex),因此涉及不同類型粒線體膜蛋白的輸送路徑。

在膜間腔中,TIMM8A 以類伴護蛋白的方式作用,可保護疏水性前驅物,避免其聚集,並引導前驅物通過膜間腔。TIMM8A 與 TIMM13 組成的複合體負責媒介部分蛋白質的輸入,包括 TIMM23、SLC25A12/ARALAR1 與 SLC25A13/ARALAR2。相較之下,主要存在的 TIMM9-TIMM10 70 kDa 複合體負責媒介更多種類蛋白質的輸入。

這些作用使 TIMM8A 參與粒線體蛋白質的定位與膜插入。來源亦指出,TIMM8A 可能是正常神經發育所必需;此處為可能性描述,並未進一步界定其作用機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 101348742 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TIMM8A ENST00000372902 GRCh38 chrX:101348642-101349742 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCACCTCTTCTTTGATTCCCTGGGATAGTGGCTTCTGAGCAAAGGCCAAGAAATTATTGTGCCTGAAATT
TCCCGAGAGAATTAAGACAGACTGAATTTGCGATGAAAATATTTTTTAGGAGGGAGGATGTAAATAGCCG
CACAAAGGGGTCCAACAGCTCTTTGAGTAGGCATTTGGTAGAGCTTGGGGGTGTGTGTGTGGGGGTGGAC
CGAATTTGGCAAGAATGAAATGGTGTCATAAAGATGGGAGGGGAGGGTGTTTTGATAAAATAAAATTACT
AGAAAGCTTGAAAGTCTTTGGTATCTCTATTAATCATGCAGCCTCCCTGAAGCGCCCTATCTCAGTATTC
CAGAAAGCTGCTGTGTAGCATTAGTTTGGCATATTCCTACACTGAGAACTCGACAGGATCCTCCAGGTTT
AAGCCCTCTTGTTAACTCCTGCCTCTGAATCAAAGATGCATTAAGCAAAAACAGTGCCTGTCACAGCACG
CATGCAATGTTATTTGAATGAATCTGAAAGTTGGGCACAAACTGCCATAGCCTCATTTCCCTACGTCGGG
AGAGGAAAACTCCATCAAAAAACGAAAGCCAGGGGCCCAGGATAGCCAACTAATCGACCCAGTCAACTAA
CTGACCCAGTGCACAACTCTGGTAGCTCAGAAAACGCGGGCTAATTTGGAAGTGGACAGGGGCGGAGCTG
TGGGGCCAGCACGGAATGGATCACGTGGTCTGAAGTAACTTCCTTTTCTCCTTTCTTTTCTTTTTGGAGT
AACATCTCAACGGCACCTCGGCTCTGGGCTGTAAGCCCTGCGATCTCAAGGCGCAAGGCTGGGCGCAACG
GCAGGGTTGCGGGGTTACGGGATTGCGGGGTCCGGGGAGTGGAACCCGCCGACTCCGGGAACGAAGCACC
GGCGCCAAGGTGTGGGAGGCGGCGGGGTGGAGTTGGACGCCTGCCTCGCGCCGACGCAGTGCACTCACGG
GGGCGGTCCCAGAGGCAGCTAGCTGTGGTTCCGGTTCCGTCGCGGAGACACGTGAAGGTCGGTGCGGAGT
TCGTCTCTGCAAGCTTGGTCGCCCTGGGATGGATTCCTCCTCCTCTTCCTC
TIMM8A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TIMM8A_1 ↗X:101,348,718負股101,348,708–101,348,767
TIMM8A_2 ↗X:101,349,227負股101,349,217–101,349,276

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_93H85H · promoter · 101348732–101349232 · regulatory

· motif · 101347687–101347702 · motif

· motif · 101347973–101347987 · motif

· motif · 101348001–101348010 · motif

· motif · 101348389–101348406 · motif

· motif · 101348602–101348619 · motif

· motif · 101348707–101348716 · motif

· motif · 101348707–101348716 · motif

· motif · 101348728–101348737 · motif

· motif · 101348962–101348977 · motif

· motif · 101349014–101349023 · motif

· motif · 101349014–101349023 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:97 aa

1 aa97 aa基序
依 O60220 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TIMM8A 蛋白質長 97 個胺基酸,屬於 small Tim 家族。其序列註解包含位於第 43 至 66 個胺基酸的 Twin CX3C motif。

基序Twin CX3C motif43–66 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O60220…

AlphaFold · O60220

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion inner membrane

TIMM8A 位於粒線體內膜的膜間腔側,並以周邊膜蛋白形式定位於膜上。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 13 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DDPTIMM8AARID3ABRK1C1QTNF2CAVIN3CCT5GLE1HTTKRT15OIP5SPRED1STAM2TIMM13WFS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TIMM8A 與 TIMM13 各以三個分子組成異源六聚體,稱為可溶性 70 kDa 複合體。此複合體與 TIM22 complex 有關聯;TIM22 complex 的核心由 TIMM22 組成。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Mohr-Tranebjaerg syndrome(MTS)是 X 連鎖隱性疾病,來源指出其由影響 TIMM8A 基因的變異所致。症狀包括幼年期開始的語言後感音神經性聽力損失,並可能伴隨肌張力不全、痙攣、吞嚥困難、認知退化、偏執及皮質性失明。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TIMM8A 是粒線體膜間腔伴護蛋白,參與部分多次跨膜蛋白輸入及嵌入內膜,也協助 β 桶狀前驅物由 TOM complex 傳至外膜 SAM complex。它可防止疏水性前驅物聚集並引導其通過膜間腔;TIMM8A-TIMM13 複合體媒介 TIMM23、SLC25A12/ARALAR1 和 SLC25A13/ARALAR2 等蛋白質輸入,TIMM9-TIMM10 70 kDa 複合體則媒介更多蛋白質輸入。TIMM8A 可能是正常神經發育所必需。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrial intermembrane chaperone that participates in the import and insertion of some multi-pass transmembrane proteins into the mitochondrial inner membrane. Also required for the transfer of beta-barrel precursors from the TOM complex to the sorting and assembly machinery (SAM complex) of the outer membrane. Acts as a chaperone-like protein that protects the hydrophobic precursors from aggregation and guide them through the mitochondrial intermembrane space. The TIMM8-TIMM13 complex mediates the import of proteins such as TIMM23, SLC25A12/ARALAR1 and SLC25A13/ARALAR2, while the predominant TIMM9-TIMM10 70 kDa complex mediates the import of much more proteins. Probably necessary for normal neurologic development

PMID 11489896 ↗ · PMID 15254020 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TIMM8A 與 TIMM13 各有三個拷貝,組成名為可溶性 70 kDa 複合體的異源六聚體。該複合體與 TIM22 complex 有關聯,而 TIM22 complex 的核心由 TIMM22 組成。資料庫紀錄
證據與來源

Heterohexamer; composed of 3 copies of TIMM8A and 3 copies of TIMM13, named soluble 70 kDa complex. Associates with the TIM22 complex, whose core is composed of TIMM22

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TIMM8A 位於粒線體內膜的膜間腔側,並以周邊膜蛋白形式定位於膜上。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion inner membrane / Peripheral membrane protein / Intermembrane side

PMID 11489896 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Mohr-Tranebjaerg syndrome(MTS)是 X 連鎖隱性疾病,來源指出其由影響 TIMM8A 基因的變異所致。疾病特徵包括幼年期開始的語言後感音神經性聽力損失,以及肌張力不全、痙攣、吞嚥困難、認知退化、偏執和皮質性失明。含實驗來源
證據與來源

Mohr-Tranebjaerg syndrome MTS An X-linked recessive disorder characterized by postlingual sensorineural deafness with onset in early childhood, dystonia, spasticity, dysphagia, mental deterioration, paranoia and cortical blindness. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 304700

PMID 10878669 ↗ · PMID 11803487 ↗ · PMID 11875042 ↗ · PMID 11956200 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000372902 · 1,210 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGCTGTGGTTCCGGTTCCGTCGCGGAGACACGTGAAGGTC40
41GGTGCGGAGTTCGTCTCTGCAAGCTTGGTCGCCCTGGGAT80
81GGATTCCTCCTCCTCTTCCTCCGCGGCGGGTTTGGGTGCA120
121GTGGACCCGCAGTTGCAGCATTTCATCGAGGTAGAGACTC160
161AAAAGCAGCGCTTCCAGCAGCTGGTGCACCAGATGACTGA200
201ACTTTGTTGGGAGAAGTGCATGGACAAGCCTGGGCCAAAG240
241TTGGACAGTCGGGCTGAGGCCTGTTTTGTGAACTGCGTTG280
281AGCGCTTCATTGATACAAGCCAGTTCATCTTGAATCGACT320
321GGAACAGACCCAGAAATCCAAGCCAGTTTTCTCAGAAAGC360
361CTTTCTGACTGATCTCAGCATTACCTCTTTGGAAAAGGAA400
401GGTAGTTCAAGAAATGAAGAGCTGTTGATGGGATGATTGA440
441AGAAACAGCTATGAGAGGATTGGCTCCCATCTTTTGTTAC480
481TCTTGGGACATCCTGTCATCTGAGAATGAACAAAGACCAA520
521TTTTTTGTGTGTGAAGCTTAAGGGTCATATGTTTGCTTGT560
561ATTTTTTAATGCTAATCTTGTGAAAATAATTGACAGGCGA600
601AAGAAAACTCTATTTAGATGCATATTACTGTACATGGGAC640
641TATGCTTTTCTCAAAGCCCCATTAACTGCTTCCTATAATT680
681TTGATAGTGGGACCACATACGTAAAAATCTCTCATTTGTG720
721TGGAGTCATTTCTGATTTCAGGGGAGATCCTTGTGTTTAT760
761CAGAAAGGGCAGAAGTAGGGGAAGAATAATTTGGTATCCT800
801TATCTAGTGTTTGATTGTCAATGCTGGAGAAAAATATCTG840
841TAAGAGTGTTTATACAGTACACTTCAGTTATCTTGATCTC880
881CCTTTCCTATATGATGATTTGCTTAAATATCCATATTAAG920
921TAAGTCTCAAGGTAGGGTAGGCAGCCTGAGAGTCTAGAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。