基因總覽
TFDP2 的正式名稱為 transcription factor Dp-2，屬於 E2F/DP 家族的蛋白質。它能與 E2F 家族成員形成異源二聚體，並以複合體形式參與轉錄調控。其蛋白質序列包含 DNA 結合區域、二聚化區域，以及與 CEBPA 互作相關的區域；另有核定位訊號與預測為無序的末端區域。這些特徵構成 TFDP2 與轉錄調控因子及 DNA 協同作用的基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000489671 ★ | 141,944,428–142,149,544 | 13 |
| ENST00001138976 | 141,944,428–142,149,594 | 13 |
| ENST00000499676 | 141,944,435–142,000,353 | 10 |
| ENST00000997106 | 141,944,435–142,149,594 | 13 |
| ENST00000997107 | 141,944,435–142,149,594 | 12 |
| ENST00000997108 | 141,944,435–142,149,594 | 12 |
| ENST00001041829 | 141,944,435–142,149,535 | 12 |
| ENST00000997109 | 141,949,808–142,149,594 | 13 |
| ENST00001041833 | 141,949,830–142,149,535 | 13 |
| ENST00000944546 | 141,950,961–142,149,535 | 12 |
| ENST00000486111 | 141,951,502–142,028,665 | 11 |
| ENST00000874024 | 141,951,519–142,149,594 | 12 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TFDP2 可促進 E2F 依賴的轉錄，並與 E2F 家族成員協同結合 DNA。這種結合發生於 E2 recognition site（5'-TTTC[CG]CGC-3'），該序列存在於多種基因的啟動子區域；這些基因的產物涉及細胞週期調控或 DNA 複製。因此，TFDP2:E2F 複合體參與細胞週期由 G1 期進入 S 期的控制。
E2F1:DP 複合體似乎同時參與細胞增殖與細胞凋亡。來源並未將這兩種作用限定為單一方向，故應理解為該複合體與兩類細胞過程皆有關聯。TFDP2 與 E2F 的轉錄調控角色，因而涵蓋細胞週期進程及增殖、凋亡相關的生物學過程。
TFDP2 也與脂肪細胞分化的抑制有關。TFDP2:E2F1 複合體可與 CEBPA 互作，阻止 CEBPA 結合其目標基因啟動子，並抑制 CEBPA 的轉錄活性；這項作用可抑制脂肪細胞分化。此機制與 TFDP2:E2F 複合體對特定轉錄因子功能的調節相關，而非僅限於細胞週期調控。
Promoter 與基因調控
>TFDP2 ENST00000489671 GRCh38 chr3:142149444-142150544 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGAGGCCCAGGCGGGAGGATCTCTTGAGTCCAGGAGTTCCAAACCAGCCTGGGAAACATGGCGAAACAGC CGGGTGTGGTGGCGCGGGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGTGGTGGTAGGATCACCTGAGACTG GGAAGTCAGGGCTCCAATGAGCCGTGATCCTGCCACCGCACTCCAGCCTCGGTGAGAGCAAGACCCCGTC TCAAAAACAAACAAAGTGGCATATAGAAGATCTATAAGATTTGACTGGAGTAAAATGAGAAAGATCTAAT CGTTTTAATGCGCTGTTCACACGGGGTTTTTAACTTCGGCACGAACGAATGAACAAAATCTTTTCATATG GAACCAAGTGTACGGGTATTTGGGGTGTGTGCAGTTTCCGCGGGACAGAATGACCTGTCCTGGTTTGGGT ATTAACTTGCCTTGATATTGAAGAACCTCCACATTCCCAGTGGTCTCTAACTCATTGTCTGAATAATTTC AAGGTGTCCCACAGTTGGCCCCACGCATAGCCTCAATCACGATCACTCGCCCCCCTGTCCCTTATTGATG CTCCCCCAGGGCGACCCCGCAAAGGCCTGGGGACCGAATGGAACTGCCCCAGTCCCCCTCCTTCCAAGAG AGCTGGGGTTTTCTGGCTTCGGGGTCAGTTGGAAAAGAGATTCCCACCCAAGTCGCAGGGTGGGAGTAGG GGGGATGAGATAGGAGTGATGAAGGAAGTGTGTCTAAAATTCTAGGCCTCAGGCCCGCAGCTGTCCCTGG AGGCGGCGGGGAAGCGGGGTGGTCGGGTCCTGCGGAGGGCTCCCAGGGAGGCCACAGGGGGAACCAAGGG GCGGTGGCTGAGTGCACGAGTCCCGCCCCTCCATCTGTTGGCCCCCTACTCTCAAAGGGAAGCCTGGGGG CGGGGTTTGTTTACTCCGTGCACGCACTGCCGGCCCGGCCAATCCGTGGGGAGCGGCGCCAGGCGTCGCA CATTCTGAGGGCCAATCGGCGCGCACTGTGCTGCTCCGCCGCCAAAGCTCGCGCGGGGGAAGCGGGGCTG TAGCTGGGCAGGGAGAGGGCGGACGAAATCGGTAGCGATCTCGGCTGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TFDP2_4 ↗ | 3:142,000,371 | 負股 | 142,000,361–142,000,420 |
| TFDP2_2 ↗ | 3:142,028,626 | 負股 | 142,028,616–142,028,675 |
| TFDP2_1 ↗ | 3:142,044,225 | 負股 | 142,044,215–142,044,274 |
| TFDP2_3 ↗ | 3:142,149,495 | 負股 | 142,149,485–142,149,544 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_CJ4SQ · enhancer · 142148146–142149521 · regulatory
ENSR3_538FQ3G · CTCF_binding_site · 142149470–142149491 · regulatory
ENSR3_B337NM · promoter · 142149522–142150034 · regulatory
ENSR3_538FQ3T · CTCF_binding_site · 142149563–142149584 · regulatory
ENSR3_538FQ4B · CTCF_binding_site · 142149660–142149681 · regulatory
ENSR3_866SS7 · enhancer · 142152470–142152667 · regulatory
· motif · 142149396–142149409 · motif
· motif · 142149472–142149488 · motif
· motif · 142149565–142149581 · motif
· motif · 142149629–142149639 · motif
· motif · 142149662–142149678 · motif
· motif · 142149675–142149685 · motif
· motif · 142149698–142149708 · motif
· motif · 142149845–142149855 · motif
· motif · 142151423–142151434 · motif
· motif · 142152838–142152850 · motif
· motif · 142152886–142152898 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：446 aa
TFDP2 蛋白長 446 個胺基酸，屬於 E2F/DP 家族。其 DNA 結合區域位於胺基酸 129–210，二聚化區域位於 219–292；另註記有 DCB1、DCB2 區域及與 CEBPA 互作的區段。胺基酸 103–118 含核定位訊號，末端 409–446 為預測的無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- E2F6O75461 · UniProt INTERACTION · 11 experiments · 2 筆來源紀錄
- E7P03129 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- E2F4Q16254 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TFDP2 與 E2F 家族成員形成異源二聚體，並為 DRTF1/E2F 及 DREAM（LINC）複合體的組成成分。TFDP2:E2F1 可與 CEBPA 互作；另有與 GMCL 互作的相似性註記。DRTF1/E2F 複合體可與低磷酸化的 RB1、RBL1 或 RBL2 互動，這些蛋白會抑制 E2F 的轉錄活化區域。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TFDP2 可促進 E2F 依賴的轉錄，並與 E2F 家族成員協同結合啟動子中的 E2 recognition site；相關基因產物涉及細胞週期調控或 DNA 複製。TFDP2:E2F 複合體參與 G1 至 S 期進程控制；E2F1:DP 複合體似乎涉及細胞增殖與凋亡。TFDP2 也可藉由抑制 CEBPA 結合目標啟動子而阻止脂肪細胞分化。 | 推論支持 | 證據與來源Can stimulate E2F-dependent transcription. Binds DNA cooperatively with E2F family members through the E2 recognition site, 5'-TTTC[CG]CGC-3', found in the promoter region of a number of genes whose products are involved in cell cycle regulation or in DNA replication. The TFDP2:E2F complex functions in the control of cell-cycle progression from G1 to S phase. The E2F1:DP complex appears to mediate both cell proliferation and apoptosis. Blocks adipocyte differentiation by repressing CEBPA binding to its target gene promoters PMID 20176812 ↗ |
| 交互作用 | TFDP2 與 E2F 成員形成異源二聚體，並組成 DRTF1/E2F 與 DREAM（LINC）複合體。低磷酸化 RB1、RBL1、RBL2 可與 DRTF1/E2F 複合體互動並抑制 E2F；RB 在 G1 期中後段磷酸化後脫離，使 E2F 具轉錄活性。DREAM 在靜止細胞抑制細胞週期相關基因，並於 S 期解離。TFDP2:E2F1 與 CEBPA 互作並抑制其轉錄活性；另有與 GMCL 互作的相似性註記。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the DRTF1/E2F transcription factor complex. Forms heterodimers with E2F family members. The complex can interact with hypophosphorylated retinoblastoma protein RB1 and related proteins (RBL1 and RBL2) that inhibit the E2F transactivation domain. During the cell cycle, RB becomes phosphorylated in mid-to-late G1 phase, detaches from the DRTF1/E2F complex rendering E2F transcriptionally active. Viral oncoproteins, notably E1A, T-antigen and HPV E7, are capable of sequestering RB protein, thus releasing the active complex. Interacts with GMCL (By similarity). Component of the DREAM complex (also named LINC complex) at least composed of E2F4, E2F5, LIN9, LIN37, LIN52, LIN54, MYBL1, MYBL2, RBL1, RBL2, RBBP4, TFDP1 and TFDP2. The complex exists in quiescent cells where it represses cell cycle-dependent genes. It dissociates in S phase when LIN9, LIN37, LIN52 and LIN54 form a subcomplex that binds to MYBL2. The complex TFDP2:E2F1 interacts with CEBPA; the interaction prevents CEBPA binding to target genes promoters and represses its transcriptional activity PMID 16360038 ↗ · PMID 17531812 ↗ |
| 細胞定位 | TFDP2 定位於細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCGCACTGTGCTGCTCCGCCGCCAAAGCTCGCGCGGGGGA40AGCGGGGCTGTAGCTGGGCAGGGAGAGGGCGGACGAAATC80GGTAGCGATCTCGGCTGCGGCGCTGCCGCAGCTGCCCGGC120CCGCGGGGCGCGCCCTGACCCTTCATCTTTGGGCAGGCTC160GAGGGCGCGCGCACGGTTGGCGTTCTGGGGCCTCAAACTC200CTGGGCCTTGACCGGGCAGGCCGCGTCTCCCCGGGTGTGA240GTCCACCGGGACCCGGCCGCCGCCTAAGCGCGGGCGCCAC280AGAAGCGGCGGCGCCCGAAGACGCGCTCCTGGCTCGGCCC320GACAGCCTCGCTTGGCCGCCAGTTCTTCTGCAGCCGAAGG360CGGTTGTTCTTTTAAAGAATTATTGAAGACGAAGGTTTTT400TTCTTTTTATTTTTTTAATGGCTTTACAGAATCTTAAATA440GAATACAGTTTGACATGACGGCAAAAAATGTTGGTTTGAC480TTCCACAAATGCAGAAGTAAGAGGATTTATAGATCAGAAT520CTCAGTCCAACAAAAGGCAACATTTCATTTGTTGCATTTC560CAGTTTCCAATACCAACTCACCTACAAAGATTTTACCAAA600AACCTTAGGACCAATAAATGTGAATGTTGGACCCCAAATG640ATTATAAGCACACCACAGAGACTAACCAGTTCAGGAAGTG680TTCTGATTGGGAGTCCATATACCCCTGCACCAGCAATGGT720TACTCAGACACACATAGCAGAAGCTACTGGCTGGGTCCCT760GGTGATAGAAAACGGGCTAGAAAATTTATAGACTCTGATT800TTTCAGAAAGTAAACGAAGCAAAAAAGGAGATAAAAATGG840GAAAGGCTTGAGACACTTTTCAATGAAAGTGTGTGAGAAA880GTTCAACGAAAAGGTACAACATCGTACAATGAAGTCGCTG920ATGAGCTGGTGTCAGAGTTCACCAATTCAAATAACCATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。