演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TEP1TP1

telomerase associated protein 1

TEP1(telomerase associated protein 1)是蛋白質編碼基因,其產物參與端粒酶核糖核蛋白複合體,也與 vault 粒子及 vault RNA 的定位和穩定相關。

Homo sapiens14q11.2UniProt Q99973
OFFICIAL SYMBOL
TEP1
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q99973
PDB / ALPHAFOLD
11GZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TEP1(telomerase associated protein 1)是位於人類第 14 號染色體的蛋白質編碼基因,產生大型蛋白質 Telomerase-associated protein 1。來源將其描述為端粒酶核糖核蛋白複合體與 vault 粒子的組成成分,顯示其涉及兩類不同的核糖核蛋白複合體。蛋白質序列長 2627 個胺基酸,包含 TROVE 與 NACHT 結構域,並具有多個 WD 重複序列。這些特徵構成其基本分子架構;來源並未提供更多可確定其家族分類或各區域作用的資訊。

Official symbol
TEP1
Gene name
telomerase associated protein 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11726
UniProt
Q99973
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TP1TLP1VAULT2p240TROVE1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q11.2
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegTEP1pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:20,365,667–20,413,507
Gene span
47,841 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262715 ★20,365,667–20,413,50155
ENST0000055693520,365,667–20,413,50753
ENST0000092153720,365,667–20,413,09355
ENST0000113311720,365,667–20,413,50755
ENST0000055398420,369,367–20,373,0805
ENST0000055654920,407,942–20,413,4292

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TEP1 是端粒酶核糖核蛋白複合體的組成成分;該複合體對染色體末端的複製不可或缺。這項描述指出 TEP1 位於與端粒維持相關的分子複合體中,但來源未進一步說明它在複合體內的具體反應步驟或作用機制。

TEP1 也參與 vault 粒子。vault 是大型核糖核蛋白複合體,可能涉及貨物運輸與訊號傳遞;這些功能以相似性推論描述,並非在此來源中確立的作用。於 vault 核糖核蛋白粒子內,TEP1 負責使 vault RNA(vRNA)定位,並穩定 vRNA 與粒子的關聯。

此外,TEP1 可與端粒酶 RNA 組件 TERC 結合,此項資訊同樣標示為相似性推論。來源未交代此結合的實驗條件,也未說明它如何影響端粒酶複合體或染色體末端複製,因此不宜將其延伸解讀為特定的調控機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 20413501 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TEP1 ENST00000262715 GRCh38 chr14:20413401-20414501 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCCACCAATCCCATTTATGAGTATTCTAAACTCCATGACCTAATGACCTCCCAGAGATCCCACCCTAAA
TACCATCGCATTGGGATTAGGGTTTCAATATATAAATTTTGGGGAGACACAAACATAAAGACCATTGCAG
GGAGTGTTGGGACTGGTGGCAATAGAGGTTTCTAAGGAAGGAAAGGGGTACTGGCTCAGTTAATAGAGGA
CAGAATGCCCTCAATTCTGAGCGGAAGCTCAGCTGTTACCTGAGACTCAAGGGTACCTCTCTAAGGAAAG
CAATGATATTTTCCAGAAGACAGCTAATCTGCTTTATATAAAGGCAGAAAGCATATTTCTCCTGCTACTA
TGTTTGGTCCTCTCTTTATGAAGCTAGGATTATTAACCTAAGGGTCACTTGTCTCTTTCCTAAGCCTGGT
TCCATCTTCCTGGAAAGGGTTCAGCATTAATCATTCAGGATGGCTCCAGATAGATTCTGTGTGATCCACG
GATCTCTCTTCTGATCAACAGGAGGGGAGGCACTTGCTCTCAGTTCAGCGAACTTTGATTGACTGATGTC
TACACTTGGTTACAGGCGGTTGCTTTCCGCTTTCCGTCTCCTTTTAAGGAGTTCCTCAAAGGAACTTTAG
GATGAATTGAGTCTGACCGTCTTTGATATTAGGAAGGAGAGGTGTACAGCTAGGCAGCGAGCATGCTAAA
ATCTTTTCCAGGAAACGGTGTTTGAAGAGTTAATGGGAGAAAAAAAGACGAAAATTAGCCAGAGGAGACG
AATTTGGTAGAGGGGGAAGCCCTAGGGACAGGAGAAAATAGGACCAGAAAGGGAAAAAAAATAGAAACAA
TAACAAACTAAACTCGGGCCCCAGAAAAGGCGGCAGGGGTCCTGGGCATTCGCGTCGCAGCCCTGGCATG
TCGTCTTGCCCGGCCCTCGGCTCGCTGCCCTTCCAGCAGCTGCTGCGCCCCGCCCGGGCCCGAGAGTCTC
CGCCCGCACCGTCTCTTCTCAGATCCGCATCCGGCTCCTCCCCCGGCTGCCACCCTTCCCACCGGCAGAA
TCCAGAGCGAAGTTTCTGCTTCCTGCTGCGGGAATCGGACGCCCCAGGTCA
TEP1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TEP1_1 ↗14:20,413,440負股20,413,430–20,413,489
TEP1_2 ↗14:20,413,884負股20,413,874–20,413,933

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2627 aa

1 aa2627 aa結構域功能區域重複區
依 Q99973 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TEP1 蛋白質長 2627 個胺基酸,含有 TROVE 結構域(223–676)與 NACHT 結構域(1162–1490)。序列另有 N 端重複區,以及標註為 WD 的 21 個重複序列,分布於蛋白質後段。另有三段被註記為無序區,分別位於 193–214、383–402 與 2506–2551。

重複區TEP1 N-terminal 11–30 aa
重複區TEP1 N-terminal 231–60 aa
重複區TEP1 N-terminal 361–90 aa
重複區TEP1 N-terminal 491–120 aa
結構域TROVE223–676 aa
結構域NACHT1162–1490 aa
重複區WD 11411–1448 aa
重複區WD 21674–1713 aa
重複區WD 31716–1754 aa
重複區WD 41757–1796 aa
重複區WD 51798–1837 aa
重複區WD 61840–1879 aa
重複區WD 71882–1921 aa
重複區WD 81925–1964 aa
重複區WD 91967–2005 aa
重複區WD 102008–2047 aa
重複區WD 112059–2098 aa
重複區WD 122105–2143 aa
重複區WD 132146–2183 aa
重複區WD 142185–2233 aa
重複區WD 152236–2275 aa
重複區WD 162278–2317 aa
重複區WD 172319–2355 aa
重複區WD 182368–2417 aa
重複區WD 192459–2500 aa
重複區WD 202553–2590 aa
重複區WD 212592–2626 aa
功能區域Disordered193–214 aa
功能區域Disordered383–402 aa
功能區域Disordered2506–2551 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 11GZ…

PDB · 11GZ

X-ray · 2.44 A · A=895-1113

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Chromosome, telomere

TEP1 的定位資料列出細胞核與染色體端粒。 資料未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome, telomere。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TP1TEP1RHOXF2UBAP2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TEP1 與 MVP 組成 vault 粒子的一部分;vault 由兩個半粒子組裝而成,每個半粒子包含 39 個相同的 MVP 次單元。完整結構內部可能結合包括 TEP1、PARP4 與 vault RNA 在內的次要成分。TEP1 亦可結合 VAULTRC1、VAULTRC2 及 VAULTRC4/hvg4 vRNAs;上述互作均以相似性推論描述。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TEP1 是端粒酶核糖核蛋白複合體的組成成分,而該複合體對染色體末端複製不可或缺。它也參與 vault 粒子;此大型核糖核蛋白複合體可能涉及貨物運輸與訊號傳遞。TEP1 可使 vault RNA(vRNA)在粒子內定位並穩定其關聯,且能與 TERC 結合;後兩項 vault 與結合描述依相似性推論。含實驗來源
證據與來源

Component of the telomerase ribonucleoprotein complex that is essential for the replication of chromosome termini. Component of the vault particle, which is a massive ribonucleoprotein complex that may play a role in cargo transport and signal transduction (By similarity). Responsible for the localizing and stabilizing vault RNA (vRNA) association in the vault ribonucleoprotein particle. Binds to TERC (By similarity)

PMID 19179534 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TEP1 與 MVP 一同構成 vault 粒子的一部分。此大型籠狀結構由兩個半粒子組成,每個半粒子含 39 個相同的 MVP 次單元;完整 vault 內部可能結合 PARP4、TEP1 與 vault RNA 等次要成分。TEP1 也可結合 VAULTRC1、VAULTRC2 和 VAULTRC4/hvg4 vRNAs;這些描述均為相似性推論。含實驗來源
證據與來源

Associates with MVP to form part of the vault particle (By similarity). The vault is a massive cage-like structure; it consists of a dimer of half-vaults, with each half-vault comprising 39 identical MVP subunits (By similarity). The two half-vaults assemble to form the complete vault, where minor vault components such as PARP4, TEP1 and vault RNAs (vRNAs) may bind to the interior (By similarity). Binds to VAULTRC1, VAULTRC2 and VAULTRC4/hvg4 vRNAs (By similarity)

PMID 19179534 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TEP1 的細胞定位列為細胞核及染色體端粒。推論支持
證據與來源

Nucleus; Chromosome, telomere

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262715 · 10,775 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGATCCGCATCCGGCTCCTCCCCCGGCTGCCACCCTTCCC40
41ACCGGCAGAATCCAGAGCGAAGTTTCTGCTTCCTGCTGCG80
81GGAATCGGACGCCCCAGGCATATACAAGCTGAGTTTCAGC120
121CATGGAAAAACTCCATGGGCATGTGTCTGCCCATCCAGAC160
161ATCCTCTCCTTGGAGAACCGGTGCCTGGCTATGCTCCCTG200
201ACTTACAGCCCTTGGAGAAACTACATCAGCATGTATCTAC240
241CCACTCAGATATCCTCTCCTTGAAGAACCAGTGCCTAGCC280
281ACGCTTCCTGACCTGAAGACCATGGAAAAACCACATGGAT320
321ATGTGTCTGCCCACCCAGACATCCTCTCCTTGGAGAACCA360
361GTGCCTGGCCACACTTTCTGACCTGAAGACCATGGAGAAA400
401CCACATGGACATGTTTCTGCCCACCCAGACATCCTCTCCT440
441TGGAGAACCGGTGCCTGGCCACCCTCTCTAGTCTAAAGAG480
481CACTGTGTCTGCCAGCCCCTTGTTCCAGAGTCTACAGATA520
521TCTCACATGACGCAAGCTGATTTGTACCGTGTGAACAACA560
561GCAATTGCCTGCTCTCTGAGCCTCCAAGTTGGAGGGCTCA600
601GCATTTCTCTAAGGGACTAGACCTTTCAACCTGCCCTATA640
641GCCCTGAAATCCATCTCTGCCACAGAGACAGCTCAGGAAG680
681CAACTTTGGGTCGTTGGTTTGATTCAGAAGAGAAGAAAGG720
721GGCAGAGACCCAAATGCCTTCTTATAGTCTGAGCTTGGGA760
761GAGGAGGAGGAGGTGGAGGATCTGGCCGTGAAGCTCACCT800
801CTGGAGACTCTGAATCTCATCCAGAGCCTACTGACCATGT840
841CCTTCAGGAAAAGAAGATGGCTCTACTGAGCTTGCTGTGC880
881TCTACTCTGGTCTCAGAAGTAAACATGAACAATACATCTG920
921ACCCCACCCTGGCTGCCATTTTTGAAATCTGTCGTGAACT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。