演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TIMM13Tim13

translocase of inner mitochondrial membrane 13

TIMM13 是粒線體 small Tim 家族的蛋白質,參與特定蛋白質輸入粒線體膜的過程,並協助疏水性前驅蛋白在粒線體膜間腔中移動。

Homo sapiens19p13.3UniProt Q9Y5L4
OFFICIAL SYMBOL
TIMM13
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9Y5L4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TIMM13(translocase of inner mitochondrial membrane 13)是由 TIMM13 基因編碼的蛋白質,屬於 small Tim 家族。它是粒線體膜間腔中的伴護蛋白,參與部分膜蛋白的輸入與粒線體膜上的組裝,也涉及外膜蛋白前驅物的轉移。TIMM13 可與 TIMM8A 或 TIMM8B 組成複合體;相較於主要負責較多蛋白質輸入的 TIMM9-TIMM10 複合體,TIMM8-TIMM13 複合體處理的對象包括 TIMM23、SLC25A12/ARALAR1 與 SLC25A13/ARALAR2。

Official symbol
TIMM13
Gene name
translocase of inner mitochondrial membrane 13
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11816
UniProt
Q9Y5L4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Tim13TIMM13B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25TIMM13pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:2,425,624–2,427,593
Gene span
1,970 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000215570 ★2,425,625–2,427,5863
ENST000010349832,425,624–2,427,5933
ENST000005918712,425,625–2,427,5933
ENST000008535302,425,625–2,427,5933
ENST000008535312,425,625–2,427,5933
ENST000008535332,425,625–2,427,5932
ENST000009390242,425,625–2,427,5933
ENST000009390262,425,625–2,427,5932
ENST000009390282,425,625–2,427,5933
ENST000011355902,425,625–2,427,5933
ENST000008535322,426,559–2,427,5933
ENST000009390252,426,563–2,427,5933

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TIMM13 是粒線體膜間腔中的伴護蛋白,參與部分多次跨膜蛋白輸入並插入粒線體內膜的過程。它也有助於將外膜 β 桶蛋白前驅物由 TOM complex 轉交至 sorting and assembly machinery(SAM complex)。

這些前驅物具疏水性,在穿越粒線體膜間腔時容易聚集。TIMM13 以類似伴護蛋白的方式保護前驅物,協助其維持可轉運狀態並通過膜間腔。來源指出,TIMM8-TIMM13 複合體負責介導 TIMM23、SLC25A12/ARALAR1 和 SLC25A13/ARALAR2 等蛋白質的輸入;相較之下,主要存在的 TIMM9-TIMM10 70 kDa 複合體介導更多種類蛋白質的輸入。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2427586 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TIMM13 ENST00000215570 GRCh38 chr19:2427486-2428586 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTCTGGGGTGCACAGCGCCAGGTTAACGCTGAAGCCTGCCCCGCTGAGCCCAGGAGCCGGGAGGCCTGC
GGGCTGACCCAGAATCCGATCATGCACCTGTCCTCATGCCAGCGGCTTTGGCTGGGGTTGGTCTGAAGCC
TGCACGCGGCAGTTCTTTGTTAAAGATCTGAGGGACTCCTCAGTCCTGGGGCGTCGCCGCCTGCAGCCTC
TTCCAAGCCCTGCGTCCAGCGAGCGTCACAGCACAACCTGCAAAAACGGAGCTGGGCTGCAGCTGGGGCT
GGCATGGACTTTCATTTCAGAGATTCGGTTTTTAAGAAGATGCATGCCTAATGTGTTCTTTTTTTTTTCC
AATGATTTGTAATATACATTTTATGACTGGAAACTTTTTTGTACAACACTCCAATAAACATTTTGATTTT
AGGTTCTGCCTCTGAGTTTATTCCTGAGGGGAAGCTCGAGCCGGGGCCTCTGCCCTAATGAAGCGGATGT
CTAAGAAAGATCCCTCCACCCCCAAGGAAAAAGGTCACTGGCTAGTGTAGCTAGTGTAAACAGGACCCAG
GCGATGCATGGGACCCTGCCCTTTTTTTTCTAGTGAGCCTCCGACGCTGTTGCACAAGCTGACTCTTCGT
CACGTGATGCGACCGGGCTCCGCCCCGGCGGCAACACGCTGTATAGACGCGCCGGGTGCCTCGTGCGCAT
GCGCGGCAGGCCCTTCGGGACGAGCTGGAGGCAGAGCGTGAGTACAAAGTGATCGGCCTCGGCCGCACGT
AGTAGCCCCCCTACTCCCCGGCCAAGTCAGGGCCTCCCTCTTCCCGCGGAGTCGCAACCACGGGTAGCTC
GTGTAGGTAACGGCAGGTCCAGGCCTCCGCATGAGCGGAGGGCCCCCCGCGCGACCTTGAATGGCCCGGG
CGCGCGCGGTCGTGTGGGAGTTGTAGTCCTCCGTCCCCGTCCGCGCGGACTCCGTTTCCCGTGGTGCCCC
GGGCGGCCCGCTTCCGGCGCAGTTAGTTACGAGTCGGCGCACGCGGCCTCGGTCCGGTTGACTTTGCGGA
GCCATGGAGGGCGGCTTCGGCTCCGATTTCGGGGGCTCCGGCAGCGGGAAG
TIMM13 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TIMM13_2 ↗19:2,427,553負股2,427,543–2,427,602
TIMM13_1 ↗19:2,427,888負股2,427,878–2,427,937

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9XZ6 · enhancer · 2423088–2423376 · regulatory

ENSR19_83WXL · enhancer · 2423631–2423818 · regulatory

ENSR19_BH28 · promoter · 2427528–2428076 · regulatory

ENSR19_BH2G · enhancer · 2429077–2429590 · regulatory

· motif · 2425230–2425238 · motif

· motif · 2425892–2425905 · motif

· motif · 2425982–2425994 · motif

· motif · 2425984–2425991 · motif

· motif · 2426422–2426430 · motif

· motif · 2426963–2426980 · motif

· motif · 2427105–2427112 · motif

· motif · 2427141–2427150 · motif

· motif · 2427141–2427150 · motif

· motif · 2427224–2427237 · motif

· motif · 2427296–2427305 · motif

· motif · 2427296–2427307 · motif

· motif · 2427296–2427307 · motif

· motif · 2427409–2427418 · motif

· motif · 2427448–2427461 · motif

· motif · 2427589–2427598 · motif

· motif · 2427766–2427777 · motif

· motif · 2427882–2427893 · motif

· motif · 2427882–2427893 · motif

· motif · 2427949–2427958 · motif

· motif · 2427949–2427958 · motif

· motif · 2428060–2428073 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:95 aa

1 aa95 aa基序
依 Q9Y5L4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TIMM13 蛋白質長 95 個胺基酸,屬於 small Tim 家族。其序列註解包含位於第 46 至 69 個胺基酸的 Twin CX3C motif。

基序Twin CX3C motif46–69 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y5L4…

AlphaFold · Q9Y5L4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion inner membrane

TIMM13 位於粒線體內膜,為周邊膜蛋白,定位於膜間腔側。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Tim13TIMM13TIMM8AUSHBP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TIMM13 與三個 TIMM8 分子(TIMM8A 或 TIMM8B)組成異源六聚體,稱為可溶性 70 kDa 複合體。此複合體與 TIM22 complex 相關;TIM22 complex 的核心由 TIMM22 組成。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TIMM13 是粒線體膜間腔中的伴護蛋白,參與部分多次跨膜蛋白輸入並插入內膜,也協助外膜 β 桶蛋白前驅物由 TOM complex 轉交至 SAM complex。它可保護疏水性前驅物避免聚集並引導其通過膜間腔;TIMM8-TIMM13 複合體介導 TIMM23、SLC25A12/ARALAR1 與 SLC25A13/ARALAR2 等蛋白質輸入,而 TIMM9-TIMM10 70 kDa 複合體介導更多蛋白質輸入。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrial intermembrane chaperone that participates in the import and insertion of some multi-pass transmembrane proteins into the mitochondrial inner membrane. Also required for the transfer of beta-barrel precursors from the TOM complex to the sorting and assembly machinery (SAM complex) of the outer membrane. Acts as a chaperone-like protein that protects the hydrophobic precursors from aggregation and guide them through the mitochondrial intermembrane space. The TIMM8-TIMM13 complex mediates the import of proteins such as TIMM23, SLC25A12/ARALAR1 and SLC25A13/ARALAR2, while the predominant TIMM9-TIMM10 70 kDa complex mediates the import of much more proteins

PMID 11489896 ↗ · PMID 15254020 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TIMM13 與三個 TIMM8 分子(TIMM8A 或 TIMM8B)組成異源六聚體,稱為可溶性 70 kDa 複合體。該複合體與 TIM22 complex 相關,而 TIM22 complex 的核心由 TIMM22 組成。資料庫紀錄
證據與來源

Heterohexamer; composed of 3 copies of TIMM8 (TIMM8A or TIMM8B) and 3 copies of TIMM13, named soluble 70 kDa complex. Associates with the TIM22 complex, whose core is composed of TIMM22

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TIMM13 定位於粒線體內膜,屬於周邊膜蛋白,並位於膜間腔側。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion inner membrane / Peripheral membrane protein / Intermembrane side

PMID 11489896 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000215570 · 1,664 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTTAGTTACGAGTCGGCGCACGCGGCCTCGGTCCGGTTG40
41ACTTTGCGGAGCCATGGAGGGCGGCTTCGGCTCCGATTTC80
81GGGGGCTCCGGCAGCGGGAAGCTGGACCCAGGGCTCATAA120
121TGGAGCAGGTGAAAGTGCAGATCGCCGTGGCCAACGCGCA160
161GGAGCTGCTGCAGAGGATGACGGACAAGTGTTTCCGGAAG200
201TGTATAGGGAAACCTGGGGGCTCCCTGGACAACTCCGAGC240
241AGAAGTGCATCGCCATGTGCATGGACCGCTACATGGACGC280
281CTGGAACACCGTGTCTCGCGCCTACAACTCGCGGCTGCAG320
321CGGGAACGAGCCAACATGTGACCGGCGAGCGCGGGCCACC360
361CCACCCTGTTCATTTCCATAAACGTGCTTTGAGAGGCGGG400
401GTCCGCATGTACGTACTGCCTGCCCGGGGCTTAGGAGGGT440
441GGCACCGGTGCTGGGACACACGGGACTGTGTCCTCGCCAC480
481CCCCCGCCCTGCCCCCTGCCAGCCAGTGCAGCTTGGATCT520
521CGGGGGTGTGGGGCCCTGTGCCTTCCTGAAGTGCTGGCAG560
561CCCAGTGGCACCTCCTTCAGGCCTTTGGGGTATTCCCCTA600
601GTGTGCCCAAGTCAGCCTCATATTCTGGGCGGACAGCTTG640
641TCTGGACTTCGGAGTTGGGGGTGGTCAGACACCACAGGAG680
681CTGTCACCTCCTGCGGATGGGCAAATAAATTGGTGGAGGA720
721CGGAGAGAAACCTCTTTATTTCCCTCCTGAGGGGTCTCTG760
761GGAAGAGGTGACGCGTGTCCCTGGAACCCCAGCTCGGAGG800
801GTCTCAGCCTCCCCTGGGTTGGGAGAAGTCCATCTTTCCC840
841CTTAGTGCCACCGGGCTGCTGAGTCACGAGGAATGTGTTG880
881CTGCTGCCACCCCTGCCCCAAAGGCTAAGGGGGACAGCCT920
921TCCCCTTGTCAGGGCTTGCTTTGACCCTGCTTCGTTCCAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。