演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TIMM10TIM10

translocase of inner mitochondrial membrane 10

TIMM10 是 small Tim 家族的粒線體膜間腔伴護蛋白,參與多次跨膜蛋白質的粒線體內膜輸入與插入。

Homo sapiens11q12.1UniProt P62072
OFFICIAL SYMBOL
TIMM10
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P62072
PDB / ALPHAFOLD
2BSK
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TIMM10(translocase of inner mitochondrial membrane 10)是由蛋白質編碼基因產生的粒線體相關蛋白,屬於 small Tim 家族。它是可溶性粒線體膜間腔伴護系統的組成成員,能與 TIMM9 等蛋白形成複合體。TIMM10 的蛋白質長度為 90 個胺基酸,序列中具有 Twin CX3C motif。其主要角色與粒線體膜蛋白質的輸送有關;伴護複合體可在蛋白質抵達粒線體膜系統的途中與其互動。

Official symbol
TIMM10
Gene name
translocase of inner mitochondrial membrane 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11814
UniProt
P62072
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TIM10TIM10ATIMM10A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q12.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegTIMM10pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:57,524,761–57,531,031
Gene span
6,271 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000257245 ★57,528,464–57,530,7543
ENST0000112609657,524,761–57,530,7793
ENST0000092751557,528,406–57,530,7843
ENST0000092751657,528,453–57,530,7793
ENST0000092752357,528,462–57,530,6613
ENST0000092751757,528,463–57,530,7793
ENST0000092752257,528,463–57,530,6623
ENST0000092752557,528,463–57,530,6613
ENST0000106592557,528,463–57,530,7794
ENST0000092751857,528,464–57,530,7793
ENST0000092751957,528,464–57,530,7793
ENST0000092752057,528,464–57,530,7794

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TIMM10 是粒線體膜間腔中的伴護蛋白,參與多次跨膜蛋白質輸入並插入粒線體內膜的過程。這些前驅蛋白具有疏水性,TIMM10 以類似伴護蛋白的方式保護它們,避免在膜間腔中聚集,並協助引導其通過該區域,朝向內膜輸送與插入。

TIMM10 也可能參與另一類粒線體膜蛋白前驅物的轉運:來源指出,它可能是將 β-barrel 前驅物由 TOM complex 移交至外膜的 sorting and assembly machinery(SAM complex)所需的因子。此作用帶有可能性,來源並未將其表述為確定必要的功能。

因此,TIMM10 的功能涵蓋粒線體膜間腔內的前驅蛋白保護與引導,並與膜蛋白輸送至內膜或外膜裝配系統相關。這些作用有助於前驅蛋白在通過膜間腔時維持不易聚集的狀態,並支援其抵達相應膜系統。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57530754 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TIMM10 ENST00000257245 GRCh38 chr11:57530654-57531754 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTGGACAATTAGGGAAGCTTATGATGACCACACAGAAAATGTCTAGCCCACCTTTTCCAATGGGCAATGT
GCCCTTGCGTCATTAATTTACATCTTGTAAATTTATTTTACCAGGAAATTGTGTGACAAATCAAGGGACT
GAGTATTGTTTCCTTGTTTCCTTCTTTTTAGTGGGGAATGAGTGAATGGTGCAGTTTGAAGAACACATTA
AGTCTTGAAAGTTGGAAAGTTCACCAGTACCCTTCTTTCCCTCACCCAAGATTAGCCCTGGTGGCAGCCG
AAATTGCTTTTATTATCTCTTTGTGGCTGAGGACCTCTAACTGTTGAAGAAAACATATTTTACACGTCTT
GTCTTTCTGCGAACAGGAAGCCTATCTCGCTTATCTTTGCAACCCCAGACGGGGCTTAGTGTGACCTACA
CACAGCAGTAATCGCACAACGTCCCGTGGAGCACTGCTTCTCAAATTTGGCTGTACATACGAATCACCTG
GGGAATTTTAAATTGTATTGCTGCCTGAGGAATTTTAAACTGTACTCCCAGAGATTCTGATTTAATTGAA
ATGAGGTGAGTCCTGGGCACTGGGATGTTTAAAAACGTTCCAGGTGATTTTAACGCGAAACAAAAACAGA
ACCGCTGTTTGGGGGCGTTCTTCCTTCTCCACGCCTGATTTGCGCACAGGAGTCGGCTGTCTGGAACGGG
GGTGAGGTTCACAGGTGTCTGTCGCCACGCCTCTTCCTACAGAACCAATAAACTGAAGCCGCTCGGTGAC
ATCCCAAAGGACTTGAATTCTGATCGGGCTGCAGACGCTCTGCACCCCGCCCAAGCTTCTATGGTACTTT
GGTGTCCTCTCTAGCACTGGCAAGTCGCCTTCCTCTTCGCCCGGCGCCAGCCGCTCCCTCTCTATGATCG
CCGAGTTCCCGGCGCCGTCTCGTTGGTATTTAATTCCGGAAGCGAGTTTGAATCAAAGAAGAGGCGGGAC
TTTCCTCCCGGAAGTAACCCACGTGCTTCCGCTGGAGCCTCTCGGGAGGCGGGTAACGTTATAGTATTTG
TCAGAAGTTGGGGTCTCCGTGGGCATTGTGATCCGTCCCAGGCAGTGGTAA
TIMM10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TIMM10_1 ↗11:57,530,750負股57,530,740–57,530,799

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_5HJBXK · CTCF_binding_site · 57526528–57526549 · regulatory

ENSR11_BFF8S · enhancer · 57526989–57527641 · regulatory

ENSR11_5HJC49 · CTCF_binding_site · 57527331–57527352 · regulatory

ENSR11_5HJC96 · CTCF_binding_site · 57528389–57528410 · regulatory

ENSR11_BFF98 · enhancer · 57529849–57530723 · regulatory

ENSR11_BFF9C · promoter · 57530724–57531293 · regulatory

· motif · 57526530–57526546 · motif

· motif · 57527275–57527288 · motif

· motif · 57527333–57527349 · motif

· motif · 57527447–57527458 · motif

· motif · 57528391–57528407 · motif

· motif · 57530334–57530349 · motif

· motif · 57530646–57530661 · motif

· motif · 57530680–57530697 · motif

· motif · 57530720–57530730 · motif

· motif · 57530742–57530751 · motif

· motif · 57530748–57530757 · motif

· motif · 57530759–57530768 · motif

· motif · 57530759–57530770 · motif

· motif · 57530759–57530770 · motif

· motif · 57530801–57530810 · motif

· motif · 57530801–57530812 · motif

· motif · 57530931–57530941 · motif

· motif · 57530972–57530985 · motif

· motif · 57530972–57530985 · motif

· motif · 57531021–57531031 · motif

· motif · 57531082–57531098 · motif

· motif · 57531259–57531272 · motif

· motif · 57531259–57531272 · motif

· motif · 57531369–57531375 · motif

· motif · 57532273–57532282 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:90 aa

1 aa90 aa基序
依 P62072 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TIMM10 長 90 個胺基酸,屬於 small Tim 家族。其序列註解包含位於第 29 至 54 個胺基酸的 Twin CX3C motif。

基序Twin CX3C motif29–54 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2BSK…

PDB · 2BSK

X-ray · 3.30 A · B/D/F=1-90

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion inner membrane

TIMM10 位於粒線體內膜的膜間腔側,並以周邊膜蛋白形式定位;來源未提供定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TIM10TIMM10SIK1TBC1D21TIMM9ZNF655
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TIMM10 與 3 個 TIMM9 分子及另外 2 個 TIMM10/TIM10A 分子組成異源六聚體,稱為可溶性 70 kDa 複合體,形成六葉 α-propeller 結構。此複合體與 TIM22 complex 的 TIMM22 組件相關聯,也會與輸送途中的多次跨膜蛋白質互動。TIMM10 另可與 TIMM9 及 FXC1/TIM10B 形成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TIMM10 是粒線體膜間腔伴護蛋白,參與多次跨膜蛋白質輸入並插入粒線體內膜。它可保護疏水性前驅物免於聚集,並協助其通過膜間腔;此外,來源指出它可能是將 β-barrel 前驅物由 TOM complex 轉交至外膜 SAM complex 所需的因子。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrial intermembrane chaperone that participates in the import and insertion of multi-pass transmembrane proteins into the mitochondrial inner membrane. May also be required for the transfer of beta-barrel precursors from the TOM complex to the sorting and assembly machinery (SAM complex) of the outer membrane. Acts as a chaperone-like protein that protects the hydrophobic precursors from aggregation and guide them through the mitochondrial intermembrane space

PMID 14726512 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TIMM10 與 TIMM9 組成異源六聚體:包含 3 個 TIMM9 和 3 個 TIMM10/TIM10A,稱為可溶性 70 kDa 複合體,並形成六葉 α-propeller 結構。此複合體與 TIM22 complex 的 TIMM22 組件相關聯,也會與輸送途中的多次跨膜蛋白質互動;TIMM10 另可與 TIMM9 及 FXC1/TIM10B 形成複合體。含實驗來源
證據與來源

Heterohexamer; composed of 3 copies of TIMM9 and 3 copies of TIMM10/TIM10A, named soluble 70 kDa complex. The complex forms a 6-bladed alpha-propeller structure and associates with the TIMM22 component of the TIM22 complex. Interacts with multi-pass transmembrane proteins in transit. Also forms a complex composed of TIMM9, TIMM10/TIM10A and FXC1/TIM10B

PMID 14726512 ↗ · PMID 16387659 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TIMM10 定位於粒線體內膜的膜間腔側,屬於周邊膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion inner membrane / Peripheral membrane protein / Intermembrane side

PMID 11489896 ↗ · PMID 14726512 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000257245 · 668 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACGTGCTTCCGCTGGAGCCTCTCGGGAGGCGGGTAACGTT40
41ATAGTATTTGTCAGAAGTTGGGGTCTCCGTGGGCATTGTG80
81ATCCGTCCCAGGCAGTGGATTAGGAGGCCAGAAGGAGATC120
121CCTTCCACGGTGCTAGGCTGAGATGGATCCTCTCAGGGCC160
161CAACAGCTGGCTGCGGAGCTGGAGGTGGAGATGATGGCCG200
201ATATGTACAACAGAATGACCAGTGCCTGCCACCGGAAGTG240
241TGTGCCTCCTCACTACAAGGAAGCAGAGCTCTCCAAGGGC280
281GAGTCTGTGTGCCTGGACCGATGTGTCTCTAAGTACCTGG320
321ACATCCATGAGCGGATGGGCAAAAAGTTGACAGAGTTGTC360
361TATGCAGGATGAAGAGCTGATGAAGAGGGTGCAGCAGAGC400
401TCTGGGCCTGCATGAGGTCCCTGTCAGTATACACCCTGGG440
441GTGTACCCCACCCCTTCCCACTTTAATAAACGTGCTCCCT480
481GTTGGGTGTCATCTGTGAAGACTGCCAGGCCTAGGCTCTC520
521TGTAGAGAGTCTTCAAGATCCCGGAGTGGTAGCGCTGTCT560
561CCTGGTGAAGGAGTATTTGTCACACTGGAATGTGACTGTG600
601TGTGTATGTATGTGTATATATATATATATATATATATATA640
641TATATATAAACAAGTTTGTTGACACCTA668

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。