演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

THY1CD90

Thy-1 cell surface antigen

THY1 編碼 Thy-1 cell surface antigen,一種以 GPI-anchor 連接細胞膜的蛋白質;它可能參與突觸形成期間及腦部其他過程中的細胞間或細胞與配體互動。

Homo sapiens11q23.3UniProt P04216
OFFICIAL SYMBOL
THY1
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P04216
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

THY1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 Thy-1 cell surface antigen,產物也稱 Thy-1 membrane glycoprotein、CDw90 或 Thy-1 antigen。其產物屬於細胞表面蛋白質,具有免疫球蛋白樣 V 型結構域,並以 GPI-anchor 連接細胞膜。這些性質構成辨識 THY1 產物的基本特徵;來源指出它可能參與腦部的細胞間或細胞與配體互動,相關作用仍以可能性表述。

Official symbol
THY1
Gene name
Thy-1 cell surface antigen
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11801
UniProt
P04216
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CD90

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q23.3
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegTHY1pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:119,415,476–119,424,985
Gene span
9,510 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000284240 ★119,415,476–119,423,1724
ENST00001139298119,415,476–119,423,9204
ENST00000918468119,416,474–119,423,9205
ENST00000918469119,417,930–119,423,9204
ENST00000918470119,417,941–119,423,9203
ENST00000918471119,417,945–119,423,9205
ENST00000956364119,417,949–119,423,1994
ENST00001097932119,418,176–119,423,9204
ENST00000900758119,418,177–119,423,9204
ENST00000918472119,418,177–119,423,9205
ENST00000918473119,418,177–119,423,9205
ENST00000918474119,418,177–119,423,1195

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

THY1 產物可能參與細胞間互動,也可能介入細胞與配體之間的互動。來源將這些可能作用連結至突觸形成期間,以及腦部的其他生物學事件;不過,現有資訊並未指出是哪一種細胞、配體或分子機制參與其中,因此不宜進一步推定具體互作對象或作用方式。

在突觸形成的脈絡下,THY1 可能透過促進或參與細胞表面之間的接觸,或細胞與配體的互動,與突觸形成相關。這項描述僅表示其可能具有參與角色,並未說明 THY1 是否直接促成突觸形成、作用於哪一階段,或對過程造成何種方向與程度的影響。

來源也將可能的作用範圍延伸至腦部其他事件,但沒有列出這些事件的種類或條件。因此,目前可支持的功能概述限於 THY1 可能涉及腦部的細胞間或細胞與配體互動,並可能與突觸形成及其他腦部過程相關;更具體的生物學意義與分子作用方式,這些資料並未提供。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 119423172 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>THY1 ENST00000284240 GRCh38 chr11:119423072-119424172 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGCTGTCTCCTCCTCTTTCCCAGAGTTCCTCTCTCTCTTCTCCCACTAGGCAGGGATGAGCAAGAGGAAT
GGCTCACCCTTGAGAGCTGGGGTCCATAGCCCAGGTCAGTTCTCCAGCTCTCCCACTTACCAGCCAAGAC
AGGAGGTGAGGATTGAGATGGGATGAACCCAGCAGGCGGCCATGGGTTAAAGGTCGCCATGAATGTAATG
TGCCCAGCACAGTGCCTGCTAAAAGGCAACACTCCCTTCCTGGTCTGAAGACCAAACAAGCAGACTGTAC
TCAGGAAAGCCAGAAGAACCTTCCAGCTGTCTGGACCAGAAGGTGCCAGCCCAGGGGCTGAAGAAGACGT
AATGCCCAGAGCAAAAAGCGCCTGCAGCCCCCTGAAGGGCTGGGTGCTCTGGAATAGATGAGGGGGCGAA
ATGGGGCTGGGGACCAGGGACGGACAGGGTGGGTCCAGCACCTGCCTCGCTTCCGAAGGGCTGCTCCAAC
ACTGAAAAACACCCAACCAGCTTCCTTTCAGAAAGACTGGAATATTCCAAAACTTCTCACTGGAGGCTCC
GGAGGAGGTGGGCTCCAGCTGAAAAGGAAATGTGGAGGCGTGGGCGCTCCCGGCCTGCATCCTGCACCTC
TTACACTTTGGTTTTCCCACAGACTCCTGAAGAATAGGTCAGAAGAAAGGGTTAAAGCCTTAAAAGGGGA
ACAACCATTGCGGGGCTCAGGGAGGAGGATAATGTTCTTTGGGCTGCCGCACCCTGATCCCCGGGGTCCC
GAACCCTCCCGTCCCTGGCCAGGCCTGCCAGCCACAGGGTGAGGGCCCCCTTCCGCCGCAACCTGCCACT
CTCACACCAATGCGGGACCGCCTTCTCTTCCTTCCCCACCCCCCACCCCACCCTGCCGTCCTTTCTCCCC
CAATCTCCGCCTCTGATTGGCTGAGCCCCCGGCTCCCCGCTCCCCCTCTCCTCCATCCCCGGTGAAAACT
GCGGGCTCCGAGCTGGGTGCAGCAACCGGAGGCGGCGGCGCGTCTGGAGGAGGCTGCAGCAGCGGAAGAC
CCCAGTCCAGGTGGGAACTGGAGCCGGTGGGACCTGGGGCTCGGGGACCGC
THY1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
THY1_1 ↗11:119,423,533負股119,423,523–119,423,582

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:161 aa

1 aa161 aa結構域訊號胜肽
依 P04216 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Thy-1 cell surface antigen 長 161 個胺基酸。序列第 1–19 位為訊號序列,第 20–126 位註解為 Ig-like V-type 結構域;現有特徵資料未提供其他區域的描述。

訊號胜肽1–19 aa
結構域Ig-like V-type20–126 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P04216…

AlphaFold · P04216

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

Thy-1 cell surface antigen 位於細胞膜,並以 lipid-anchor/GPI-anchor 錨定。 此資料描述的是 THY1 蛋白本身的膜定位,未提供定位改變條件、異構型差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CD90THY1APP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能THY1 可能參與腦部突觸形成期間及其他腦部事件中的細胞間互動,或細胞與配體之間的互動;來源以可能性描述,未指出具體互作對象或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May play a role in cell-cell or cell-ligand interactions during synaptogenesis and other events in the brain

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位THY1 蛋白位於細胞膜,並以 lipid-anchor/GPI-anchor 錨定;資料未描述定位改變條件或其他定位差異。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000284240 · 4,502 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCAACCGGAGGCGGCGGCGCGTCTGGAGGAGGCTGCAGC40
41AGCGGAAGACCCCAGTCCAGATCCAGGACTGAGATCCCAG80
81AACCATGAACCTGGCCATCAGCATCGCTCTCCTGCTAACA120
121GTCTTGCAGGTCTCCCGAGGGCAGAAGGTGACCAGCCTAA160
161CGGCCTGCCTAGTGGACCAGAGCCTTCGTCTGGACTGCCG200
201CCATGAGAATACCAGCAGTTCACCCATCCAGTACGAGTTC240
241AGCCTGACCCGTGAGACAAAGAAGCACGTGCTCTTTGGCA280
281CTGTGGGGGTGCCTGAGCACACATACCGCTCCCGAACCAA320
321CTTCACCAGCAAATACAACATGAAGGTCCTCTACTTATCC360
361GCCTTCACTAGCAAGGACGAGGGCACCTACACGTGTGCAC400
401TCCACCACTCTGGCCATTCCCCACCCATCTCCTCCCAGAA440
441CGTCACAGTGCTCAGAGACAAACTGGTCAAGTGTGAGGGC480
481ATCAGCCTGCTGGCTCAGAACACCTCGTGGCTGCTGCTGC520
521TCCTGCTCTCCCTCTCCCTCCTCCAGGCCACGGATTTCAT560
561GTCCCTGTGACTGGTGGGGCCCATGGAGGAGACAGGAAGC600
601CTCAAGTTCCAGTGCAGAGATCCTACTTCTCTGAGTCAGC640
641TGACCCCCTCCCCCCAATCCCTCAAACCTTGAGGAGAAGT680
681GGGGACCCCACCCCTCATCAGGAGTTCCAGTGCTGCATGC720
721GATTATCTACCCACGTCCACGCGGCCACCTCACCCTCTCC760
761GCACACCTCTGGCTGTCTTTTTGTACTTTTTGTTCCAGAG800
801CTGCTTCTGTCTGGTTTATTTAGGTTTTATCCTTCCTTTT840
841CTTTGAGAGTTCGTGAAGAGGGAAGCCAGGATTGGGGACC880
881TGATGGAGAGTGAGAGCATGTGAGGGGTAGTGGGATGGTG920
921GGGTACCAGCCACTGGAGGGGTCATCCTTGCCCATCGGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。