基因總覽
TIMM10(translocase of inner mitochondrial membrane 10)是由蛋白質編碼基因產生的粒線體相關蛋白,屬於 small Tim 家族。它是可溶性粒線體膜間腔伴護系統的組成成員,能與 TIMM9 等蛋白形成複合體。TIMM10 的蛋白質長度為 90 個胺基酸,序列中具有 Twin CX3C motif。其主要角色與粒線體膜蛋白質的輸送有關;伴護複合體可在蛋白質抵達粒線體膜系統的途中與其互動。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000257245 ★ | 57,528,464–57,530,754 | 3 |
| ENST00001126096 | 57,524,761–57,530,779 | 3 |
| ENST00000927515 | 57,528,406–57,530,784 | 3 |
| ENST00000927516 | 57,528,453–57,530,779 | 3 |
| ENST00000927523 | 57,528,462–57,530,661 | 3 |
| ENST00000927517 | 57,528,463–57,530,779 | 3 |
| ENST00000927522 | 57,528,463–57,530,662 | 3 |
| ENST00000927525 | 57,528,463–57,530,661 | 3 |
| ENST00001065925 | 57,528,463–57,530,779 | 4 |
| ENST00000927518 | 57,528,464–57,530,779 | 3 |
| ENST00000927519 | 57,528,464–57,530,779 | 3 |
| ENST00000927520 | 57,528,464–57,530,779 | 4 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TIMM10 是粒線體膜間腔中的伴護蛋白,參與多次跨膜蛋白質輸入並插入粒線體內膜的過程。這些前驅蛋白具有疏水性,TIMM10 以類似伴護蛋白的方式保護它們,避免在膜間腔中聚集,並協助引導其通過該區域,朝向內膜輸送與插入。
TIMM10 也可能參與另一類粒線體膜蛋白前驅物的轉運:來源指出,它可能是將 β-barrel 前驅物由 TOM complex 移交至外膜的 sorting and assembly machinery(SAM complex)所需的因子。此作用帶有可能性,來源並未將其表述為確定必要的功能。
因此,TIMM10 的功能涵蓋粒線體膜間腔內的前驅蛋白保護與引導,並與膜蛋白輸送至內膜或外膜裝配系統相關。這些作用有助於前驅蛋白在通過膜間腔時維持不易聚集的狀態,並支援其抵達相應膜系統。
Promoter 與基因調控
>TIMM10 ENST00000257245 GRCh38 chr11:57530654-57531754 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGGACAATTAGGGAAGCTTATGATGACCACACAGAAAATGTCTAGCCCACCTTTTCCAATGGGCAATGT GCCCTTGCGTCATTAATTTACATCTTGTAAATTTATTTTACCAGGAAATTGTGTGACAAATCAAGGGACT GAGTATTGTTTCCTTGTTTCCTTCTTTTTAGTGGGGAATGAGTGAATGGTGCAGTTTGAAGAACACATTA AGTCTTGAAAGTTGGAAAGTTCACCAGTACCCTTCTTTCCCTCACCCAAGATTAGCCCTGGTGGCAGCCG AAATTGCTTTTATTATCTCTTTGTGGCTGAGGACCTCTAACTGTTGAAGAAAACATATTTTACACGTCTT GTCTTTCTGCGAACAGGAAGCCTATCTCGCTTATCTTTGCAACCCCAGACGGGGCTTAGTGTGACCTACA CACAGCAGTAATCGCACAACGTCCCGTGGAGCACTGCTTCTCAAATTTGGCTGTACATACGAATCACCTG GGGAATTTTAAATTGTATTGCTGCCTGAGGAATTTTAAACTGTACTCCCAGAGATTCTGATTTAATTGAA ATGAGGTGAGTCCTGGGCACTGGGATGTTTAAAAACGTTCCAGGTGATTTTAACGCGAAACAAAAACAGA ACCGCTGTTTGGGGGCGTTCTTCCTTCTCCACGCCTGATTTGCGCACAGGAGTCGGCTGTCTGGAACGGG GGTGAGGTTCACAGGTGTCTGTCGCCACGCCTCTTCCTACAGAACCAATAAACTGAAGCCGCTCGGTGAC ATCCCAAAGGACTTGAATTCTGATCGGGCTGCAGACGCTCTGCACCCCGCCCAAGCTTCTATGGTACTTT GGTGTCCTCTCTAGCACTGGCAAGTCGCCTTCCTCTTCGCCCGGCGCCAGCCGCTCCCTCTCTATGATCG CCGAGTTCCCGGCGCCGTCTCGTTGGTATTTAATTCCGGAAGCGAGTTTGAATCAAAGAAGAGGCGGGAC TTTCCTCCCGGAAGTAACCCACGTGCTTCCGCTGGAGCCTCTCGGGAGGCGGGTAACGTTATAGTATTTG TCAGAAGTTGGGGTCTCCGTGGGCATTGTGATCCGTCCCAGGCAGTGGTAA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TIMM10_1 ↗ | 11:57,530,750 | 負股 | 57,530,740–57,530,799 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_5HJBXK · CTCF_binding_site · 57526528–57526549 · regulatory
ENSR11_BFF8S · enhancer · 57526989–57527641 · regulatory
ENSR11_5HJC49 · CTCF_binding_site · 57527331–57527352 · regulatory
ENSR11_5HJC96 · CTCF_binding_site · 57528389–57528410 · regulatory
ENSR11_BFF98 · enhancer · 57529849–57530723 · regulatory
ENSR11_BFF9C · promoter · 57530724–57531293 · regulatory
· motif · 57526530–57526546 · motif
· motif · 57527275–57527288 · motif
· motif · 57527333–57527349 · motif
· motif · 57527447–57527458 · motif
· motif · 57528391–57528407 · motif
· motif · 57530334–57530349 · motif
· motif · 57530646–57530661 · motif
· motif · 57530680–57530697 · motif
· motif · 57530720–57530730 · motif
· motif · 57530742–57530751 · motif
· motif · 57530748–57530757 · motif
· motif · 57530759–57530768 · motif
· motif · 57530759–57530770 · motif
· motif · 57530759–57530770 · motif
· motif · 57530801–57530810 · motif
· motif · 57530801–57530812 · motif
· motif · 57530931–57530941 · motif
· motif · 57530972–57530985 · motif
· motif · 57530972–57530985 · motif
· motif · 57531021–57531031 · motif
· motif · 57531082–57531098 · motif
· motif · 57531259–57531272 · motif
· motif · 57531259–57531272 · motif
· motif · 57531369–57531375 · motif
· motif · 57532273–57532282 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:90 aa
TIMM10 長 90 個胺基酸,屬於 small Tim 家族。其序列註解包含位於第 29 至 54 個胺基酸的 Twin CX3C motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TIMM10 位於粒線體內膜的膜間腔側,並以周邊膜蛋白形式定位;來源未提供定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- SIK1P57059 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBC1D21Q8IYX1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TIMM9Q9Y5J7 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- ZNF655Q8N720 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TIMM10 與 3 個 TIMM9 分子及另外 2 個 TIMM10/TIM10A 分子組成異源六聚體,稱為可溶性 70 kDa 複合體,形成六葉 α-propeller 結構。此複合體與 TIM22 complex 的 TIMM22 組件相關聯,也會與輸送途中的多次跨膜蛋白質互動。TIMM10 另可與 TIMM9 及 FXC1/TIM10B 形成複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TIMM10 是粒線體膜間腔伴護蛋白,參與多次跨膜蛋白質輸入並插入粒線體內膜。它可保護疏水性前驅物免於聚集,並協助其通過膜間腔;此外,來源指出它可能是將 β-barrel 前驅物由 TOM complex 轉交至外膜 SAM complex 所需的因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrial intermembrane chaperone that participates in the import and insertion of multi-pass transmembrane proteins into the mitochondrial inner membrane. May also be required for the transfer of beta-barrel precursors from the TOM complex to the sorting and assembly machinery (SAM complex) of the outer membrane. Acts as a chaperone-like protein that protects the hydrophobic precursors from aggregation and guide them through the mitochondrial intermembrane space PMID 14726512 ↗ |
| 交互作用 | TIMM10 與 TIMM9 組成異源六聚體:包含 3 個 TIMM9 和 3 個 TIMM10/TIM10A,稱為可溶性 70 kDa 複合體,並形成六葉 α-propeller 結構。此複合體與 TIM22 complex 的 TIMM22 組件相關聯,也會與輸送途中的多次跨膜蛋白質互動;TIMM10 另可與 TIMM9 及 FXC1/TIM10B 形成複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterohexamer; composed of 3 copies of TIMM9 and 3 copies of TIMM10/TIM10A, named soluble 70 kDa complex. The complex forms a 6-bladed alpha-propeller structure and associates with the TIMM22 component of the TIM22 complex. Interacts with multi-pass transmembrane proteins in transit. Also forms a complex composed of TIMM9, TIMM10/TIM10A and FXC1/TIM10B PMID 14726512 ↗ · PMID 16387659 ↗ |
| 細胞定位 | TIMM10 定位於粒線體內膜的膜間腔側,屬於周邊膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrion inner membrane / Peripheral membrane protein / Intermembrane side PMID 11489896 ↗ · PMID 14726512 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACGTGCTTCCGCTGGAGCCTCTCGGGAGGCGGGTAACGTT40ATAGTATTTGTCAGAAGTTGGGGTCTCCGTGGGCATTGTG80ATCCGTCCCAGGCAGTGGATTAGGAGGCCAGAAGGAGATC120CCTTCCACGGTGCTAGGCTGAGATGGATCCTCTCAGGGCC160CAACAGCTGGCTGCGGAGCTGGAGGTGGAGATGATGGCCG200ATATGTACAACAGAATGACCAGTGCCTGCCACCGGAAGTG240TGTGCCTCCTCACTACAAGGAAGCAGAGCTCTCCAAGGGC280GAGTCTGTGTGCCTGGACCGATGTGTCTCTAAGTACCTGG320ACATCCATGAGCGGATGGGCAAAAAGTTGACAGAGTTGTC360TATGCAGGATGAAGAGCTGATGAAGAGGGTGCAGCAGAGC400TCTGGGCCTGCATGAGGTCCCTGTCAGTATACACCCTGGG440GTGTACCCCACCCCTTCCCACTTTAATAAACGTGCTCCCT480GTTGGGTGTCATCTGTGAAGACTGCCAGGCCTAGGCTCTC520TGTAGAGAGTCTTCAAGATCCCGGAGTGGTAGCGCTGTCT560CCTGGTGAAGGAGTATTTGTCACACTGGAATGTGACTGTG600TGTGTATGTATGTGTATATATATATATATATATATATATA640TATATATAAACAAGTTTGTTGACACCTA668cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。