演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TERF2TRF2

telomeric repeat binding factor 2

TERF2(telomeric repeat binding factor 2)是端粒保護系統 shelterin 的組成蛋白,能辨識端粒 DNA,並參與維持染色體末端的完整性。

Homo sapiens16q22.1UniProt Q15554
OFFICIAL SYMBOL
TERF2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q15554
PDB / ALPHAFOLD
9Q9M
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TERF2 是人類的蛋白質編碼基因,產物為 telomeric repeat binding factor 2。其蛋白質是 shelterin(telosome)複合體的一員,主要位於端粒相關的染色體末端。蛋白質序列包含 TRFH 二聚化區域、HTH myb-type 結構域及 H-T-H DNA 結合基序,另有數段被註記為無序區域;這些區域構成其辨識及組成端粒相關分子複合體的結構基礎。

Official symbol
TERF2
Gene name
telomeric repeat binding factor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11729
UniProt
Q15554
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TRF2TRBF2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616q22.1
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegTERF2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:69,355,464–69,408,571
Gene span
53,108 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000254942 ★69,355,567–69,386,00710
ENST0000090303969,355,464–69,386,02910
ENST0000096642969,355,464–69,386,02910
ENST0000113261769,355,464–69,386,02910
ENST0000093014269,355,571–69,386,02910
ENST0000102270269,355,571–69,386,02910
ENST0000056605169,356,334–69,361,4712
ENST0000108426469,362,896–69,386,0296
ENST0000056958469,364,967–69,372,2824
ENST0000108426569,364,970–69,386,0297
ENST0000056675069,366,935–69,385,5706
ENST0000056954269,366,947–69,384,6503

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TERF2 可辨識端粒上的雙股 5'-TTAGGG-3' 重複序列,並在端粒維護與保護中扮演核心角色。它是 shelterin 的組成成員;shelterin 與端粒酶添加的重複序列結合,使染色體末端受到保護,避免被 DNA 損傷監測系統視為需要修復的末端。若缺少這種保護,染色體末端可能遭 DNA 修復途徑不適當處理,並發生端對端融合。

TERF2 除了直接結合端粒 DNA,也負責將多種端粒保護所需的因子與酵素帶至端粒,包括 shelterin 成員、TERF2IP/RAP1 與 DCLRE1B/Apollo。它與 DCLRE1B/Apollo 協同參與端粒環(T loop)形成:在前導股端粒產生 3' 單股突出端,而 T loop 被提出可能有助於避免染色體末端遭降解或修復。TERF2 不僅需要將 DCLRE1B/Apollo 招募至端粒,也能活化其核酸外切酶活性。

TERF2 對 DNA 的結合偏好正超螺旋構形。它與 DCLRE1B/Apollo 一同控制端粒複製叉通過時所需的 DNA 拓撲異構酶,包括 TOP1、TOP2A 與 TOP2B,避免端粒拓撲異常。TERF2 招募 TERF2IP/RAP1 至端粒,並據相似性推定參與抑制同源導向修復(HDR);此作用可能影響端粒長度。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 69386007 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TERF2 ENST00000254942 GRCh38 chr16:69385907-69387007 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGCCACCTGCACTTCTGAGTTGTCTTTGAGTGGCCCCAAACTGGATCTTTGCAGGTTCCAGACTAGTGG
GGCTGGTAGGACAATCTTTGAAGCTAGACCAGTTACTGGGCCTCTCAGGAAGAGGCACCCACAACCACCA
TCCTGAACTAAGGTCTGAGCTGGAGGTTCTCCATTTGGTCAAGTGCCAGTTGGTGAATTCCAAGAGTATC
AGAGATATCTGAAAGTGACTCAGACCCTCTATGGGACTATGGGTGGTCCTTTTGCTTATTTTTCTAATTG
TTCTACAACAAAATGTGTTATTTTTGTGATTACAAAGAGTATATGTCTAGCGGCTGGGTTGCCAGGTGCA
TTCTATTTATTGGTATCACACTGGTCTTTGCTTTATAATTACAGTATTTGTTAAAATACAAATTTGTTTA
AAGACTTTCCTCTGTGTATGCTCTCTTCCACAATTTTCAAAGTGTTTAATAAGGTGCACATATTTGGTTT
TCTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGACTGGAGTGCAATGGCGC
GATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCGCGGGTTCAAGCGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT
AGGATTACAGGCATGCGCCACCACGTCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGT
TGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT
ACAGGCGTAGAGCCACCGATCCCGGCCTGTTTTTCAGTCTCTAATACACTGTTCCGCGTCCCTAGCATAG
TAGCTGTTTTCTGTAAATTCGGAGCGAAGTTGACTGCAAAACCCGCCGGGTTCACCGGCCTGGGCGGTGT
GGACTTCAAGCCCCAGGAGGCATTGCGGCCGGCACATCGGGAACTACGGCGTCTGAGAAGGGGGCCGGGC
CCTCCGGTCCTTTCCCTCCCAGAAGCCCGCGGGCGGCTCGGAACGCTGTTTCTATCATGGCCGCGGGAGC
CGGGACGGCGGGCCCCGCTTCCGGCCCGGGCGTCGTGCGTGACCCAGCGGC
TERF2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TERF2_1 ↗16:69,385,988負股69,385,978–69,386,037

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_932JL2 · promoter · 69385978–69386437 · regulatory

· motif · 69381316–69381328 · motif

· motif · 69384909–69384921 · motif

· motif · 69384912–69384925 · motif

· motif · 69384912–69384925 · motif

· motif · 69385709–69385722 · motif

· motif · 69385755–69385768 · motif

· motif · 69385914–69385930 · motif

· motif · 69385933–69385942 · motif

· motif · 69386120–69386137 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:542 aa

1 aa542 aa結構域DNA 結合功能區域基序
依 Q15554 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TERF2 蛋白質長 542 個胺基酸。其 TRFH 二聚化區域位於第 84–287 位;C 端含 HTH myb-type 結構域(第 484–541 位),其中第 512–537 位註記為 H-T-H DNA 結合基序。序列另有數段無序區域,並在第 371–375 位註記核定位訊號。

結構域HTH myb-type484–541 aa
DNA 結合區H-T-H motif512–537 aa
功能區域Disordered1–86 aa
功能區域TRFH dimerization84–287 aa
功能區域Disordered288–323 aa
功能區域Disordered358–464 aa
基序Nuclear localization signal371–375 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9Q9M…

PDB · 9Q9M

EM · 2.81 A · J=1-542

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Chromosome, telomere

TERF2 位於細胞核及染色體端粒;間期細胞中與端粒 DNA 共定位,分裂中期則位於染色體末端。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome, telomere。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 34 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TRF2TERF2ATMBLMCCDC137DCLRE1BDDX21H2AXHDGFL2HEXIM1HMGN2MCPH1NAIF1ORC1ORC2POT1RPL13SLX4TERF2IPTINF2WRNZC3H18EBNA1Ppp1r10ATXN1ATXN3DCTN1ELAVL4HTTPMP22PRKNSNCASOD1TARDBPTDP1UCHL1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 34 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TERF2 可形成同源二聚體,並是由 TERF1、TERF2、TINF2、TERF2IP/RAP1、ACD 與 POT1 組成的 shelterin 複合體成員。它與 DCLRE1B/Apollo、TERF2IP/RAP1 有直接交互作用,也與 SLX4/BTBD12、NBN、DSP 及 FBXO47 有交互作用。與未磷酸化 NBN 的交互作用發生於 G1 期,並可防止 ATM 活化及非同源末端接合修復;在細胞核中與 DSP 的交互作用則是 DSP 結合端粒所需。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TERF2 結合端粒雙股 5'-TTAGGG-3' 重複序列,參與端粒維護並防止染色體末端融合;它也是 shelterin 的組成成員,可招募端粒保護因子,包括 TERF2IP/RAP1 與 DCLRE1B/Apollo。TERF2 與 DCLRE1B/Apollo 協助形成端粒環,產生前導股端粒的 3' 單股突出端,且負責招募並活化 DCLRE1B/Apollo。兩者也共同調控端粒複製所需的拓撲異構酶及 DNA 拓撲;TERF2 偏好結合正超螺旋 DNA,並據相似性推定透過招募 TERF2IP/RAP1 參與抑制 HDR,可能影響端粒長度。含實驗來源
證據與來源

Binds the telomeric double-stranded 5'-TTAGGG-3' repeat and plays a central role in telomere maintenance and protection against end-to-end fusion of chromosomes. In addition to its telomeric DNA-binding role, required to recruit a number of factors and enzymes required for telomere protection, including the shelterin complex, TERF2IP/RAP1 and DCLRE1B/Apollo. Component of the shelterin complex (telosome) that is involved in the regulation of telomere length and protection. Shelterin associates with arrays of double-stranded 5'-TTAGGG-3' repeats added by telomerase and protects chromosome ends; without its protective activity, telomeres are no longer hidden from the DNA damage surveillance and chromosome ends are inappropriately processed by DNA repair pathways. Together with DCLRE1B/Apollo, plays a key role in telomeric loop (T loop) formation by generating 3' single-stranded overhang at the leading end telomeres: T loops have been proposed to protect chromosome ends from degradation and repair. Required both to recruit DCLRE1B/Apollo to telomeres and activate the exonuclease activity of DCLRE1B/Apollo. Preferentially binds to positive supercoiled DNA. Together with DCLRE1B/Apollo, required to control the amount of DNA topoisomerase (TOP1, TOP2A and TOP2B) needed for telomere replication during fork passage and prevent aberrant telomere topology. Recruits TERF2IP/RAP1 to telomeres, thereby participating in to repressing homology-directed repair (HDR), which can affect telomere length (By similarity)

PMID 15608617 ↗ · PMID 16166375 ↗ · PMID 20655466 ↗ · PMID 28216226 ↗ · PMID 31595153 ↗ · PMID 9326950 ↗ · PMID 9326951 ↗ · PMID 9476899 ↗

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交互作用TERF2 可形成同源二聚體,並參與由 TERF1、TERF2、TINF2、TERF2IP/RAP1、ACD 與 POT1 組成的 shelterin 複合體。它與 DCLRE1B/Apollo、TERF2IP/RAP1 有直接交互作用,也與 NBN、SLX4/BTBD12、DSP 及 FBXO47 交互作用。TERF2 與未磷酸化 NBN 的交互作用發生於 G1 期,可防止 ATM 活化及非同源末端接合修復;在細胞核中與 DSP 的交互作用則是 DSP 結合端粒所需。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Component of the shelterin complex (telosome) composed of TERF1, TERF2, TINF2, TERF2IP/RAP1, ACD and POT1. Interacts with NBN; interaction takes place with unphosphorylated NBN during G1 phase and prevents to prevent ATM activation and non-homologous end joining repair. Interacts with SLX4/BTBD12. Interacts with DCLRE1B/Apollo and TERF2IP/RAP1; the interaction is direct. Interacts with DSP in the nucleus; the interaction is required for DSP telomere binding. Interacts with FBXO47 (By similarity)

PMID 10888888 ↗ · PMID 15316005 ↗ · PMID 15383534 ↗ · PMID 15608617 ↗ · PMID 16606622 ↗ · PMID 16730175 ↗ · PMID 16730176 ↗ · PMID 18202258 ↗ · PMID 18468965 ↗ · PMID 18593705 ↗ · PMID 19596235 ↗ · PMID 20655466 ↗ · PMID 28216226 ↗ · PMID 31595153 ↗

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細胞定位TERF2 位於細胞核及染色體端粒;間期細胞中與端粒 DNA 共定位,分裂中期則位於染色體末端。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Chromosome, telomere; Colocalizes with telomeric DNA in interphase cells and is located at chromosome ends during metaphase

PMID 20655466 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000254942 · 2,996 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAGCCCGCGGGCGGCTCGGAACGCTGTTTCTATCATGG40
41CCGCGGGAGCCGGGACGGCGGGCCCCGCTTCCGGCCCGGG80
81CGTCGTGCGTGACCCAGCGGCGTCACAGCCGAGGAAGCGG120
121CCCGGCCGGGAGGGCGGGGAGGGCGCGCGGCGATCGGACA160
161CGATGGCGGGAGGAGGCGGGAGTAGCGACGGCAGCGGGCG200
201GGCAGCTGGCAGGCGGGCGTCCCGCAGTAGCGGGCGGGCC240
241CGGCGGGGGCGCCACGAGCCGGGGCTGGGGGGCCCGGCGG280
281AGCGCGGCGCGGGGGAGGCACGGCTGGAAGAGGCAGTCAA320
321TCGCTGGGTGCTCAAGTTCTACTTCCACGAGGCGCTGCGG360
361GCCTTTCGGGGTAGCCGGTACGGGGACTTCAGACAGATCC400
401GGGACATCATGCAGGCTTTGCTTGTCAGGCCCTTGGGGAA440
441GGAGCACACCGTGTCCCGATTGCTGCGGGTTATGCAGTGT480
481CTGTCGCGGATTGAAGAAGGGGAAAATTTAGACTGTTCCT520
521TTGATATGGAGGCTGAGCTCACACCACTGGAATCAGCTAT560
561CAATGTGCTGGAGATGATTAAAACGGAATTTACACTGACA600
601GAAGCAGTGGTCGAATCCAGTAGAAAACTGGTCAAGGAAG640
641CTGCTGTCATTATTTGTATCAAAAACAAAGAATTTGAAAA680
681GGCTTCAAAAATTTTGAAAAAACATATGTCCAAGGACCCC720
721ACAACTCAGAAGCTGAGAAATGATCTCCTGAATATTATTC760
761GAGAAAAGAACTTGGCCCATCCTGTTATCCAGAACTTTTC800
801ATATGAGACCTTCCAGCAGAAGATGCTGCGCTTCCTGGAG840
841AGCCACCTGGATGACGCCGAGCCCTACCTCCTCACGATGG880
881CCAAAAAGGCTTTGAAATCTGAGTCCGCTGCCTCAAGTAC920
921AGGGAAGGAAGATAAACAGCCAGCACCAGGGCCTGTGGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。