基因總覽
TERF1 是蛋白質編碼基因，產物 telomeric repeat binding factor 1 可辨識端粒的雙股 DNA 重複序列，並是 shelterin（telosome）複合體的組成成員。此蛋白質的基本特性與端粒 DNA 結合能力相連；其所屬複合體與端粒長度調節及染色體末端保護有關。此外，TERF1 也涉及有絲分裂紡錘體的調節。來源未提供其蛋白質家族分類。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000276603 ★ | 73,008,864–73,048,123 | 10 |
| ENST00000679115 | 73,008,801–73,047,479 | 11 |
| ENST00000517390 | 73,008,801–73,048,123 | 9 |
| ENST00000678860 | 73,008,801–73,048,123 | 10 |
| ENST00000678518 | 73,008,801–73,048,123 | 9 |
| ENST00000276602 | 73,008,801–73,048,123 | 9 |
| ENST00000899325 | 73,008,801–73,048,123 | 11 |
| ENST00000912757 | 73,008,801–73,048,123 | 10 |
| ENST00000912758 | 73,008,801–73,048,123 | 8 |
| ENST00000912759 | 73,008,801–73,048,123 | 6 |
| ENST00000912760 | 73,008,801–73,048,123 | 5 |
| ENST00000912762 | 73,008,801–73,048,123 | 4 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TERF1 產物可結合端粒雙股 DNA 上的 5'-TTAGGG-3' 重複序列，並負向調節端粒長度。這項作用與 shelterin 複合體的功能相連：shelterin 會結合由端粒酶添加的雙股 5'-TTAGGG-3' 重複序列陣列，參與端粒長度調節及染色體末端保護。
染色體末端的保護作用可避免端粒被 DNA 損傷監測機制視為需要處理的損傷位置。若缺少 shelterin 的保護活性，端粒便不再受到隱蔽，染色體末端可能遭 DNA 修復途徑不適當地處理。TERF1 作為 shelterin 成員，參與這項與端粒保護相關的功能。
除端粒相關角色外，TERF1 也參與有絲分裂紡錘體的調節。現有來源未進一步說明其在紡錘體調節中的分子作用方式，因此不宜據此延伸具體機制。
Promoter 與基因調控
>TERF1 ENST00000276603 GRCh38 chr8:73007864-73008964 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGTGCATAAACGATGTTCAGTGAATTTTCATAAAGTGAACCCACATCAAGGAACAGAAAACGGAGCCAG GCGTTGTGGCTCAGGCCTGTAAACCCAGCACTTTGGCAGGAGGATAACTTGAAGCCAGGAGTTGGAGACC AGCCTGAGCAACAGAGCGAAATCCTGTCTCAAAGGAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAACAAAAACAATAA CCAGACCACCCATCCCCATTTAGAATTTCTTTTTGTGCTAAGTTTCAAAATTCAAAATAAGCATTCACTT GTTTTCTACAAACTGCATTCTATAGTCGATCTCAAACCTTGATTGAGATACATTTCCATTATAGTATACT CTTTCTAGAGCACTGATCTCAAAATGTGGTGCCCAGCCAAGTAGCGTTGGACTTTCAAATTCAAGGATCC CAAGCTAGACCAGCAGAACAGGAATTCTGGGAGTGGAGCCCGGCAATTTGTGTTTTAGCAAGCCCCCAGG CTGATTCTGATGCATCTTAAGGTTGGAGAAGCATGGATATTGTCAGTTGTAATAGTTGTTGTTCGTGATC ACGTAGTAACTGTTAGATGAAAACTAGGGTTTAAAAGTGTTACGCTTGTCTAATAGTGACAAGTTCTCAT TACCCATCTCTTTCTGAAATAGGCTGCAGGCAAATGCGTTTTCATTTTAAATAACCGTGTTGTTGTTCCA GTCAAGGTTGCATTTTACAAGGAATAAGGAAGATAAAGCTGCCTCCTCCTATCCTAATCTCGCTCCTCGC TCAGTATGGAGTCGTCCGGTTTACCTACAAAGCCCTGCCCTAGACTGGCGGCAAATTCAACGCCCAGAGG CAGGAACAGGTGTCGGCCAATCAGAAGCCGGAACAGGTGTCGGCCAATCAGAAGCCAGGCTTGAACCGCT CGCCCATGTCCCGCCGGCGGAAGAGACTCTCCGCGGCCACGCCCCGAGCCCTCGAATGCGAGCCAATCGT TGCTCGGCGCCTGAAGGGGCAGTACCCAAGCGAGCCATTTAACATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCC CCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGAGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TERF1_1 ↗ | 8:73,008,864 | 正股 | 73,008,815–73,008,874 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_933ZF6 · promoter · 73008370–73008874 · regulatory
ENSR8_933ZG5 · enhancer · 73011719–73012204 · regulatory
· motif · 73008885–73008895 · motif
· motif · 73009175–73009186 · motif
· motif · 73012648–73012664 · motif
TERF1 的表現量會隨細胞週期變化：在 G1 與 S 期維持低量，至 G2 期及有絲分裂期增加。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：439 aa
telomeric repeat binding factor 1 長 439 個胺基酸。其 TRFH 區域位於第 58 至 268 個胺基酸，與二聚化有關；C 端含 HTH myb-type 結構域及 H-T-H DNA 結合基序。第 337 至 356 位有核定位訊號。來源亦註記數段無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TERF1 可與端粒 DNA 共定位；此端粒定位在間期與前期細胞可見，在中期、後期及末期減少。 它也與有絲分裂紡錘體相關，並在間期與 TRIOBP isoform 1 於端粒共定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome, telomere。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 94 個夥伴
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- HSPA6P17066 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
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TERF1 可形成同源二聚體，且二聚體可包含兩種異構型；與 GNL3L 的互作可促進同源二聚化。TERF1 是由 TERF1、TERF2、TINF2、TERF2IP、ACD 與 POT1 組成的 shelterin 複合體成員。來源另記載其與多種蛋白質互作，包括 ATM、TNKS1、TNKS2、PINX1、NEK2、MAPRE1、RLIM、FBXO4、TIN2、RTEL1 及 TRIOBP isoform 1。TINF2 的互作可抑制 TERF1 與 FBXO4 互作及其後續多聚泛素化和蛋白酶體降解；GNL3L 與 TIN2 對 TERF1 的互作彼此互斥。與 CCDC79/TERB1 及 FBXO47 的互作標註為 By similarity。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TERF1 可結合端粒雙股 5'-TTAGGG-3' 重複序列，並負向調節端粒長度，也參與有絲分裂紡錘體調節。它是 shelterin 複合體成員；該複合體結合端粒酶添加的重複序列陣列，參與端粒長度調節及染色體末端保護。缺少保護活性時，端粒可能遭 DNA 修復途徑不適當處理。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds the telomeric double-stranded 5'-TTAGGG-3' repeat and negatively regulates telomere length. Involved in the regulation of the mitotic spindle. Component of the shelterin complex (telosome) that is involved in the regulation of telomere length and protection. Shelterin associates with arrays of double-stranded 5'-TTAGGG-3' repeats added by telomerase and protects chromosome ends; without its protective activity, telomeres are no longer hidden from the DNA damage surveillance and chromosome ends are inappropriately processed by DNA repair pathways PMID 16166375 ↗ · PMID 31595153 ↗ |
| 交互作用 | TERF1 可形成包含兩種異構型的同源二聚體，並與多種蛋白質互作，也是 shelterin 複合體成員。GNL3L 可促進其二聚化；TINF2 與 GNL3L 的互作彼此互斥。TINF2 可阻止 FBXO4 互作及後續多聚泛素化、蛋白酶體降解；與 CCDC79/TERB1、FBXO47 的互作屬相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; can contain both isoforms. Found in a complex with POT1; TINF2 and TNKS1. Interacts with ATM, TINF2, TNKS1, TNKS2, PINX1, NEK2 and MAPRE1. Component of the shelterin complex (telosome) composed of TERF1, TERF2, TINF2, TERF2IP ACD and POT1. Interacts with RLIM (via N-terminus). Interacts with FBXO4. Interaction with TINF2 protects against interaction with FBXO4 and subsequent polyubiquitination and proteasomal degradation. Interacts with GNL3L; this interaction promotes homodimerization. Interacts with TIN2. Interacts with RTEL1. Interactions with GNL3L and TIN2 are mutually exclusive. Interacts with CCDC79/TERB1 (By similarity). Interacts with TRIOBP isoform 1; mediates TERF1 localization to the centrosome. Interacts with FBXO47 (By similarity) PMID 24692559 ↗ |
| 細胞定位 | TERF1 位於細胞核、細胞質紡錘體及染色體端粒相關區域。它在間期與前期和端粒 DNA 共定位，但端粒定位於中期、後期及末期減少；此外，TERF1 與有絲分裂紡錘體相關，並在間期與 TRIOBP isoform 1 於端粒共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Chromosome, telomere; Colocalizes with telomeric DNA in interphase and prophase cells. Telomeric localization decreases in metaphase, anaphase and telophase. Associates with the mitotic spindle. Colocalizes with TRIOBP isoform 1 at the telomeres in interphase PMID 24692559 ↗ · PMID 11943150 ↗ |
| 調控 | TERF1 表現量受到細胞週期調控，在 G1 期與 S 期較低，並於 G2 期及有絲分裂期增加。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Expression is tightly regulated during the cell cycle; levels are low in G1 and S phase and increase during G2 phase and mitosis |
核酸與蛋白質序列
AGTACCCAAGCGAGCCATTTAACATGGCGGAGGATGTTTC40CTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGG80GATGCCGACCCTACTGAGGAGCAGATGGCAGAAACAGAGA120GAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGA160GTGCCAGGTGCAGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAG200GAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCG240TGGCTGCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCT280TTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCGC320AGGACCCGCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCATGGACTAT360CCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACGATATACATATG400TCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGAT440GCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATTACACCCTTGGAAT480CAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGA520CAAACTTCATGAAGAAATACAGAATTTAATTAAAATTCAG560GCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAG600CAGAAGAAGTCTTTGAAAGAATATTTGGTGATCCAAATTC640TCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCT680CAGAAAGATACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCT720ACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTA760TGTGCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCA800GCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGAACAATAA840CTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGA880AACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAAAGTGTTAGTGAC920AAACAGTCTGCGGTAACTGAATCCTCAGAGGGTACAGTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。