基因總覽
THY1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 Thy-1 cell surface antigen,產物也稱 Thy-1 membrane glycoprotein、CDw90 或 Thy-1 antigen。其產物屬於細胞表面蛋白質,具有免疫球蛋白樣 V 型結構域,並以 GPI-anchor 連接細胞膜。這些性質構成辨識 THY1 產物的基本特徵;來源指出它可能參與腦部的細胞間或細胞與配體互動,相關作用仍以可能性表述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000284240 ★ | 119,415,476–119,423,172 | 4 |
| ENST00001139298 | 119,415,476–119,423,920 | 4 |
| ENST00000918468 | 119,416,474–119,423,920 | 5 |
| ENST00000918469 | 119,417,930–119,423,920 | 4 |
| ENST00000918470 | 119,417,941–119,423,920 | 3 |
| ENST00000918471 | 119,417,945–119,423,920 | 5 |
| ENST00000956364 | 119,417,949–119,423,199 | 4 |
| ENST00001097932 | 119,418,176–119,423,920 | 4 |
| ENST00000900758 | 119,418,177–119,423,920 | 4 |
| ENST00000918472 | 119,418,177–119,423,920 | 5 |
| ENST00000918473 | 119,418,177–119,423,920 | 5 |
| ENST00000918474 | 119,418,177–119,423,119 | 5 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
THY1 產物可能參與細胞間互動,也可能介入細胞與配體之間的互動。來源將這些可能作用連結至突觸形成期間,以及腦部的其他生物學事件;不過,現有資訊並未指出是哪一種細胞、配體或分子機制參與其中,因此不宜進一步推定具體互作對象或作用方式。
在突觸形成的脈絡下,THY1 可能透過促進或參與細胞表面之間的接觸,或細胞與配體的互動,與突觸形成相關。這項描述僅表示其可能具有參與角色,並未說明 THY1 是否直接促成突觸形成、作用於哪一階段,或對過程造成何種方向與程度的影響。
來源也將可能的作用範圍延伸至腦部其他事件,但沒有列出這些事件的種類或條件。因此,目前可支持的功能概述限於 THY1 可能涉及腦部的細胞間或細胞與配體互動,並可能與突觸形成及其他腦部過程相關;更具體的生物學意義與分子作用方式,這些資料並未提供。
Promoter 與基因調控
>THY1 ENST00000284240 GRCh38 chr11:119423072-119424172 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGCTGTCTCCTCCTCTTTCCCAGAGTTCCTCTCTCTCTTCTCCCACTAGGCAGGGATGAGCAAGAGGAAT GGCTCACCCTTGAGAGCTGGGGTCCATAGCCCAGGTCAGTTCTCCAGCTCTCCCACTTACCAGCCAAGAC AGGAGGTGAGGATTGAGATGGGATGAACCCAGCAGGCGGCCATGGGTTAAAGGTCGCCATGAATGTAATG TGCCCAGCACAGTGCCTGCTAAAAGGCAACACTCCCTTCCTGGTCTGAAGACCAAACAAGCAGACTGTAC TCAGGAAAGCCAGAAGAACCTTCCAGCTGTCTGGACCAGAAGGTGCCAGCCCAGGGGCTGAAGAAGACGT AATGCCCAGAGCAAAAAGCGCCTGCAGCCCCCTGAAGGGCTGGGTGCTCTGGAATAGATGAGGGGGCGAA ATGGGGCTGGGGACCAGGGACGGACAGGGTGGGTCCAGCACCTGCCTCGCTTCCGAAGGGCTGCTCCAAC ACTGAAAAACACCCAACCAGCTTCCTTTCAGAAAGACTGGAATATTCCAAAACTTCTCACTGGAGGCTCC GGAGGAGGTGGGCTCCAGCTGAAAAGGAAATGTGGAGGCGTGGGCGCTCCCGGCCTGCATCCTGCACCTC TTACACTTTGGTTTTCCCACAGACTCCTGAAGAATAGGTCAGAAGAAAGGGTTAAAGCCTTAAAAGGGGA ACAACCATTGCGGGGCTCAGGGAGGAGGATAATGTTCTTTGGGCTGCCGCACCCTGATCCCCGGGGTCCC GAACCCTCCCGTCCCTGGCCAGGCCTGCCAGCCACAGGGTGAGGGCCCCCTTCCGCCGCAACCTGCCACT CTCACACCAATGCGGGACCGCCTTCTCTTCCTTCCCCACCCCCCACCCCACCCTGCCGTCCTTTCTCCCC CAATCTCCGCCTCTGATTGGCTGAGCCCCCGGCTCCCCGCTCCCCCTCTCCTCCATCCCCGGTGAAAACT GCGGGCTCCGAGCTGGGTGCAGCAACCGGAGGCGGCGGCGCGTCTGGAGGAGGCTGCAGCAGCGGAAGAC CCCAGTCCAGGTGGGAACTGGAGCCGGTGGGACCTGGGGCTCGGGGACCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| THY1_1 ↗ | 11:119,423,533 | 負股 | 119,423,523–119,423,582 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:161 aa
Thy-1 cell surface antigen 長 161 個胺基酸。序列第 1–19 位為訊號序列,第 20–126 位註解為 Ig-like V-type 結構域;現有特徵資料未提供其他區域的描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Thy-1 cell surface antigen 位於細胞膜,並以 lipid-anchor/GPI-anchor 錨定。 此資料描述的是 THY1 蛋白本身的膜定位,未提供定位改變條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | THY1 可能參與腦部突觸形成期間及其他腦部事件中的細胞間互動,或細胞與配體之間的互動;來源以可能性描述,未指出具體互作對象或作用機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May play a role in cell-cell or cell-ligand interactions during synaptogenesis and other events in the brain |
| 細胞定位 | THY1 蛋白位於細胞膜,並以 lipid-anchor/GPI-anchor 錨定;資料未描述定位改變條件或其他定位差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCAACCGGAGGCGGCGGCGCGTCTGGAGGAGGCTGCAGC40AGCGGAAGACCCCAGTCCAGATCCAGGACTGAGATCCCAG80AACCATGAACCTGGCCATCAGCATCGCTCTCCTGCTAACA120GTCTTGCAGGTCTCCCGAGGGCAGAAGGTGACCAGCCTAA160CGGCCTGCCTAGTGGACCAGAGCCTTCGTCTGGACTGCCG200CCATGAGAATACCAGCAGTTCACCCATCCAGTACGAGTTC240AGCCTGACCCGTGAGACAAAGAAGCACGTGCTCTTTGGCA280CTGTGGGGGTGCCTGAGCACACATACCGCTCCCGAACCAA320CTTCACCAGCAAATACAACATGAAGGTCCTCTACTTATCC360GCCTTCACTAGCAAGGACGAGGGCACCTACACGTGTGCAC400TCCACCACTCTGGCCATTCCCCACCCATCTCCTCCCAGAA440CGTCACAGTGCTCAGAGACAAACTGGTCAAGTGTGAGGGC480ATCAGCCTGCTGGCTCAGAACACCTCGTGGCTGCTGCTGC520TCCTGCTCTCCCTCTCCCTCCTCCAGGCCACGGATTTCAT560GTCCCTGTGACTGGTGGGGCCCATGGAGGAGACAGGAAGC600CTCAAGTTCCAGTGCAGAGATCCTACTTCTCTGAGTCAGC640TGACCCCCTCCCCCCAATCCCTCAAACCTTGAGGAGAAGT680GGGGACCCCACCCCTCATCAGGAGTTCCAGTGCTGCATGC720GATTATCTACCCACGTCCACGCGGCCACCTCACCCTCTCC760GCACACCTCTGGCTGTCTTTTTGTACTTTTTGTTCCAGAG800CTGCTTCTGTCTGGTTTATTTAGGTTTTATCCTTCCTTTT840CTTTGAGAGTTCGTGAAGAGGGAAGCCAGGATTGGGGACC880TGATGGAGAGTGAGAGCATGTGAGGGGTAGTGGGATGGTG920GGGTACCAGCCACTGGAGGGGTCATCCTTGCCCATCGGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。