基因總覽
TEX13A（testis expressed 13A）是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，其產物 Testis-expressed protein 13A 屬於 TEX13 family，長 409 個胺基酸。來源所述的特性包括辨識特定序列的單股 RNA，以及參與轉錄抑制與精子運動相關過程；其中部分功能註解標示為依相似性推定。蛋白質序列含有 RanBP2-type zinc finger，另有一段被註解為無序區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000600991 ★ | 105,218,929–105,220,694 | 3 |
| ENST00000609007 | 105,218,929–105,220,694 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEX13A 可結合含有共識序列 5'-AGGUAA-3' 的單股 RNA（ssRNA）。此項 RNA 結合特性提供了其與 RNA 相關功能的直接線索；來源未進一步說明結合後如何影響 RNA 的處理或命運。
依相似性推定，TEX13A 參與轉錄抑制。來源將第 92 至 408 個胺基酸標註為轉錄抑制所需區域，但未提供此區域如何作用於轉錄過程的細節，因此不宜據此延伸描述具體分子機制。
來源亦依相似性指出，TEX13A 對精子快速運動及 mRNA 及時降解是必要的，並將 mRNA 降解與其和 CNOT1 的互作相連結。這些功能註解描述的是精子運動與 mRNA 降解兩項相關角色；但來源沒有交代實驗條件或更完整的因果步驟。另有關 CNOT1 互作可能抑制其結合 mRNA 的說法，屬於可能性描述，並非確定結論。
Promoter 與基因調控
>TEX13A ENST00000600991 GRCh38 chrX:105220594-105221694 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCATGTAAACAGACTGAAACTTAACATAAGCTGTATAAAAGACAGCCTAATTTCAGCCAAACACAACTAG CCAGGCTCCAGCTAATTACAGGCAGTCAAGTGACAAGACCATGTCCAAATAAGGCAAATGCCTTGCTGTA GCCAATCAGGTGATTTTTCTCTTTTGTGTCCAAACTCAGCCTATAAAAATTCACTTCTCATGTTGCTGGG AATAGCTCTCTGAAACTCTTCTGGTTCTGAGTACTGACAAATTCATGACTCGTTTTTCTTTTTTTTTTTT TTTGGTTGTTGTTTATGTGTAAACAAACTGTTAACGTTGTCTAACGTTTTTCTTTTAACAGGGAAAAGGG GGAGTCATATCATGAACATTCTGATTGTATGTGTCTGTAGGACATGTATGAAATGTGAATCTAGATTGGG AGTTTGACATCTACAGGCCAAATCATGCCAACTGCCTGGTTTTATAAATGAACTTTTATTAGAACATGGC CATGGTCATTTCTTCAGGTATTATTTATGGCTGCTTTTGTGCTACAAGTAGTTGGGATAATCTTTTGCCC ACAAAGCCTCAAATGCCTGCTATCTTGCCCGTTTCAGAAAAAGGTCACTAACCTGTATACTAGGATTTAG GAGTCTGGAAAATGAACTGCAGAATTTTCATGGGTTGGGGGCTTTTTCGTGTTCTAGAACATACCCATTA TTCCCCCTTCAACCTCTAGGGGGGTCCCTACTAGCCGTTGGCATGGGACAAACCATTGTCAAGAGGGAGG GATACATGGGACTTTTTTGACTTGATTATAAGGGCTTAATTTTCTTGGTTCTAAGTCTTTTCTGACCACT CCTGTTTCTTCCGACCTTTAAGGGCTCCCAACCATGTGACAGGTTCCCTTAAATCCCAATGGAGTGGCAG GGGCCTTCCTCACTCACTCCCTTCCACTCCTGGTATCTCTGGAAATTGGAACAGTCCCAGAGTAAAAGCC GACGTTGGCCCTGAGTCTTCCTTTCCCTGGAACCTTAGGAGGGAGAGAGATCTTCCTCTCTCTTCGGGCG TGTTAAGACAGCGGGGTTGGCCTGTACTTCCTCTGGCCCTGGCTGAAGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEX13A_1 ↗ | X:105,220,694 | 負股 | 105,220,684–105,220,743 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 105221568–105221583 · motif
· motif · 105221568–105221583 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：409 aa
Testis-expressed protein 13A 長 409 個胺基酸，屬於 TEX13 family。其第 376 至 400 個胺基酸區段含有 RanBP2-type zinc finger；第 347 至 374 個胺基酸區段則被註解為無序區域。第 92 至 408 個胺基酸區段被標示為轉錄抑制所需，但此功能註解是依相似性推定。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ATP5POP48047 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYO15BQ96JP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBC1D10AQ9BXI6 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TTC23Q5W5X9-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TXNP10599 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TEX13A 與 CNOT1 互作。來源指出，這項互作可能抑制 CNOT1 與 mRNA 結合，進而抑制由 CNOT1 介導的 mRNA 降解；此作用以可能性表述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEX13A 可結合含有共識序列 5'-AGGUAA-3' 的單股 RNA。依相似性推定，它參與轉錄抑制，並透過與 CNOT1 互作，對精子的快速運動及 mRNA 及時降解具有必要作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds to ssRNA containing the consensus sequence 5'-AGGUAA-3'. Plays a role in transcriptional repression (By similarity). Required for rapid sperm motility and timely degradation of mRNA via its interaction with CNOT1 (By similarity) PMID 21256132 ↗ |
| 交互作用 | TEX13A 與 CNOT1 互作；此互作可能抑制 CNOT1 結合 mRNA，並進一步抑制由 CNOT1 介導的 mRNA 降解。來源以可能性描述此作用。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with CNOT1; the interaction may inhibit CNOT1 binding to mRNA and subsequently CNOT1-mediated mRNA degradation |
核酸與蛋白質序列
CTTTCCCTGGAACCTTAGGAGGGAGAGAGATCTTCCTCTC40TCTTCGGGCGTGTTAAGACAGCGGGGTTGGCCTGTACTTC80CTCTGGCCCTGGCTGAAGAGGGCTAGTGAAACCGTTAAAC120CCCTAGGCGATCATGGCCTTGAGACCTGAGGACCCCAGTA160GCGGGTTCCGGCATAGCAACGTGGTGGCCTTCATCAACGA200GAAAATGGCCAGGCACACGAAAGGCCCCGAGTTCTATCTT240GAGAATATATCCTTATCCTGGGAGAAGGTGGAAGACAAGC280TGAGGGCCATACTGGAGGACAGCGAGGTGCCCAGTGAGGT320CAAAGAGGCCTGCACCTGGGGCAGCCTGGCCTTGGGAGTG360CGCTTTGCCCACAGGCAGGCACAGCTACAAAGGCACAGGG400TGCGGTGGCTGCACGGCTTCGCCAAACTGCACAAATCAGC440CGCACAGGCCTTGGCATCAGACCTGAAGAAGCTCAGGGAG480CAGCAGGAGACGGAACGCAAGGAGGCGGCCTCCCGGCTAA520GAATGGCCCAGACCAGCCTCGTGGAGGTGCAGAAAGAGAG560AGACAAGGAGCTGGTGTCTCCCCATGAGTGGGAGCAGGGG600GCAGGGTGGCCAGGCCTGGCCACTGCCGGAGGGGTTTGCA640CAGAAGGAGCAGCTGAGGAGGAAGAAGAGGCGGCGGTGGC680TGCTGCTGGTGCTGCTGGAGGAAAAGGAGCAGAAGAAGAG720CAGAGGGATGTGGAGGTTGTGGCTGCCCCTGTGGAGGCCA760TGGCTCCCCCTGTGGAGGCTGGGGCTGCCCCCATGGAGAC800CCAGTTCCCCCACGTGGAGGCCAGGGCTGCCTCCATGGAG840ACCACAGAGAAGCTGGAGAGAATCCTCCTGCAGCTCCTTG880GAGATGCTGATCAGGAAAAGTACACCTATTGGGGGCAGAA920GGAGGGAGATCTCCGGTCGGTCGAAACAGCCACATCTTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。