基因總覽
TGFB1I1 是蛋白質編碼基因，產物英文名稱為 transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein，屬於 paxillin family。此蛋白具有多個蛋白質互作區域，並含有四個 LIM zinc-binding domain；其結構也包括轉錄活化區與數個 LD motif。這些特徵與它在黏著斑及細胞核中協調分子互作的角色相符，使其能參與不同細胞訊號模組之間的連結。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000394863 ★ | 31,472,152–31,477,958 | 11 |
| ENST00000565454 | 31,471,585–31,474,590 | 7 |
| ENST00000902093 | 31,471,959–31,478,727 | 11 |
| ENST00000902094 | 31,471,959–31,478,727 | 10 |
| ENST00000965082 | 31,471,959–31,478,727 | 6 |
| ENST00000965083 | 31,471,959–31,478,727 | 11 |
| ENST00000965084 | 31,471,959–31,478,727 | 11 |
| ENST00000965085 | 31,471,959–31,478,727 | 11 |
| ENST00000977022 | 31,471,959–31,475,460 | 7 |
| ENST00001134630 | 31,471,959–31,478,727 | 11 |
| ENST00000565360 | 31,472,168–31,474,759 | 6 |
| ENST00000361773 | 31,472,208–31,478,727 | 11 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TGFB1I1 的產物可作為分子接頭，在黏著斑複合體與細胞核中協調多種蛋白質互作。它能將不同的細胞內訊號模組連接至質膜受體，並參與調節 Wnt 與 TGFB 訊號路徑，顯示其作用涉及訊號模組與膜受體間的協調。來源亦指出，它可能調節 SLC6A3 與 SLC6A4 導向質膜的過程，進而影響這兩種分子的活性；此項作用以可能性描述。
在細胞核中，TGFB1I1 可作為核受體共活化因子，調節 glucocorticoid receptor、androgen receptor、mineralocorticoid receptor 與 progesterone receptor 的轉錄活性。這項功能與其協調蛋白質互作的特性並行，使它能參與核受體相關的轉錄調控。來源也指出，TGFB1I1 可能具有鋅依賴的 DNA 結合活性，但未將此描述為已確定的功能。
這些訊號與轉錄層面的角色，可能與細胞生長、增殖、遷移、分化及細胞衰老等過程有關。現有資料支持其參與多類細胞活動，但未進一步界定各過程中的具體作用方向或條件，因此不宜將其概括為促進或抑制特定細胞結果。
Promoter 與基因調控
>TGFB1I1 ENST00000394863 GRCh38 chr16:31471152-31472252 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCTCGCATTTTTAAAAAGCTCCCCAGGTTGTTCCGATTTGCTGCTGGGTTGATACTCACATTCCAGTGC TCAGATCTGTCCAGAAGAGTGGCTGCAGCACAGTTGTCTGTCCATAACTACCTCTATGGCCTCTCGTTTC CACCTCGTTTCTCAGGGTCTCAGTCCAGGGAAGGCCTTGCCACTTTGTGGCTGGAGACTGTGTCTTGCTT TCTGCTCTGAGTTCATCAGTAACTTGGGAAAGGGCTGTTTCAGAGCAGGCCTGGGCCACCTCAGTGCTGA GGAAGGGCTTTGTCTTGCAGGCTGGCTGGGGGTTGGTTGCCTGGGAGTGTTTTCCCCGAATTTGCAAGGG GCTTGCGCCCGGGTTCGAGTTTACGTGTGTCCATGACCAAGTCTTGGAGGGAAGGTCCTAGTGTAGAGTC TGTGGGTGGGTTCACTGTGTCTGTCCCCGTCCCTCAGATTTCTTTGTGTCTGGTATGTATGCCTCTTGGG GCCTCTATTTATCTGTCAGGGTCTCCGATGGGAGGGTCTCCGAACCTGAGGTCTAATTGAGCCTTAGAAT ATCACTCCTGCTACCAATCCAAAAATTCCGTCTGGGACAAGTCTCCCAGGAATGGCATGGGTGGGAGGGA GGCTCTTGTCTAGGACTCAGGCGCTAGCTTTGAGCGGTGTCTGTTTGGGGGCCTCAGTCCGTGTCTGTAA GTCTCCCTAGGGAGCGGCTCTGGGGCTTGGTCTGGAGAAGCCACTTCTCTCTGGCTCTGGCCTCCTGGGG CTCCCTGCAGCTGAGGCCAAGGCTGGGGTGTGGCCGCCTCCGCGGCAGGCCGGCGGGCTGGGCTCGGGTG GGCCGGGGCGCTCCCTCCTTTCCACGCCCCCACCTCGGGTTCCCCCGTTCATCGCCCCCCCATCCCCATC TCAGCGGGTCCCGGCTTCCTTACATGGTCACGGCCGGGCTTCCAGCTCCCGGACGTCCCCCGCCCCCCGC CCCCACCGGACACGGCCCCCGCCCTGTTCGCCCCGCGCCACCGGCCCGCGCCCCGCCATGGAGGACCTGG GTGAGTGGGGCCGGATCCCCGGGTCCGTGGCCCCTCACCGCTGCCCAGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TGFB1I1_1 ↗ | 16:31,472,166 | 正股 | 31,472,117–31,472,176 |
| TGFB1I1_2 ↗ | 16:31,473,418 | 正股 | 31,473,369–31,473,428 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_B88LK · enhancer · 31466951–31467655 · regulatory
ENSR16_B88M8 · promoter · 31471662–31472218 · regulatory
ENSR16_59DTJ6 · CTCF_binding_site · 31472522–31472543 · regulatory
ENSR16_B88MD · promoter · 31472715–31473436 · regulatory
ENSR16_59DTKX · CTCF_binding_site · 31472898–31472928 · regulatory
ENSR16_59DTSC · CTCF_binding_site · 31474287–31474308 · regulatory
· motif · 31470805–31470816 · motif
· motif · 31471853–31471866 · motif
· motif · 31471853–31471866 · motif
· motif · 31472524–31472540 · motif
· motif · 31472900–31472916 · motif
· motif · 31472909–31472925 · motif
· motif · 31473318–31473333 · motif
· motif · 31473320–31473333 · motif
· motif · 31473323–31473335 · motif
· motif · 31473399–31473411 · motif
· motif · 31473482–31473494 · motif
· motif · 31474289–31474305 · motif
· motif · 31476183–31476199 · motif
· motif · 31476183–31476199 · motif
· motif · 31477084–31477097 · motif
TGFB1I1 的表現會受到 TNF 與 hydrogen peroxide 上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：461 aa
TGFB1I1 蛋白長 461 個胺基酸，屬於 paxillin family。其 C 端含四個連續的 LIM zinc-binding domain；N 端區域則註有轉錄活化區及與 PTK2/FAK1、PTK2B/PYK2 互作的區段。蛋白質中另有四個 LD motif，且數段區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TGFB1I1 位於細胞連結中的黏著斑、細胞核基質，以及細胞質的細胞骨架相關區域；它也與肌動蛋白細胞骨架相關，並與壓力纖維共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- PTK2Q05397 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF4Q9BUZ4 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- YPMT1.25AcO68743 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TGFB1I1 可形成同源寡聚體，並與多種蛋白質互作；資料也記載它與 ARHGEF7 形成複合體。互作對象包括黏著斑相關的 PTK2/FAK1、PTK2B/PYK2、CSK、talin、VCL、PXN、ILK、LIMS1、LIMS2、PARVA、GIT1 與 GIT2，以及訊號或轉錄相關的 SMAD3、TCF3、TCF7L2、PPARG、NR3C1、SLC6A3 和 SLC6A4。與 androgen receptor 的互作具有配體依賴性；TGFB1I1 透過 LIM zinc-binding domain 2 直接結合 CBLC 的 RING-type zinc finger，並增強 CBLC 的 E3 ubiquitin-protein ligase 活性。部分互作僅標示為相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TGFB1I1 蛋白可在黏著斑複合體與細胞核中作為分子接頭，協調多種蛋白質互作並連結細胞內訊號模組與質膜受體；它調節 Wnt 與 TGFB 訊號，也可能影響 SLC6A3、SLC6A4 到達質膜及其活性。在細胞核中，它作為共活化因子調節四類核受體的轉錄活性；另可能具有鋅依賴的 DNA 結合活性，並可能參與多種細胞過程。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as a molecular adapter coordinating multiple protein-protein interactions at the focal adhesion complex and in the nucleus. Links various intracellular signaling modules to plasma membrane receptors and regulates the Wnt and TGFB signaling pathways. May also regulate SLC6A3 and SLC6A4 targeting to the plasma membrane hence regulating their activity. In the nucleus, functions as a nuclear receptor coactivator regulating glucocorticoid, androgen, mineralocorticoid and progesterone receptor transcriptional activity. May play a role in the processes of cell growth, proliferation, migration, differentiation and senescence. May have a zinc-dependent DNA-binding activity PMID 10075738 ↗ · PMID 11463817 ↗ · PMID 11856738 ↗ · PMID 12177201 ↗ · PMID 12445807 ↗ · PMID 12700349 ↗ · PMID 15211577 ↗ · PMID 15561701 ↗ · PMID 16141357 ↗ · PMID 16624805 ↗ · PMID 16803896 ↗ · PMID 16849583 ↗ · PMID 17166536 ↗ · PMID 17233630 ↗ · PMID 9032249 ↗ |
| 交互作用 | TGFB1I1 可形成同源寡聚體，並與多種訊號、黏著斑及轉錄相關蛋白互作，也可與 ARHGEF7 形成複合體。它與 androgen receptor 的互作依賴配體；另可直接透過 LIM zinc-binding domain 2 結合 CBLC 的 RING-type zinc finger，並增強 CBLC 的 E3 ubiquitin-protein ligase 活性。部分互作依據標示為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer (By similarity). Interacts with PPARG. Interacts with TRAF4. Interacts with CRIP2 (By similarity). Interacts with HSPB1 (By similarity). Interacts with ILK (By similarity). Interacts with LIMS1 and LIMS2 (By similarity). Interacts with NCK2 (By similarity). Interacts with NUDT16L1 (By similarity). Interacts with PAK (By similarity). Interacts with PTPN12 (By similarity). Interacts with TCF3 (By similarity). Interacts with TCF7L2 (By similarity). Interacts with VCL (By similarity). Interacts (via LD motif 3) with GIT1. Also interacts with GIT2 (By similarity). Forms a complex with ARHGEF7 (By similarity). Interacts with AR/androgen receptor in a ligand-dependent manner. Interacts with CSK. Interacts with PTK2/FAK1 and PTK2B/PYK2. Interacts with SLC6A3 and SLC6A4. Interacts with NR3C1. Interacts with SMAD3. Interacts with MAPK15. Interacts with SRC. Interacts with LYN. Interacts with talin. Interacts (via LIM zinc-binding domain 2) with CBLC (via RING-type zinc finger); the interaction is direct and enhances CBLC E3 ubiquitin-protein ligase activity. Interacts with PARVA (By similarity). Interacts with PXN (By similarity) PMID 10075738 ↗ · PMID 10838081 ↗ · PMID 11311131 ↗ · PMID 11856738 ↗ · PMID 12153727 ↗ · PMID 12177201 ↗ · PMID 12700349 ↗ · PMID 12714604 ↗ · PMID 15211577 ↗ · PMID 15561701 ↗ · PMID 15687259 ↗ · PMID 16330715 ↗ · PMID 16624805 ↗ · PMID 16803896 ↗ · PMID 17202804 ↗ · PMID 17233630 ↗ · PMID 23145173 ↗ · PMID 9422762 ↗ · PMID 9664039 ↗ · PMID 9756887 ↗ |
| 細胞定位 | TGFB1I1 的定位包括細胞連結中的黏著斑、細胞核基質，以及細胞質的細胞骨架；它與肌動蛋白細胞骨架相關，並與壓力纖維共定位。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cell junction, focal adhesion; Nucleus matrix; Cytoplasm, cytoskeleton; Associated with the actin cytoskeleton; colocalizes with stress fibers |
| 調控 | TNF 與 hydrogen peroxide 均可上調 TGFB1I1。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCCTGTTCGCCCCGCGCCACCGGCCCGCGCCCCGCCATG40GAGGACCTGGATGCCCTGCTCTCTGACCTGGAGACTACCA80CCTCGCACATGCCAAGGTCAGGGGCTCCCAAAGAGCGCCC120TGCGGAGCCTCTCACCCCTCCCCCATCCTATGGCCACCAG160CCACAGACAGGGTCTGGGGAGTCTTCAGGAGCCTCGGGGG200ACAAGGACCACCTGTACAGCACGGTATGCAAGCCTCGGTC240CCCAAAGCCTGCAGCCCCGGCGGCCCCTCCATTCTCCTCT280TCCAGCGGTGTCTTGGGTACCGGGCTCTGTGAGCTAGATC320GGTTGCTTCAGGAACTTAATGCCACTCAGTTCAACATCAC360AGATGAAATCATGTCTCAGTTCCCATCTAGCAAGGTGGCT400TCAGGAGAGCAGAAGGAGGACCAGTCTGAAGATAAGAAAA440GACCCAGCCTCCCTTCCAGCCCGTCTCCTGGCCTCCCAAA480GGCTTCTGCCACCTCAGCCACTCTGGAGCTGGATAGACTG520ATGGCCTCACTCTCTGACTTCCGCGTTCAAAACCATCTTC560CAGCCTCTGGGCCAACTCAGCCACCGGTGGTGAGCTCCAC600AAATGAGGGCTCCCCATCCCCACCAGAGCCGACTGGCAAG640GGCAGCCTAGACACCATGCTGGGGCTGCTGCAGTCCGACC680TCAGCCGCCGGGGTGTTCCCACCCAGGCCAAAGGCCTCTG720TGGCTCCTGCAATAAACCTATTGCTGGGCAAGTGGTGACG760GCTCTGGGCCGCGCCTGGCACCCCGAGCACTTCGTTTGCG800GAGGCTGTTCCACCGCCCTGGGAGGCAGCAGCTTCTTCGA840GAAGGATGGAGCCCCCTTCTGCCCCGAGTGCTACTTTGAG880CGCTTCTCGCCAAGATGTGGCTTCTGCAACCAGCCCATCC920GACACAAGATGGTGACCGCCTTGGGCACTCACTGGCACCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。