基因總覽
THBS3 是蛋白質編碼基因，其產物 thrombospondin 3 為 thrombospondin 家族的黏附性醣蛋白。這類蛋白可參與細胞與細胞、細胞與基質之間的互動；thrombospondin 3 亦能與 fibrinogen、fibronectin、laminin 及 type V collagen 結合。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000368378 ★ | 155,195,588–155,207,897 | 23 |
| ENST00000541576 | 155,195,584–155,207,982 | 22 |
| ENST00000457183 | 155,195,584–155,207,982 | 21 |
| ENST00000541990 | 155,195,584–155,207,899 | 22 |
| ENST00000902273 | 155,195,584–155,207,982 | 22 |
| ENST00000902274 | 155,195,584–155,207,982 | 21 |
| ENST00000902275 | 155,195,584–155,207,982 | 23 |
| ENST00000960679 | 155,195,584–155,207,982 | 21 |
| ENST00000960680 | 155,195,584–155,207,982 | 23 |
| ENST00000960681 | 155,195,584–155,207,982 | 21 |
| ENST00001037013 | 155,195,584–155,207,982 | 22 |
| ENST00001037015 | 155,195,584–155,207,982 | 22 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thrombospondin 3 是黏附性醣蛋白，參與細胞彼此之間，以及細胞與細胞外基質之間的互動。這些作用關係呈現其在細胞接觸與基質接觸中的角色；現有資料未進一步說明其作用所依賴的具體分子機制或生理條件。
此蛋白可與 fibrinogen、fibronectin、laminin 及 type V collagen 結合。這些結合對象涵蓋不同的蛋白質，包括細胞外基質相關分子；來源僅支持其具有結合能力，未指出結合的細節、各對象之間的差異，或這些結合如何調節細胞行為。
因此，THBS3 的功能可概括為透過黏附相關互動，連結細胞間及細胞與基質的接觸，並具有與多種蛋白質結合的能力。現有來源未提供特定組織、實驗系統、調控條件或下游結果，故不宜據此推定更細緻的生物學作用。
Promoter 與基因調控
>THBS3 ENST00000368378 GRCh38 chr1:155207797-155208897 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTCTTGCCAAACTGCACGTGGCCTGTACTGCTCCAGGGCCCCTTGGGGCTCGTCCCCGAGCGGGGACTG CGGGGGGGTCCCCCGAGCAGCATGTTTTCCACAGCGCGTTATGTTTGGAGCGGGCCCTGCGCCGCCTGTC GCCATGGAAACAAAACAGGGGCGGTGGCGGCGGCCGGAGCGGAGGCCGGGCTGGGGCTTGGGTGGGGGAG GGGAAGAGAGGCTCGCAGGCTGTCGCTTAGGTGACGGGAACTCAGGCGCCCCTCTGCTTCATCCGGGTCA CGGCCCGTCCGCTAGTACCCACAGTGTTCCACAGTCTGGTCCTTGGCTCCTCGCCTGTACCCCTGGTCTT CTGCGCCTGTCCCTGGTGTCCCTTTCCTCTTTTTTGGTTTCTTCACTCTGACCTCACTGACCACTGCTTT AGATTCTCCCTTCAGTTCCCGTCAGACGCTTCCAGACTCCCAAGCTTTCCTACGAATGAGGGAAAATGGA GAAACAGGCACTTGTCAGGGGACCCCCCACCCTAATAAAGAGCACTTGCTCCGCCAGAACAGCAAAATTC ATGCCATGTGGGCATCCCTGGGCACTATAGCAAGCTAGTTGCGGCCACTCCCTTGGCATCCTTTCCTGCC AGCTGTGGAATAATGCCCACTGTCTAGCACTGCCCCTGCCAGGGGTTCTTGCCTTCCACAATCGTGGCTT CCAGAAAACAGTGGCATTCGGTAGCGCTGTGTGCCGAGACCCCCAACAATGATGACTGCGGAGAGGGAGG CACCTGGGGGAGGATCATTAGGGAGAGGTAGAAAGCAGGGAGGCCTCCAGGATTCTTTCCCAGTGCCCCT GGTTCCCAGAGCTGATGATGCCTCCAGGGTGATTGGCAGCTCTTTGTTTCAGCCCCCCCTCACCCGCCTG CTGGCCCCCCCTCCAATTCTGTCCCTCCGCCCCCCGGCTCCTGCTCTCTCCGCCTAGCCTTTTCCCCTCC CAGCTGCCTGCCTGCCAGGGGTAGTGAGCCGGCTGAGAGGCATGGAGACGCAGGAACTTCGGGGGGCCCT GGCTCTTCTCCTCCTTTGCTTTTTCACATCTGCCAGTCAGGATCTGCAGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| THBS3_1 ↗ | 1:155,207,895 | 負股 | 155,207,885–155,207,944 |
| THBS3_2 ↗ | 1:155,209,118 | 負股 | 155,209,108–155,209,167 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_CKDSD · enhancer · 155206724–155207886 · regulatory
ENSR1_53CHN22 · CTCF_binding_site · 155207008–155207029 · regulatory
ENSR1_53CHN28 · CTCF_binding_site · 155207054–155207075 · regulatory
ENSR1_CKDSG · promoter · 155207887–155209257 · regulatory
ENSR1_53CHNB4 · CTCF_binding_site · 155208752–155208773 · regulatory
ENSR1_53CHNDS · CTCF_binding_site · 155209346–155209367 · regulatory
ENSR1_B35RND · enhancer · 155211482–155212045 · regulatory
· motif · 155207010–155207026 · motif
· motif · 155207056–155207072 · motif
· motif · 155207229–155207242 · motif
· motif · 155207229–155207242 · motif
· motif · 155207282–155207290 · motif
· motif · 155208482–155208499 · motif
· motif · 155208493–155208500 · motif
· motif · 155208493–155208506 · motif
· motif · 155208684–155208694 · motif
· motif · 155208731–155208741 · motif
· motif · 155208754–155208770 · motif
· motif · 155208847–155208860 · motif
· motif · 155208847–155208860 · motif
· motif · 155209127–155209140 · motif
· motif · 155209127–155209140 · motif
· motif · 155209154–155209162 · motif
· motif · 155209154–155209171 · motif
· motif · 155209216–155209227 · motif
· motif · 155209226–155209235 · motif
· motif · 155209250–155209260 · motif
· motif · 155209290–155209305 · motif
· motif · 155209348–155209364 · motif
· motif · 155210923–155210936 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：956 aa
thrombospondin 3 長 956 個胺基酸，屬於 thrombospondin 家族。蛋白質包含 Laminin G-like 區域、三個 EGF-like 區域、八個 TSP type-3 重複序列，以及 TSP C-terminal 區域；其中前兩個 EGF-like 區域標註為 calcium-binding。另有部分區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CALRP27797 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLSTP36957 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEK7Q8TDX7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
thrombospondin 3 被註記為以二硫鍵連結的寡聚體。此資料描述其寡聚狀態及連結方式，並未指出寡聚體的組成成員。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | thrombospondin 3 是黏附性醣蛋白，可介導細胞彼此之間，以及細胞與基質之間的互動。它也能與 fibrinogen、fibronectin、laminin 和 type V collagen 結合；來源未進一步交代這些結合的條件或功能後果。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Adhesive glycoprotein that mediates cell-to-cell and cell-to-matrix interactions. Can bind to fibrinogen, fibronectin, laminin and type V collagen |
| 交互作用 | thrombospondin 3 被描述為寡聚體，且其亞基之間以二硫鍵連結。此註記提供寡聚狀態與連結方式的資訊，但未指出寡聚體的組成或其形成條件。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTAGTGAGCCGGCTGAGAGGCATGGAGACGCAGGAACTTC40GGGGGGCCCTGGCTCTTCTCCTCCTTTGCTTTTTCACATC80TGCCAGTCAGGATCTGCAGGTAATTGACCTGCTGACTGTG120GGCGAGTCTCGGCAGATGGTAGCTGTGGCAGAGAAGATCC160GGACAGCCTTGCTCACTGCTGGGGACATCTACCTCTTATC200CACCTTCCGCCTGCCCCCCAAGCAGGGTGGTGTCCTCTTT240GGCCTCTATTCTCGCCAAGACAACACTCGATGGCTGGAGG280CCTCTGTTGTAGGCAAGATCAACAAAGTACTGGTGCGATA320CCAGCGGGAGGATGGCAAAGTCCACGCCGTGAACCTACAG360CAAGCGGGCCTGGCTGATGGGCGCACACACACAGTTCTCC400TGCGACTCCGAGGTCCCTCCAGACCCAGCCCTGCCCTACA440TCTCTACGTGGACTGCAAACTGGGTGACCAACATGCAGGC480CTTCCAGCACTGGCCCCCATTCCTCCAGCGGAGGTCGATG520GGCTGGAGATTAGGACTGGACAGAAGGCGTATTTGAGGAT560GCAGGGCTTTGTGGAATCTATGAAAATTATTCTGGGTGGG600TCCATGGCCCGGGTAGGAGCCCTGAGTGAGTGTCCATTCC640AAGGGGACGAGTCCATCCACAGTGCAGTGACCAATGCACT680GCACTCCATTCTAGGGGAGCAGACCAAGGCGCTGGTCACC720CAACTCACCCTCTTCAACCAGATCCTGGTGGAGCTGCGGG760ATGATATACGAGACCAGGTGAAGGAAATGTCCCTGATCCG800AAACACCATTATGGAGTGTCAGGTGTGCGGCTTCCATGAG840CAGCGTTCCCACTGCAGCCCCAATCCCTGCTTCCGAGGTG880TGGACTGCATGGAAGTGTACGAGTACCCAGGCTACCGCTG920TGGGCCCTGCCCCCCTGGCCTGCAGGGCAACGGCACCCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。