基因總覽
TFF2（trefoil factor 2）是蛋白質編碼基因，產物屬於 trefoil factor 家族。其蛋白質長 129 個胺基酸，含有兩個 P-type 結構域；這些結構域分別位於第 29–73 與第 79–122 個胺基酸。蛋白質序列另有位於第 1–23 個胺基酸的訊號區段。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000291526 ★ | 42,346,357–42,350,994 | 4 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TFF2 與胃腸道生理功能相關，來源描述指出它會抑制胃腸道蠕動，也會抑制胃酸分泌。這些作用涵蓋腸胃道運動與胃部酸分泌兩方面；來源未進一步交代其作用所經由的分子機制或發生條件。
TFF2 也可能是胃黏液的結構成分，但這項功能以推測方式提出。依據序列相似性，TFF2 可能透過與醣蛋白上的醣類側鏈相互作用，協助穩定黏液凝膠中的醣蛋白。此描述表示其可能參與胃黏液結構維持，並非已確證的機制；來源也未提供此作用的實驗情境或其他細節。
Promoter 與基因調控
>TFF2 ENST00000291526 GRCh38 chr21:42350894-42351994 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGAGGATGGAGCCTGGGGGACGAGGGCCTGGAGGATGGGGGCCTGGAGTATGGGGCCTGCTCTCCAGAC CCTGAGGACAGCCCCGTGGTGGACCAAGGATTTTGGGTTTCCTGCGTCTCTGGGCCCCTGACTGCTCAAC CATCAGAAACAGACTGGCAACCCCCTGTCATTTCCCTGGCGTGGGGAACTTCGGGTCCCCTCTGTCCTTC CCACCACACTTTTCCCTCTTTCTTTCCGGGTGTCTACTCTCTGGCTTCTGTCTTCTCTGTCAGGTCCACA GAATCCTTCTCCAGCACATCCTACCCCAGGAAGGCCATGGGCTGGGTCCCAGGTGCCATCTTTCAGAAGA TGTAGAGCATTCCCATGGAACAAAAATAACCCATTTCAGGGGTTGGCTGAAAATGAACTTATTAAAACCT GCCTGTCACAGGCTACTCCGCTGACCCTGTCAGCCTCATCTCCATGGAGAGCAGCCCCTCCTGCTGAAGA TGGGACAAAGGGCATCGTGCTGCGGTTGGGGAGGCTCTAACCACAGCCCTGGGAGCAGTCTCTTACCTCC TCTGAGATGCTTCCCTTCCTCAGGGAGGGGACTTTTCCATGCTATCTGCTGGCCTGTACATTTTCCCCAG TAAACTTGGCCCTAATATTTTCTAAATTCCTGTGGTCCCTGCCCACTCTATCAATAGAAATGCATAGCTT ATCCCTTCCTGGGTGTGACCCTGTGTGTGCCCAGCCCCAGACCTGCACGTGGCCGGTTTTCCACGCTGGC AGCCTGGCATGACCCAACTCTCTGTCCAGGGCAGGAAGAGGTATCACCGAGCAGGGAGAGAGTCACCCTG GCCCGGAAGCCTCGCCTGCACAGGGCACAGCTGCCTCTTGCCTCCTCTTCGCCTCCACGGTGGAAGGGCT GGGGCCACGGGGCAGAGAAGAAAGGTTATCTCTGCTTGTTGGACAAACAGAGGGGAGATTATAAAACATA CCCGGCAGTGGACACCATGCATTCTGCAAGCCACCCTGGGGTGCAGCTGAGCTAGACATGGGACGGCGAG ACGCCCAGCTCCTGGCAGCGCTCCTCGTCCTGGGGCTATGTGCCCTGGCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TFF2_1 ↗ | 21:42,350,994 | 負股 | 42,350,984–42,351,043 |
| TFF2_2 ↗ | 21:42,351,175 | 負股 | 42,351,165–42,351,224 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_9LRTF · enhancer · 42351116–42351487 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：129 aa
TFF2 蛋白質長 129 個胺基酸。其序列第 1–23 位為訊號區段；第 29–73 位與第 79–122 位各有一個 P-type 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TFF2 的定位註記為分泌。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- DDX3XO00571 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNAJB1P25685 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNM2P50570-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ELAVL2Q12926-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCRL4Q96PJ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 18 experiments
- PDLIM5Q96HC4-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PMP22A0A6Q8PF08 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNRPGP62308 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAF7Q15545 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TUBBP07437 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZHX2Q9Y6X8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFF2 可抑制胃腸道蠕動與胃酸分泌。它也可能是胃黏液的結構成分，並可能藉由與醣類側鏈相互作用，穩定黏液凝膠中的醣蛋白；此結構功能及作用方式屬於依序列相似性提出的推測。 | 推論支持 | 證據與來源Inhibits gastrointestinal motility and gastric acid secretion. Could function as a structural component of gastric mucus, possibly by stabilizing glycoproteins in the mucus gel through interactions with carbohydrate side chains (By similarity) |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATTCTGCAAGCCACCCTGGGGTGCAGCTGAGCTAGACATG40GGACGGCGAGACGCCCAGCTCCTGGCAGCGCTCCTCGTCC80TGGGGCTATGTGCCCTGGCGGGGAGTGAGAAACCCTCCCC120CTGCCAGTGCTCCAGGCTGAGCCCCCATAACAGGACGAAC160TGCGGCTTCCCTGGAATCACCAGTGACCAGTGTTTTGACA200ATGGATGCTGTTTCGACTCCAGTGTCACTGGGGTCCCCTG240GTGTTTCCACCCCCTCCCAAAGCAAGAGTCGGATCAGTGC280GTCATGGAGGTCTCAGACCGAAGAAACTGTGGCTACCCGG320GCATCAGCCCCGAGGAATGCGCCTCTCGGAAGTGCTGCTT360CTCCAACTTCATCTTTGAAGTGCCCTGGTGCTTCTTCCCG400AAGTCTGTGGAAGACTGCCATTACTAAGAGAGGCTGGTTC440CAGAGGATGCATCTGGCTCACCGGGTGTTCCGAAACCAAA480GAAGAAACTTCGCCTTATCAGCTTCATACTTCATGAAATC520CTGGGTTTTCTTAACCATCTTTTCCTCATTTTCAATGGTT560TAACATATAATTTCTTTAAATAAAACCCTTAAAATCTGCT600AAA603cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。