基因總覽
TGM4 是一種蛋白質編碼基因，其產物 transglutaminase 4 屬於 transglutaminase 超家族及 transglutaminase 家族。現有資料將它與哺乳類生殖過程相連，並指出其酵素作用發生於精液道中的蛋白質及特定蛋白質。來源未提供蛋白質長度、結構域或其他結構特徵，因此不據此延伸描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296125 ★ | 44,874,608–44,914,990 | 14 |
| ENST00000705784 | 44,874,608–44,914,990 | 15 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TGM4 的產物與哺乳類生殖過程相關。資料指出，它在精液道中催化蛋白質交聯，也能促進多胺與特定蛋白質結合；這些描述限定於精液道，並未進一步指出涉及哪些特定蛋白質或多胺，也未說明這些反應對生殖過程的具體影響。
其催化反應可描述為：將一個蛋白質上的 L-glutaminyl 基團與另一個蛋白質上的 L-lysyl 基團連接，形成蛋白質間的交聯產物並釋出 NH4(+)，亦即形成 L-lysyl-N(6)-5-L-glutamyl 連結。此反應說明了蛋白質交聯的化學方式；來源未提供反應速率、底物範圍或調控條件。
此外，每個亞基可結合一個 Ca(2+) 離子。來源僅指出此結合數量，未說明鈣離子結合如何影響酵素活性，也沒有提供其他條件或實驗情境。因此，現有資料支持的功能重點限於其在精液道中的蛋白質交聯與多胺結合，以及每亞基結合一個 Ca(2+) 離子的特性。
Promoter 與基因調控
>TGM4 ENST00000296125 GRCh38 chr3:44873608-44874708 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAATTTGATGATGAGAACTTCATCCTAAAGCATACAGGTCCTGGCATGTTGTCCATGGCAAATGCTGGAC CCAATACAAATGGTTCCCAGTTTTTAATCTGCACTGCCAAGACTGAGTGGTTGGATGGCAAGCTTGTGGT CTTTGGCAAGGTGAAGGCATGAATATTGTGGAGGCCATGGAGTGCTTTGTGTCCAGGAATGGCAAGACCG GCCAGAAGATCACCATTGCTGACTGTGGACAGCTCTTATAAGTTTGACTTGTGTTTTATCTTAACCACCA GACCATTCCTTCTGTAGCTCAGGGGAGCACCCTCCACCCCATTTGCTCCCAGTATCCTAGAATCTTTGTG CTCTCGCTGCGGTTCCCTTTGGGTTCCATGTTTTCCTTGTTCCCTTCCATGCCTAGCTGGATTGCAGAGT TAAGTTTATGATTATGAAATAAAAACTAAATAACAAAATAATAATAATAGTACATTATTTGCTTCTCAGT GCATACAACATCTCTGGAAAGATCTAAAAGAAACTGGTAGTAGGATTCAACAAGGTGGACAGGGGGCATT TTTTTCCATTTTGAACCATGTGGATGCATTATATATTCAAAATGTAAAACAAAAAACTCACAAGCATCTC TTACTTTTTCAACTTGAAGAAAAGAGAAGAAGAAGAAAACCCTAAAGTCAGTAAAGGTTAGCCTGGGTTC CTAGACTTAAGCTTGATAGTAACCAGAATGTCAGGCCACATGTGGTGTAGGTCATAGGGTCCTGGCTTTT GGTCACCCACTGTTAGGCTCATATAACAGACAAGGAGGTGCCATTGTCCGTTGTCTGTCCCTTTTACATC AGCTCATCTTGGCTCCTGATTTCCTGGGTCTGATATGGAAGATTCCGGGATTTTATTATTTCTAATCAAC ATCGCCTTCCCAAACCCCGCCCCTTGGCAGCCATAGCAAGGCCACATCTAGCCCAGGATCACATAAAAAG GGCTGTTTCCTCCCCTGAGGACCGACTGTGTGGAAGCACCAGGCATCAGAGATAGAGTCTTCCCTGGCAT TGCAGGAGAGAATCTGAAGGGATGATGGATGCATCAAAAGGTGAGTGGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TGM4_1 ↗ | 3:44,874,611 | 正股 | 44,874,562–44,874,621 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_83BLPR · enhancer · 44870502–44870688 · regulatory
· motif · 44875793–44875802 · motif
· motif · 44875793–44875802 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：684 aa
transglutaminase 4 屬於 transglutaminase 超家族中的 transglutaminase 家族。現有蛋白質註解未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
資料將 transglutaminase 4 註記為同源二聚體，表示其複合體形式由相同蛋白質亞基組成；此註記未提供其他結合夥伴或複合體功能資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TGM4 與哺乳類生殖過程相關，並在精液道中催化蛋白質交聯，以及多胺與特定蛋白質的結合；資料未進一步指定相關蛋白質或多胺。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Associated with the mammalian reproductive process. Catalyzes the cross-linking of proteins and the conjugation of polyamines to specific proteins in the seminal tract |
| 分子活性 | L-glutaminyl-[protein] + L-lysyl-[protein] = [protein]-L-lysyl-N(6)-5-L-glutamyl-[protein] + NH4(+) | 推論支持 | 證據與來源L-glutaminyl-[protein] + L-lysyl-[protein] = [protein]-L-lysyl-N(6)-5-L-glutamyl-[protein] + NH4(+) |
| 分子活性 | TGM4 每個蛋白質亞基可結合一個 Ca(2+) 離子；此註解未說明結合條件或其對蛋白質功能的影響。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Homodimer | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACCGACTGTGTGGAAGCACCAGGCATCAGAGATAGAGTCT40TCCCTGGCATTGCAGGAGAGAATCTGAAGGGATGATGGAT80GCATCAAAAGAGCTGCAAGTTCTCCACATTGACTTCTTGA120ATCAGGACAACGCCGTTTCTCACCACACATGGGAGTTCCA160AACGAGCAGTCCTGTGTTCCGGCGAGGACAGGTGTTTCAC200CTGCGGCTGGTGCTGAACCAGCCCCTACAATCCTACCACC240AACTGAAACTGGAATTCAGCACAGGGCCGAATCCTAGCAT280CGCCAAACACACCCTGGTGGTGCTCGACCCGAGGACGCCC320TCAGACCACTACAACTGGCAGGCAACCCTTCAAAATGAGT360CTGGCAAAGAGGTCACAGTGGCTGTCACCAGTTCCCCCAA400TGCCATCCTGGGCAAGTACCAACTAAACGTGAAAACTGGA440AACCACATCCTTAAGTCTGAAGAAAACATCCTATACCTTC480TCTTCAACCCATGGTGTAAAGAGGACATGGTTTTCATGCC520TGATGAGGACGAGCGCAAAGAGTACATCCTCAATGACACG560GGCTGCCATTACGTGGGGGCTGCCAGAAGTATCAAATGCA600AACCCTGGAACTTTGGTCAGTTTGAGAAAAATGTCCTGGA640CTGCTGCATTTCCCTGCTGACTGAGAGCTCCCTCAAGCCC680ACAGATAGGAGGGACCCCGTGCTGGTGTGCAGGGCCATGT720GTGCTATGATGAGCTTTGAGAAAGGCCAGGGCGTGCTCAT760TGGGAATTGGACTGGGGACTACGAAGGTGGCACAGCCCCA800TACAAGTGGACAGGCAGTGCCCCGATCCTGCAGCAGTACT840ACAACACGAAGCAGGCTGTGTGCTTTGGCCAGTGCTGGGT880GTTTGCTGGGATCCTGACTACAGTGCTGAGAGCGTTGGGC920ATCCCAGCACGCAGTGTGACAGGCTTCGATTCAGCTCACG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。