基因總覽
THBD 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 thrombomodulin。其產物是單次穿膜的第一型膜蛋白，主要位於血管內皮細胞表面，具有細胞外區段、跨膜區段及短胞質區段。細胞外部分包含 C-type lectin domain 與多個 EGF-like domain，其中部分 EGF-like domain 帶有鈣結合註記。作為內皮細胞受體，thrombomodulin 參與多種生理過程的調節；其細胞外區域也包含與整合素結合相關的區段。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377103 ★ | 23,045,633–23,049,672 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
thrombomodulin 是血管內皮細胞受體，在止血、凝血、纖維蛋白溶解、發炎及血管新生等生理過程中具有調節作用。其功能之一是作為凝血酶的輔因子，促進血管內皮細胞表面的 protein C（PROC）活化，啟動活化 protein C 的抗凝血路徑。這顯示 thrombomodulin 可參與調整凝血反應，而非僅作為細胞表面的受體。
thrombomodulin 也能加速血漿 carboxypeptidase B2（CPB2）的活化。CPB2 可移除包括 kinins 與 anaphylatoxins 在內之受質的 C 端鹼性胺基酸；此作用會導致纖維蛋白溶解受到抑制。來源亦指出 thrombomodulin 可改變 protease-activated receptor 1（PAR1）的切割特異性，並抑制內皮細胞通透性與發炎；此項保護作用的敘述標示為依相似性推定。
在發炎調節方面，thrombomodulin 可藉由隔離 HMGB1，阻止 HMGB1 與 RAGE 等細胞受體接觸，進而限制其促發炎反應。這項作用與 thrombomodulin 作為抗凝血輔因子的功能有所區別，說明其調節發炎並非單由 protein C 活化路徑所致。整體來看，來源描述的功能涵蓋凝血與纖維蛋白溶解調節，以及內皮屏障和發炎反應的控制。
Promoter 與基因調控
>THBD ENST00000377103 GRCh38 chr20:23049572-23050672 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGACTCTGGACGAAATGGAAACCTCCTTAGCCGACCCGGGTGGGATCAGCTGGGATCCTGCGCGCTCCCC TGGGGGGTTGCCAGCCACTCTGTTGGGGTGCAAGAAGCACCATCCTTCGGAAGCTGGGCCGAAACTGGCC AGGCTGACTCGCTCCCACGCGCCCGCCCCTACCCGGCGCCGCAGCAATTCACCTGCCACCGCCTCTGAGC CGGGTCCGGACTTCGGCGCCCTGACAGTGTCCCCGCGACTTCCCCACCCGATGAGATGGGGTCTGGCGTT GGCCAGTGCGTGTCCAGGGACTCGCGGGTCCCTGGCCAGCCATGGGGCAGAGGGCGCTGGTGTTAGGCCA GTCTTCCCCACCCTGCCCCGTCACCCCAGCCACACCCACTGTCCTGTGAGGCCAAGCGCGCTCCGCTGGT TTCCTGAGCCAGGCACCTTGGCCGCGGACAGGATCCAGCTGTCTCTCCTTGCGATCCTGTCTTCGGGGAA GTCCACGTCCTAGGCAGGTCCTCCCAAAGTGCCCTTGGTGCCGATCACCCCTCCCAGCGTCTTGCAGGTC CTGTGCACCACCTCCCCCACTCCCCATTCAAAGCCCTCTTCTCTGAAGTCTCCGGTTCCCAGAGCTCTTG CAATCCAGGCTTTCCTTGGAAGTGGCTGTAACATGTATGAAAAGAAAGAAAGGAGGACCAAGAGATGAAA GAGGGCTGCACGCGTGGGGGCCCGAGTGGTGGGCGGGGACAGTCGTCTTGTTACAGGGGTGCTGGCCTTC CCTGGCGCCTGCCCCTGTCGGCCCCGCCCGAGAACCTCCCTGCGCCAGGGCAGGGTTTACTCATCCCGGC GAGGTGATCCCATGCGCGAGGGCGGGCGCAAGGGCGGCCAGAGAACCCAGCAATCCGAGTATGCGGCATC AGCCCTTCCCACCAGGCACTTCCTTCCTTTTCCCGAACGTCCAGGGAGGGAGGGCCGGGCACTTATAAAC TCGAGCCCTGGCCGATCCGCATGTCAGAGGCTGCCTCGCAGGGGCTGCGCGCAGCGGCAAGAAGTGTCTG GGCTGGGACGGACAGGAGAGGCTGTCGCCATCGGCGTCCTGTGCCCCTCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_9C5ZK · enhancer · 23046424–23046803 · regulatory
ENSR20_8N9ZH · enhancer · 23047119–23047313 · regulatory
ENSR20_57FCZB · CTCF_binding_site · 23047908–23047929 · regulatory
ENSR20_57FD7B · CTCF_binding_site · 23049198–23049219 · regulatory
ENSR20_B6KHQ · promoter · 23049662–23050189 · regulatory
ENSR20_C49QG · enhancer · 23050190–23051592 · regulatory
ENSR20_57FDGN · CTCF_binding_site · 23050790–23050811 · regulatory
ENSR20_57FDH9 · CTCF_binding_site · 23050921–23050945 · regulatory
ENSR20_9C634 · promoter · 23051593–23052077 · regulatory
· motif · 23047571–23047584 · motif
· motif · 23047571–23047584 · motif
· motif · 23047796–23047812 · motif
· motif · 23047910–23047926 · motif
· motif · 23048294–23048310 · motif
· motif · 23048294–23048310 · motif
· motif · 23049200–23049216 · motif
· motif · 23050792–23050808 · motif
· motif · 23050923–23050939 · motif
· motif · 23050926–23050942 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：575 aa
thrombomodulin 長 575 個胺基酸，含 18 個胺基酸的訊號序列。胞外區段位於第 19–515 位，接續第 516–539 位的螺旋型跨膜區，胞質區段為第 540–575 位。胞外部分包含 C-type lectin domain，以及六個 EGF-like domain；第 3 與第 6 個 EGF-like domain 標註為鈣結合區。第 481–515 位區段與 alpha-L/beta-2 及 alpha-M/beta-2 integrin 結合相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
thrombomodulin 是單次穿膜的第一型膜蛋白。 來源提供的是膜定位與拓撲分類，未指出定位改變的條件或異構型差異。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
- AIG1Q9NVV5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APOC4P55056 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD79AP11912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CIDEBQ9UHD4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYBC1Q9BQA9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EBPQ15125 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- F2P00734 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPX8Q8TED1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIR2DL3P43628 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MMGT1Q8N4V1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTIF3Q9H2K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MUC1P15941-11 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PDZK1IP1Q13113 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PHF24Q9UPV7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RHBDD2Q6NTF9-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC19A3Q9BZV2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC35C2Q9NQQ7-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM14BQ9NUH8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM35AQ53FP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM86BQ8N661 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMX2Q9Y320 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
thrombomodulin 與 thrombin（F2）互作，該互作會使 thrombin 的特異性由促凝血轉為抗凝血及抗纖維蛋白溶解。ANGP1 與 ANGP2 會抑制 thrombin/thrombomodulin 複合體產生活化 protein C 及 TAFIa/CPB2；PF4 則增強活化 protein C 的生成。thrombomodulin 與 HMGB1 的互作可抑制 HMGB1 的發炎活性。來源也列出其與 ITGAL、ITGAM 及 ITGB2 的互作，但未描述其功能結果。
疾病與遺傳關聯
THBD 變異與 thrombophilia due to thrombomodulin defect 有關，但 thrombomodulin 在血栓形成中的角色仍具爭議；靜脈血栓的發病可能還涉及 THBD 變異以外的遺傳或環境風險因素。THBD 變異也與 atypical hemolytic uremic syndrome 6 的疾病易感性相關，其他基因可能修飾其表型。該症候群屬複雜遺傳疾病，可見微血管病性溶血性貧血、血小板減少與腎衰竭，且不伴腸炎及腹瀉發作；與典型溶血性尿毒症候群相比，非典型形式預後較差，死亡率較高，並常進展至末期腎病。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | thrombomodulin 是內皮細胞受體，參與止血、凝血、纖維蛋白溶解、發炎與血管新生的調節。它促進血管內皮細胞表面的凝血酶活化 protein C，啟動抗凝血路徑；也加速 CPB2 活化，使其移除 kinins 或 anaphylatoxins 等受質的 C 端鹼性胺基酸，導致纖維蛋白溶解受抑制。依相似性推定，它可改變 PAR1 切割特異性並抑制內皮通透性與發炎；此外可隔離 HMGB1，避免其接觸 RAGE 等受體而引發發炎反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endothelial cell receptor that plays a critical role in regulating several physiological processes including hemostasis, coagulation, fibrinolysis, inflammation, and angiogenesis. Acts as a cofactor for thrombin activation of protein C/PROC on the surface of vascular endothelial cells leading to initiation of the activated protein C anticoagulant pathway. Also accelerates the activation of the plasma carboxypeptidase B2/CPB2, which catalyzes removal of C-terminal basic amino acids from its substrates including kinins or anaphylatoxins leading to fibrinolysis inhibition. Plays critical protective roles in changing the cleavage specificity of protease-activated receptor 1/PAR1, inhibiting endothelial cell permeability and inflammation (By similarity). Suppresses inflammation distinctly from its anticoagulant cofactor activity by sequestering HMGB1 thereby preventing it from engaging cellular receptors such as RAGE and contributing to the inflammatory response PMID 10761923 ↗ · PMID 15841214 ↗ · PMID 26663133 ↗ · PMID 29323190 ↗ · PMID 33836597 ↗ · PMID 9395524 ↗ |
| 交互作用 | thrombomodulin 與 ITGAL、ITGAM、ITGB2、thrombin/F2、ANGP1、ANGP2、PF4 及 HMGB1 互作。與 thrombin 的互作會使其特異性由促凝血轉為抗凝血及抗纖維蛋白溶解；ANGP1 與 ANGP2 抑制 thrombin/thrombomodulin 複合體產生活化 protein C 及 TAFIa/CPB2，PF4 則增強活化 protein C 的生成。與 HMGB1 的互作會抑制其發炎活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with ITGAL, ITGAM and ITGB2. Interacts with thrombin/F2; this interaction switches the specificity of thrombin from a procoagulant to an anticoagulant and antifibrinolytic protease. Interacts with ANGP1 and ANGP2; these interactions significantly inhibit the generation of activated PC and TAFIa/CPB2 by the thrombin/thrombomodulin complex. Interacts with PF4; this interaction enhances generation of activated protein C. Interacts with HMGB1; this interaction inhibits HMGB1 inflammatory activity PMID 10761923 ↗ · PMID 15841214 ↗ · PMID 27055590 ↗ · PMID 29323190 ↗ · PMID 9395524 ↗ |
| 細胞定位 | thrombomodulin 是膜蛋白，屬於單次穿膜的第一型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | |
| 疾病關聯 | thrombomodulin 缺陷相關血栓體質是一種以血栓傾向為特徵的止血異常，可能由影響 THBD 的變異造成。然而，thrombomodulin 在血栓形成中的作用仍有爭議；靜脈血栓的發病可能還需要 THBD 變異以外的遺傳或環境風險因素共同參與。 | 含實驗來源 | 證據與來源Thrombophilia due to thrombomodulin defect THPH12 A hemostatic disorder characterized by a tendency to thrombosis. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry. The role of thrombomodulin in thrombosis is controversial. It is likely that genetic or environmental risk factors in addition to THBD variation are involved in the pathogenesis of venous thrombosis MIM: 614486 PMID 12139752 ↗ · PMID 7811989 ↗ · PMID 9198186 ↗ |
| 疾病關聯 | 非典型溶血性尿毒症候群 6 是複雜遺傳疾病，特徵包括微血管病性溶血性貧血、血小板減少、腎衰竭，且沒有腸炎與腹瀉發作。相較典型形式，非典型病例預後較差、死亡率較高，也常進展至末期腎病。疾病易感性與影響 THBD 的變異相關，其他基因可能修飾表型。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hemolytic uremic syndrome, atypical, 6 AHUS6 An atypical form of hemolytic uremic syndrome. It is a complex genetic disease characterized by microangiopathic hemolytic anemia, thrombocytopenia, renal failure and absence of episodes of enterocolitis and diarrhea. In contrast to typical hemolytic uremic syndrome, atypical forms have a poorer prognosis, with higher death rates and frequent progression to end-stage renal disease. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. Other genes may play a role in modifying the phenotype MIM: 612926 PMID 19625716 ↗ · PMID 20513133 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATGTCAGAGGCTGCCTCGCAGGGGCTGCGCGCAGCGGCAA40GAAGTGTCTGGGCTGGGACGGACAGGAGAGGCTGTCGCCA80TCGGCGTCCTGTGCCCCTCTGCTCCGGCACGGCCCTGTCG120CAGTGCCCGCGCTTTCCCCGGCGCCTGCACGCGGCGCGCC160TGGGTAACATGCTTGGGGTCCTGGTCCTTGGCGCGCTGGC200CCTGGCCGGCCTGGGGTTCCCCGCACCCGCAGAGCCGCAG240CCGGGTGGCAGCCAGTGCGTCGAGCACGACTGCTTCGCGC280TCTACCCGGGCCCCGCGACCTTCCTCAATGCCAGTCAGAT320CTGCGACGGACTGCGGGGCCACCTAATGACAGTGCGCTCC360TCGGTGGCTGCCGATGTCATTTCCTTGCTACTGAACGGCG400ACGGCGGCGTTGGCCGCCGGCGCCTCTGGATCGGCCTGCA440GCTGCCACCCGGCTGCGGCGACCCCAAGCGCCTCGGGCCC480CTGCGCGGCTTCCAGTGGGTTACGGGAGACAACAACACCA520GCTATAGCAGGTGGGCACGGCTCGACCTCAATGGGGCTCC560CCTCTGCGGCCCGTTGTGCGTCGCTGTCTCCGCTGCTGAG600GCCACTGTGCCCAGCGAGCCGATCTGGGAGGAGCAGCAGT640GCGAAGTGAAGGCCGATGGCTTCCTCTGCGAGTTCCACTT680CCCAGCCACCTGCAGGCCACTGGCTGTGGAGCCCGGCGCC720GCGGCTGCCGCCGTCTCGATCACCTACGGCACCCCGTTCG760CGGCCCGCGGAGCGGACTTCCAGGCGCTGCCGGTGGGCAG800CTCCGCCGCGGTGGCTCCCCTCGGCTTACAGCTAATGTGC840ACCGCGCCGCCCGGAGCGGTCCAGGGGCACTGGGCCAGGG880AGGCGCCGGGCGCTTGGGACTGCAGCGTGGAGAACGGCGG920CTGCGAGCACGCGTGCAATGCGATCCCTGGGGCTCCCCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。