演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TEX15CT42

testis expressed 15, meiosis and synapsis associated

TEX15 是生殖細胞減數分裂與轉座子沉默所需的蛋白質,與染色體聯會及減數重組相關。

Homo sapiens8p12UniProt Q9BXT5
OFFICIAL SYMBOL
TEX15
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q9BXT5
PDB / ALPHAFOLD
無模型
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TEX15 的正式名稱為 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated,是蛋白質編碼基因,其產物為 Testis-expressed protein 15。來源將其描述為精子生成及雄性胚胎生殖細胞中 PIWIL4-piRNA 路徑的重要參與者,並指出它屬於 TEX15 family。現有資料未提供更詳細的家族特徵或蛋白質整體結構描述。

Official symbol
TEX15
Gene name
testis expressed 15, meiosis and synapsis associated
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11738
UniProt
Q9BXT5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CT42

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p12
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegTEX15pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:30,831,425–30,913,024
Gene span
81,600 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000643185 ★30,831,544–30,913,00811
ENST0000063895130,831,425–30,888,70610
ENST0000113976130,831,425–30,913,00811
ENST0000025624630,831,546–30,849,0174

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TEX15 在精子生成過程中是正常染色體聯會與生殖細胞減數重組所需的蛋白質。來源指出,它對減數分裂染色體上形成 DMC1 與 RAD51 焦點是必要的;這項觀察提示 TEX15 可能特別參與 DNA 雙股斷裂修復,但此功能描述標示為依相似性推論。

在雄性胚胎生殖細胞中,TEX15 被描述為 PIWIL4-piRNA 路徑執行轉座子 DNA 甲基化與沉默所必需的因子。PIWIL4-piRNA 會結合新生的轉座子轉錄本,並與 TEX15 互作;TEX15 可能進一步將表觀遺傳沉默機制帶至轉座子位點。這項路徑及作用方式同樣是依相似性推論,不能視為已在此來源中直接證實。

TEX15 並非 piRNA 生合成所必需。來源所描述的角色因此與 piRNA 引導的轉座子沉默執行階段相關,而不是 piRNA 的生成;此區分有助於界定其在雄性胚胎生殖細胞中的功能範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 30913008 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TEX15 ENST00000643185 GRCh38 chr8:30912908-30914008 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTGTGAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGAATCTCACTCCTTTGCCCAGGCTGGA
GTGCAGTGGCGTGAGCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCC
TTTCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGCATTTTTTAGTAGAGACT
GGGATTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACACCTCAGGTGATCCGCCCGTCTCGGCCTTTCAGAGT
GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGAATACTGCATCTTTTAAGCTGCCTGTCTTCAGCG
TCTTCGCCCCTAAAGGATTCACCCACTGAAGGATGAAGTGACTCTCAGGCCTGCAATTGTAAAACTAAAT
CTGAGTGACTGGACTGGAAGACTTCGATTCTGTAATCTATATAGCCTCTGAATCAGGCTTTCATAAGCCG
CGCTATGAAGTAGAATTAATTTTCTGAGTGCAAGGATTTTTTTTGTTTTTGGCAGAGGAGGTCTCACTAT
GTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAACGCACCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGAGATCACCGACCACCG
CACCCGACAGAATGAGTCTGGTAAAAATCTTCATGCTTTAGATCCCTGAAACTTGGATGTACTTGTTAGC
TCCAAGCTGAAGCCTTAGCTAAGGGATTTGGCCATTAGCTGAGCAACATAAAGTCCTCCCCGATCTTCTA
ACTCCTTTTGAATTAAATTAGAAAGCCATGACAAAACGATCGTTTTGTTGAAGGCCCACTCCGTGTACAC
GGAGTAGGCACTGAACACACAGTTTGCTTCAGGACATGGAAAGTCTCTCAGGAGTCCGTTCCTGCGCGGG
CCCCACCTACGGGCTTCGAGCTTCCACGTGCAGGGCCTCTGGCTCCGCCCCCGGCGCAGTGCGCAAGCGC
CGCTGCTTTCCGAGCTGCCTGCTCACTGTGCGCACCTCGCTGGGGGGTGCTGCTGTGTTCCTGAGGCTTC
CAGGGAAGGCAGTGGGCGAAGGTCTGTACCGTGCTAAGATTGAGTCTGAGG
TEX15 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_C53S5 · enhancer · 30911435–30912683 · regulatory

ENSR8_8WJKF · enhancer · 30912845–30912997 · regulatory

ENSR8_8WJKH · promoter · 30912998–30913164 · regulatory

· motif · 30913028–30913039 · motif

· motif · 30913028–30913039 · motif

· motif · 30913058–30913074 · motif

· motif · 30917700–30917711 · motif

· motif · 30917769–30917783 · motif

· motif · 30917769–30917783 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2789 aa

1 aa2789 aa功能區域
依 Q9BXT5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Testis-expressed protein 15 屬於 TEX15 family,長度為 2789 個胺基酸。序列註解標示出五段預測的無序區:胺基酸 34–99、169–191、1063–1166、2303–2331 及 2351–2379。來源未提供其他結構域或功能區域註解。

功能區域Disordered34–99 aa
功能區域Disordered169–191 aa
功能區域Disordered1063–1166 aa
功能區域Disordered2303–2331 aa
功能區域Disordered2351–2379 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
目前沒有可用的 PDB 或 AlphaFold DB 模型。
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

TEX15 被標示位於細胞質與細胞核。 來源未說明其在不同條件下的定位變化,也未提供異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CT42TEX15
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源記載 TEX15 與 PIWIL4、PIWIL2 互作;此外,PIWIL4-piRNA 與 TEX15 的關聯被描述為參與轉座子沉默路徑。這些資料未進一步說明互作是否形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TEX15 變異與 Spermatogenic failure 25(SPGF25)相關。此病為自體隱性不孕症,精子生成缺陷可導致嚴重少精症或無精症;來源指出,致病原因是影響該基因的變異,未提供特定變異細節。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TEX15 是精子生成時正常染色體聯會與生殖細胞減數重組所需的因子,並對減數分裂染色體上形成 DMC1、RAD51 焦點必要,提示其可能參與 DNA 雙股斷裂修復。它也參與雄性胚胎生殖細胞中 PIWIL4-piRNA 引導的轉座子甲基化與沉默;PIWIL4-piRNA 結合新生轉座子轉錄本並與 TEX15 互作,TEX15 可能招募沉默機制。上述內容均標示為依相似性推論;TEX15 不需參與 piRNA 生合成。推論支持
證據與來源

Required during spermatogenesis for normal chromosome synapsis and meiotic recombination in germ cells. Necessary for formation of DMC1 and RAD51 foci on meiotic chromosomes, suggesting a specific role in DNA double-stranded break repair (By similarity). Essential executor of PIWIL4-piRNA pathway directed transposon DNA methylation and silencing in the male embryonic germ cells (By similarity). PIWIL4-piRNA binds to nascent transposon transcripts and interacts with TEX15, which may in turn recruit the epigenetic silencing machinery to the transposon loci (By similarity). Not required for piRNA biosynthesis (By similarity)

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交互作用TEX15 與 PIWIL4 及 PIWIL2 互作;來源未提供互作條件或其所屬複合體的進一步說明。推論支持
證據與來源

Interacts with PIWIL4 and PIWIL2

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細胞定位TEX15 的細胞內定位標示為細胞質與細胞核;來源未說明定位條件或不同異構型之間的差異。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus

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疾病關聯Spermatogenic failure 25(SPGF25)是一種自體隱性不孕症,精子生成缺陷可造成嚴重少精症或無精症。來源指出此病由影響 TEX15 的變異所致,但未列出具體變異資訊。含實驗來源
證據與來源

Spermatogenic failure 25 SPGF25 An autosomal recessive infertility disorder caused by spermatogenesis defects that result in severe oligozoospermia or azoospermia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617960

PMID 26199321 ↗ · PMID 28303806 ↗ · PMID 28355598 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000643185 · 11,476 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCACTGTGCGCACCTCGCTGGGGGGTGCTGCTGTGTTC40
41CTGAGGCTTCCAGGGAAGGCAGTGGGCGAAGGTCTGTACC80
81GTGCTAAGATTGAGTCTGAGGAACTGACTGAGCAAAGAAG120
121ACAGCTCAAGATGTTCCCTTATCAGTTTTCATGTATGGAC160
161TGAGTACTGATTATAACTGTGTAATGCTGGATGCCATTGA200
201AGAGTGGCCAACAAAATGGAAATGAAAGAAACTGCTAAAC240
241AGGATACACTGTGGCAAATGAGCTCAACTAGCAAACCCGT280
281GTTGAATACTCGTGAAGTCAATCCTTTGAAGAAATTCACC320
321ATTCCTAAGATCAGGAGGACAGCTGAGAAAGTTTACTTGT360
361CACCTTGTTACACCAATAGTAGAGAGTATAGTTTTATACA400
401TGATACTCTTAACCAGTGCAGGCTTGATGTAAACTGTGAT440
441CTGCAGTCGTTATGGCAGTTTGGGGATACAAAACTGGTTC480
481ACAATGAGGAACTGGAAAAAAATTTTACTGCTAAGAGGTC520
521AGAGATGCGTGAAAGTGGAAGACATTGCAGGGAACTTGAA560
561GAACAGTTCTGCTTTTTAGCACTTCCCCAGAGTGATGTAG600
601CCCAGATATATCAGAATGGAATAAGTACCAGAGCATCTAC640
641ATTGAAGATACTAGGAAATCCTCTTCTTGGAATTTATATG680
681TTTAGACATGTTGATATTGCCTTGAATTATTCTCATAGTC720
721AAAGCATTACTGTAGAAAGTATTTTAATTTTTAAGGTTCT760
761CTTTGGAAAAGTGAAGAAAATCCAACCTTCTGTGGATAAA800
801AATAAAGTTTCTTTGGATCCTTCTCCTAACTTTGATTGCC840
841ATATGTCAAGAAATGCACCTTCTTTGAAAGATACCATTGA880
881ACTGCAAGCCTACAGTTCAGCAGTGTACTTCTATGAATAC920
921AGTGTCCTTTCAAAGCCTGTAGATAAACCTAGGCAATGTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。