演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TEX11TSGA3

testis expressed 11

TEX11 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,產物屬於 SPO22 家族,參與減數分裂時的染色體聯會與交叉互換形成。

Homo sapiensXq13.1UniProt Q8IYF3
OFFICIAL SYMBOL
TEX11
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q8IYF3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TEX11(testis expressed 11)是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,基因產物屬於 SPO22 家族。現有資料將其與減數分裂中的染色體聯會及交叉互換形成相連結,並指出它在精母細胞與胎兒卵母細胞的聯會複合體上呈離散焦點排列。這些特徵使 TEX11 成為與減數分裂染色體行為相關的蛋白質;來源未提供其胺基酸長度或更細部的結構描述。

Official symbol
TEX11
Gene name
testis expressed 11
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11733
UniProt
Q8IYF3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TSGA3TGC1ZIP4ZIP4HMZIP4Spo22

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq13.1
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegTEX11pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:70,528,940–70,908,711
Gene span
379,772 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000374333 ★70,528,940–70,908,71130
ENST0000037432070,528,940–70,724,29219
ENST0000039588970,528,940–70,908,71131
ENST0000034430470,528,941–70,897,54629

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TEX11 是減數分裂期間交叉互換的調節因子。交叉互換是減數分裂染色體重組過程的一部分;來源指出 TEX11 參與交叉互換的形成,但未進一步說明其調節方式、直接作用對象或分子步驟。因此,現有資訊支持其在這項過程中具有調節角色,不能據此推定特定的催化活性或完整機制。

TEX11 也參與染色體聯會的起始和/或維持。聯會涉及減數分裂染色體之間的配對組織;來源將 TEX11 的作用描述為可能涵蓋聯會開始形成,或在形成後協助維持,並未判定其作用只限於其中一個階段。資料亦未詳述它如何促成聯會,或其與聯會複合體其他成分之間的功能分工。

染色體聯會與交叉互換形成是來源明確連結至 TEX11 的兩項減數分裂相關過程。這些描述顯示 TEX11 的已知功能重點位於減數分裂期間的染色體組織與重組,但來源沒有提供其對生殖細胞發育或生育能力影響的直接機制證據,也未量化其對交叉互換數量或聯會程度的作用。相關功能註解帶有同源相似性證據,因此應保留其證據性質,不將簡短註解延伸為已完全解析的作用模型。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 70908711 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TEX11 ENST00000374333 GRCh38 chrX:70908611-70909711 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCAACTCCCGACCTCAGGTGATCTACCCGCCTCGGCCTCCGAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCA
CCGTGCTCGGCCTATTTATTTATTTATTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC
AATGTCTCGGCTCACCACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCCTCCTGCCTCAACCTCCCAA
GTAGCTGGCATTATAGGCATGCACCACCACGCCCAGCTAATTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCT
CCATGTTTGTCAGGCTGGTCTGGAGCACCCGATCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTT
GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCCCCCGACTTATTTTTTATTTTTAAGAGACATGATCTCGCTGTCTCC
CAGGCTGGAGTGCAGTGGTGGGATCATGGCTTATTGGACCTAAACTCTCAGGCTCAAATGATCCTTCCAC
CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAACTACAGGCGTGTGCCACCACACCTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGG
TTCAGGTGCAGTCTGGCTTGTTGATCAGGCTGGCCTCGACTAGTCTCCTCAGCTTCTAATATTTCTGCTA
TTTCTGACCTTTGCCACTCTTGCATAACCAGTGATCAACAATGTCTACTTGCTTTATTTCTTTTTCTGTT
CTTTTTTTTGTGTGTGTGAAGTCCTGCTCTCCTTTTGGTAATCCTGGCCATCTGCACTTTTCCCTCAATT
CATTGTCTTATGCTTTCAGAATTACATCATATTTGCTTACTCTCAGTTATTCTCACCCTGAACTCACCAA
GTGACTGACTCTCTGAACTGCATCCCCAGGATCTAAGGTCTAGACTGGGTCGCAAGGCTTAGGCTCCGTG
ACACAGCGTAAAGGCCAAGTGGGAGTGGCTTTAGTGGCCTAGCGTGACACCGCTAGCGTCGCTAGGGGGC
GGAGTTTTCTGAACGTCCTCGTGCGCTGTGGACGGAGGTTGTGGAGAGAGCAGGGCGGCATTGGTGGCTG
CGGCTGAGGTGAGTGGTTTAGTGGGCAGGAAGGGGTAGAATAGGCTTCAAG
TEX11 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TEX11_1 ↗X:70,908,711負股70,908,701–70,908,760

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_8449S6 · promoter · 70908701–70908861 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:940 aa

TEX11 蛋白屬於 SPO22 家族。可用資料未提供其結構域、功能區段或序列特徵的進一步描述,因此無法據此補充更細部的蛋白質結構資訊。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8IYF3…

AlphaFold · Q8IYF3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Chromosome

TEX11 定位於染色體,並在精母細胞與胎兒卵母細胞中,沿著聯會複合體形成一列列彼此分離的焦點。 此定位描述限定於所列的生殖細胞類型;來源未說明其他細胞中的定位或焦點排列是否會改變。

未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TSGA3TEX11BEX1BORCS8CBY2CCDC198CDKN1ACENPPCOL20A1CXCL14DUSP21FAM156AFBF1GATAD2BHYIING3LIN37MAPK9MAPKBP1MYEF2NEFLPEX39POM121PPP1R18REXO1L1PRIBC1SEPTIN1SNW1SNX7STMN2TBC1D22BTIPINTSC22D4UTP14CATXN3BCL2L2BRMS1LCCDC198CD74CEP85LDMTNEFHC1FAAP20FAM161BFAM217AGPSM3GRXCR1HOXB5KANK2KCTD10KRT6BLRCH2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 61 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TEX11 與 SYCP2、PBXIP1、SHOC1 及 REDIC1 有互作註解。資料另指出,TEX11 可能阻止 PBXIP1 與 ESR2 互作,但此關係標示為同源相似性推論,不應視為已確立的直接結合機制。來源未將這些互作描述為特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TEX11 變異與 X 連鎖精子生成失敗症 2(SPGFX2)相關。此不孕症疾病由精子生成缺陷所致,特徵包括睪丸萎縮表現混合及無精子症,並伴隨減數分裂停滯。來源將疾病歸因於影響 TEX11 所代表基因的變異,但未在此提供特定變異或其作用機制。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TEX11 是減數分裂交叉互換的調節因子,並參與染色體聯會的起始和/或維持,以及交叉互換的形成。來源未進一步界定它在聯會不同階段的具體作用,也未提供交叉互換形成的分子機制。推論支持
證據與來源

Regulator of crossing-over during meiosis. Involved in initiation and/or maintenance of chromosome synapsis and formation of crossovers

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TEX11 與 SYCP2、PBXIP1、SHOC1 及 REDIC1 有互作註解;另有資料指出它可能阻止 PBXIP1 與 ESR2 互作。後一項關係標示為同源相似性推論,來源未將所列互作描述為特定複合體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with SYCP2. Interacts with PBXIP1; may prevent interaction between PBXIP1 and ESR2 (By similarity). Interacts with SHOC1. Interacts with REDIC1

PMID 29742103 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TEX11 定位於染色體,並在精母細胞與胎兒卵母細胞中,沿聯會複合體形成一列列離散焦點。來源未說明其他細胞類型中的定位情形。推論支持
證據與來源

Chromosome; Forms arrays of discrete foci along synaptonemal complexes in spermatocytes and fetal oocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯X 連鎖精子生成失敗症 2(SPGFX2)是不孕症,與精子生成缺陷有關,特徵包括混合型睪丸萎縮、無精子症及減數分裂停滯。來源指出,影響 TEX11 所代表基因的變異會造成此疾病,但未列出特定變異或作用機制。含實驗來源
證據與來源

Spermatogenic failure, X-linked, 2 SPGFX2 An infertility disorder caused by spermatogenesis defects. It is characterized by mixed testicular atrophy and azoospermia with meiotic arrest. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 309120

PMID 25970010 ↗ · PMID 28718531 ↗ · PMID 32741963 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000374333 · 3,012 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGCGCTGTGGACGGAGGTTGTGGAGAGAGCAGGGCGGCA40
41TTGGTGGCTGCGGCTGAGGCTTGAGCCAGAGATTTAAAAA80
81TGGACAATGATGATTTTTTTTCCATGGACTTTAAAGAAGT120
121TGTTGAAAACCTGGTTACAAATGATAATTCACCTAACATA160
161CCAGAGGCAATTGATAGACTCTTCAGCGACATAGCAAATA200
201TCAACAGGGAGTCTATGGCTGAAATAACAGACATTCAGAT240
241TGAAGAAATGGCAGTAAACCTATGGAACTGGGCACTTACC280
281ATAGGAGGAGGTTGGCTTGTAAATGAAGAGCAGAAAATTA320
321GATTACATTATGTTGCTTGCAAGTTGCTGAGTATGTGTGA360
361AGCCTCATTTGCCTCAGAACAAAGTATTCAACGACTGATT400
401ATGATGAATATGAGAATAGGAAAAGAATGGTTGGATGCTG440
441GAAATTTTCTAATCGCTGATGAATGTTTTCAAGCTGCTGT480
481GGCCAGTCTGGAGCAATTATACGTCAAATTAATTCAAAGG520
521AGCTCCCCTGAGGCTGACTTGACCATGGAGAAGATTACTG560
561TTGAGAGTGACCACTTCAGAGTGCTTTCTTACCAAGCAGA600
601GTCAGCAGTTGCTCAAGGGGATTTTCAAAGAGCATCTATG640
641TGTGTACTGCAATGTAAAGATATGTTGATGAGGCTCCCCC680
681AGATGACTTCAAGTCTTCATCATCTCTGTTACAACTTTGG720
721AGTAGAAACCCAGAAGAATAATAAATATGAAGAAAGTTCT760
761TTCTGGCTTAGCCAAAGCTATGATATTGGGAAGATGGATA800
801AGAAATCTACTGGGCCAGAAATGCTGGCTAAAGTTCTACG840
841GCTATTAGCCACGAATTATTTGGATTGGGATGACACCAAA880
881TATTATGATAAGGCTCTCAATGCTGTAAACCTAGCAAACA920
921AGGAACATTTAAGTTCTCCTGGGCTTTTCTTAAAAATGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。