基因總覽
THRSP(thyroid hormone responsive)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 SPOT14 family。此蛋白長 146 個胺基酸,屬於短蛋白;序列中第 83 至 104 個胺基酸被註記為無序區。現有資料將它與脂質生成調控及轉錄調節相關聯,並指出其可與其他蛋白質形成同源或異源二聚體。這些基本特徵提供了認識 THRSP 產物的概況;更具體的功能與可能作用方式,仍須依各項資料所標示的證據性質理解。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000281030 ★ | 78,063,861–78,068,351 | 2 |
| ENST00001137587 | 78,063,660–78,068,351 | 2 |
| ENST00001120389 | 78,063,669–78,068,351 | 2 |
| ENST00000881052 | 78,063,861–78,068,351 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
THRSP 參與脂質生成的調控,這項作用在泌乳期乳腺中特別受到關注。它也與含中等長度脂肪酸鏈的三酸甘油酯生合成有關,來源指出 THRSP 對此生合成過程具有重要性,但未進一步界定其作用步驟。
一種可能的調控方式是 THRSP 與 MID1IP1 互作,並阻止 MID1IP1 與 ACACA 互作;資料以「By similarity」標示這項機制,因此應視為相似性推論,而非在此處直接確立的作用。此模型將 THRSP 與脂質生成調節連結起來,但來源未提供更多條件或實驗細節。
此外,THRSP 可能具有轉錄共活化因子的功能,也可能調節轉錄因子 THRB 的活性。這些描述均保留「可能」的限定,來源並未在此說明受調控基因或具體轉錄機制。據此,THRSP 的資料所涵蓋的功能範圍包括脂質生成相關作用,以及可能參與轉錄調節;不同作用的細節與證據強度並不完全相同。
Promoter 與基因調控
>THRSP ENST00000281030 GRCh38 chr11:78062861-78063961 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTCTTTTGATCCCAGCCGCTTGTCTGGACTGATACAAAGCATTTTTATTAGTTTGTCTTATTCAATCCT CACACCACCTCAAATTTACAGAGGATATGGATCTGGTTAACTTGTATGACTATGTAACCTCATGTCAGTC CACAGCACTGCCTGGAGGTGGGTAGAGGTGGTCCTGGGCTGGAATCCCAGCCCCAGTGGGACCTTGAGCA AGTTACTTTAGCTGTCTGCACCTAAATTTCCTCACTGGCAAAACAGGAATACTGGTGGTTCACACCTGCA ATTCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGTCCAGAAGTTCAAAACCAGACTGGGCAA CATAGCAAGACCATCTCTACAAAAATTAAATAAATAAAACATTTACAAGGGTTGTGGTGAAGATTAAATG AGATCACTCACGAAAAAGCTCAGCAGACCCTGATGTGCAGTAGGTGCTCAATAAATGTTAGCCAGCAAAA AACAAACAAAAAAAAACTCAGCTAGGAAATTGCAGTACTGGGCTTCTGACTCCAACCTCAGTGTTCCTTG CCCCACATCAAGCTGTTTCACTTCAAATCCTCTCCATTTCACAATGGAGTCACCCCAGGTTGAAGGAGTG AACTGTGCTTTGGAGGGCTGCCCTAAGCAGGCAGCAAAGAGACAGCTTGGTCTCCAGTGACCTGAAAGAA TTATTTATTGCCCTGAAGTCCAGTATACCAGTTGCCAAAGGGAAAAGCTTCCTTCCAACTGGCTCAGCAA GCTGACAGAGGAAGAGTCGGGTTCTTGCTGGGGCAGTCATGCAGAGCTGGGATGACAAGTAGAAGGCTGG CAGATCTGTCTCTGGGCAGATGGATCACCTGATACAGATGCTGGGGCCTGAGCCCTGGGATTGGCCCAAA ACAGGGCTGTGTTGACCCAACAGCTGGGCATTGGCATCCTGTCAATCTGCCGAGAGCCTAGAAATAGTGC GGGGGCAGTCTGCTGGTCTCATTGTGTCAGAGGAAGCAACCATGCAGGTGCTAACCAAGCGTTACCCCAA GAACTGCCTGCTGACCGTCATGGACCGGTATGCAGCCGAGGTGCACAACAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| THRSP_1 ↗ | 11:78,063,861 | 正股 | 78,063,812–78,063,871 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_935ZK6 · enhancer · 78061136–78061404 · regulatory
· motif · 78061047–78061062 · motif
· motif · 78061597–78061607 · motif
· motif · 78061603–78061616 · motif
· motif · 78061673–78061686 · motif
· motif · 78061673–78061688 · motif
· motif · 78062263–78062272 · motif
· motif · 78062263–78062272 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:146 aa
THRSP 蛋白長 146 個胺基酸,屬於 SPOT14 family。序列第 83 至 104 位胺基酸區段被註記為無序區;這是序列特徵描述,資料未進一步說明該區段的功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
THRSP 蛋白被記錄於細胞核與細胞質。 現有資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEPSINQ96N21 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZMYND12Q9H0C1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
THRSP 可形成同源二聚體,並可與 MID1IP1 形成異源二聚體;後者的註記帶有「By similarity」限定。另有資料指出 THRSP 與 THRB 及 PLAGL1 互作,但未進一步說明這些互作是否涉及直接結合或共同組成複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | THRSP 參與脂質生成調控,尤其與泌乳期乳腺相關,並對含中等長度脂肪酸鏈的三酸甘油酯生合成具有重要性。它可能藉由與 MID1IP1 互作並阻止 MID1IP1 與 ACACA 互作來調節脂質生成;此機制標示為相似性推論。此外,THRSP 可能具有轉錄共活化因子功能,並可能調節 THRB 的轉錄因子活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in the regulation of lipogenesis, especially in lactating mammary gland. Important for the biosynthesis of triglycerides with medium-length fatty acid chains. May modulate lipogenesis by interacting with MID1IP1 and preventing its interaction with ACACA (By similarity). May function as transcriptional coactivator. May modulate the transcription factor activity of THRB PMID 17418816 ↗ · PMID 18299245 ↗ |
| 交互作用 | THRSP 可形成同源二聚體,也可與 MID1IP1 形成異源二聚體;與 MID1IP1 的異源二聚體關係標示為相似性推論。資料另指出 THRSP 與 THRB 及 PLAGL1 互作,但未提供這些互作的更多性質或實驗條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Heterodimer with MID1IP1 (By similarity). Interacts with THRB and PLAGL1 PMID 17418816 ↗ · PMID 18299245 ↗ |
| 細胞定位 | THRSP 的細胞內定位記錄包括細胞核與細胞質。資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTGTGTCAGAGGAAGCAACCATGCAGGTGCTAACCAAGC40GTTACCCCAAGAACTGCCTGCTGACCGTCATGGACCGGTA80TGCAGCCGAGGTGCACAACATGGAGCAGGTGGTGATGATC120CCCAGCCTTCTGCGGGACGTGCAGCTGAGTGGGCCTGGGG160GCCAGGCCCAGGCTGAGGCCCCTGATCTCTACACCTACTT200CACCATGCTCAAGGCCATCTGTGTGGATGTGGACCATGGG240CTGCTGCCGCGGGAGGAGTGGCAGGCCAAGGTGGCAGGCA280GCGAAGAGAATGGAACCGCAGAGACAGAGGAAGTCGAGGA320CGAGAGTGCCTCAGGAGAGCTGGACCTGGAAGCCCAGTTC360CACCTGCACTTCTCCAGCCTCCATCACATCCTCATGCACC400TCACCGAGAAAGCCCAGGAGGTGACAAGGAAATACCAGGA440AATGACGGGACAAGTTTGGTAGACCTTGGACACTAGGGAA480GATCCCTTCACATGATAGAAGACAGACTCTTTGATGAGGT520CGGCGGAGCAGTTCACTAGCCAATGATGAGAGCAGAAAGG560CCTAGACCTGCAGCCAGAAGTGAAGGCGGCTCAGTTCTCC600GGGATGCTTCTCTACCTCCTGAGCACCAATTCCTGGATTC640CAGTCACTGGCTCACCTTTAGAATGTCTGTTGCTATTCAC680TGCTCCCCTCGCTCCTCTTAACAGCTTGGGGAGGTGACCA720GTGGTTCAGGAGGGACTAGACAATTACCTGTCCAGTGTGG760TATGGTAGGAAGAGTGTAGGTGTTGGCACGTGACCAAAAT800TCACATCCCTCCTCATGGCAGTCATTCAGTATGTGTACTT840GTACAAGTTATTTAACCCATTGGAGCCTAAATTCCCTCAT880CTATAAAATGGGGATAATATTATCTACCTCACAAGCTTAT920GAAAACTAAACATGATGAATCAAAAGCACTTGGCATGTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。