演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TEX12

testis expressed 12

TEX12(testis expressed 12)是蛋白質編碼基因;其產物 Testis-expressed protein 12 與減數分裂前期的聯會複合體中央區相關。

Homo sapiens11q23.1UniProt Q9BXU0
OFFICIAL SYMBOL
TEX12
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9BXU0
PDB / ALPHAFOLD
6HK9
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TEX12(testis expressed 12)是蛋白質編碼基因,產物名稱為 Testis-expressed protein 12。現有資料將其描述為聯會複合體中央區橫向中央元件的組成部分;相關功能註記標示為依相似性推定,並非此處提供的直接驗證。來源未提供其家族分類或更完整的結構描述,因此不據此延伸說明。

Official symbol
TEX12
Gene name
testis expressed 12
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11734
UniProt
Q9BXU0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q23.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegTEX12pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:112,167,313–112,173,057
Gene span
5,745 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000280358 ★112,167,372–112,172,5565
ENST00000530752112,167,313–112,173,0575
ENST00001090795112,167,313–112,173,0574
ENST00001143737112,167,372–112,173,0575
ENST00000863453112,168,989–112,173,0574

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

依相似性推定,Testis-expressed protein 12 是減數分裂前期聯會複合體(synaptonemal complex)橫向中央元件的組成部分。這個中央元件形成於同源染色體之間,因此 TEX12 的註記將其與減數分裂前期染色體聯會區域相連。此功能描述屬於依相似性推定,來源未提供直接實驗結果,故不應視為已由該資料確證。

其納入聯會複合體中央元件被描述為需要 SYCP1;換言之,來源指出在缺少此條件時,TEX12 不具備所述的中央元件納入條件。這項依相似性推定的關係,界定了 SYCP1 與 TEX12 位於同一中央結構形成脈絡中的條件性關聯,但沒有交代具體分子作用方式,也不足以推論兩者直接結合。

因此,現有資料支持的功能範圍,限於 TEX12 作為聯會複合體中央元件組成部分的註記,以及其納入該元件需有 SYCP1。來源未進一步說明此組成關係對染色體配對或其他減數分裂結果的影響,也未提供可延伸至其他生物學過程的資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 112167372 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TEX12 ENST00000280358 GRCh38 chr11:112166372-112167472 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATTGAGCGCTTATTTTCTAGGAACTTATTTAAAACAACCGGCTTCTTCACAAACAGCAAATAAATATAC
ACACACAGAATACTTCCAAGACTTAATGATAACTAACATTTAATCAAGCAAAAGGAAAAAAAAAACCTTA
GTAATGTATGTAAATGTTAAATATAGTTCTCTAAGATGTAAGATTTTGTACCTGGAGCTTATGGATGTGT
GTTATTGACCTTTGTGTTATGAGGTAATTTGCTTTTTTTTTTCTTCCACATCCACTAACTGGGCGTAAGC
TTGGAATGTATATCTTTGAAATTGCAGGTCAAAGCCTCCGCATTAAAGCACCCGATGAGGCAAAGCTACA
ATTATGTGAGCCATGTGTGTTATGCAACACTTTTTGATAGCTGTTGCCAATTAGACTTAACTTATTGACA
CACCCGGGGAAGAATTTTCTAAGAAGGCGTGATTCTGAACGTTTGGTTGCACCAAAGAGGAAGAGGGGGC
AGTAACTGAGGCTCTGGATCTAAAAGCCTTGCTTGTGGGCCAGGGGAACACGTGATTAAAGCCTTCCTGC
AAACAGAGCATCTGCAAACGCAGTTTTAAACCCTTCCTGCAAACAAACCAAGTAAATTTTACTCGAAAAG
AGGCCGTGGATGTGCTATTTTGTGTTCCTTTGCTGAGATTCTAAGCTGCTGGGACACACACCGGCCTTGC
TTTGGCAAGTCTTCCTTGTTCTTTCTTGACCAGTTTCAGATTTTTTCCTGGTTCAAACACACACAGGGTG
GCAGGGAGAGATTTTTGTTTCACGAGTATTCCAAGTGGAGGGGAAAGAGCGGGAGAAAACCGGGAAAAAG
CTGCCTTTCCGTGGGGCCTGGCTCTGGGAGGCTACGGTGGGGAAGTTGGGGGGGGTGGTGGTGGGAGAGC
TGTCACGTGACTCGTGCAGGGGCTGCTGGGAGTGCGGCGCGCTTCCCACCTCCACCCCCGAAGTCCGAGC
ACCCCGCGCCCGGGGTCTTCACTCCCTCGCGTTCGCTGACGAGGAAGGTCCCCATACCGCGAAGTACATT
GGCCTTGGGGTGGGGCTGGAGGGATGGGCGCCTGTGAGAATGTGACGGACT
TEX12 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TEX12_1 ↗11:112,167,372正股112,167,323–112,167,382

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_CF5HN · enhancer · 112162810–112164063 · regulatory

ENSR11_5ZDBHQ · CTCF_binding_site · 112163982–112164003 · regulatory

ENSR11_93MJ2X · promoter · 112164064–112164433 · regulatory

ENSR11_93MJ3M · enhancer · 112166558–112166982 · regulatory

· motif · 112163984–112164000 · motif

· motif · 112165153–112165164 · motif

· motif · 112166740–112166749 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:123 aa

1 aa123 aa功能區域
依 Q9BXU0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Testis-expressed protein 12 長 123 個胺基酸。序列第 1 至 39 位被註記為無序區域;此項特徵來自序列分析註解。來源未列出其他結構域或功能區域。

功能區域Disordered1–39 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6HK9…

PDB · 6HK9

X-ray · 1.45 A · A/B=49-123

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Chromosome

在減數分裂前期 I,TEX12 位於聯會複合體中央區、側向元件之間的橫向中央元件;其出現限於染色體核心已完成聯會的位置。 此定位描述針對 TEX12,來源未提供其他階段或異構型的定位差異。

未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 30 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TEX12TEX12AIMP2AP2B1BACE2CCNCCEP57COX5BCRYAADYNC1H1FAM161BFAM9CFGFR3GRIN2CHRASINCA1KCNIP3KLF11LENG1MESDMSGN1NUP54NUP58OIP5PAK1PPP1R13BSGF29SMARCE1SUOXSYCE2UBQLN1ZNF835
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料註記 TEX12 與 SYCE2 有交互作用,但未進一步說明此關係屬於直接結合或複合體組成,也未提供實驗情境或功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能依相似性推定,TEX12 是減數分裂前期形成於同源染色體之間的聯會複合體橫向中央元件的組成部分;其納入該中央元件需要 SYCP1。此註記屬推定性描述。推論支持
證據與來源

Component of the transverse central element of synaptonemal complexes (SCS), formed between homologous chromosomes during meiotic prophase (By similarity). Requires SYCP1 in order to be incorporated into the central element (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用資料註記 TEX12 與 SYCE2 有交互作用;未提供此交互作用是否為直接結合、所處實驗系統或其功能後果等資訊。推論支持
證據與來源

Interacts with SYCE2

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位在減數分裂前期 I,TEX12 位於聯會複合體中央區中、側向元件之間的橫向中央元件;此定位只見於染色體核心已聯會的位置。來源未說明其他階段的定位。推論支持
證據與來源

Chromosome; In prophase I stage of meiosis, localizes in the transverse central elements of the central region between lateral elements of the synaptonemal complexes. Found only where the chromosome cores are synapsed

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000280358 · 1,144 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCCCTCGCGTTCGCTGACGAGGAAGGTCCCCATACCGC40
41GAAGTACATTGGCCTTGGGGTGGGGCTGGAGGGATGGGCG80
81CCTGTGAGAATGTGACGGACTGTGACACAAGGAAGGCTGG120
121TGCCTTCGGAATATGATGGCAAATCACCTTGTAAAGCCTG160
161ATAATAGAAATTGCAAGAGGCCAAGAGAATTGGAGTCTCC200
201AGTGCCAGATAGTCCACAGCTGTCCTCTCTTGGAAAATCA240
241GATTCATCTTTCTCTGAAATTTCCGGACTATTTTATAAAG280
281ATGAAGCCTTGGAGAAAGATTTAAATGATGTGAGCAAGGA320
321AATTAATCTAATGTTGTCTACCTATGCAAAGCTTTTAAGT360
361GAGAGAGCAGCAGTAGATGCATCTTACATTGATGAGATAG400
401ATGAACTCTTCAAAGAAGCCAATGCTATTGAAAACTTTCT440
441AATACAAAAAAGAGAGTTCCTGCGACAGAGGTTTACAGTG480
481ATTGCAAACACATTACACAGATAAAATATATACTTGAAAT520
521AAGCTGAGAATTTAAACCTATTATTGTTATAATGAAAGAA560
561TGACATTTATGCTTTGAAAGCTCTCGAGTTGTTAAAGAAA600
601ATGTATATCTCGAATAGAGAAGGGGAAACTCCTTGAATTT640
641CTAGGTTTAAAAAGGAACTTTTAAATTCCTTAATGTTAAT680
681ATTAATGTTCATGTTAATGTCCTAAGCTGGCCATTAACAT720
721GAACTACGTCACTTTTCTTTTGAGGGTCAAATATTTAGTG760
761CATTTTATAGAAGTGTAAATTATTTAAATCTTATGTGGAT800
801TCTTTTATTTTTTCCTTAAACTTCTTAGTGTTTCTGAAAC840
841TTCTAAAAAAGGATTCAGTTAATTTATAATGTTTAATAAT880
881ATTATACTTTTAGAATATTTTGTTTAAATATCAGATAGTT920
921TTGGAGATAATTTTGAAATTTTTTTTATGGTCAGGATTAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。