演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

THRSPSPOT14

thyroid hormone responsive

THRSP 編碼 SPOT14 family 蛋白,參與脂質生成調控,尤其與泌乳期乳腺中的脂質生成相關;其可能也影響 THRB 的轉錄因子活性。

Homo sapiens11q14.1UniProt Q92748
OFFICIAL SYMBOL
THRSP
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q92748
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

THRSP(thyroid hormone responsive)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 SPOT14 family。此蛋白長 146 個胺基酸,屬於短蛋白;序列中第 83 至 104 個胺基酸被註記為無序區。現有資料將它與脂質生成調控及轉錄調節相關聯,並指出其可與其他蛋白質形成同源或異源二聚體。這些基本特徵提供了認識 THRSP 產物的概況;更具體的功能與可能作用方式,仍須依各項資料所標示的證據性質理解。

Official symbol
THRSP
Gene name
thyroid hormone responsive
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11800
UniProt
Q92748
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SPOT14LpgpS14THRPLPGP1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q14.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegTHRSPpq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:78,063,660–78,068,351
Gene span
4,692 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000281030 ★78,063,861–78,068,3512
ENST0000113758778,063,660–78,068,3512
ENST0000112038978,063,669–78,068,3512
ENST0000088105278,063,861–78,068,3512

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

THRSP 參與脂質生成的調控,這項作用在泌乳期乳腺中特別受到關注。它也與含中等長度脂肪酸鏈的三酸甘油酯生合成有關,來源指出 THRSP 對此生合成過程具有重要性,但未進一步界定其作用步驟。

一種可能的調控方式是 THRSP 與 MID1IP1 互作,並阻止 MID1IP1 與 ACACA 互作;資料以「By similarity」標示這項機制,因此應視為相似性推論,而非在此處直接確立的作用。此模型將 THRSP 與脂質生成調節連結起來,但來源未提供更多條件或實驗細節。

此外,THRSP 可能具有轉錄共活化因子的功能,也可能調節轉錄因子 THRB 的活性。這些描述均保留「可能」的限定,來源並未在此說明受調控基因或具體轉錄機制。據此,THRSP 的資料所涵蓋的功能範圍包括脂質生成相關作用,以及可能參與轉錄調節;不同作用的細節與證據強度並不完全相同。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 78063861 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>THRSP ENST00000281030 GRCh38 chr11:78062861-78063961 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTCTTTTGATCCCAGCCGCTTGTCTGGACTGATACAAAGCATTTTTATTAGTTTGTCTTATTCAATCCT
CACACCACCTCAAATTTACAGAGGATATGGATCTGGTTAACTTGTATGACTATGTAACCTCATGTCAGTC
CACAGCACTGCCTGGAGGTGGGTAGAGGTGGTCCTGGGCTGGAATCCCAGCCCCAGTGGGACCTTGAGCA
AGTTACTTTAGCTGTCTGCACCTAAATTTCCTCACTGGCAAAACAGGAATACTGGTGGTTCACACCTGCA
ATTCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGTCCAGAAGTTCAAAACCAGACTGGGCAA
CATAGCAAGACCATCTCTACAAAAATTAAATAAATAAAACATTTACAAGGGTTGTGGTGAAGATTAAATG
AGATCACTCACGAAAAAGCTCAGCAGACCCTGATGTGCAGTAGGTGCTCAATAAATGTTAGCCAGCAAAA
AACAAACAAAAAAAAACTCAGCTAGGAAATTGCAGTACTGGGCTTCTGACTCCAACCTCAGTGTTCCTTG
CCCCACATCAAGCTGTTTCACTTCAAATCCTCTCCATTTCACAATGGAGTCACCCCAGGTTGAAGGAGTG
AACTGTGCTTTGGAGGGCTGCCCTAAGCAGGCAGCAAAGAGACAGCTTGGTCTCCAGTGACCTGAAAGAA
TTATTTATTGCCCTGAAGTCCAGTATACCAGTTGCCAAAGGGAAAAGCTTCCTTCCAACTGGCTCAGCAA
GCTGACAGAGGAAGAGTCGGGTTCTTGCTGGGGCAGTCATGCAGAGCTGGGATGACAAGTAGAAGGCTGG
CAGATCTGTCTCTGGGCAGATGGATCACCTGATACAGATGCTGGGGCCTGAGCCCTGGGATTGGCCCAAA
ACAGGGCTGTGTTGACCCAACAGCTGGGCATTGGCATCCTGTCAATCTGCCGAGAGCCTAGAAATAGTGC
GGGGGCAGTCTGCTGGTCTCATTGTGTCAGAGGAAGCAACCATGCAGGTGCTAACCAAGCGTTACCCCAA
GAACTGCCTGCTGACCGTCATGGACCGGTATGCAGCCGAGGTGCACAACAT
THRSP 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
THRSP_1 ↗11:78,063,861正股78,063,812–78,063,871

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_935ZK6 · enhancer · 78061136–78061404 · regulatory

· motif · 78061047–78061062 · motif

· motif · 78061597–78061607 · motif

· motif · 78061603–78061616 · motif

· motif · 78061673–78061686 · motif

· motif · 78061673–78061688 · motif

· motif · 78062263–78062272 · motif

· motif · 78062263–78062272 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:146 aa

1 aa146 aa功能區域
依 Q92748 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

THRSP 蛋白長 146 個胺基酸,屬於 SPOT14 family。序列第 83 至 104 位胺基酸區段被註記為無序區;這是序列特徵描述,資料未進一步說明該區段的功能。

功能區域Disordered83–104 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q92748…

AlphaFold · Q92748

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm

THRSP 蛋白被記錄於細胞核與細胞質。 現有資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPOT14THRSPINCA1TEPSINZMYND12
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

THRSP 可形成同源二聚體,並可與 MID1IP1 形成異源二聚體;後者的註記帶有「By similarity」限定。另有資料指出 THRSP 與 THRB 及 PLAGL1 互作,但未進一步說明這些互作是否涉及直接結合或共同組成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能THRSP 參與脂質生成調控,尤其與泌乳期乳腺相關,並對含中等長度脂肪酸鏈的三酸甘油酯生合成具有重要性。它可能藉由與 MID1IP1 互作並阻止 MID1IP1 與 ACACA 互作來調節脂質生成;此機制標示為相似性推論。此外,THRSP 可能具有轉錄共活化因子功能,並可能調節 THRB 的轉錄因子活性。含實驗來源
證據與來源

Plays a role in the regulation of lipogenesis, especially in lactating mammary gland. Important for the biosynthesis of triglycerides with medium-length fatty acid chains. May modulate lipogenesis by interacting with MID1IP1 and preventing its interaction with ACACA (By similarity). May function as transcriptional coactivator. May modulate the transcription factor activity of THRB

PMID 17418816 ↗ · PMID 18299245 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用THRSP 可形成同源二聚體,也可與 MID1IP1 形成異源二聚體;與 MID1IP1 的異源二聚體關係標示為相似性推論。資料另指出 THRSP 與 THRB 及 PLAGL1 互作,但未提供這些互作的更多性質或實驗條件。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Heterodimer with MID1IP1 (By similarity). Interacts with THRB and PLAGL1

PMID 17418816 ↗ · PMID 18299245 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位THRSP 的細胞內定位記錄包括細胞核與細胞質。資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm

PMID 18299245 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000281030 · 1,174 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTGTGTCAGAGGAAGCAACCATGCAGGTGCTAACCAAGC40
41GTTACCCCAAGAACTGCCTGCTGACCGTCATGGACCGGTA80
81TGCAGCCGAGGTGCACAACATGGAGCAGGTGGTGATGATC120
121CCCAGCCTTCTGCGGGACGTGCAGCTGAGTGGGCCTGGGG160
161GCCAGGCCCAGGCTGAGGCCCCTGATCTCTACACCTACTT200
201CACCATGCTCAAGGCCATCTGTGTGGATGTGGACCATGGG240
241CTGCTGCCGCGGGAGGAGTGGCAGGCCAAGGTGGCAGGCA280
281GCGAAGAGAATGGAACCGCAGAGACAGAGGAAGTCGAGGA320
321CGAGAGTGCCTCAGGAGAGCTGGACCTGGAAGCCCAGTTC360
361CACCTGCACTTCTCCAGCCTCCATCACATCCTCATGCACC400
401TCACCGAGAAAGCCCAGGAGGTGACAAGGAAATACCAGGA440
441AATGACGGGACAAGTTTGGTAGACCTTGGACACTAGGGAA480
481GATCCCTTCACATGATAGAAGACAGACTCTTTGATGAGGT520
521CGGCGGAGCAGTTCACTAGCCAATGATGAGAGCAGAAAGG560
561CCTAGACCTGCAGCCAGAAGTGAAGGCGGCTCAGTTCTCC600
601GGGATGCTTCTCTACCTCCTGAGCACCAATTCCTGGATTC640
641CAGTCACTGGCTCACCTTTAGAATGTCTGTTGCTATTCAC680
681TGCTCCCCTCGCTCCTCTTAACAGCTTGGGGAGGTGACCA720
721GTGGTTCAGGAGGGACTAGACAATTACCTGTCCAGTGTGG760
761TATGGTAGGAAGAGTGTAGGTGTTGGCACGTGACCAAAAT800
801TCACATCCCTCCTCATGGCAGTCATTCAGTATGTGTACTT840
841GTACAAGTTATTTAACCCATTGGAGCCTAAATTCCCTCAT880
881CTATAAAATGGGGATAATATTATCTACCTCACAAGCTTAT920
921GAAAACTAAACATGATGAATCAAAAGCACTTGGCATGTGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。