基因總覽
TEX15 的正式名稱為 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated,是蛋白質編碼基因,其產物為 Testis-expressed protein 15。來源將其描述為精子生成及雄性胚胎生殖細胞中 PIWIL4-piRNA 路徑的重要參與者,並指出它屬於 TEX15 family。現有資料未提供更詳細的家族特徵或蛋白質整體結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000643185 ★ | 30,831,544–30,913,008 | 11 |
| ENST00000638951 | 30,831,425–30,888,706 | 10 |
| ENST00001139761 | 30,831,425–30,913,008 | 11 |
| ENST00000256246 | 30,831,546–30,849,017 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEX15 在精子生成過程中是正常染色體聯會與生殖細胞減數重組所需的蛋白質。來源指出,它對減數分裂染色體上形成 DMC1 與 RAD51 焦點是必要的;這項觀察提示 TEX15 可能特別參與 DNA 雙股斷裂修復,但此功能描述標示為依相似性推論。
在雄性胚胎生殖細胞中,TEX15 被描述為 PIWIL4-piRNA 路徑執行轉座子 DNA 甲基化與沉默所必需的因子。PIWIL4-piRNA 會結合新生的轉座子轉錄本,並與 TEX15 互作;TEX15 可能進一步將表觀遺傳沉默機制帶至轉座子位點。這項路徑及作用方式同樣是依相似性推論,不能視為已在此來源中直接證實。
TEX15 並非 piRNA 生合成所必需。來源所描述的角色因此與 piRNA 引導的轉座子沉默執行階段相關,而不是 piRNA 的生成;此區分有助於界定其在雄性胚胎生殖細胞中的功能範圍。
Promoter 與基因調控
>TEX15 ENST00000643185 GRCh38 chr8:30912908-30914008 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTGTGAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGAATCTCACTCCTTTGCCCAGGCTGGA GTGCAGTGGCGTGAGCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCC TTTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGCATTTTTTAGTAGAGACT GGGATTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACACCTCAGGTGATCCGCCCGTCTCGGCCTTTCAGAGT GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGAATACTGCATCTTTTAAGCTGCCTGTCTTCAGCG TCTTCGCCCCTAAAGGATTCACCCACTGAAGGATGAAGTGACTCTCAGGCCTGCAATTGTAAAACTAAAT CTGAGTGACTGGACTGGAAGACTTCGATTCTGTAATCTATATAGCCTCTGAATCAGGCTTTCATAAGCCG CGCTATGAAGTAGAATTAATTTTCTGAGTGCAAGGATTTTTTTTGTTTTTGGCAGAGGAGGTCTCACTAT GTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACGCACCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGAGATCACCGACCACCG CACCCGACAGAATGAGTCTGGTAAAAATCTTCATGCTTTAGATCCCTGAAACTTGGATGTACTTGTTAGC TCCAAGCTGAAGCCTTAGCTAAGGGATTTGGCCATTAGCTGAGCAACATAAAGTCCTCCCCGATCTTCTA ACTCCTTTTGAATTAAATTAGAAAGCCATGACAAAACGATCGTTTTGTTGAAGGCCCACTCCGTGTACAC GGAGTAGGCACTGAACACACAGTTTGCTTCAGGACATGGAAAGTCTCTCAGGAGTCCGTTCCTGCGCGGG CCCCACCTACGGGCTTCGAGCTTCCACGTGCAGGGCCTCTGGCTCCGCCCCCGGCGCAGTGCGCAAGCGC CGCTGCTTTCCGAGCTGCCTGCTCACTGTGCGCACCTCGCTGGGGGGTGCTGCTGTGTTCCTGAGGCTTC CAGGGAAGGCAGTGGGCGAAGGTCTGTACCGTGCTAAGATTGAGTCTGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_C53S5 · enhancer · 30911435–30912683 · regulatory
ENSR8_8WJKF · enhancer · 30912845–30912997 · regulatory
ENSR8_8WJKH · promoter · 30912998–30913164 · regulatory
· motif · 30913028–30913039 · motif
· motif · 30913028–30913039 · motif
· motif · 30913058–30913074 · motif
· motif · 30917700–30917711 · motif
· motif · 30917769–30917783 · motif
· motif · 30917769–30917783 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:2789 aa
Testis-expressed protein 15 屬於 TEX15 family,長度為 2789 個胺基酸。序列註解標示出五段預測的無序區:胺基酸 34–99、169–191、1063–1166、2303–2331 及 2351–2379。來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TEX15 被標示位於細胞質與細胞核。 來源未說明其在不同條件下的定位變化,也未提供異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
來源記載 TEX15 與 PIWIL4、PIWIL2 互作;此外,PIWIL4-piRNA 與 TEX15 的關聯被描述為參與轉座子沉默路徑。這些資料未進一步說明互作是否形成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
TEX15 變異與 Spermatogenic failure 25(SPGF25)相關。此病為自體隱性不孕症,精子生成缺陷可導致嚴重少精症或無精症;來源指出,致病原因是影響該基因的變異,未提供特定變異細節。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEX15 是精子生成時正常染色體聯會與生殖細胞減數重組所需的因子,並對減數分裂染色體上形成 DMC1、RAD51 焦點必要,提示其可能參與 DNA 雙股斷裂修復。它也參與雄性胚胎生殖細胞中 PIWIL4-piRNA 引導的轉座子甲基化與沉默;PIWIL4-piRNA 結合新生轉座子轉錄本並與 TEX15 互作,TEX15 可能招募沉默機制。上述內容均標示為依相似性推論;TEX15 不需參與 piRNA 生合成。 | 推論支持 | 證據與來源Required during spermatogenesis for normal chromosome synapsis and meiotic recombination in germ cells. Necessary for formation of DMC1 and RAD51 foci on meiotic chromosomes, suggesting a specific role in DNA double-stranded break repair (By similarity). Essential executor of PIWIL4-piRNA pathway directed transposon DNA methylation and silencing in the male embryonic germ cells (By similarity). PIWIL4-piRNA binds to nascent transposon transcripts and interacts with TEX15, which may in turn recruit the epigenetic silencing machinery to the transposon loci (By similarity). Not required for piRNA biosynthesis (By similarity) |
| 交互作用 | TEX15 與 PIWIL4 及 PIWIL2 互作;來源未提供互作條件或其所屬複合體的進一步說明。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | TEX15 的細胞內定位標示為細胞質與細胞核;來源未說明定位條件或不同異構型之間的差異。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | Spermatogenic failure 25(SPGF25)是一種自體隱性不孕症,精子生成缺陷可造成嚴重少精症或無精症。來源指出此病由影響 TEX15 的變異所致,但未列出具體變異資訊。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spermatogenic failure 25 SPGF25 An autosomal recessive infertility disorder caused by spermatogenesis defects that result in severe oligozoospermia or azoospermia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617960 PMID 26199321 ↗ · PMID 28303806 ↗ · PMID 28355598 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTCACTGTGCGCACCTCGCTGGGGGGTGCTGCTGTGTTC40CTGAGGCTTCCAGGGAAGGCAGTGGGCGAAGGTCTGTACC80GTGCTAAGATTGAGTCTGAGGAACTGACTGAGCAAAGAAG120ACAGCTCAAGATGTTCCCTTATCAGTTTTCATGTATGGAC160TGAGTACTGATTATAACTGTGTAATGCTGGATGCCATTGA200AGAGTGGCCAACAAAATGGAAATGAAAGAAACTGCTAAAC240AGGATACACTGTGGCAAATGAGCTCAACTAGCAAACCCGT280GTTGAATACTCGTGAAGTCAATCCTTTGAAGAAATTCACC320ATTCCTAAGATCAGGAGGACAGCTGAGAAAGTTTACTTGT360CACCTTGTTACACCAATAGTAGAGAGTATAGTTTTATACA400TGATACTCTTAACCAGTGCAGGCTTGATGTAAACTGTGAT440CTGCAGTCGTTATGGCAGTTTGGGGATACAAAACTGGTTC480ACAATGAGGAACTGGAAAAAAATTTTACTGCTAAGAGGTC520AGAGATGCGTGAAAGTGGAAGACATTGCAGGGAACTTGAA560GAACAGTTCTGCTTTTTAGCACTTCCCCAGAGTGATGTAG600CCCAGATATATCAGAATGGAATAAGTACCAGAGCATCTAC640ATTGAAGATACTAGGAAATCCTCTTCTTGGAATTTATATG680TTTAGACATGTTGATATTGCCTTGAATTATTCTCATAGTC720AAAGCATTACTGTAGAAAGTATTTTAATTTTTAAGGTTCT760CTTTGGAAAAGTGAAGAAAATCCAACCTTCTGTGGATAAA800AATAAAGTTTCTTTGGATCCTTCTCCTAACTTTGATTGCC840ATATGTCAAGAAATGCACCTTCTTTGAAAGATACCATTGA880ACTGCAAGCCTACAGTTCAGCAGTGTACTTCTATGAATAC920AGTGTCCTTTCAAAGCCTGTAGATAAACCTAGGCAATGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。