基因總覽
TESK2(testis associated actin remodelling kinase 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白質激酶超家族中的 TKL Ser/Thr protein kinase 家族。蛋白質長 571 個胺基酸,具有蛋白質激酶結構域;序列末端另有一段被註記為無序區域。這些特徵構成其作為激酶的基本分子架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000372086 ★ | 45,343,883–45,491,163 | 11 |
| ENST00000372084 | 45,343,877–45,457,799 | 9 |
| ENST00000873857 | 45,343,877–45,491,203 | 10 |
| ENST00000873858 | 45,343,877–45,491,203 | 11 |
| ENST00000873859 | 45,343,877–45,491,203 | 12 |
| ENST00000873860 | 45,343,877–45,491,203 | 12 |
| ENST00000873861 | 45,343,877–45,491,203 | 10 |
| ENST00000873862 | 45,343,877–45,491,155 | 12 |
| ENST00000873863 | 45,343,877–45,491,203 | 11 |
| ENST00000873864 | 45,343,877–45,491,203 | 12 |
| ENST00000937751 | 45,343,877–45,491,203 | 9 |
| ENST00000937752 | 45,343,877–45,491,168 | 11 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TESK2 具有雙重專一性蛋白質激酶活性,能催化自身磷酸化,也能磷酸化外源底物。其底物磷酸化可發生於絲胺酸、蘇胺酸及酪胺酸殘基,反應以 ATP 為磷酸基供體,並產生 ADP。這種對不同胺基酸殘基的作用範圍,是來源所述的酵素活性特徵。
已知 TESK2 可在 cofilin 的 Ser-3 位點進行磷酸化。此項資料指出特定底物與位點,但未進一步提供該磷酸化作用如何影響 cofilin 或細胞內後續事件,因此不宜據此延伸描述其下游效應。
來源另指出,TESK2 可能在精子發生中扮演重要角色;此為可能的生物學作用,資料未提供其參與階段或具體機制。結合已記載的激酶活性,TESK2 的功能描述包括對自身及外源蛋白質的磷酸化,以及其與精子發生的可能關聯,但現有資訊不足以界定兩者之間的因果或詳細分子途徑。
Promoter 與基因調控
>TESK2 ENST00000372086 GRCh38 chr1:45491063-45492163 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTAATCCCGGCACTTTCGTAGGCCAACGTGGGCCGATCACTTGAGTCCAGGAGTTACAGACCAGCCTGGG CAACATGGTAAACCCCGTCTCTACAAAATATACAAAAAATTAGTCAGGCATGCTGGCGTGTGCCTGTAGT CCCAGCTATCCGGGGAGGCTGAGTTGGGAGGATCATCTTAATCCAGGAGTTTGAGGCTGCAAGTGAGCCA TGATCGCTCCATTGCACTCCATCATCCTGGGCGACAGAGTGAGACCCTTCTAAAAAAAAAACAACCAACA AAAACAACAAAAAATCCCAACTTATTCCCCACCAGCTTTCTTTCAAAATCTGTTTTCAAGCTAGCTGAAG TGTTACCTCCTCTAAGCTTTCACTTAACCGAATCTCATAGTCATGATTAATTGCTTCCCTAGCATTTTGT TTAGCTCTACTGATTGCTCTTACTATTTCAAGTCGGTATTATTGATATATTTTTTCCTCCTCACTATACT GAAATCCTGCAGGACGCAGCATTCTTACCGCTTTTCCTTACTCAGCTATACCTTGACCAACCCGAAAGCC GCGCCAGTCTAGTCCATTTTCTATTGGCTTTATCAATTACCAATCATTTCTGTGTTTAACATTTTTATTG GTCCATCTTGTGTTTACTGCCCCGCCCTCTAAGAGGCTCCTGGACTTGGGTTTCCCCCAGGTGTATTCCC TCCTCCTCGGTTCCGCCTTTCCCACACACTGCTTCTTCTGTTTTTACCTCGACTTCCTTCCTATTGGTTC CCTTCGTCCTCCGGAGTTGGCACCTACGGCTGTTGATTGGCTTTTCTGGACGCCCATTGTGCCCACCCTC ATACCACGTGGCATTCCTAGCGCTAATTGGGCAATTCCACTACCTCGTTTATCAGGAGTTGACGGTTGAC TGGCTACTCTGAGGGAGGGCTTGAGGGAGGGGCGTGGCCAGCCGAGACCCCGCCCCCAACCCCCCTGCTG GGCCGGGTAGGCGTTTCAGTCTTTCGCGGCCCGGGAGCTCAGCAGAGCTACCAGCTGCCCTGTTGGCTTC GCTGGTCGGATCGTCCTCCTGGCCCCGCCAAACAGGCGGGGGGAGCGGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TESK2_1 ↗ | 1:45,491,163 | 負股 | 45,491,153–45,491,212 |
| TESK2_2 ↗ | 1:45,496,638 | 負股 | 45,496,628–45,496,687 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_C6HTN · enhancer · 45489826–45491152 · regulatory
ENSR1_9N3J2 · promoter · 45491153–45491653 · regulatory
ENSR1_BC2QR · enhancer · 45493027–45493573 · regulatory
ENSR1_5DNWM7 · CTCF_binding_site · 45493302–45493323 · regulatory
· motif · 45489182–45489191 · motif
· motif · 45489182–45489191 · motif
· motif · 45489954–45489966 · motif
· motif · 45490121–45490132 · motif
· motif · 45491065–45491075 · motif
· motif · 45491189–45491199 · motif
· motif · 45491190–45491200 · motif
· motif · 45491197–45491207 · motif
· motif · 45491216–45491226 · motif
· motif · 45491221–45491231 · motif
· motif · 45491289–45491298 · motif
· motif · 45491312–45491321 · motif
· motif · 45491312–45491321 · motif
· motif · 45491314–45491330 · motif
· motif · 45491314–45491330 · motif
· motif · 45491443–45491456 · motif
· motif · 45491505–45491515 · motif
· motif · 45491626–45491640 · motif
· motif · 45491626–45491640 · motif
· motif · 45493304–45493320 · motif
· motif · 45493392–45493405 · motif
· motif · 45493392–45493405 · motif
· motif · 45493498–45493509 · motif
· motif · 45493498–45493509 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:571 aa
TESK2 蛋白質長 571 個胺基酸,屬於 protein kinase superfamily 中的 TKL Ser/Thr protein kinase 家族。其蛋白質激酶結構域位於第 58 至 313 個胺基酸;第 521 至 571 個胺基酸則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TESK2 被記錄於細胞核。 來源未提供定位變化的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAEP62258 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TESK2 具有雙重專一性蛋白質激酶活性,可催化自身磷酸化,也能磷酸化外源底物;作用位點包括絲胺酸、蘇胺酸與酪胺酸殘基。來源另指出 TESK2 可磷酸化 cofilin 的 Ser-3,並可能在精子發生中扮演重要角色。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Dual specificity protein kinase activity catalyzing autophosphorylation and phosphorylation of exogenous substrates on both serine/threonine and tyrosine residues. Phosphorylates cofilin at 'Ser-3'. May play an important role in spermatogenesis |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | TESK2 的細胞定位記錄為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTCGCGGCCCGGGAGCTCAGCAGAGCTACCAGCTGCCC40TGTTGGCTTCGCTGGTCGGATCGTCCTCCTGGCCCCGCCA80AACAGGCGGGGGGAGCGGCCCCGACTGTGGGGCCATGGCA120GTAGTCTCCTCGTTCGCCGCCGCCGCTAGCCTAGCTGAGT160CGCCGGCTTCTGCGCTAGGGGCTCCCACCGCCTCCGCAGG200CTAAGGAGCCGCTGCCACCAACGAGCTGTGAGGGTTACTA240TGCTCCCTCTTTGCCGCCGTCTCCTCCTCTTGCCCGCGCA280GGCACCCCTCTGGCTGCTCAGTCCTGCCTCAGTGTCAAAC320CAGAAGAGAAGTAAAATTCAACAAAAATTTATGTGTGGAG360TTCCTTCTTAAAAGAAGAAAAAAGTGATTATTTAGACTAT400GGATCGGAGCAAACGGAATTCAATTGCAGGATTTCCTCCA440CGTGTGGAGCGTCTTGAAGAGTTTGAAGGAGGTGGTGGAG480GAGAAGGAAATGTGAGCCAGGTGGGAAGAGTTTGGCCATC520TTCGTATCGAGCTCTTATAAGTGCCTTTTCCAGACTGACG560CGTTTGGATGATTTCACCTGTGAAAAAATAGGGTCTGGCT600TCTTTTCTGAAGTGTTCAAGGTACGACACCGAGCTTCTGG640TCAGGTGATGGCTCTTAAGATGAACACATTGAGCAGTAAC680CGGGCAAACATGCTGAAAGAAGTACAGCTCATGAATAGAC720TCTCCCATCCCAACATCCTTAGGTTCATGGGTGTATGTGT760TCATCAAGGACAATTGCATGCACTTACAGAGTATATCAAC800TCCGGGAACCTGGAACAGTTGCTAGACAGTAACCTGCATT840TGCCTTGGACTGTGAGGGTAAAACTGGCCTATGACATAGC880AGTGGGCCTCAGCTACCTTCACTTCAAAGGCATTTTTCAT920CGGGACCTCACATCTAAGAACTGCCTGATAAAGAGGGATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。