基因總覽
THBS4 是蛋白質編碼基因，產物 thrombospondin 4 為 thrombospondin 家族的黏附性糖蛋白。其蛋白質包含 Laminin G-like、EGF-like、TSP type-3 重複序列及 TSP C-terminal 等區域，並具有細胞附著位點。這些結構特色構成其與細胞及細胞外基質發生相互作用的分子基礎；其更具體的生物學作用依不同組織狀態而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000350881 ★ | 80,035,348–80,083,287 | 22 |
| ENST00000854343 | 80,035,312–80,084,042 | 21 |
| ENST00000854344 | 80,035,312–80,084,042 | 22 |
| ENST00000970348 | 80,035,312–80,084,042 | 22 |
| ENST00000970349 | 80,035,312–80,084,042 | 21 |
| ENST00001132735 | 80,035,312–80,084,042 | 22 |
| ENST00000511733 | 80,036,023–80,084,042 | 22 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thrombospondin 4 是黏附性糖蛋白，能介導細胞與細胞之間，以及細胞與細胞外基質（ECM）之間的相互作用。它也會結合 ECM 的結構性蛋白質，並在組織受損時調節 ECM，參與心臟的保護性與適應性基質重塑。這些作用與細胞增殖、移動、黏附及附著等過程相關。
在心臟中，thrombospondin 4 與壓力負荷下的適應反應、心肌功能及重塑有關。它也參與內質網壓力反應：透過與 activating transcription factor 6 alpha（ATF6）的作用，促進適應性內質網壓力反應因子的產生，並保護心肌免受壓力負荷影響。
此外，thrombospondin 4 與發炎反應及神經損傷後的反應相關，包括調節血管發炎，以及中樞神經系統（CNS）損傷後的發炎反應。周邊神經受傷後，它可能參與脊髓突觸前敏感性增加及神經病理性疼痛狀態；這些作用以可能性描述，並非確定結論。
依相似性推定，thrombospondin 4 也可能在損傷後，以 NOTCH1 依賴的方式調節來自腦室下區（SVZ）微環境的保護性星狀膠質細胞生成。此項作用屬於相似性推定，不能視為已確立的功能。
Promoter 與基因調控
>THBS4 ENST00000350881 GRCh38 chr5:80034348-80035448 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCCAGTTTGTGGCTTATTAAACTTTGAAATGGAATTATTTGAGACATAAAAGAGATAGCAATACTTTGC TGGATGTTCTCCATTAGTCGAGATTGTTACAGAGGAGAAATTTTTGCCACTGTTTATCAAATATTTTTTC CTCTAGTTAATCCATATCATTCCGGGAGCTTTGCCCAGGAAAAGGACGAATTACTTGCGTTCCTCCGATC TCTTTCAAGTTCTACTCCCGTACCTTTAAACTGTCACACGGAATCTTTGGTGACAGAGGAATAGAGGTGG GCAAGCAGGGCGTTTGGAAACCATACTGAAAACGAATTATCCATAAAGCACAGATTCACCAGCCTAGAAA TGGCTCTGTCTGGATGGATTCCTTGAGATGTGTTTTATCTCCATTAAAAACACAACAACTTTCAAACTTT CACTGTGTCTCAAAATGATAGAGAAAAAAATTCAGCCTTTCAAGTATTCAAGAAAAGCTTGAAGAAATAA AAGAAACTCGCTGCTCTCTGGGCCACTTTAGGAGGCAGAGCGTTCCTGGAGAACTTCAGGATTCATTCGC AAGGGAACCCAAGGTGGGCATTCAAAGCCGATCCAAAGGATATTCTTCTTTTTAGAAAACAAAAGGAGCG CAAGGAGTAGGGGACTGAAGGTGCCCAAAGCTAGTGGGTCAGTGTCACTTTCTTCCTCCCTTTCGCCCCT TTCCTCCCGCTCCTTTCTCCCCTGTGGTCTCTGCTCAGCACCCCTTTCTCTCCAGCCCCGACTGCCCATC TTCGCCCCTACCCTCGCGCGTCGGGGCCGTGTCTACACCCACCCCAGGACCTGGTCCGTCCAGGCTCCTT CCCATCCTCACACCCGCGCCTTTCTCCCTGCGGCCCCGGCTCGCTGCTCCAGCTGCCCAGCTCTTCCCAG GACAGGGGATCCCGCCAAGGGGGCCGCCCCCGCCCCGGCCCTCCCCCGCCCGGCCGCACCATAAAGCGCC CGGCCGCTGCCGCGGAGCCCAGCAGCCAGCTCCCCAGCACCGCACGGCGGGGACGCGAGCGCGCCCCCGA CGGCAGCCCGGACGCCGAGCACGGGTCACCTGCGGCGCCGGCCCGGGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| THBS4_2 ↗ | 5:79,991,332 | 正股 | 79,991,283–79,991,342 |
| THBS4_1 ↗ | 5:80,035,348 | 正股 | 80,035,299–80,035,358 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_936QPC · promoter · 80035048–80035358 · regulatory
· motif · 80032280–80032294 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：961 aa
thrombospondin 4 長 961 個胺基酸，N 端具有 26 個胺基酸的訊號序列。其結構包含 Laminin G-like、4 個 EGF-like 區域（其中 EGF-like 2 與 3 為鈣結合型）、8 個 TSP type-3 重複序列及 TSP C-terminal 區域。另註有一段無序區與細胞附著位點。
蛋白質三維結構
細胞內定位
thrombospondin 4 註記位於內質網與肌漿網，也會分泌至細胞外空間及細胞外基質。 這些資料同時涵蓋細胞內與分泌後的位置，未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
未繪示構造：Sarcoplasmic reticulum。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
thrombospondin 4 以二硫鍵連結形成同源五聚體。資料另記載它與 PTBP3 及 NOTCH1 相互作用；其中 NOTCH1 的互作註記為依相似性推定。thrombospondin 4 透過 EGF-like 3 鈣結合區與 ATF6 相互作用，並促進 ATF6 的加工、活化及移入細胞核。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | thrombospondin 4 是黏附性糖蛋白，可介導細胞間及細胞與細胞外基質的相互作用，並涉及細胞增殖、移動、黏附與附著。它結合細胞外基質結構蛋白，於組織損傷時調節基質，參與心臟保護性及適應性重塑，也涉及壓力負荷下的心臟反應、心肌功能與重塑。它透過與 ATF6 相互作用參與內質網壓力反應，並與中樞神經系統損傷後發炎、血管發炎調節相關；周邊神經損傷後可能參與脊髓突觸前敏感性及神經病理性疼痛。依相似性推定，它可能以 NOTCH1 依賴方式調節損傷後 SVZ 的保護性星狀膠質細胞生成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adhesive glycoprotein that mediates cell-to-cell and cell-to-matrix interactions and is involved in various processes including cellular proliferation, migration, adhesion and attachment, inflammatory response to CNS injury, regulation of vascular inflammation and adaptive responses of the heart to pressure overload and in myocardial function and remodeling. Binds to structural extracellular matrix (ECM) proteins and modulates the ECM in response to tissue damage, contributing to cardioprotective and adaptive ECM remodeling. Plays a role in ER stress response, via its interaction with the activating transcription factor 6 alpha (ATF6) which produces adaptive ER stress response factors and protects myocardium from pressure overload. May contribute to spinal presynaptic hypersensitivity and neuropathic pain states after peripheral nerve injury. May play a role in regulating protective astrogenesis from the subventricular zone (SVZ) niche after injury in a NOTCH1-dependent manner (By similarity) PMID 19441079 ↗ |
| 交互作用 | thrombospondin 4 形成由二硫鍵連結的同源五聚體，並與 PTBP3 相互作用。它與 NOTCH1 的互作屬依相似性推定。thrombospondin 4 透過 EGF-like 3 鈣結合區與 ATF6 相互作用，並促進 ATF6 的加工、活化及核轉位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homopentamer; disulfide-linked. Interacts with PTBP3. Interacts with NOTCH1 (By similarity). Interacts (via EGF-like 3; calcium-binding domain) with ATF6 and facilitates its processing, activation and nuclear translocation PMID 19441079 ↗ · PMID 22682248 ↗ · PMID 7852353 ↗ |
| 細胞定位 | thrombospondin 4 註記位於內質網及肌漿網，也會分泌至細胞外空間與細胞外基質。 | 推論支持 | 證據與來源Endoplasmic reticulum; Sarcoplasmic reticulum; Secreted; Secreted, extracellular space; Secreted, extracellular space, extracellular matrix |
核酸與蛋白質序列
AGCAGCCAGCTCCCCAGCACCGCACGGCGGGGACGCGAGC40GCGCCCCCGACGGCAGCCCGGACGCCGAGCACGGGTCACC80TGCGGCGCCGGCCCGGGCGCCGACCGAGGTTCAACGCACG120GCCCGGGGACCCCCAGGCGGGGCCAACGCCGCCGTCGCCC160CCGGCCTCGCGGGGAGCAGGAAGAGCCAACATGCTGGCCC200CGCGCGGAGCCGCCGTCCTCCTGCTGCACCTGGTCCTGCA240GCGGTGGCTAGCGGCAGGCGCCCAGGCCACCCCCCAGGTC280TTTGACCTTCTCCCATCTTCCAGTCAGAGGCTAAACCCAG320GCGCTCTGCTGCCAGTCCTGACAGACCCCGCCCTGAATGA360TCTCTATGTGATTTCCACCTTCAAGCTGCAGACTAAAAGT400TCAGCCACCATCTTCGGTCTTTACTCTTCAACTGACAACA440GTAAATATTTTGAATTTACTGTGATGGGACGCTTAAACAA480AGCCATCCTCCGTTACCTGAAGAACGATGGGAAGGTGCAT520TTGGTGGTTTTCAACAACCTGCAGCTGGCAGACGGAAGGC560GGCACAGGATCCTCCTGAGGCTGAGCAATTTGCAGCGAGG600GGCCGGCTCCCTAGAGCTCTACCTGGACTGCATCCAGGTG640GATTCCGTTCACAATCTCCCCAGGGCCTTTGCTGGCCCCT680CCCAGAAACCTGAGACCATTGAATTGAGGACTTTCCAGAG720GAAGCCACAGGACTTCTTGGAAGAGCTGAAGCTGGTGGTG760AGAGGCTCACTGTTCCAGGTGGCCAGCCTGCAAGACTGCT800TCCTGCAGCAGAGTGAGCCACTGGCTGCCACAGGCACAGG840GGACTTTAACCGGCAGTTCTTGGGTCAAATGACACAATTA880AACCAACTCCTGGGAGAGGTGAAGGACCTTCTGAGACAGC920AGGTTAAGGAAACATCATTTTTGCGAAACACCATAGCTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。