基因總覽
TFPI(tissue factor pathway inhibitor)是蛋白質編碼基因,產生的蛋白質長度為304個胺基酸。其蛋白質包含三個 BPTI/Kunitz inhibitor 結構域,並有訊號序列註解。這些特徵構成 TFPI 的基本分子架構;其主要生物學角色與凝血調控相關,詳細作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000233156 ★ | 187,464,230–187,554,435 | 8 |
| ENST00000392365 | 187,463,823–187,516,395 | 8 |
| ENST00000897898 | 187,463,823–187,554,497 | 9 |
| ENST00000897899 | 187,463,823–187,554,497 | 8 |
| ENST00000897900 | 187,463,823–187,554,497 | 9 |
| ENST00000897901 | 187,463,823–187,554,497 | 9 |
| ENST00000897902 | 187,463,823–187,554,497 | 10 |
| ENST00000897903 | 187,463,823–187,554,497 | 9 |
| ENST00000897904 | 187,463,823–187,554,497 | 8 |
| ENST00000897905 | 187,463,823–187,554,497 | 8 |
| ENST00000897906 | 187,463,823–187,554,497 | 10 |
| ENST00000897907 | 187,463,823–187,554,497 | 8 |
顯示 12/64 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TFPI 具有抗血栓作用,來源描述其可直接抑制 factor X(Xa),也可在 Xa 依賴的情況下抑制 VIIa/tissue factor 活性。這兩種抑制方式涉及凝血相關因子的不同組合,且來源對其複合體形成機制保留推測性。
在 Xa 依賴的抑制作用中,TFPI 被認為可能形成由 Xa、LACI、VIIa 與 TF 組成的四元複合體;來源以「presumably」描述此機制,因此不應視為已確定的複合體形成方式。這項說明將 Xa 與 VIIa/tissue factor 活性的抑制連結起來,但未提供更細的反應步驟或作用條件。
除了對凝血相關活性的抑制,TFPI 也具有與血漿脂蛋白結合的能力。來源未進一步說明這種結合與其抗血栓作用之間是否存在直接關係,也未指出特定脂蛋白種類。因此,依現有資訊,TFPI 可概括為具有抗血栓作用、能抑制 factor X,並能以 Xa 依賴方式抑制 VIIa/tissue factor 活性的蛋白質;其在血漿中亦可與脂蛋白結合。
Promoter 與基因調控
>TFPI ENST00000233156 GRCh38 chr2:187554335-187555435 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATTCAATATGTATTAAAAACACTCAAGATGAAAGGTTACCTTTTACAGAGAGGTCTAAGGAAAGCAAGAA AAATTGAAGGCACAAAGAATCTGAGATGCAGAAGCAAGAAACTCCTACATTTTCTGACCAAATGTCTTCA GCCTTCCTGGCAAAGTAGATTCTGCCCATTTATTAGATCTCTAGTGATCTTAGTCTGATATGACCATAAT TCCAATACAGAGACAGTACGGATGAACCTCAATGATAGGGACATACAGCAGAGACTCTGGTTGACATCTG TAAATATTTACATATTTTGTAGAATAATAATAATAGAAATACAGAAAACAGCGATAATGATAGCCAACAA TTATTGGAGGTTTGCTACATGCTGGGTCCTGCCTTAAGTACTTTTTATGTATTAAGCCATTTAGTACTTA CATCAAGCCCAGAAACTTTTATTATCGACATTTTAGGAACAAAGGAACTGAGGCATAGTGAATTCAAATA ACTGGGCTGAGTAGCCAAGTTAGCAAGTAGCTAAGGTAGGGCTCAAAGCCTGACACCTGCAATAGATAAT GCATTACATTGTCTCACTAAGAGAGACCTCCAACGGTAGCCCTCAGACTTTTAAAAAAAATAAATACATT GACAGTGGGTGAAACAAATGAAATAACTTGAAGAAGAAACAAACTGCAAAAAAGCTTATTAACAGTGTAA TAATAAATATGTAATTTTTTAAACCCTAACTCTAGGGGGAAAAAAGCATTCTTTTTCAACTGATTACAAA AACAATCCTGGAAAGTAAAGGAAATAGCTATTCAAAATGATCGTATCTGAAATCTTGGTGTAAGCTGTTT CCTTCATCTGTTTCCTCCACTAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAGAGGTTTAGACTAAATAGAGTC AGAGTTGCAGTGACCTAAACAGGAAGTTGGGCTATTCCCAACTGCCAGTGATCTCTGAAGCCGACTCTGA GGCTCCCTCTTTGCTCTAACAGACAGCAGCGACTTTAGGCTGGATAATAGTCAAATTCTTACCTCGCTCT TTCACTGCTAGTAAGATCAGATTGCGTTTCTTTCAGTTACTCTTCAATCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TFPI_1 ↗ | 2:187,554,435 | 負股 | 187,554,425–187,554,484 |
| TFPI_2 ↗ | 2:187,565,803 | 負股 | 187,565,793–187,565,852 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_87HTSJ · enhancer · 187549269–187549485 · regulatory
ENSR2_B3D7XZ · enhancer · 187549901–187550480 · regulatory
ENSR2_94QFXD · enhancer · 187551396–187551694 · regulatory
ENSR2_94QFZ3 · promoter · 187553607–187554107 · regulatory
ENSR2_94QFZ6 · enhancer · 187554108–187554420 · regulatory
ENSR2_94QFZ9 · promoter · 187554421–187554928 · regulatory
· motif · 187550946–187550952 · motif
· motif · 187553359–187553365 · motif
· motif · 187553589–187553598 · motif
· motif · 187553589–187553598 · motif
· motif · 187553640–187553655 · motif
· motif · 187553641–187553655 · motif
· motif · 187553642–187553655 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:304 aa
TFPI 蛋白質長304個胺基酸,序列註解包含位於第1至28位的訊號序列。蛋白質具有三個 BPTI/Kunitz inhibitor 結構域,分別位於第54至104位、第125至175位及第217至267位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TFPI 的 Alpha 異構型標註為分泌型;Beta 異構型則與微粒體膜相關,並帶有脂質錨定及 GPI 錨定的定位註解。 這些定位資訊依異構型而異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
未繪示構造:Microsome membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFPI 可直接抑制 factor X(Xa),也能在 Xa 依賴的情況下抑制 VIIa/tissue factor 活性;後者可能透過 Xa、LACI、VIIa 與 TF 組成的四元複合體進行。來源以推測方式描述此複合體,並指出 TFPI 具有抗血栓作用,也能與血漿中的脂蛋白結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Inhibits factor X (X(a)) directly and, in a Xa-dependent way, inhibits VIIa/tissue factor activity, presumably by forming a quaternary Xa/LACI/VIIa/TF complex. It possesses an antithrombotic action and also the ability to associate with lipoproteins in plasma PMID 20676107 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform Alpha; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | TFPI 的 Beta 異構型標註為與微粒體膜相關,並具有脂質錨定及 GPI 錨定的定位特徵。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGACAGCAGCGACTTTAGGCTGGATAATAGTCAAATTCTT40ACCTCGCTCTTTCACTGCTAGTAAGATCAGATTGCGTTTC80TTTCAGTTACTCTTCAATCGCCAGTTTCTTGATCTGCTTC120TAAAAGAAGAAGTAGAGAAGATAAATCCTGTCTTCAATAC160CTGGAAGGAAAAACAAAATAACCTCAACTCCGTTTTGAAA200AAAACATTCCAAGAACTTTCATCAGAGATTTTACTTAGAT240GATTTACACAATGAAGAAAGTACATGCACTTTGGGCTTCT280GTATGCCTGCTGCTTAATCTTGCCCCTGCCCCTCTTAATG320CTGATTCTGAGGAAGATGAAGAACACACAATTATCACAGA360TACGGAGTTGCCACCACTGAAACTTATGCATTCATTTTGT400GCATTCAAGGCGGATGATGGCCCATGTAAAGCAATCATGA440AAAGATTTTTCTTCAATATTTTCACTCGACAGTGCGAAGA480ATTTATATATGGGGGATGTGAAGGAAATCAGAATCGATTT520GAAAGTCTGGAAGAGTGCAAAAAAATGTGTACAAGAGATA560ATGCAAACAGGATTATAAAGACAACATTGCAACAAGAAAA600GCCAGATTTCTGCTTTTTGGAAGAAGATCCTGGAATATGT640CGAGGTTATATTACCAGGTATTTTTATAACAATCAGACAA680AACAGTGTGAACGTTTCAAGTATGGTGGATGCCTGGGCAA720TATGAACAATTTTGAGACACTGGAAGAATGCAAGAACATT760TGTGAAGATGGTCCGAATGGTTTCCAGGTGGATAATTATG800GAACCCAGCTCAATGCTGTGAATAACTCCCTGACTCCGCA840ATCAACCAAGGTTCCCAGCCTTTTTGAATTTCACGGTCCC880TCATGGTGTCTCACTCCAGCAGACAGAGGATTGTGTCGTG920CCAATGAGAACAGATTCTACTACAATTCAGTCATTGGGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。