基因總覽
TFF1（trefoil factor 1）是由蛋白質編碼基因 TFF1 產生的分泌型蛋白質。其蛋白質序列長 84 個胺基酸，包含位於 N 端的訊號序列，以及一段標註為 P-type 的結構域。現有資料指出，TFF1 的主要角色與胃腸黏膜表面的黏液凝膠有關，並可能影響尿液中草酸鈣晶體的生長；相關作用細節見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000291527 ★ | 42,362,282–42,366,535 | 3 |
| ENST00001093239 | 42,362,282–42,366,541 | 3 |
| ENST00001093243 | 42,362,282–42,366,541 | 2 |
| ENST00001093244 | 42,362,282–42,366,535 | 3 |
| ENST00001093245 | 42,362,282–42,366,541 | 3 |
| ENST00001131636 | 42,362,282–42,366,541 | 3 |
| ENST00001011062 | 42,362,284–42,366,541 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TFF1 的一項主要作用是穩定覆蓋胃腸黏膜的黏液凝膠。這層凝膠可形成物理屏障，協助隔開多種有害物質與黏膜表面；因此，TFF1 所支持的凝膠穩定性與黏膜屏障的維持相關。來源未進一步說明其穩定黏液凝膠的分子機制，也未指出作用所需的特定條件。
此外，TFF1 可能抑制尿液中草酸鈣晶體的生長。這項作用以「可能」描述，來源未提供抑制程度、發生條件或更詳細的作用方式，因此不能據此推論其在尿液中的具體生理效應。現有資料支持的功能範圍，主要是黏液凝膠穩定與對草酸鈣晶體生長的可能抑制。
Promoter 與基因調控
>TFF1 ENST00000291527 GRCh38 chr21:42366435-42367535 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAGCTCCGAGCAGGGGAGGGGAGTGAGGCATGGTACAGGAGAGCAGGAGGCTGTCCTCTAAAATACAGG AGTCCAGGGGACCAACTGGGAAGGTGTGGGAGGGGGAGGGAGGGAGCCCCATAGACACAGGGGAGTGAAC CACGTTCACTTTGTCAGTTTTTGATGGCAGCTCGTATATACTATTTTTTTCTCCCTCCTGCCCCCAGCCC CTCCCAGAAGGAGACTTAATCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTAGGGTGATCTCGACTCACTGCAACCT CCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGACTTAACCTCCAGAGTAGCTAGGATTACAGGCACCCGCCAC CATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTC TCAAACTCCTGACTTTAAGTGATCCGCCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCA CTGCGCCAGGCCTACAATTTCATTATTAAAACAATTCCACTGTAAAAGAATTAGCTTAGGCCTAGACGGA ATGGGCTTCATGAGCTCCTTCCCTTCCCCCTGCAAGGTCACGGTGGCCACCCCGTGAGCCACTGTTGTCA CGGCCAAGCCTTTTTCCGGCCATCTCTCACTATGAATCACTTCTGCAGTGAGTACAGTATTTACCCTGGC GGGAGGGCCTCTCAGATATGAGTAGGACCTGGATTAAGGTCAGGTTGGAGGAGACTCCCATGGGAAAGAG GGACTTTCTGAATCTCAGATCCCTCAGCCAAGATGACCTCACCACATGTCGTCTCTGTCTATCAGCAAAT CCTTCCATGTAGCTTGACCATGTCTAGGAAACACCTTTGATAAAAATCAGTGGAGATTATTGTCTCAGAG GATCCCCGGGCCTCCTTAGGCAAATGTTATCTAACGCTCTTTAAGCAAACAGAGCCTGCCCTATAAAATC CGGGGCTCGGGCGGCCTCTCATCCCTGACTCGGGGTCGCCTTTGGAGCAGAGAGGAGGCAATGGCCACCA TGGAGAACAAGGTGATCTGCGCCCTGGTCCTGGTGTCCATGCTGGCCCTCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TFF1_1 ↗ | 21:42,366,535 | 負股 | 42,366,525–42,366,584 |
| TFF1_2 ↗ | 21:42,366,794 | 負股 | 42,366,784–42,366,843 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_74H92T · promoter · 42364352–42364452 · regulatory
ENSR21_838M2J · enhancer · 42364453–42364641 · regulatory
ENSR21_5CZ3GJ · CTCF_binding_site · 42366342–42366363 · regulatory
ENSR21_9LS2W · promoter · 42366525–42367025 · regulatory
ENSR21_9LS35 · enhancer · 42367380–42367698 · regulatory
· motif · 42364858–42364871 · motif
· motif · 42365541–42365555 · motif
· motif · 42366109–42366122 · motif
· motif · 42366344–42366360 · motif
· motif · 42366726–42366733 · motif
· motif · 42368177–42368186 · motif
· motif · 42368177–42368186 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：84 aa
TFF1 蛋白質長 84 個胺基酸。其第 1–24 位胺基酸為訊號序列；第 29–72 位則標註為 P-type 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TFF1 被標註為分泌型蛋白質；來源未提供其在細胞內其他區域的定位或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- BTN3A1O00481 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BTNL8Q6UX41 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD300LDQ6UXZ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCRL4Q96PJ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIEZO1Q92508 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SIGLEC8Q9NYZ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- VSNL1P62760 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF250P15622-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TFF1 與 GKN2 形成異源二聚體，兩者以二硫鍵連接。資料描述的是實體組成與連結方式，未提供其他互作或功能關係細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFF1 可穩定覆蓋胃腸黏膜的黏液凝膠，該凝膠提供抵禦多種有害物質的物理屏障；此外，TFF1 可能抑制尿液中草酸鈣晶體的生長。 | 含實驗來源 | 證據與來源Stabilizer of the mucous gel overlying the gastrointestinal mucosa that provides a physical barrier against various noxious agents. May inhibit the growth of calcium oxalate crystals in urine PMID 16308573 ↗ |
| 交互作用 | TFF1 與 GKN2 形成異源二聚體，兩個分子之間以二硫鍵連接。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATCCCTGACTCGGGGTCGCCTTTGGAGCAGAGAGGAGGCA40ATGGCCACCATGGAGAACAAGGTGATCTGCGCCCTGGTCC80TGGTGTCCATGCTGGCCCTCGGCACCCTGGCCGAGGCCCA120GACAGAGACGTGTACAGTGGCCCCCCGTGAAAGACAGAAT160TGTGGTTTTCCTGGTGTCACGCCCTCCCAGTGTGCAAATA200AGGGCTGCTGTTTCGACGACACCGTTCGTGGGGTCCCCTG240GTGCTTCTATCCTAATACCATCGACGTCCCTCCAGAAGAG280GAGTGTGAATTTTAGACACTTCTGCAGGGATCTGCCTGCA320TCCTGACGCGGTGCCGTCCCCAGCACGGTGATTAGTCCCA360GAGCTCGGCTGCCACCTCCACCGGACACCTCAGACACGCT400TCTGCAGCTGTGCCTCGGCTCACAACACAGATTGACTGCT440CTGACTTTGACTACTCAAAATTGGCCTAAAAATTAAAAGA480GATCGATATTAA492cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。