基因總覽
THRA 是蛋白質編碼基因，其產物 thyroid hormone receptor alpha 屬於核內荷爾蒙受體家族的 NR1 亞家族。這類受體可參與轉錄調控；thyroid hormone receptor alpha 能高親和力結合三碘甲狀腺素與甲狀腺素。蛋白質具有核受體 DNA 結合區與核受體配體結合區，另有調節區域；這些結構註解構成其辨識 DNA、荷爾蒙及調控轉錄的基本分子特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000450525 ★ | 40,062,965–40,093,002 | 9 |
| ENST00000577288 | 40,058,290–40,076,912 | 3 |
| ENST00000585047 | 40,061,904–40,077,604 | 4 |
| ENST00000578218 | 40,062,193–40,083,866 | 5 |
| ENST00000394121 | 40,062,193–40,093,867 | 10 |
| ENST00000264637 | 40,062,810–40,093,867 | 10 |
| ENST00000584985 | 40,062,810–40,093,867 | 10 |
| ENST00000860601 | 40,062,810–40,093,864 | 10 |
| ENST00000932773 | 40,062,810–40,090,026 | 9 |
| ENST00000983676 | 40,062,810–40,093,867 | 10 |
| ENST00001126650 | 40,062,810–40,093,865 | 10 |
| ENST00001141536 | 40,062,810–40,093,002 | 9 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thyroid hormone receptor alpha 是甲狀腺荷爾蒙受體，能高親和力結合三碘甲狀腺素與甲狀腺素。它屬核內荷爾蒙受體，功能上可作為轉錄活化因子，也可作為轉錄抑制因子；因此，其作用方向可依情境而異，來源並未將其限定為單一方向。
另有不結合甲狀腺荷爾蒙的形式，其功能描述為甲狀腺荷爾蒙作用的弱顯性負向抑制因子。這項特性與可結合荷爾蒙的受體形式不同，說明 THRA 產物相關功能具有形式差異；資料未提供更細的作用機制或生理過程細節。
Promoter 與基因調控
>THRA ENST00000450525 GRCh38 chr17:40061965-40063065 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTGTGGTGTGTGTATGTGTGTGCTGGGGGTGGGGCTGGCATGGTGGAGACCTCTCCTTTGGGTTGGGTTA GGGGGTCCATTTGTATGCAGCCCACCGTCTTCCTTAGATTGACTCTGGTACCATTTGGATTTTTGTGGGA GCAAACATGGGGGGAAATACCACCACCCGGGAGCTAGGAATTGAGGGGGTATGGCAGATCTTGTCCCCTC CCCGAGCTCAGGAGAGGGAGCAGATTGTTGGGGGAAATGGCTGGTGACAGAGAATAGAAAGAGCCTATAT GGAGAAGGGTGACGTTGGAAAAGGGAGGCAGTGGATCGGTATTGATGTTAGAAATGAGAGGGGAGGGAGG TAACAGGGAATGAACCCCCACAAGGATGAAAAACGTAAGATGATTGAAGTTAAAAGGACATCAGGGGTCA CCTGCCCAGCCCTCGCAGCTGAAGCTTGAGGAAGCTCTGCCCCCGACAGCAGTGGCGATTTGTCAAGGTC ACACAGTGAGTTACCGGCGGAGAAGGGACCCGAACTCCCAAACAAACTACACCTGCAAGCGTTTGGTGTT TAGACTTTCTCCCCGATGTATAAGGTGCAGGCTGCTCGTCGATACTTCCTCCTCCACCCTCACGGTGCAC ACCCGAAAACCCCCCAATTCTCCCGGCAAGCAAAGGCTATTTTTTAATGACATCTTTTCCAAAATATGTC ACCAAGTACCCACTCCTGCGGGAGCCGCCCGGGCTGGGGAGGGCGAGTCCGAGCGGGGCGGGGCAGAGGC GGCCGAGGGGCGGCCGGACCTCTGGCGGGGGTCCCGGGGCGCGGCAGGGGGCGGGGGGCGGGGGCGGGCG GCGGCGAGGCGGCCTGCAGGGAGCAGCCGCGAGCCGGCCGGGCGCGCCGAGCCCGAGCCCCAGCCGGAGC GGGGCGGGGGAGGGAGGAGCCAGAGCGGCCGCCGCCTCTGCCGGAGGAGCCGCGGGGCCGCCACACTCGC CCCCCGCCCCCCCCGCGCTCACTCGCACTCACACCCGGGCGCAGGAGGCGGGCGGCCCGGGCCCCACCGG CCCCCCATGGACGCCCCCAGCACGGGGCGCTGAGACCCCCGCGTCGCTGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| THRA_2 ↗ | 17:40,062,829 | 正股 | 40,062,780–40,062,839 |
| THRA_1 ↗ | 17:40,062,965 | 正股 | 40,062,916–40,062,975 |
| THRA_3 ↗ | 17:40,074,426 | 正股 | 40,074,377–40,074,436 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_9KW9Z · enhancer · 40058275–40058670 · regulatory
ENSR17_B9XMW · enhancer · 40061109–40061757 · regulatory
ENSR17_74CLC8 · promoter · 40062103–40062203 · regulatory
ENSR17_B9XN4 · promoter · 40062320–40062975 · regulatory
ENSR17_5CFFDZ · CTCF_binding_site · 40062368–40062389 · regulatory
· motif · 40062370–40062386 · motif
· motif · 40063116–40063129 · motif
· motif · 40063116–40063129 · motif
· motif · 40063120–40063133 · motif
· motif · 40063139–40063152 · motif
· motif · 40063139–40063152 · motif
· motif · 40063232–40063247 · motif
· motif · 40063237–40063249 · motif
· motif · 40063679–40063690 · motif
· motif · 40064196–40064209 · motif
· motif · 40064196–40064209 · motif
· motif · 40066446–40066458 · motif
· motif · 40066448–40066455 · motif
· motif · 40066448–40066463 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：490 aa
thyroid hormone receptor alpha 的蛋白質長 490 個胺基酸，屬核內荷爾蒙受體 NR1 亞家族。註解標示其核受體 DNA 結合區位於第 53–127 位，包含兩個 C4 型鋅指；核受體配體結合區位於第 163–407 位。N 端第 1–52 位為調節區，且第 1–32 位與第 457–490 位被註解為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
thyroid hormone receptor alpha 定位於細胞核。 Alpha-2 異構型則註解為可見於細胞核與細胞質；在過度表現的條件下，Alpha-2 被觀察到位於細胞質，並與 TACC1 共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- AMOTL2Q9Y2J4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CD160O95971 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- L3MBTL3Q96JM7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MED1Q15648 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAR1BP31321 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SYAP1Q96A49 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TACC1O75410-7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Ncoa6Q9JLI4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
thyroid hormone receptor alpha 可形成同源二聚體，或與 RXRB 形成異源二聚體並結合 DNA。它與共活化因子 NCOA3、NCOA6 互作，並使標的基因轉錄大幅增加；此外，資料列出其與 C1D、AKAP13、TP53INP2、PER2 的互作，並指出可能與 SFPQ 互作。Alpha-1 與 Alpha-2 異構型均可與 TACC1 互作，但 Alpha-1 的互作較弱；有 T3 時，Alpha-1 與 TACC1 的互作降低，Alpha-2 則未見此變化。
疾病與遺傳關聯
THRA 相關變異被列為先天性非甲狀腺腫型甲狀腺功能低下症 6（CHNG6）的病因。疾病特徵包括生長與發育遲緩、骨骼發育不良、甲狀腺素略低及三碘甲狀腺素偏高。患者對甲狀腺荷爾蒙的敏感性呈組織差異：下視丘－腦下垂體軸與肝臟仍保有反應，骨骼、胃腸道及心肌則呈抗性。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | thyroid hormone receptor alpha 是核內荷爾蒙受體，可作為轉錄抑制因子或活化因子，並能高親和力結合甲狀腺荷爾蒙，包括三碘甲狀腺素與甲狀腺素。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nuclear hormone receptor that can act as a repressor or activator of transcription. High affinity receptor for thyroid hormones, including triiodothyronine and thyroxine PMID 12699376 ↗ · PMID 14673100 ↗ · PMID 18237438 ↗ · PMID 19926848 ↗ |
| 功能 | 有一種形式不結合甲狀腺荷爾蒙，並作為甲狀腺荷爾蒙作用的弱顯性負向抑制因子；此敘述未提供更細的機制或作用條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Does not bind thyroid hormone and functions as a weak dominant negative inhibitor of thyroid hormone action PMID 8910441 ↗ |
| 交互作用 | thyroid hormone receptor alpha 以二聚體形式結合 DNA，可形成同源二聚體或與 RXRB 形成異源二聚體；與 NCOA3、NCOA6 互作會大幅增強標的基因轉錄。另列有 C1D、AKAP13、TP53INP2、PER2 互作，並指出可能與 SFPQ 互作。Alpha-1、Alpha-2 均與 TACC1 互作，但 Alpha-1 較弱；T3 會降低 Alpha-1 而非 Alpha-2 與 TACC1 的互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds DNA as a dimer; homodimer and heterodimer with RXRB. Interacts with NCOA3 and NCOA6 coactivators, leading to a strong increase of transcription of target genes. Probably interacts with SFPQ. Interacts with C1D. Interacts with AKAP13. Interacts with TP53INP2. Interacts with PER2. Isoform alpha-2 and isoform alpha-1 interact with TACC1, but the interaction with alpha-1 is weaker. The interaction with isoform alpha-1, but not alpha-2, is decreased in the presence of thyroid hormone T3 PMID 10567404 ↗ · PMID 12699376 ↗ · PMID 16781732 ↗ · PMID 18030323 ↗ · PMID 18237438 ↗ · PMID 19926848 ↗ · PMID 20078863 ↗ · PMID 9267036 ↗ · PMID 9627117 ↗ |
| 細胞定位 | thyroid hormone receptor alpha 的定位為細胞核。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Alpha-2 異構型可見於細胞質與細胞核；在過度表現時，其細胞質定位與 TACC1 共定位。 | 推論支持 | 證據與來源Isoform Alpha-2; Cytoplasm; Nucleus; When overexpressed found in the cytoplasm where it colocalizes with TACC1 |
| 疾病關聯 | THRA 相關變異可導致先天性非甲狀腺腫型甲狀腺功能低下症 6（CHNG6），其特徵包括生長與發育遲緩、骨骼發育不良、甲狀腺素略低及三碘甲狀腺素偏高。荷爾蒙敏感性具有組織差異：下視丘－腦下垂體軸與肝臟仍有反應，骨骼、胃腸道及心肌則呈抗性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hypothyroidism, congenital, non-goitrous, 6 CHNG6 A disease characterized by growth retardation, developmental retardation, skeletal dysplasia, borderline low thyroxine levels and high triiodothyronine levels. There is differential sensitivity to thyroid hormone action, with retention of hormone responsiveness in the hypothalamic pituitary axis and liver but skeletal, gastrointestinal, and myocardial resistance. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614450 PMID 22168587 ↗ · PMID 24969835 ↗ · PMID 25670821 ↗ · PMID 26037512 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTCGCACTCACACCCGGGCGCAGGAGGCGGGCGGCCCGG40GCCCCACCGGCCCCCCATGGACGCCCCCAGCACGGGGCGC80TGAGACCCCCGCGTCGCTGCCCAGCCCGGTCCGGCGCGCC120ACGCCGAGGGATCTCTGGACAGGACAAGACTCCGAAGCTA160CTCCCCCAGCACACAGCCCGGGACCCACAAACCCAGCTTG200CCCCCAGCCCTCCCACCTGCCACTCCCTGGCCCCTCCCAC240CGCCCGCCCCCCTTGGGGCGCAGGGCATGGTGTGAAAGGC280CAAGTGCTGAGGCGGGTATCATGGGTGCTGTGCCCTAGGG320CCTGGGTGGCAGGGGGTGGGTGGCCTGTGGGTGTGCCGGG360GGGGCCAGTGTGCCCACCCCAGTCTCTTGGCGTGCTGGAG400GGCATCCTGGATGGAATTGAAGTGAATGGAACAGAAGCCA440AGCAAGGTGGAGTGTGGGTCAGACCCAGAGGAGAACAGTG480CCAGGTCACCAGATGGAAAGCGAAAAAGAAAGAACGGCCA520ATGTTCCCTGAAAACCAGCATGTCAGGGTATATCCCTAGT560TACCTGGACAAAGACGAGCAGTGTGTCGTGTGTGGGGACA600AGGCAACTGGTTATCACTACCGCTGTATCACTTGTGAGGG640CTGCAAGGGCTTCTTTCGCCGCACAATCCAGAAGAACCTC680CATCCCACCTATTCCTGCAAATATGACAGCTGCTGTGTCA720TTGACAAGATCACCCGCAATCAGTGCCAGCTGTGCCGCTT760CAAGAAGTGCATCGCCGTGGGCATGGCCATGGACTTGGTT800CTAGATGACTCGAAGCGGGTGGCCAAGCGTAAGCTGATTG840AGCAGAACCGGGAGCGGCGGCGGAAGGAGGAGATGATCCG880ATCACTGCAGCAGCGACCAGAGCCCACTCCTGAAGAGTGG920GATCTGATCCACATTGCCACAGAGGCCCATCGCAGCACCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。