基因總覽
TFPI2(tissue factor pathway inhibitor 2)是蛋白質編碼基因。其產物屬於蛋白酶抑制因子,蛋白質序列含有三個 BPTI/Kunitz 抑制劑結構域,並具有位於 N 端的訊號序列。來源資料指出,此蛋白質可抑制數種蛋白酶;其具體作用與限制見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000222543 ★ | 93,885,396–93,890,753 | 5 |
| ENST00000650573 | 93,883,933–93,890,957 | 5 |
| ENST00000898459 | 93,883,933–93,890,957 | 4 |
| ENST00001105233 | 93,883,933–93,890,957 | 5 |
| ENST00001105234 | 93,883,933–93,890,957 | 5 |
| ENST00001105236 | 93,883,933–93,890,957 | 4 |
| ENST00001105237 | 93,883,933–93,890,957 | 5 |
| ENST00001105238 | 93,883,933–93,890,957 | 3 |
| ENST00001139956 | 93,883,933–93,890,753 | 5 |
| ENST00001105235 | 93,885,831–93,890,957 | 5 |
| ENST00000451238 | 93,886,434–93,890,170 | 4 |
| ENST00000649913 | 93,887,375–93,890,753 | 4 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TFPI2 的產物可抑制多種蛋白酶,包括 trypsin、plasmin,以及 factor VIIa/tissue factor;對 factor Xa 的抑制作用較弱。來源亦指出,它對 thrombin 沒有作用,顯示其抑制對象具有選擇性,不能將此作用概括為抑制所有凝血相關蛋白酶。
TFPI2 可能參與 plasmin 介導的基質重塑調控。這項功能描述帶有可能性,來源未進一步說明其作用機制或基質重塑的具體結果,因此不宜將其表述為已確立的調控途徑。
另有資料指出,含 ABCB1、TFPI2 與 PPP2R3C 的複合體會導致 ABCB1 去磷酸化。這項敘述描述的是複合體與 ABCB1 去磷酸化之間的關係;來源未提供更多細節,不能據此補充各成員的作用方式或其他生物學後果。
Promoter 與基因調控
>TFPI2 ENST00000222543 GRCh38 chr7:93890653-93891753 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTAATCTATGGTAATCGAAATGAGAAGAGTGTTTGCCCCTGGCCTAAGGATGGAAGGATTGATTTAGGA AAAAGTCTGCAGGAGCTTTCTGGAGTGATGGAAATGTTCTAACTCTTTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTT TTTCTTCGTTTCGAGACGGAGTTCCACTCTGCCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTGGGCTCAC TGCAGCCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGGGGCTGGGACTACAGGTG CCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTGTTTTTAATAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTA GTCTCGAACTCCTGATTTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAG CTACCGCGCCCAGCCAAAATGTTCTAATTCTTTATTGGTGGCTACACAGTTGTCAAAATTTATCAAACTG TCCACCTACGATATATTATAAGCCTGTATTAAATGTAAATTAGAACTCGATTGAAATCTGTGTGTATAAA TATAAATATACACTTATTTACATTTCTAATCTAATCTGAAGGTCCATTGCAACGAATCCCGCTCCGCTCT GACCCAAGAACTCCGCACTTTCTCTCCACCAGCCTTTCAAATACCTGAACTTCATGCCTTCAAGAGGTGG ATTCCGGCTTCTTTACAGCGCAATCACTAGCAGGTCATTTCCGTCTAGCTTGCAGATTTCCCATTACTGA CACAAACGCTCCCTCAGGGCGTCCCCGTCTGGACTACAGGAGAAAGTTTGGGAGGCAGGTTCAACTTTTC AACTTGGCGGGGAATTCCTCTCCCTCTTACACAGTTTGCAGCGCGGGGGCGGCGGGGTGACAGTCCCCGT GCATGAATCAGCCACCCCTCAGGCTCCGCCCCGGCGGGGGTCGGCCGGACGCTCGCCCCGCATAAAGCGG GCACCCGGGCCGCCTGGAGCAGAAAGCCGCGCACCTCCTCCCGCCAGGCGCTTTCTCGGACGCCTTGCCC AGCGGGCCGCCCGACCCCCTGCACCATGGACCCCGCTCGCCCCCTGGGGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TFPI2_1 ↗ | 7:93,890,753 | 負股 | 93,890,743–93,890,802 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_93D974 · enhancer · 93889278–93889683 · regulatory
ENSR7_77J3RW · promoter · 93890737–93890834 · regulatory
ENSR7_93D97J · enhancer · 93890835–93891197 · regulatory
ENSR7_84QJHM · enhancer · 93895348–93895574 · regulatory
· motif · 93889405–93889419 · motif
· motif · 93889405–93889419 · motif
· motif · 93891821–93891834 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:235 aa
TFPI2 蛋白質長 235 個胺基酸。序列第 1–22 位為訊號序列;第 36–86、96–149 與 158–208 位分別註記為 BPTI/Kunitz inhibitor 1、2 與 3。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TFPI2 的定位註記為分泌型;資料未提供其他定位或定位改變的條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
TFPI2 與 ABCB1、PPP2R3C 一同出現在一個複合體中。來源將該複合體與 ABCB1 去磷酸化相連,但未進一步說明 TFPI2 是否直接結合 ABCB1,或各複合體成員在此過程中的個別作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFPI2 可能參與 plasmin 介導的基質重塑調控;它可抑制 trypsin、plasmin 與 factor VIIa/tissue factor,對 factor Xa 的抑制較弱,且不影響 thrombin。 | 含實驗來源 | 證據與來源May play a role in the regulation of plasmin-mediated matrix remodeling. Inhibits trypsin, plasmin, factor VIIa/tissue factor and weakly factor Xa. Has no effect on thrombin PMID 7872799 ↗ |
| 交互作用 | TFPI2 與 ABCB1、PPP2R3C 同處一個複合體;該複合體與 ABCB1 去磷酸化相關,但此敘述未指出 TFPI2 是否直接結合 ABCB1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Finds in a complex with ABCB1, TFPI2 and PPP2R3C; leading to the dephosphorylation of ABCB1 PMID 24333728 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGAAAGCCGCGCACCTCCTCCCGCCAGGCGCTTTCTCGGA40CGCCTTGCCCAGCGGGCCGCCCGACCCCCTGCACCATGGA80CCCCGCTCGCCCCCTGGGGCTGTCGATTCTGCTGCTTTTC120CTGACGGAGGCTGCACTGGGCGATGCTGCTCAGGAGCCAA160CAGGAAATAACGCGGAGATCTGTCTCCTGCCCCTAGACTA200CGGACCCTGCCGGGCCCTACTTCTCCGTTACTACTACGAC240AGGTACACGCAGAGCTGCCGCCAGTTCCTGTACGGGGGCT280GCGAGGGCAACGCCAACAATTTCTACACCTGGGAGGCTTG320CGACGATGCTTGCTGGAGGATAGAAAAAGTTCCCAAAGTT360TGCCGGCTGCAAGTGAGTGTGGACGACCAGTGTGAGGGGT400CCACAGAAAAGTATTTCTTTAATCTAAGTTCCATGACATG440TGAAAAATTCTTTTCCGGTGGGTGTCACCGGAACCGGATT480GAGAACAGGTTTCCAGATGAAGCTACTTGTATGGGCTTCT520GCGCACCAAAGAAAATTCCATCATTTTGCTACAGTCCAAA560AGATGAGGGACTGTGCTCTGCCAATGTGACTCGCTATTAT600TTTAATCCAAGATACAGAACCTGTGATGCTTTCACCTATA640CTGGCTGTGGAGGGAATGACAATAACTTTGTTAGCAGGGA680GGATTGCAAACGTGCATGTGCAAAAGCTTTGAAAAAGAAA720AAGAAGATGCCAAAGCTTCGCTTTGCCAGTAGAATCCGGA760AAATTCGGAAGAAGCAATTTTAAACATTCTTAATATGTCA800TCTTGTTTGTCTTTATGGCTTATTTGCCTTTATGGTTGTA840TCTGAAGAATAATATGACAGCATGAGGAAACAAATCATTG880GTGATTTATTCACCAGTTTTTATTAATACAAGTCACTTTT920TAAAAAATTTGGATTTTTTTATATATAACTAGCTGCTATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。