演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

THPOTPO

thrombopoietin

THPO 編碼 thrombopoietin,是一種細胞激素,參與巨核細胞增殖與成熟,並可能是循環血小板的主要生理調節因子。

Homo sapiens3q27.1UniProt P40225
OFFICIAL SYMBOL
THPO
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P40225
PDB / ALPHAFOLD
1V7M
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

thrombopoietin 是由 THPO 編碼的蛋白質,屬於 EPO/TPO family。它是一種具譜系特異性的細胞激素,主要與巨核細胞及血小板生理調節相關。蛋白質序列含有訊號胜肽,且其 C 端第 257 至 353 位胺基酸區域被註記為無序區。這些基本特徵提供了其分泌性細胞激素的背景;其對巨核細胞發育的具體作用見功能說明。

Official symbol
THPO
Gene name
thrombopoietin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11795
UniProt
P40225
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TPOMPLLGMGDF

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33q27.1
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegTHPOpq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:184,367,389–184,381,968
Gene span
14,580 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000647395 ★184,371,935–184,378,2076
ENST00001111155184,367,389–184,378,2076
ENST00001111156184,367,389–184,378,2077
ENST00000649095184,371,935–184,379,6887
ENST00000876541184,371,944–184,378,2156
ENST00000992664184,371,944–184,378,2116
ENST00000445696184,372,269–184,378,1406
ENST00000876539184,372,290–184,381,6456
ENST00000421442184,372,327–184,376,2596
ENST00000876542184,372,329–184,378,2416
ENST00000962183184,372,329–184,380,7636
ENST00000876544184,372,330–184,378,1556

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

thrombopoietin 是具譜系特異性的細胞激素,作用於已承諾分化為巨核細胞的前驅細胞,促進這些細胞增殖與成熟。它的作用時序偏向巨核細胞發育的晚期,來源並未指出其在較早發育階段具有相同作用,因此其功能描述應限定於已進入巨核細胞分化路徑的前驅細胞及晚期發育階段。

巨核細胞是血小板生成過程中的關鍵細胞;thrombopoietin 對巨核細胞增殖和成熟的影響,連結了細胞發育與循環血小板的調節。來源指出,它可能是循環血小板的主要生理調節因子,但此處以「可能」表述,並非確定其為唯一或必然的主要調節者。現有資料未進一步說明其下游分子機制或其他作用細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 184378207 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>THPO ENST00000647395 GRCh38 chr3:184378107-184379207 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCCTTCCTAATCTTGGGAGACATCTCGTCTGGCTGGACGGGAAAATTCCAGGATCTAGGCCACACTTCT
CAGCAGACATGCCCATCCTTGGGGAGGAGGAACAGGAGAGAGCCTGAGGAAGTTCTGGGGGACAGGGGGA
TGATGGGATCAAGGTCAGGCCAGGAAGCCCCTGAGGACAGAGACTGTGGGGAGACTGGGACTGGGAAGAA
AGCAAAGGAGCTAGAGCCAGGGCCAAAGGAAAAGGGGGGCCAGCAGGGAGGTATTTGCGGGGGAGGTCCA
GCAGCTGTCTTTCCTAAGACAGGGACACATGGGCCTGGTTATTCCTCTTGTCACATGTGGAACGGTAGGA
GATGGAAGACGGAGACAGAACAAGCAAAGGAGGGCCCTGGGCACAGAGGTCTGTGTGTGTAGCCATCTAA
GCCACTGGACCCCAGCAGACGAGCACCTAAGCTCAGGCTTAACCCAGTGCACGTGTGCGCACATACATGT
GCCCCGCACCTGACAGTCCACTCAACCCGTCCAAACCCTTTCCCCATAACACCAACCCATAACAGGAGAT
TTCTCTCATGTGGGCAATATCCGTGTTCCCACTTCGAAAGGGGGAATGACAAGATAGGACTCCCTAGGGG
ATTACAGAAAGAAAAGCAGGAAAGCAAGCATCCTGTTGGATTTCAGCAGCAGGTATGATGTCCAGGGAAA
AGAAATTTGGATAGCCAGGGAGTGAAAACCCCACCAATCTTAAACAAGACCTCTGTGCTTCTTCCCCAGC
AACACAAATGTCCTGCCAGATTCCTCCTGGAAAAAAACTTCTGCTCCTGTCCCCCTCCAGGTCCCAGGTT
GCCCATGTCCAGGAAAAGATGGATCCCCCTATCCAAATCTTCTCCGTGGTGTGTGTGGGTGGAGGAGTGG
ACCCTGGTCCAGGCAGGGGCTCCAGGGAAGAGAAGGCGTCACTTCCGGGGGCCTTCACCAGTGTCTGGTG
GCTCCCTTCTCTGATTGGGCAGAAGTGGCCCAGGCAGGCGTATGACCTGCTGCTGTGGAGGGGCTGTGCC
CCACCGCCACATGTCTTCCTACCCATCTGCTCCCCAGAGGGCTGCCTGCTG
THPO 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
THPO_2 ↗3:184,376,184負股184,376,174–184,376,233
THPO_3 ↗3:184,378,088負股184,378,078–184,378,137
THPO_1 ↗3:184,378,207負股184,378,197–184,378,256

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_94P6TT · enhancer · 184373556–184373848 · regulatory

ENSR3_94P6X4 · promoter · 184377770–184378065 · regulatory

ENSR3_87FCTD · promoter · 184378130–184378384 · regulatory

ENSR3_B3CKZ8 · enhancer · 184378807–184379677 · regulatory

ENSR3_B3CKZC · promoter · 184379678–184380329 · regulatory

ENSR3_87FCXK · promoter · 184381958–184382094 · regulatory

· motif · 184377815–184377828 · motif

· motif · 184377815–184377828 · motif

· motif · 184377897–184377907 · motif

· motif · 184377994–184378004 · motif

· motif · 184378028–184378042 · motif

· motif · 184378297–184378307 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:353 aa

1 aa353 aa功能區域訊號胜肽
依 P40225 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

thrombopoietin 長 353 個胺基酸,屬於 EPO/TPO family。其第 1 至 21 位胺基酸為訊號胜肽;第 257 至 353 位則註記為無序區。資料未提供其他結構區域的詳細說明。

訊號胜肽1–21 aa
功能區域Disordered257–353 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1V7M…

PDB · 1V7M

X-ray · 2.51 A · V/X=22-184

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

thrombopoietin 被註記為分泌型蛋白質。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TPOTHPOMPL
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

thrombopoietin 與 MPL/TPOR 有交互作用。來源僅記載此交互作用,未說明其是否代表特定複合體,亦未提供其他互作或功能關係細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

THPO 變異與數種血小板相關疾病有關。Thrombocythemia 1 的特徵是血小板過度生成、循環血小板數增加,並可能伴隨自發性出血或血栓事件。先天性無巨核細胞性血小板減少症 2 為常染色體隱性疾病,出生時巨核細胞與血小板嚴重減少,可能在兒童期進展為廣泛性骨髓再生不良;多數患者的血小板減少會進一步發展為全血球減少。Thrombocytopenia 9 為常染色體顯性疾病,患者血小板數偏低,但通常沒有明顯出血傾向;部分患者有輕微黏膜皮膚出血,也有人沒有症狀。這些資料描述的是影響 THPO 的變異與疾病的關聯。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能thrombopoietin 是具譜系特異性的細胞激素,作用於已承諾分化為巨核細胞的前驅細胞,促進其增殖與成熟;其作用發生在巨核細胞發育的晚期,並可能是循環血小板的主要生理調節因子。含實驗來源
證據與來源

Lineage-specific cytokine affecting the proliferation and maturation of megakaryocytes from their committed progenitor cells. It acts at a late stage of megakaryocyte development. It may be the major physiological regulator of circulating platelets

PMID 24085763 ↗ · PMID 29191945 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用thrombopoietin 與 MPL/TPOR 有交互作用;此項敘述未進一步說明交互作用的機制或其是否形成特定複合體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MPL/TPOR

PMID 37633268 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted含實驗來源
證據與來源

Secreted

PMID 32150607 ↗ · PMID 7822271 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Thrombocythemia 1(THCYT1)是骨髓增生性疾病,特徵為血小板過度生成及循環血小板數增加,並可能伴隨自發性出血或血栓事件。此疾病與影響 THPO 的變異相關。含實驗來源
證據與來源

Thrombocythemia 1 THCYT1 A myeloproliferative disorder characterized by excessive platelet production, resulting in increased numbers of circulating platelets. It can be associated with spontaneous hemorrhages and thrombotic episodes. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 187950

PMID 9425899 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯先天性無巨核細胞性血小板減少症 2(CAMT2)是常染色體隱性疾病,出生時巨核細胞及血小板嚴重減少,並可能在兒童期進展為廣泛性骨髓再生不良。多數患者的血小板減少會進展為全血球減少;此疾病與影響 THPO 的變異相關。含實驗來源
證據與來源

Amegakaryocytic thrombocytopenia, congenital, 2 CAMT2 A form of congenital amegakaryocytic thrombocytopenia, a hematologic disorder characterized by severe reduction of megakaryocytes and platelets at birth, and evolving into generalized bone marrow aplasia during childhood. CAMT2 is an autosomal recessive form. Most patients present with thrombocytopenia that progresses to pancytopenia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620481

PMID 24085763 ↗ · PMID 28559357 ↗ · PMID 29191945 ↗ · PMID 36226497 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Thrombocytopenia 9(THC9)是常染色體顯性血小板減少症,患者循環血小板數偏低,但通常沒有明顯出血傾向。部分患者可能有輕微黏膜皮膚出血,另有患者沒有症狀;此疾病與影響 THPO 的變異相關。含實驗來源
證據與來源

Thrombocytopenia 9 THC9 A form of thrombocytopenia, a hematologic disorder defined by a decrease in the number of platelets in circulating blood, resulting in the potential for increased bleeding and decreased ability for clotting. THC9 is an autosomal dominant form characterized by low platelet counts in the absence of significant bleeding tendency. Some individuals may have mild mucocutaneous bleeding, whereas others may be asymptomatic. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620478

PMID 28466964 ↗ · PMID 32150607 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000647395 · 1,918 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAGTGGCCCAGGCAGGCGTATGACCTGCTGCTGTGGAG40
41GGGCTGTGCCCCACCGCCACATGTCTTCCTACCCATCTGC80
81TCCCCAGAGGGCTGCCTGCTGTGCACTTGGGTCCTGGAGC120
121CCTTCTCCACCCGGATAGATTCTTCACCCTTGGCCCGCCT160
161TTGCCCCACCCTACTCTGCCCAGAAGTGCAAGAGCCTAAG200
201CCGCCTCCATGGCCCCAGGAAGGATTCAGGGGAGAGGCCC240
241CAAACAGGGAGCCACGCCAGCCAGACACCCCGGCCAGAAT280
281GGAGCTGACTGAATTGCTCCTCGTGGTCATGCTTCTCCTA320
321ACTGCAAGGCTAACGCTGTCCAGCCCGGCTCCTCCTGCTT360
361GTGACCTCCGAGTCCTCAGTAAACTGCTTCGTGACTCCCA400
401TGTCCTTCACAGCAGACTGAGCCAGTGCCCAGAGGTTCAC440
441CCTTTGCCTACACCTGTCCTGCTGCCTGCTGTGGACTTTA480
481GCTTGGGAGAATGGAAAACCCAGATGGAGGAGACCAAGGC520
521ACAGGACATTCTGGGAGCAGTGACCCTTCTGCTGGAGGGA560
561GTGATGGCAGCACGGGGACAACTGGGACCCACTTGCCTCT600
601CATCCCTCCTGGGGCAGCTTTCTGGACAGGTCCGTCTCCT640
641CCTTGGGGCCCTGCAGAGCCTCCTTGGAACCCAGCTTCCT680
681CCACAGGGCAGGACCACAGCTCACAAGGATCCCAATGCCA720
721TCTTCCTGAGCTTCCAACACCTGCTCCGAGGAAAGGTGCG760
761TTTCCTGATGCTTGTAGGAGGGTCCACCCTCTGCGTCAGG800
801CGGGCCCCACCCACCACAGCTGTCCCCAGCAGAACCTCTC840
841TAGTCCTCACACTGAACGAGCTCCCAAACAGGACTTCTGG880
881ATTGTTGGAGACAAACTTCACTGCCTCAGCCAGAACTACT920
921GGCTCTGGGCTTCTGAAGTGGCAGCAGGGATTCAGAGCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。