演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TFR2HFE3

transferrin receptor 2

TFR2 編碼 transferrin receptor 2,參與細胞攝取與 transferrin 結合的鐵;其不同異構型具有不同的細胞定位。

Homo sapiens7q22.1UniProt Q9UP52
OFFICIAL SYMBOL
TFR2
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9UP52
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TFR2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 transferrin receptor 2,產物為 Transferrin receptor protein 2。此蛋白質屬於 peptidase M28 family 的 M28B subfamily,長 801 個胺基酸。其結構包含細胞質區段、單次穿膜區段及細胞外區段;另有一段被註記為無序區域,以及與內吞作用相關的訊號。這些結構特徵構成辨識 TFR2 的基本分子資訊。

Official symbol
TFR2
Gene name
transferrin receptor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11762
UniProt
Q9UP52
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HFE3TFRC2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q22.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegTFR2pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:100,620,416–100,642,779
Gene span
22,364 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000223051 ★100,620,420–100,641,55218
ENST00000431692100,620,416–100,641,78316
ENST00000462107100,620,416–100,642,77019
ENST00000855220100,620,416–100,642,77019
ENST00000855221100,620,416–100,642,77020
ENST00000855222100,620,416–100,642,77019
ENST00000855223100,620,416–100,642,77019
ENST00000855224100,620,416–100,642,77019
ENST00000855225100,620,416–100,642,77019
ENST00000855226100,620,416–100,642,77019
ENST00000855227100,620,416–100,642,77018
ENST00000855228100,620,416–100,642,77019

顯示 12/85 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TFR2 的主要功能是介導細胞攝取與 transferrin 結合的鐵。來源指出,這種攝取作用不依賴鐵本身;也就是說,TFR2 參與此過程的描述,並未將其限制為由鐵含量決定。資料未進一步說明攝取的分子步驟或其調控方式,因此不宜延伸推論更細部的作用機制。

除鐵攝取外,TFR2 也可能參與鐵代謝、肝細胞功能及紅血球分化。這些是來源列出的可能相關功能,並未提供足以界定其作用方向、必要性或彼此關係的細節。因此,較適合將它們視為 TFR2 可能涉入的生物學範疇,而不是已完整確立的連續機制。

就功能層次而言,現有資料將 TFR2 與細胞鐵攝取及若干鐵代謝相關過程相連,但沒有指出特定細胞或實驗條件,也未提供各項功能的證據強度比較。故可確認的核心描述是其介導 transferrin-bound iron 的細胞攝取;對鐵代謝、肝細胞功能與紅血球分化的參與則保留可能性表述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 100641552 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TFR2 ENST00000223051 GRCh38 chr7:100641452-100642552 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAGGGAAACTTGGTGGGACCCTGAGCCCTCCTCTTCAGAGCTACTTGTCTTGGGGCCCTCGGAAGGGTT
TGGGGACCTGCGCCCCCTGCCTGTTTAGCAGTTTATGCCTGTGACATGTTTCTGGGGTGAGGCTAACTGG
CCTTTCATCAGCCTCAGAACCCAAAGAGGTAGAAACCCATGTGATCCAAGTCCTTCGGTGACCAAACGGG
CCGGTGCCCAGGGAGGACCATGACTTGTCCAGGGTCACCCAGCTCTGCCCACACCTTGGCGGGGACTCTG
ATCACTCCTCCCCACTGACCCACATATCCCTGACCCCAGGACCCCTATCTGGGAGCTCTCGCTGGTCTCA
TCTGACCATGTGCTCCCACCTGTGCCCCTCCTTCTCCAGCAGCCAGCAGGAGTCTGAGAACGACCTTTCA
AAAGAGACACACATGCACACCACCAGACCAGACCCCCAAGTCACACCACTGTGGTGCCTCCAGCTTAGAA
TGCCACTGGGGCAAGTGTCAGGACAGGGAGGACAGCTGATATGTCACAGGACCGGGGCACTGGGGGACTC
TGAAGGCCAGATGAGGAAGGGGCAGATGTCTTAGGGGTGAATCTTCCACCTGGGCATGGCGGGGCTTAGG
AAGGGGTCCCCAGGATCCAGGGAGGGGTAAAAGCAGGAGAGGGGAGGGGGCACCCATGTCTCTGCCCTCC
CCCACTATCGGCCCCCTTCCCCCACCCCTGATGGGAACTAGGAGGCCAAAGTCCGCCCCAAGGTCAAAAA
ATTGATTGTTTTGCAGGGAGGAGGCAGGCGTGGGGCTGTGGAGAGATTGGCAGGGGAGAGCACAGCCCCT
TGTGCTCTGGCCTGGACCCGGGGGCCACGTCTGGAAGGCTGGACTGAGGCCAGGACTGTGCCCCCACCCT
TGGGGGTGGTGAGGAGCAGCCTTGGTTCAGGCTGCCTGCCAGGACTGATAAGGGGCCCTCCTAGGGCTCC
CACAAACGGTTTATCGGTTTATCGCTGGGGGACAGCCTGCAGGCTTCAGGAGGGGACACAAGCATGGAGC
GGCTTTGGGGTCTATTCCAGAGAGCGGTAAGACTAGTGGGATTGGGAAGAC
TFR2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TFR2_1 ↗7:100,641,552負股100,641,542–100,641,601

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_93GXK4 · enhancer · 100642319–100642710 · regulatory

ENSR7_5TN5XC · CTCF_binding_site · 100642456–100642477 · regulatory

ENSR7_93GXK7 · promoter · 100642711–100643046 · regulatory

· motif · 100641648–100641663 · motif

· motif · 100641796–100641811 · motif

· motif · 100641796–100641811 · motif

· motif · 100641797–100641811 · motif

· motif · 100642458–100642474 · motif

· motif · 100642557–100642570 · motif

· motif · 100642557–100642570 · motif

· motif · 100642724–100642737 · motif

· motif · 100642724–100642737 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:801 aa

1 aa801 aa功能區域基序跨膜區拓樸區域
依 Q9UP52 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Transferrin receptor protein 2 長 801 個胺基酸,包含第 1–83 位的細胞質區、第 84–104 位的螺旋型穿膜區,以及第 105–801 位的細胞外區。第 84–104 位區段亦被註記為第二型膜蛋白的訊號錨定區。第 16–45 位為無序區域,第 23–26 位有內吞作用訊號;蛋白質屬於 peptidase M28 family 的 M28B subfamily。

拓樸區域Cytoplasmic1–83 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein84–104 aa
拓樸區域Extracellular105–801 aa
功能區域Disordered16–45 aa
基序Endocytosis signal23–26 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UP52…

AlphaFold · Q9UP52

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cytoplasm

一般形式的 TFR2 位於細胞膜,屬於單次穿膜的第二型膜蛋白。 Isoform Beta 缺少穿膜區,資料將其定位描述為細胞質,並指出它可能位於細胞內;此定位帶有推測性。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HFE3TFR2OLFM4SEC22A
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TFR2 被註記為同源二聚體,表示其可由相同蛋白質亞基組成二聚體。來源未提供其他互作夥伴或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TFR2 與 Hemochromatosis 3(HFE3)相關。此病症屬鐵代謝異常,特徵為鐵過量並沉積於多種器官,可能造成器官衰竭及肝硬化、肝細胞瘤、糖尿病、心肌病、關節炎與低促性腺激素性性腺功能低下等嚴重疾病;明顯病況通常在鐵逐漸累積數十年後才出現。資料指出,影響此基因的變異會造成該病症。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TFR2 介導細胞攝取與 transferrin 結合的鐵,而且此作用不依賴鐵本身。它也可能參與鐵代謝、肝細胞功能及紅血球分化;來源未進一步界定這些可能功能的作用方向或具體機制。資料庫紀錄
證據與來源

Mediates cellular uptake of transferrin-bound iron in a non-iron dependent manner. May be involved in iron metabolism, hepatocyte function and erythrocyte differentiation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer資料庫紀錄
證據與來源

Homodimer

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TFR2 位於細胞膜,並屬於單次穿膜的第二型膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type II membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform Beta 缺少穿膜區,定位於細胞質,且可能位於細胞內;其細胞內定位帶有推測性。推論支持
證據與來源

Isoform Beta; Cytoplasm; Lacks the transmembrane domain. Probably intracellular

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Hemochromatosis 3(HFE3)是鐵代謝異常疾病,特徵為鐵過量並沉積於多種器官,可能導致器官衰竭,以及肝硬化、肝細胞瘤、糖尿病、心肌病、關節炎與低促性腺激素性性腺功能低下等嚴重病況。疾病嚴重表現通常要在鐵逐步累積數十年後才出現;資料指出,影響 TFR2 的變異會造成此病。含實驗來源
證據與來源

Hemochromatosis 3 HFE3 A disorder of iron metabolism characterized by iron overload. Excess iron is deposited in a variety of organs leading to their failure, and resulting in serious illnesses including cirrhosis, hepatomas, diabetes, cardiomyopathy, arthritis, and hypogonadotropic hypogonadism. Severe effects of the disease usually do not appear until after decades of progressive iron loading. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 604250

PMID 11313241 ↗ · PMID 12130528 ↗ · PMID 14633868 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000223051 · 2,886 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATCGCTGGGGGACAGCCTGCAGGCTTCAGGAGGGGACACA40
41AGCATGGAGCGGCTTTGGGGTCTATTCCAGAGAGCGCAAC80
81AACTGTCCCCAAGATCCTCTCAGACCGTCTACCAGCGTGT120
121GGAAGGCCCCCGGAAAGGGCACCTGGAGGAGGAAGAGGAA160
161GACGGGGAGGAGGGGGCGGAGACATTGGCCCACTTCTGCC200
201CCATGGAGCTGAGGGGCCCTGAGCCCCTGGGCTCTAGACC240
241CAGGCAGCCAAACCTCATTCCCTGGGCGGCAGCAGGACGG280
281AGGGCTGCCCCCTACCTGGTCCTGACGGCCCTGCTGATCT320
321TCACTGGGGCCTTCCTACTGGGCTACGTCGCCTTCCGAGG360
361GTCCTGCCAGGCGTGCGGAGACTCTGTGTTGGTGGTCAGT400
401GAGGATGTCAACTATGAGCCTGACCTGGATTTCCACCAGG440
441GCAGACTCTACTGGAGCGACCTCCAGGCCATGTTCCTGCA480
481GTTCCTGGGGGAGGGGCGCCTGGAGGACACCATCAGGCAA520
521ACCAGCCTTCGGGAACGGGTGGCAGGCTCGGCCGGGATGG560
561CCGCTCTGACTCAGGACATTCGCGCGGCGCTCTCCCGCCA600
601GAAGCTGGACCACGTGTGGACCGACACGCACTACGTGGGG640
641CTGCAATTCCCGGATCCGGCTCACCCCAACACCCTGCACT680
681GGGTCGATGAGGCCGGGAAGGTCGGAGAGCAGCTGCCGCT720
721GGAGGACCCTGACGTCTACTGCCCCTACAGCGCCATCGGC760
761AACGTCACGGGAGAGCTGGTGTACGCCCACTACGGGCGGC800
801CCGAAGACCTGCAGGACCTGCGGGCCAGGGGCGTGGATCC840
841AGTGGGCCGCCTGCTGCTGGTGCGCGTGGGGGTGATCAGC880
881TTCGCCCAGAAGGTGACCAATGCTCAGGACTTCGGGGCTC920
921AAGGAGTGCTCATATACCCAGAGCCAGCGGACTTCTCCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。