演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

THBS1TSP1

thrombospondin 1

THBS1 編碼 thrombospondin 1,是具有黏附作用的多功能醣蛋白,參與細胞間及細胞與基質的互動,並影響發炎、血管新生與組織修復等過程。

Homo sapiens15q14UniProt P07996
OFFICIAL SYMBOL
THBS1
CHROMOSOME
15
UNIPROT
P07996
PDB / ALPHAFOLD
1UX6
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

THBS1 是蛋白質編碼基因,產物 thrombospondin 1 屬於 thrombospondin family。這是一種具黏附作用的多功能醣蛋白,可介導細胞彼此之間,以及細胞與細胞外基質之間的互動。蛋白質具有多個不同區域,包括 Laminin G-like、VWFC、TSP type-1、EGF-like 與 TSP C-terminal 等結構域,並含有多個 TSP type-3 重複序列。其結構特色與其作為細胞及基質互動介面的角色相呼應;具體生物作用則依不同受體與情境而異。

Official symbol
THBS1
Gene name
thrombospondin 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11785
UniProt
P07996
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TSP1THBSTSPTHBS-1TSP-1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q14
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegTHBS1pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:39,580,130–39,599,466
Gene span
19,337 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000260356 ★39,581,079–39,599,46622
ENST0000088075039,580,130–39,599,46623
ENST0000088075239,580,397–39,599,46621
ENST0000111593339,580,397–39,590,40513
ENST0000111593439,580,397–39,587,8528
ENST0000113334639,580,397–39,599,46622
ENST0000088075139,580,405–39,599,46623
ENST0000039759139,581,079–39,582,4073

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

thrombospondin 1 可作為細胞黏附相關的分子,介導細胞與細胞、以及細胞與細胞外基質之間的互動。其作用涵蓋多種生物過程,包括發炎調節、血管新生、傷口癒合、活性氧(ROS)與一氧化氮(NO)訊號、細胞凋亡、細胞衰老,以及細胞自我更新與幹性;也與心血管及代謝恆定有關。不同作用可經由不同受體或訊號途徑發生,不能視為單一方向的調節效果。

在免疫調節方面,thrombospondin 1 可透過自分泌回饋迴路,抑制樹突細胞活化及細胞激素釋放,因而有助於發炎消退與免疫恆定。它是 CD47 的配體,可經 CD47 調節 NO 訊號;依相似性推定,這也可能使其具有升壓作用並支持血壓。thrombospondin 1 經 CD47 亦與傷口癒合受到負向調節有關,但該作用依相似性推定。

在血管與氧化壓力相關作用中,thrombospondin 1 可依情境透過 CD36 或 CD47 抑制血管新生。它經 CD47 參與內皮細胞衰老,並提高 NADPH oxidase NOX1 的含量與活化,進而產生過量 ROS;另可透過依賴 TP53-CDKN1A-RB1 訊號的方式促進細胞衰老。它也可作為 SIRPA 的配體,在非吞噬細胞中透過與 SIRPA 的作用,刺激 NADPH oxidase 衍生的 ROS 生成。

在細胞命運與代謝方面,thrombospondin 1 經 CD47 訊號抑制幹細胞自我更新,可能與調節轉錄因子 POU5F1/OCT4、SOX2、MYC/c-Myc 及 KLF4 有關;這項機制屬於依相似性推定。當游離脂肪酸升高時,它也可能透過 CD36 促使足細胞凋亡。於飲食誘導的肥胖中,thrombospondin 1 可能藉由加劇脂肪組織發炎而參與代謝功能障礙,且部分影響可能來自脂肪細胞增生增加;它也可能參與正常老化期間的代謝失調等年齡相關狀況。

此外,thrombospondin 1 可透過與 ATF6 的作用參與內質網壓力反應,並與產生適應性內質網壓力反應因子有關。上述作用顯示其功能涉及多種生理調節,但部分細節僅有依相似性推定的支持,應保留其推論性質。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39581079 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>THBS1 ENST00000260356 GRCh38 chr15:39580079-39581179 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAAATACAATAATAGGCAGAGAGTAATTTATTACTCTATGGGTCTGCTCTGTAAATAGCTGAAGACTCT
GGAGCCAGATGGTTCTGCAAATTCTCCAAACAGGAGTCACGTTAAGAAGCACGAGTGGGCACAAAAACTG
TTTTTCAAGACACAATTTCAATTTGGCTTGTGGAAACTGGATACGAGTAAGTTTCCTTAAAATTCGAGTA
GAAAGCAGCTGTCCTCCCCGGGCCCCTTGATGAGAATACGCACACCGCCCCCAAGCGGCCGGCCGAGGGA
GCGCCGCGGCAGCGGGAGAGGCGTCTCTGTGGGCCCCCTGGCAGCCGCGGCAGGAAAGGGCCCGAAGGCA
GCGAAGGCGAACGCGGCGCACCAACCTGCCGGCCCCGCCGACGCCGCGCTCACCTCCCTCCGGGGCGGGC
GTGGGGCCAGCTCAGGACAGGCGCTCGGGGGACGCGTGTCCTCACCCCACGGGGACGGTGGAGGAGAGTC
AGCGAGGGCCCGAGGGGCAGGTACTTTAACGAATGGCTCTCTTGGTGTCCCCTGCGCCCCGTCGGCCCAT
TTTTCTTTTTACAAAACGGGCCCAGTCTCTAGTATCCACCTCTCGCCATCAACCAGGCATTCCGGGAGAT
CAGCTCGCCCGAAAGCCCCTGCGCCACCCCGCGGGCCCTCCTAGGTGGTCTCCCCAGCCCCGTCCCTTTT
CGGGATGCTTGCTGATCACCCCGAGCCCGCGTGGCGCAAGAGTACGAGCGCCGAGCCCGTGCGCGCCAAG
GCTGCGTGGGCGGGCACCGACTTTTCTGAGAAGTTCTAGTGCTCCCAAGCCCCGACCCCCGCCCCCTTCA
CTTTCTAGCTGGAAAGTTGCGCGCCAGGCAGCGGGGGGCGGAGAGAGGAGCCCAGACTGGCCCCCACCTC
CCGCTTCCTGCCCGGCCGCCGCCCATTGGCCGGAGGAATCCCCAGGAATGCGAGCGCCCCTTTAAAAGCG
CGCGGCTCCTCCGCCTTGCCAGCCGCTGCGCCCGAGCTGGCCTGCGAGTTCAGGGCTCCTGTCGCTCTCC
AGGAGCAACCTCTACTCCGGACGCACAGGCATTCCCCGCGCCCCTCCAGCC
THBS1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
THBS1_1 ↗15:39,581,079正股39,581,030–39,581,089

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_B9T46 · enhancer · 39578850–39579588 · regulatory

ENSR15_5CBCPN · CTCF_binding_site · 39580193–39580214 · regulatory

ENSR15_5CBCQB · CTCF_binding_site · 39580330–39580351 · regulatory

ENSR15_9KP6R · promoter · 39580589–39581089 · regulatory

ENSR15_5CBCS6 · CTCF_binding_site · 39580726–39580747 · regulatory

ENSR15_5CBCTF · CTCF_binding_site · 39581001–39581022 · regulatory

ENSR15_5CBD48 · CTCF_binding_site · 39582257–39582278 · regulatory

ENSR15_9KP8D · promoter · 39586071–39586571 · regulatory

· motif · 39579581–39579590 · motif

· motif · 39579792–39579807 · motif

· motif · 39579792–39579807 · motif

· motif · 39580195–39580211 · motif

· motif · 39580332–39580348 · motif

· motif · 39580728–39580744 · motif

· motif · 39580897–39580907 · motif

· motif · 39580904–39580914 · motif

· motif · 39580952–39580962 · motif

· motif · 39580979–39580989 · motif

· motif · 39581003–39581019 · motif

· motif · 39581031–39581040 · motif

· motif · 39582259–39582275 · motif

THBS1 的表現可受 PGE2、S. aureus 與 lipopolysaccharide 誘導;動脈及肺實質在受傷或承受壓力後也會出現誘導表現。此外,正常老化期間,血管(包括動脈)中的表現會增加。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1170 aa

1 aa1170 aa結構域功能區域基序重複區訊號胜肽
依 P07996 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

thrombospondin 1 長 1170 個胺基酸,含有訊號胜肽,以及 Laminin G-like、VWFC、TSP type-1、EGF-like 和 TSP C-terminal 結構域;另有八個 TSP type-3 重複序列。其 heparin-binding 區域位於序列前段。已註記一段參與三聚體形成及細胞外基質滯留的區域,以及一個 cell attachment site。這些特徵描述蛋白質的序列組成與區域註解。

訊號胜肽1–18 aa
結構域Laminin G-like65–270 aa
結構域VWFC316–373 aa
結構域TSP type-1 1379–429 aa
結構域TSP type-1 2435–490 aa
結構域TSP type-1 3492–547 aa
結構域EGF-like 1547–587 aa
結構域EGF-like 2646–690 aa
重複區TSP type-3 1691–726 aa
重複區TSP type-3 2727–762 aa
重複區TSP type-3 3763–785 aa
重複區TSP type-3 4786–821 aa
重複區TSP type-3 5822–844 aa
重複區TSP type-3 6845–882 aa
重複區TSP type-3 7883–918 aa
重複區TSP type-3 8919–954 aa
結構域TSP C-terminal958–1170 aa
功能區域Heparin-binding47–95 aa
功能區域Involved in retention in extracellular matrix (ECM); involved in trimer formation531–1152 aa
功能區域Disordered839–934 aa
基序Cell attachment site926–928 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1UX6…

PDB · 1UX6

X-ray · 1.90 A · A=834-1170

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Cell surface;Secreted, extracellular space, extracellular matrix;Endoplasmic reticulum;Sarcoplasmic reticulum

thrombospondin 1 可由凝血酶活化的血小板分泌;在細胞外 Ca(2+) 存在時,會結合細胞表面。 它也可納入纖維母細胞的細胞外基質,其中三聚體形式的 C-terminal 區域是基質滯留所需。 另有依相似性資料指出,蛋白質可在內質網與肌漿網中被偵測,並參與內質網壓力反應。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

未繪示構造:Cell surface;Sarcoplasmic reticulum。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TSP1THBS1FN1PCOLCETGFB1CD36HTRA1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

thrombospondin 1 以二硫鍵連結形成同源三聚體。它可結合 fibrinogen、fibronectin、laminin、type V collagen、heparin,以及 integrins alpha-V/beta-1、alpha-V/beta-3 和 alpha-IIb/beta-3。它透過 C-terminal domain 與 CD47 互作,並透過 TSP type I repeats 與 CD36 及 HRG 互作;HRG 的結合會阻斷 thrombospondin 1 經 CD36 產生的抗血管新生作用。它也與 SIRPA 互作並刺激其磷酸化,與 ATF6 互作則屬依相似性支持。與 FN1 的互作可受 TNFAIP6 增強;TNFAIP6 可能作為兩者之間的橋接分子。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能thrombospondin 1 是黏附性醣蛋白,介導細胞間及細胞與基質的互動,並參與發炎、血管新生、傷口癒合、ROS 與 NO 訊號、凋亡、衰老、幹細胞自我更新及心血管和代謝恆定。它可抑制樹突細胞活化與細胞激素釋放;作為 CD47、CD36 與 SIRPA 配體,參與多種依情境而異的調節。部分幹細胞、傷口癒合、脂肪代謝及 NO 相關作用為依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Adhesive glycoprotein that mediates cell-to-cell and cell-to-matrix interactions. Multifunctional, involved in inflammation, angiogenesis, wound healing, reactive oxygen species (ROS) signaling, nitrous oxide (NO) signaling, apoptosis, senescence, aging, cellular self-renewal, stemness, and cardiovascular and metabolic homeostasis. Negatively modulates dendritic cell activation and cytokine release, as part of an autocrine feedback loop, contributing to the resolution of inflammation and immune homeostasis. Ligand for receptor CD47. Modulates nitrous oxide (NO) signaling via CD47, hence playing a role as a pressor agent, supporting blood pressure (By similarity). Plays a role in endothelial cell senescence, acting via CD47, by increasing the abundance and activation of NADPH oxidase NOX1, and so generating excess ROS. Inhibits stem cell self-renewal, acting via CD47 signaling, probably by regulation of the stem cell transcription factors POU5F1/OCT4, SOX2, MYC/c-Myc and KLF4 (By similarity). Negatively modulates wound healing, acting via CD47 (By similarity). Ligand for receptor CD36. Involved in inducing apoptosis in podocytes in response to elevated free fatty acids, acting via CD36 (By similarity). Plays a role in suppressing angiogenesis, acting, depending on context, via CD36 or CD47. Promotes cellular senescence in a TP53-CDKN1A-RB1 signaling-dependent manner. Ligand for immunoglobulin-like cell surface receptor SIRPA. Involved in ROS signaling in non-phagocytic cells, stimulating NADPH oxidase-derived ROS production, acting via interaction with SIRPA. Plays a role in metabolic dysfunction in diet-induced obesity, perhaps acting by exacerbating adipose inflammatory activity; its effects may be mediated, at least in part, through enhanced adipocyte proliferation (By similarity). Plays a role in ER stress response, via its interaction with the activating transcription factor 6 alpha (ATF6) which produces adaptive ER stress response factors (By similarity). May be involved in age-related conditions, including metabolic dysregulation, during normal aging

PMID 10613822 ↗ · PMID 11134179 ↗ · PMID 1371676 ↗ · PMID 14568985 ↗ · PMID 15014436 ↗ · PMID 18285447 ↗ · PMID 19004835 ↗ · PMID 2430973 ↗ · PMID 24511121 ↗ · PMID 29042481 ↗ · PMID 32679764 ↗ · PMID 6489349 ↗ · PMID 8550562 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用thrombospondin 1 以二硫鍵形成同源三聚體,可結合 fibrinogen、fibronectin、laminin、type V collagen、heparin 及多種 integrins。它經 C-terminal domain 與 CD47、經 TSP type I repeats 與 CD36 和 HRG 互作;HRG 會阻斷其透過 CD36 產生的抗血管新生作用。另與 ATF6、FN1 和 SIRPA 互作;TNFAIP6 可增強其與 FN1 的互作,並可能充當橋接分子,而與 SIRPA 的互作會促進 SIRPA 磷酸化。含實驗來源
證據與來源

Homotrimer; disulfide-linked. Can bind to fibrinogen, fibronectin, laminin, type V collagen and integrins alpha-V/beta-1, alpha-V/beta-3 and alpha-IIb/beta-3. Binds heparin. Interacts (via the C-terminal domain) with CD47. Interacts (via the TSP type I repeats) with CD36; the interaction conveys an antiangiogenic effect. Interacts (via the TSP type I repeats) with HRG; the interaction blocks the antiangiogenic effect of THBS1 with CD36. Interacts with ATF6 (via lumenal domain) (By similarity). Interacts with FN1; this interaction is enhanced by TNFAIP6, which may act as a bridging molecule between FN1 and THBS1. Interacts with SIRPA; the interaction stimulates phosphorylation of SIRPA

PMID 101549 ↗ · PMID 10613822 ↗ · PMID 11134179 ↗ · PMID 1371676 ↗ · PMID 16407063 ↗ · PMID 18042364 ↗ · PMID 18065761 ↗ · PMID 18285447 ↗ · PMID 19004835 ↗ · PMID 24511121 ↗ · PMID 2478219 ↗ · PMID 6489349 ↗ · PMID 6693501 ↗ · PMID 8550562 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位thrombospondin 1 可由凝血酶活化的血小板分泌,並在細胞外 Ca(2+) 存在時結合細胞表面;它也會納入纖維母細胞的細胞外基質。三聚體形式的 C-terminal 區域是其滯留於細胞外基質所需。依相似性資料,蛋白質亦可在內質網與肌漿網中被偵測,並參與內質網壓力反應。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Cell surface; Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Endoplasmic reticulum; Sarcoplasmic reticulum; Secreted by thrombin-activated platelets and binds to the cell surface in the presence of extracellular Ca(2+). Incorporated into the extracellular matrix (ECM) of fibroblasts. The C-terminal region in trimeric form is required for retention in the ECM. Also detected in the endoplasmic reticulum and sarcoplasmic reticulum where it plays a role in the ER stress response (By similarity)

PMID 101549 ↗ · PMID 14568985 ↗ · PMID 6777381 ↗ · PMID 18285447 ↗ · PMID 6341993 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控THBS1 表現可受 PGE2、S. aureus 與 lipopolysaccharide 誘導;動脈及肺實質在受傷或承受壓力後也會被誘導表現。正常老化期間,血管中的 THBS1 表現增加,相關觀察涵蓋動脈。含實驗來源
證據與來源

Expression is induced by PGE2, S.aureus and lipopolysaccharide. Induced in arteries and lung parenchyma following injury or stress. Expression in vasculature, including arteries, increases in normal aging

PMID 14568985 ↗ · PMID 27742621 ↗ · PMID 29042481 ↗ · PMID 32679764 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000260356 · 7,789 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCCGCTGCGCCCGAGCTGGCCTGCGAGTTCAGGGCTCCT40
41GTCGCTCTCCAGGAGCAACCTCTACTCCGGACGCACAGGC80
81ATTCCCCGCGCCCCTCCAGCCCTCGCCGCCCTCGCCACCG120
121CTCCCGGCCGCCGCGCTCCGGTACACACAGGATCCCTGCT160
161GGGCACCAACAGCTCCACCATGGGGCTGGCCTGGGGACTA200
201GGCGTCCTGTTCCTGATGCATGTGTGTGGCACCAACCGCA240
241TTCCAGAGTCTGGCGGAGACAACAGCGTGTTTGACATCTT280
281TGAACTCACCGGGGCCGCCCGCAAGGGGTCTGGGCGCCGA320
321CTGGTGAAGGGCCCCGACCCTTCCAGCCCAGCTTTCCGCA360
361TCGAGGATGCCAACCTGATCCCCCCTGTGCCTGATGACAA400
401GTTCCAAGACCTGGTGGATGCTGTGCGGGCAGAAAAGGGT440
441TTCCTCCTTCTGGCATCCCTGAGGCAGATGAAGAAGACCC480
481GGGGCACGCTGCTGGCCCTGGAGCGGAAAGACCACTCTGG520
521CCAGGTCTTCAGCGTGGTGTCCAATGGCAAGGCGGGCACC560
561CTGGACCTCAGCCTGACCGTCCAAGGAAAGCAGCACGTGG600
601TGTCTGTGGAAGAAGCTCTCCTGGCAACCGGCCAGTGGAA640
641GAGCATCACCCTGTTTGTGCAGGAAGACAGGGCCCAGCTG680
681TACATCGACTGTGAAAAGATGGAGAATGCTGAGTTGGACG720
721TCCCCATCCAAAGCGTCTTCACCAGAGACCTGGCCAGCAT760
761CGCCAGACTCCGCATCGCAAAGGGGGGCGTCAATGACAAT800
801TTCCAGGGGGTGCTGCAGAATGTGAGGTTTGTCTTTGGAA840
841CCACACCAGAAGACATCCTCAGGAACAAAGGCTGCTCCAG880
881CTCTACCAGTGTCCTCCTCACCCTTGACAACAACGTGGTG920
921AATGGTTCCAGCCCTGCCATCCGCACTAACTACATTGGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。