基因總覽
TEX11(testis expressed 11)是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,基因產物屬於 SPO22 家族。現有資料將其與減數分裂中的染色體聯會及交叉互換形成相連結,並指出它在精母細胞與胎兒卵母細胞的聯會複合體上呈離散焦點排列。這些特徵使 TEX11 成為與減數分裂染色體行為相關的蛋白質;來源未提供其胺基酸長度或更細部的結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374333 ★ | 70,528,940–70,908,711 | 30 |
| ENST00000374320 | 70,528,940–70,724,292 | 19 |
| ENST00000395889 | 70,528,940–70,908,711 | 31 |
| ENST00000344304 | 70,528,941–70,897,546 | 29 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEX11 是減數分裂期間交叉互換的調節因子。交叉互換是減數分裂染色體重組過程的一部分;來源指出 TEX11 參與交叉互換的形成,但未進一步說明其調節方式、直接作用對象或分子步驟。因此,現有資訊支持其在這項過程中具有調節角色,不能據此推定特定的催化活性或完整機制。
TEX11 也參與染色體聯會的起始和/或維持。聯會涉及減數分裂染色體之間的配對組織;來源將 TEX11 的作用描述為可能涵蓋聯會開始形成,或在形成後協助維持,並未判定其作用只限於其中一個階段。資料亦未詳述它如何促成聯會,或其與聯會複合體其他成分之間的功能分工。
染色體聯會與交叉互換形成是來源明確連結至 TEX11 的兩項減數分裂相關過程。這些描述顯示 TEX11 的已知功能重點位於減數分裂期間的染色體組織與重組,但來源沒有提供其對生殖細胞發育或生育能力影響的直接機制證據,也未量化其對交叉互換數量或聯會程度的作用。相關功能註解帶有同源相似性證據,因此應保留其證據性質,不將簡短註解延伸為已完全解析的作用模型。
Promoter 與基因調控
>TEX11 ENST00000374333 GRCh38 chrX:70908611-70909711 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCCAACTCCCGACCTCAGGTGATCTACCCGCCTCGGCCTCCGAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCA CCGTGCTCGGCCTATTTATTTATTTATTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC AATGTCTCGGCTCACCACAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCCTCCTGCCTCAACCTCCCAA GTAGCTGGCATTATAGGCATGCACCACCACGCCCAGCTAATTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCT CCATGTTTGTCAGGCTGGTCTGGAGCACCCGATCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTT GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCCCCCGACTTATTTTTTATTTTTAAGAGACATGATCTCGCTGTCTCC CAGGCTGGAGTGCAGTGGTGGGATCATGGCTTATTGGACCTAAACTCTCAGGCTCAAATGATCCTTCCAC CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAACTACAGGCGTGTGCCACCACACCTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGG TTCAGGTGCAGTCTGGCTTGTTGATCAGGCTGGCCTCGACTAGTCTCCTCAGCTTCTAATATTTCTGCTA TTTCTGACCTTTGCCACTCTTGCATAACCAGTGATCAACAATGTCTACTTGCTTTATTTCTTTTTCTGTT CTTTTTTTTGTGTGTGTGAAGTCCTGCTCTCCTTTTGGTAATCCTGGCCATCTGCACTTTTCCCTCAATT CATTGTCTTATGCTTTCAGAATTACATCATATTTGCTTACTCTCAGTTATTCTCACCCTGAACTCACCAA GTGACTGACTCTCTGAACTGCATCCCCAGGATCTAAGGTCTAGACTGGGTCGCAAGGCTTAGGCTCCGTG ACACAGCGTAAAGGCCAAGTGGGAGTGGCTTTAGTGGCCTAGCGTGACACCGCTAGCGTCGCTAGGGGGC GGAGTTTTCTGAACGTCCTCGTGCGCTGTGGACGGAGGTTGTGGAGAGAGCAGGGCGGCATTGGTGGCTG CGGCTGAGGTGAGTGGTTTAGTGGGCAGGAAGGGGTAGAATAGGCTTCAAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEX11_1 ↗ | X:70,908,711 | 負股 | 70,908,701–70,908,760 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_8449S6 · promoter · 70908701–70908861 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:940 aa
TEX11 蛋白屬於 SPO22 家族。可用資料未提供其結構域、功能區段或序列特徵的進一步描述,因此無法據此補充更細部的蛋白質結構資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TEX11 定位於染色體,並在精母細胞與胎兒卵母細胞中,沿著聯會複合體形成一列列彼此分離的焦點。 此定位描述限定於所列的生殖細胞類型;來源未說明其他細胞中的定位或焦點排列是否會改變。
未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 61 個夥伴
- BEX1Q9HBH7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BORCS8Q96FH0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- CBY2Q8NA61 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CCDC198Q9NVL8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDKN1AP38936 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CENPPQ6IPU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COL20A1Q9P218-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL14O95715 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DUSP21Q9H596 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FAM156AQ8NDB6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FBF1Q8TES7-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GATAD2BQ8WXI9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HYIQ5T013 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ING3A0A0C4DG38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- LIN37Q96GY3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAPK9P45984 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- MAPKBP1O60336 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- MYEF2Q9P2K5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEFLI6L9F6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- PEX39Q5I0X4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POM121Q96HA1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PPP1R18Q6NYC8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- REXO1L1PQ8IX06 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RIBC1Q8N443 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEPTIN1Q8WYJ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TEX11 與 SYCP2、PBXIP1、SHOC1 及 REDIC1 有互作註解。資料另指出,TEX11 可能阻止 PBXIP1 與 ESR2 互作,但此關係標示為同源相似性推論,不應視為已確立的直接結合機制。來源未將這些互作描述為特定複合體。
疾病與遺傳關聯
TEX11 變異與 X 連鎖精子生成失敗症 2(SPGFX2)相關。此不孕症疾病由精子生成缺陷所致,特徵包括睪丸萎縮表現混合及無精子症,並伴隨減數分裂停滯。來源將疾病歸因於影響 TEX11 所代表基因的變異,但未在此提供特定變異或其作用機制。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEX11 是減數分裂交叉互換的調節因子,並參與染色體聯會的起始和/或維持,以及交叉互換的形成。來源未進一步界定它在聯會不同階段的具體作用,也未提供交叉互換形成的分子機制。 | 推論支持 | 證據與來源Regulator of crossing-over during meiosis. Involved in initiation and/or maintenance of chromosome synapsis and formation of crossovers |
| 交互作用 | TEX11 與 SYCP2、PBXIP1、SHOC1 及 REDIC1 有互作註解;另有資料指出它可能阻止 PBXIP1 與 ESR2 互作。後一項關係標示為同源相似性推論,來源未將所列互作描述為特定複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with SYCP2. Interacts with PBXIP1; may prevent interaction between PBXIP1 and ESR2 (By similarity). Interacts with SHOC1. Interacts with REDIC1 PMID 29742103 ↗ |
| 細胞定位 | TEX11 定位於染色體,並在精母細胞與胎兒卵母細胞中,沿聯會複合體形成一列列離散焦點。來源未說明其他細胞類型中的定位情形。 | 推論支持 | 證據與來源Chromosome; Forms arrays of discrete foci along synaptonemal complexes in spermatocytes and fetal oocytes |
| 疾病關聯 | X 連鎖精子生成失敗症 2(SPGFX2)是不孕症,與精子生成缺陷有關,特徵包括混合型睪丸萎縮、無精子症及減數分裂停滯。來源指出,影響 TEX11 所代表基因的變異會造成此疾病,但未列出特定變異或作用機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spermatogenic failure, X-linked, 2 SPGFX2 An infertility disorder caused by spermatogenesis defects. It is characterized by mixed testicular atrophy and azoospermia with meiotic arrest. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 309120 PMID 25970010 ↗ · PMID 28718531 ↗ · PMID 32741963 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTGCGCTGTGGACGGAGGTTGTGGAGAGAGCAGGGCGGCA40TTGGTGGCTGCGGCTGAGGCTTGAGCCAGAGATTTAAAAA80TGGACAATGATGATTTTTTTTCCATGGACTTTAAAGAAGT120TGTTGAAAACCTGGTTACAAATGATAATTCACCTAACATA160CCAGAGGCAATTGATAGACTCTTCAGCGACATAGCAAATA200TCAACAGGGAGTCTATGGCTGAAATAACAGACATTCAGAT240TGAAGAAATGGCAGTAAACCTATGGAACTGGGCACTTACC280ATAGGAGGAGGTTGGCTTGTAAATGAAGAGCAGAAAATTA320GATTACATTATGTTGCTTGCAAGTTGCTGAGTATGTGTGA360AGCCTCATTTGCCTCAGAACAAAGTATTCAACGACTGATT400ATGATGAATATGAGAATAGGAAAAGAATGGTTGGATGCTG440GAAATTTTCTAATCGCTGATGAATGTTTTCAAGCTGCTGT480GGCCAGTCTGGAGCAATTATACGTCAAATTAATTCAAAGG520AGCTCCCCTGAGGCTGACTTGACCATGGAGAAGATTACTG560TTGAGAGTGACCACTTCAGAGTGCTTTCTTACCAAGCAGA600GTCAGCAGTTGCTCAAGGGGATTTTCAAAGAGCATCTATG640TGTGTACTGCAATGTAAAGATATGTTGATGAGGCTCCCCC680AGATGACTTCAAGTCTTCATCATCTCTGTTACAACTTTGG720AGTAGAAACCCAGAAGAATAATAAATATGAAGAAAGTTCT760TTCTGGCTTAGCCAAAGCTATGATATTGGGAAGATGGATA800AGAAATCTACTGGGCCAGAAATGCTGGCTAAAGTTCTACG840GCTATTAGCCACGAATTATTTGGATTGGGATGACACCAAA880TATTATGATAAGGCTCTCAATGCTGTAAACCTAGCAAACA920AGGAACATTTAAGTTCTCCTGGGCTTTTCTTAAAAATGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。