演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

THDYT5b

tyrosine hydroxylase

TH 編碼 tyrosine hydroxylase,參與兒茶酚胺生合成;其催化反應是由 L-tyrosine 生成 L-Dopa 的限速步驟。

Homo sapiens11p15.5UniProt P07101
OFFICIAL SYMBOL
TH
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P07101
PDB / ALPHAFOLD
6ZVP
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

tyrosine hydroxylase 是由 TH 基因編碼的蛋白質,屬於 biopterin-dependent aromatic amino acid hydroxylase 家族。此蛋白質長 528 個胺基酸,序列第 33 至 65 位被註記為無序區域。來源資料指出,它參與兒茶酚胺生合成,並在此途徑中負責一項關鍵反應;其具體底物與催化條件詳述於功能部分。

Official symbol
TH
Gene name
tyrosine hydroxylase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11782
UniProt
P07101
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DYT5b

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.5
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegTHpq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:2,163,929–2,171,968
Gene span
8,040 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000352909 ★2,163,929–2,171,81513
ENST000003336842,163,929–2,171,81511
ENST000003811752,163,929–2,171,81514
ENST000003811782,163,929–2,171,96814
ENST000008531172,163,929–2,171,96813
ENST000009412112,163,930–2,171,96813
ENST000009412122,163,930–2,171,81513
ENST000004120762,165,679–2,168,1066

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tyrosine hydroxylase 催化 L-tyrosine 轉換為 L-Dopa,這是兒茶酚胺生合成的限速步驟。反應使用 tetrahydrobiopterin 與分子氧,生成 L-Dopa 及氧化後的 tetrahydrobiopterin 產物。此步驟也列於 dopamine 生合成途徑中,位於由 L-tyrosine 生成 dopamine 的兩個步驟之首。

除 L-tyrosine 外,tyrosine hydroxylase 也能催化 phenylalanine 與 tryptophan 的羥化,但對這些底物的專一性較低;此項描述為依相似性推定。來源亦指出,該蛋白質正向調節出生後發育期間視網膜玻璃體血管的退化,此功能同樣標示為依相似性推定。

另有兩筆功能註記指出其缺乏催化活性,但未提供適用情境或條件,因此不能據此判定這項描述與上述催化功能之間的關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2171815 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TH ENST00000352909 GRCh38 chr11:2171715-2172815 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTGGGCGTGGGCTGGATGCGGGTGCCTGCGGGGCGGACATGGAACTTGGGGGAGGCTCTAGGCTGGGGT
TGTCCTCAAGGGAGTTCTCAGGTCACCCCAGGGTCACCCTCAACCCGGGGCCTGGTGGGGTAGAGGAGAA
ACTGCAAAGGTCTCTCCAAGGGGAAGGCATCAGGGCCCTCAGCACTGAGGGACGTGCGTGCTCTTTAAAG
AAGGGGCCACAGGACCCCGAGGGAAGCCAGGAGCTAGCAGTGGGCCATAGAGGGGCTGAGTGGGGTGGGT
GGAAGCCGTCCCTGGCCCTGGTCGCCCTGGCAACCCTGGTGGGGACTGTGATGCAGGAGGTGGCAGCCAT
TTGGAAACGCGTGGCGTCTCCTTAGAGATGTCTTCTTCAGCCTCCCAGGGTCCTCCACACTGGACAGGTG
GGCCCTCCTGGGACATTCTGGACCCCACGGGGCGAGCTTGGGAAGCCGCTGCAAGGGCCACACCTGCAGG
GCCCGGGGGCTGTGGGCAGATGGCACTCCTAGGAACCACGTCTATGAGACACACGGCCTGGAATCTTCTG
GAGAAGCAAACAAATTGCCTCCTGACATCTGAGGCTGGAGGCTGGATTCCCCGTCTTGGGGCTTTCTGGG
TCGGTCTGCCACGAGGTTCTGGTGTTCATTAAAAGTGTGCCCCTGGGCTGCCAGAAAGCCCCTCCCTGTG
TGCTCTCTTGAGGGCTGTGGGGCCAAGGGGACCCTGGCTGTCTCAGCCCCCCGCAGAGCACGAGCCCCTG
GTCCCCGCAAGCCCGCGGGCTGAGGATGATTCAGACAGGGCTGGGGAGTGAAGGCAATTAGATTCCACGG
ACGAGCCCTTTCTCCTGCGCCTCCCTCCTTCCTCACCCACCCCCGCCTCCATCAGGCACAGCAGGCAGGG
GTGGGGGATGTAAGGAGGGGAAGGTGGGGGACCCAGAGGGGGCTTTGACGTCAGCTCAGCTTATAAGAGG
CTGCTGGGCCAGGGCTGTGGAGACGGAGCCCGGACCTCCACACTGAGCCATGCCCACCCCCGACGCCACC
ACGCCACAGGCCAAGGGCTTCCGCAGGGCCGTGTCTGAGCTGGACGCCAAG
TH 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TH_1 ↗11:2,171,815負股2,171,805–2,171,864

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:528 aa

1 aa528 aa功能區域
依 P07101 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tyrosine hydroxylase 長 528 個胺基酸,屬於 biopterin-dependent aromatic amino acid hydroxylase 家族。其第 33 至 65 位胺基酸區段被註記為無序區域。

功能區域Disordered33–65 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6ZVP…

PDB · 6ZVP

EM · 4.00 A · A/B/C/D=71-528

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, perinuclear region;Nucleus;Cell projection, axon;Cytoplasm;Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle

tyrosine hydroxylase 註記位於細胞質、核周區域、細胞核、軸突及分泌性與突觸囊泡;並有其表現於多巴胺能軸突與軸突末端的描述。 定位與磷酸化狀態相關:Ser-19 磷酸化時呈核分布;Ser-31 與 Ser-40 也磷酸化時則呈細胞質分布。 這些定位變化為依相似性推定。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, axon。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 10 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DYT5bTHCRABP1HNRNPKMDFINFICPIAS2PUF60RBMY1A1TSPYL4UMAD1ZNF569
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tyrosine hydroxylase 形成同源四聚體。當其 Ser-19 磷酸化時,可與 YWHAG 互作;一個 YWHAG 二聚體結合一個 TH 四聚體,且此互作可能影響其他位點的磷酸化與去磷酸化。另有依相似性推定的資料指出,TH 與 NT5DC2 互作;此互作會降低 TH 的磷酸化程度及催化活性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TH 變異會造成常染色體隱性 Segawa syndrome,屬於 DOPA 反應性肌張力不全,可在嬰兒期或幼兒早期發病,表現為持續的不自主肌肉收縮,常導致姿勢異常;部分病例在嬰兒期也有帕金森症狀。此病對 L-Dopa 有良好反應。另有研究在一名 Parkinson disease 患者發現跨越 TH 的 34 kb 缺失,對照組未見此缺失;資料僅指出 TH 可能參與該病的致病過程,不能據此視為已確立因果。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

8 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 8 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TH 編碼的 tyrosine hydroxylase 催化 L-tyrosine 生成 L-Dopa,這是兒茶酚胺(包括 dopamine、noradrenaline 與 adrenaline)生合成的限速步驟,反應使用 tetrahydrobiopterin 和分子氧。該酵素也能羥化 phenylalanine 與 tryptophan,但專一性較低,此描述依相似性推定;另有依相似性推定的資料指出,它正向調節出生後發育期間視網膜玻璃體血管的退化。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the conversion of L-tyrosine to L-dihydroxyphenylalanine (L-Dopa), the rate-limiting step in the biosynthesis of catecholamines, dopamine, noradrenaline, and adrenaline. Uses tetrahydrobiopterin and molecular oxygen to convert tyrosine to L-Dopa (Ref.18). In addition to tyrosine, is able to catalyze the hydroxylation of phenylalanine and tryptophan with lower specificity (By similarity). Positively regulates the regression of retinal hyaloid vessels during postnatal development (By similarity)

PMID 15287903 ↗ · PMID 1680128 ↗ · PMID 17391063 ↗ · PMID 24753243 ↗ · PMID 34922205 ↗ · PMID 8528210 ↗

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功能此筆功能註記表示該蛋白質缺乏催化活性,但沒有提供適用的情境或條件。含實驗來源
證據與來源

Lacks catalytic activity

PMID 17391063 ↗

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分子活性(6R)-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin + L-tyrosine + O2 = (4aS,6R)-4a-hydroxy-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin + L-dopa含實驗來源
證據與來源

(6R)-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin + L-tyrosine + O2 = (4aS,6R)-4a-hydroxy-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin + L-dopa

PMID 15287903 ↗ · PMID 1680128 ↗ · PMID 17391063 ↗ · PMID 24753243 ↗ · PMID 34922205 ↗ · PMID 8528210 ↗

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分子活性此筆註記將 TH 相關功能列於兒茶酚胺生合成與 dopamine 生合成,並指出由 L-tyrosine 生成 dopamine 的途徑中共有兩個步驟,TH 涉及其中第一步。資料庫紀錄
證據與來源

Catecholamine biosynthesis; dopamine biosynthesis; dopamine from L-tyrosine: step 1/2

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交互作用TH 形成同源四聚體。Ser-19 磷酸化時,TH 與 YWHAG 互作;一個 YWHAG 二聚體結合一個 TH 四聚體,此互作可能影響其他位點的磷酸化與去磷酸化。TH 也與 NT5DC2 互作;依相似性推定,此互作會降低 TH 的磷酸化程度並減少其催化活性。含實驗來源
證據與來源

Homotetramer (Ref.18). Interacts (when phosphorylated at Ser-19) with YWHAG; one YWHAG dimer binds to one TH tetramer and this interaction may influence the phosphorylation and dephosphorylation of other sites. Interacts with NT5DC2; the interaction results in reduced phosphorylation and decreased catalytic activity of TH (By similarity)

PMID 24947669 ↗

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細胞定位TH 註記位於細胞質、核周區域、細胞核、軸突及分泌性與突觸囊泡,並有其表現於多巴胺能軸突和軸突末端的描述。依相似性推定,Ser-19 磷酸化時呈核分布;Ser-31 與 Ser-40 也磷酸化時則呈細胞質分布。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, perinuclear region; Nucleus; Cell projection, axon; Cytoplasm; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle; When phosphorylated at Ser-19 shows a nuclear distribution and when phosphorylated at Ser-31 as well at Ser-40 shows a cytosolic distribution (By similarity). Expressed in dopaminergic axons and axon terminals

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疾病關聯TH 相關變異會造成常染色體隱性 Segawa syndrome,這是一種 DOPA 反應性肌張力不全,通常在嬰兒期或幼兒早期發病。患者有持續的不自主肌肉收縮,常造成姿勢異常;部分病例在嬰兒期也出現帕金森症狀。此病對 L-Dopa 有良好反應。含實驗來源
證據與來源

Segawa syndrome autosomal recessive ARSEGS A form of DOPA-responsive dystonia presenting in infancy or early childhood. Dystonia is defined by the presence of sustained involuntary muscle contractions, often leading to abnormal postures. Some cases present with parkinsonian symptoms in infancy. Unlike all other forms of dystonia, it is an eminently treatable condition, due to a favorable response to L-DOPA. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 605407

PMID 10585338 ↗ · PMID 11196107 ↗ · PMID 11246459 ↗ · PMID 15505183 ↗ · PMID 15747353 ↗ · PMID 16049992 ↗ · PMID 17696123 ↗ · PMID 18058633 ↗ · PMID 18554280 ↗ · PMID 19491146 ↗ · PMID 20056467 ↗ · PMID 20430833 ↗ · PMID 21940685 ↗ · PMID 22264700 ↗ · PMID 22815559 ↗ · PMID 23762320 ↗ · PMID 23939262 ↗ · PMID 24753243 ↗ · PMID 7814018 ↗ · PMID 8528210 ↗ · PMID 8817341 ↗ · PMID 9613851 ↗ · PMID 9703425 ↗

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疾病關聯資料指出 TH 可能參與 Parkinson disease 的致病過程。一項全基因組拷貝數變異分析在一名 Parkinson disease 患者發現跨越 TH 的 34 kb 缺失,但在任何對照個體中均未發現;此資料呈現的是可能的疾病關聯,並未確立因果關係。含實驗來源
證據與來源

May play a role in the pathogenesis of Parkinson disease (PD). A genome-wide copy number variation analysis has identified a 34 kilobase deletion over the TH gene in a PD patient but not in any controls

PMID 20809526 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 8 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000352909 · 1,827 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACGGAGCCCGGACCTCCACACTGAGCCATGCCCACCCC40
41CGACGCCACCACGCCACAGGCCAAGGGCTTCCGCAGGGCC80
81GTGTCTGAGCTGGACGCCAAGCAGGCAGAGGCCATCATGT120
121CCCCGCGGTTCATTGGGCGCAGGCAGAGCCTCATCGAGGA160
161CGCCCGCAAGGAGCGGGAGGCGGCGGTGGCAGCAGCGGCC200
201GCTGCAGTCCCCTCGGAGCCCGGGGACCCCCTGGAGGCTG240
241TGGCCTTTGAGGAGAAGGAGGGGAAGGCCGTGCTAAACCT280
281GCTCTTCTCCCCGAGGGCCACCAAGCCCTCGGCGCTGTCC320
321CGAGCTGTGAAGGTGTTTGAGACGTTTGAAGCCAAAATCC360
361ACCATCTAGAGACCCGGCCCGCCCAGAGGCCGCGAGCTGG400
401GGGCCCCCACCTGGAGTACTTCGTGCGCCTCGAGGTGCGC440
441CGAGGGGACCTGGCCGCCCTGCTCAGTGGTGTGCGCCAGG480
481TGTCAGAGGACGTGCGCAGCCCCGCGGGGCCCAAGGTCCC520
521CTGGTTCCCAAGAAAAGTGTCAGAGCTGGACAAGTGTCAT560
561CACCTGGTCACCAAGTTCGACCCTGACCTGGACTTGGACC600
601ACCCGGGCTTCTCGGACCAGGTGTACCGCCAGCGCAGGAA640
641GCTGATTGCTGAGATCGCCTTCCAGTACAGGCACGGCGAC680
681CCGATTCCCCGTGTGGAGTACACCGCCGAGGAGATTGCCA720
721CCTGGAAGGAGGTCTACACCACGCTGAAGGGCCTCTACGC760
761CACGCACGCCTGCGGGGAGCACCTGGAGGCCTTTGCTTTG800
801CTGGAGCGCTTCAGCGGCTACCGGGAAGACAATATCCCCC840
841AGCTGGAGGACGTCTCCCGCTTCCTGAAGGAGCGCACGGG880
881CTTCCAGCTGCGGCCTGTGGCCGGCCTGCTGTCCGCCCGG920
921GACTTCCTGGCCAGCCTGGCCTTCCGCGTGTTCCAGTGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。