基因總覽
THOP1 是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因，正式名稱為 thimet oligopeptidase 1。其蛋白質產物屬於 peptidase M3 家族；來源所述的基本角色包括處理短神經胜肽及參與細胞質胜肽降解。資料亦指出，THOP1 可作用於 amyloid-beta precursor protein，並與 cannabinoid signaling pathway 的調節相關。這些描述呈現其作為胜肽代謝相關酵素的多種角色；具體底物與分子作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000307741 ★ | 2,785,503–2,815,807 | 13 |
| ENST00000877633 | 2,785,494–2,815,807 | 13 |
| ENST00000877634 | 2,785,494–2,815,807 | 14 |
| ENST00000877635 | 2,785,494–2,815,807 | 14 |
| ENST00000917965 | 2,785,494–2,815,807 | 13 |
| ENST00000917966 | 2,785,494–2,815,807 | 14 |
| ENST00000917967 | 2,785,494–2,815,807 | 12 |
| ENST00000917968 | 2,785,494–2,815,807 | 13 |
| ENST00000917969 | 2,785,494–2,815,807 | 13 |
| ENST00000917970 | 2,785,494–2,815,807 | 12 |
| ENST00000917971 | 2,785,494–2,815,807 | 14 |
| ENST00000917972 | 2,785,494–2,815,807 | 13 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
THOP1 參與長度少於 20 個胺基酸殘基的神經胜肽代謝，也參與細胞質中的胜肽降解。其切割偏好受底物序列影響：對長度為 5 至 15 個殘基的底物，較偏好切開 P1、P2 與 P3′位置帶有疏水性殘基，且 P1′位置為小型殘基的鍵結。這項偏好描述了其處理短胜肽時的序列條件。
THOP1 也能降解 amyloid-beta precursor protein，並產生 amyloidogenic fragments。來源指出這項作用，但未進一步說明產物的後續效應或其在特定生理情境中的影響，因此不宜延伸推論。
此外，THOP1 可藉由降解 hemopressin 參與調節 cannabinoid signaling pathway。hemopressin 是 cannabinoid receptor CNR1 的拮抗胜肽；相關調節作用標註為 By similarity，屬於相似性推定，並非此處提供的直接實驗證明。THOP1 每個亞基可結合一個鋅離子；來源未進一步列出鋅離子在上述各項作用中的具體機制。
Promoter 與基因調控
>THOP1 ENST00000307741 GRCh38 chr19:2784503-2785603 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGACTCCCTCCAGCCCCTCCAAAGCAAAAGAAAACAAAACAAAAACAAAAAAAGGGAAGAAAGGAGGTCG GTTGTTTTGGTTTTTGCCAGTTTAATTGTAGTACATTGTTTTTTCTGGGTGCCCTAACAGTTCAAGACAG ATGGTTCAAGATGTTTTTTGTTTTAACCCACAACACTGCATGTAGGTCAGGCTACTGCACTGTTCCACAA CACCTGTTATTTGACATGAATCCGTTTACTTGCTTTTGTTTCTGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC TTGGCCCGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGG TCAAGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCCTCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCCG GGGTGGGGGCTGGCGCCTGTAGTCCCAGCTCCTGGAAAGGCTGAGGCAGGAAAATTACTTGAACCAGGGA GGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCTGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTC TCAAAAACAACCAAAGCACCAAAACTTCTGGTTAATTTAATTGATTCGTCGGATTCAGATGCTGGAAAGT GGGCCTGGGATATACAGTAAGCGATCAATAATAACACTGGCCCAACACACAGCTATAAGAAGCGAGGCAA GTACACATTAACGCGGTAGCCTGAAGCCCAAGCGAAGTCTCAGCGCAATGAGCCGCGCAGAGGCTCAGAG GCGTCAGCGGCGTGCGCGGTTTCCAAGGAAACCGTCCGTCCTAGCCACCCCAGCGGCTCTGGAATGGTAG AGCAAGAGGCTCCGCCCACGCACCGCCGAGACCAATAACGGACCGGGAGGGTTACGGCGAGTGCGCAGAG GGCTCCAGCGCACTCCCGGCCCTCCTCCTTTAGCTGTGGGCGGGGCTCAGGGGCGCGTGCGTCCTGCCCT CCCTGTGCGCGCGCCGCCCCAGCATGCCCCGGGAGCGCGGGCGGCGGGCCCCTTGGTCCTCAGGCGGCCG TGGCGGCGGTGGCGGCGGTTGGGCCGAGGCAGGCGGCCTCAGTGGCCGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| THOP1_1 ↗ | 19:2,785,503 | 正股 | 2,785,454–2,785,513 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：689 aa
THOP1 蛋白質屬於 peptidase M3 家族。現有來源僅提供家族分類，未提供可據以描述其結構域、功能區域或序列特徵的資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
THOP1 的定位資料為細胞質；來源未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- EPN2O95208-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Calm3P62161 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
來源將 THOP1 描述為單體，未列出其與其他蛋白質形成複合體或實體結合的夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | THOP1 參與少於 20 個胺基酸殘基的神經胜肽代謝及細胞質胜肽降解，也能降解 amyloid-beta precursor protein 並產生 amyloidogenic fragments；另可藉由降解 CNR1 的拮抗胜肽 hemopressin 調節 cannabinoid signaling pathway，此作用為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in the metabolism of neuropeptides under 20 amino acid residues long. Involved in cytoplasmic peptide degradation. Able to degrade the amyloid-beta precursor protein and generate amyloidogenic fragments. Also acts as a regulator of cannabinoid signaling pathway by mediating degradation of hemopressin, an antagonist peptide of the cannabinoid receptor CNR1 (By similarity) PMID 17251185 ↗ · PMID 7639763 ↗ |
| 分子活性 | 對長度為 5 至 15 個胺基酸殘基的底物，THOP1 較偏好切開 P1、P2 與 P3′位置帶有疏水性殘基，且 P1′位置為小型殘基的鍵結。 | 推論支持 | 證據與來源Preferential cleavage of bonds with hydrophobic residues at P1, P2 and P3' and a small residue at P1' in substrates of 5 to 15 residues. PMID 7639763 ↗ |
| 分子活性 | THOP1 每個亞基可結合一個鋅離子；來源未提供該結合的其他條件或功能影響。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Monomer | 推論支持 | |
| 細胞定位 | THOP1 的定位資料為細胞質；此筆資料未提供定位變化條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCATGCCCCGGGAGCGCGGGCGGCGGGCCCCTTGGTCCT40CAGGCGGCCGTGGCGGCGGTGGCGGCGGTTGGGCCGAGGC80AGGCGGCCTCAGTGGCCGAGGTGGCTGGACGCGTAGCAGG120TGGAAGGAGGGAGGGAGCCGCAGGCGCAGACCCACCCGCC160ATGAAGCCCCCCGCAGCCTGTGCAGGAGACATGGCGGACG200CAGCATCTCCGTGCTCTGTGGTAAACGACCTGCGGTGGGA240CCTGAGTGCCCAGCAGATAGAGGAGCGCACCAGGGAGCTC280ATCGAGCAGACCAAGCGCGTGTATGACCAGGTTGGCACCC320AGGAGTTTGAGGACGTGTCCTACGAGAGCACGCTCAAGGC360GCTGGCCGATGTGGAGGTCACCTACACAGTTCAGAGGAAT400ATCCTTGACTTCCCCCAGCATGTTTCCCCCTCCAAGGACA440TCCGGACAGCCAGCACAGAGGCCGACAAGAAGCTCTCTGA480GTTCGACGTGGAGATGAGCATGAGGGAGGACGTGTACCAG520AGGATCGTGTGGCTCCAGGAGAAAGTTCAGAAGGACTCAC560TGAGGCCCGAGGCTGCGCGGTACCTGGAGCGGCTAATCAA600GCTGGGCCGGAGAAATGGGCTTCACCTCCCCAGAGAGACT640CAGGAAAACATCAAACGCATCAAGAAGAAGCTGAGCCTTC680TGTGCATCGACTTCAACAAGAACCTGAACGAGGACACGAC720CTTCCTGCCCTTCACGCTCCAGGAGCTAGGAGGGCTCCCC760GAGGACTTTCTGAACTCCCTGGAGAAGATGGAGGACGGCA800AGTTGAAGGTCACCCTCAAGTACCCCCATTACTTCCCCCT840CCTGAAGAAATGCCACGTGCCTGAGACCAGGAGGAAAGTG880GAGGAGGCCTTCAACTGCCGGTGCAAGGAGGAGAACTGCG920CTATCCTCAAGGAGCTGGTGACGCTGCGGGCCCAGAAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。