基因總覽
TEKT3 是蛋白質編碼基因,其產物 tektin 3 屬於 tektin 家族。此蛋白被描述為微管內部蛋白,存在於纖毛與鞭毛的軸絲結構中,也是精子鞭毛雙聯微管的組成成分。這些特性將 TEKT3 置於纖毛與鞭毛微管相關蛋白的脈絡中;來源並指出其可在微管壁形成絲狀聚合物。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395930 ★ | 15,303,812–15,341,597 | 9 |
| ENST00000338696 | 15,303,812–15,331,620 | 7 |
| ENST00000539245 | 15,312,282–15,341,597 | 8 |
| ENST00000536146 | 15,331,143–15,338,556 | 2 |
| ENST00000539316 | 15,331,166–15,341,632 | 2 |
| ENST00000543896 | 15,331,340–15,341,593 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEKT3 產生的 tektin 3 是纖毛與鞭毛軸絲雙聯微管中的微管內部蛋白。纖毛與鞭毛的微管結構為其提供所在位置;在人類資料中,tektin 3 被列為纖毛及鞭毛中由 dynein 裝飾的雙聯微管成分。此描述將它定位在軸絲微管內部結構,而非僅泛稱與微管相關。
依據相似性推定,tektin 3 可在纖毛與鞭毛微管壁形成絲狀聚合物。此項結構特性提示它參與微管壁的組織,但現有來源沒有進一步說明聚合物的組成方式或分子作用細節,因此不宜延伸推論其具體組裝機制。
在精子中,tektin 3 被認為是鞭毛雙聯微管的一部分;依據相似性資料,它對正常精子活動力具有必要性。這項功能描述連結了鞭毛微管結構與精子運動,但來源未提供更細的生理測量或作用步驟。整體而言,TEKT3 的已知功能重點在於纖毛與鞭毛微管內部結構,以及其與正常精子活動力的關聯;其中微管壁聚合與活動力必要性的描述屬於依據相似性推定。
Promoter 與基因調控
>TEKT3 ENST00000395930 GRCh38 chr17:15341497-15342597 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTCTGAATTGGCAAAGCTGAGGACCAGCCCCCGACTTGAAGTCACTTCATTGAGGTCTCCTAGGGGCTG GGCAGCCTGCCTTATCCTGGCAAGTCCCTCCGCCTCGTCCTTGGGTGGAGTGCCACACAGTGATTCCCAG AAAAGCCAAAAATAATTAACTGAGGGCTTTATTTTCTTTAGCATTACTAGTTACCAAAGTAACTCGGTGA ATTCTCTTGCTGCTCACACGGTTAGACTGCTGCCTCATGGAAAGATGCCTTGAAGTTTGACTGATTTGAG TTTTAGTGTTAGCTCTGCCACTGAGTCACATTGTCTAAGTCAATTAACTTCTCGAACTTCAGTTTCTTCA TCTGTACAATATAAACCCCTCTTACAGGTTTGGAAAGAGGTTGCATGGATGAGCAATGATGTATGTATGT AAAAATGTGGGCCAGCACCTGGAAGAAACAGTACGGGCTGCTGTTTACGGAAATATTTGCTGAAGAGAGA GAGGGAAAGCCCAAACCATTTTCTTAGAGTGAGGAAGCAGGGAAGGAACACTAGATAATTCTGTCACAGG AGAAGCTCTGCTGGAGAGAAGAGAGGCTGGTCAGGAAAGGTGGGGGCTTGTCAACACCTAGGCAGGTGTT AGGGTTCCAGGCAGCCCTGATGTGCCTTAGAATCGGCCAAGTTCTTCGCAGCTGGAAGAGTTCCGAATCA GGCTTCACAGGAGAGGTCGGGAAATCACCGAGGCCTCTCCCTTGGGCTACTCTTCACCCCTTTCACCTCC CAAACCAAGGAGGTCTCCCGGAGGGCGGGGAGCCTCGGTTACTAAGCGTGAGCGCGTCCATAGTAACCGC CGCCCGACGGGTTTCCCTCCTGGCCTGACAGCTCCCGCCTCTCCTATAACTGGCCAGTCAGCTCCGGCGA GCCGGCCGGGGCGGCCGCTGAGTGGCCCTCAGGCGCTGCTATCGTCACAGATAGGAAAGGCGGGGCCAGG GCCAGACTGGTCTGGGCCCCAGTCGAGGGCTGCAGGTGGTAGGCTGCGACCCCTTCCTCCCACAGCCCCT TCCCGCCCCTCGCCGGGCATCCGCCGACAGGTGAGTGGTCTCGCTGACTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEKT3_1 ↗ | 17:15,341,597 | 負股 | 15,341,587–15,341,646 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_8G6RW · promoter · 15340961–15341119 · regulatory
ENSR17_984F3 · enhancer · 15341120–15341586 · regulatory
ENSR17_984F7 · promoter · 15341587–15342087 · regulatory
ENSR17_8G6TL · enhancer · 15343872–15344113 · regulatory
· motif · 15340034–15340045 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
精子中,tektin 3 優先位於鞭毛,也可在頭部觀察到。 依據相似性資料,其鞭毛定位偏向軸絲周邊,並與粒線體鞘及外緻密纖維相關;中央軸絲區則未檢出。 頭部位置的報告不一致,且定位會隨精子活化及頂體反應而改變:活化後可由頂體後區移至赤道區,頂體反應後則留在頂體後區而非赤道區。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 33 個夥伴
- AJUBAQ96IF1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARID5AQ03989 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASPGQ86U10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATN1Q86V38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CALCOCO2Q13137 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CNOT2Q9NZN8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDI1Q8WTU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GORASP2Q9H8Y8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- HNRNPH1P31943 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IKZF3Q9UKT9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INSCQ1MX18 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP15-1Q3LI76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-5Q3LI72 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP26-1Q6PEX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP3-1Q9BYR8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-1Q3LI64 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-2Q3LI66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP8-1Q8IUC2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LASP1Q14847-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO2P25791-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- METTL27Q8N6F8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OIP5O43482 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PLAGL2Q9UPG8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLEKHG4Q58EX7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
tektin 3 是精子鞭毛雙聯微管的組成成分,此組成關係依據相似性推定。來源另報告它與 TEKT1、TEKT2、TEKT4、TEKT5 及 CCDC38 互作;其中與前四者的互作有 PubMed 文獻支持,與 CCDC38 的互作則依據相似性推定。來源未進一步界定這些互作是否形成同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Spermatogenic failure 81(SPGF81)是一種男性不孕症,與 oligoasthenoteratozoospermia 有關,特徵包括精子前向活動力降低。患者精子可見頂體發育不全,以及頂體與精子頭部分離。來源指出,此疾病可能由影響 TEKT3 的變異所致;此為可能的致病關聯,並非將所有相關病例都歸因於 TEKT3。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | tektin 3 是纖毛與鞭毛軸絲中由 dynein 裝飾的雙聯微管之微管內部蛋白。依據相似性推定,它可在纖毛與鞭毛微管壁形成絲狀聚合物,且對正常精子活動力具有必要性;後兩項功能描述帶有相似性推定的證據限制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Microtubule inner protein (MIP) part of the dynein-decorated doublet microtubules (DMTs) in cilia and flagellar axoneme. Forms filamentous polymers in the walls of ciliary and flagellar microtubules (By similarity). Required for normal sperm mobility (By similarity) PMID 36191189 ↗ |
| 交互作用 | tektin 3 依據相似性推定為精子鞭毛雙聯微管的組成成分。來源報告它與 TEKT1、TEKT2、TEKT4 及 TEKT5 互作,並依據相似性推定它也與 CCDC38 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Microtubule inner protein component of sperm flagellar doublet microtubules (By similarity). Interacts with TEKT1, TEKT2, TEKT4 and TEKT5. Interacts with CCDC38 (By similarity) PMID 36708031 ↗ |
| 細胞定位 | 精子中的 tektin 3 優先位於鞭毛,也見於頭部;依據相似性資料,它在鞭毛位於軸絲周邊並與粒線體鞘、外緻密纖維相關,中央軸絲區未檢出。頭部定位報告有差異,包括頂體赤道區、頂體後區及前端帽區;精子活化後可由頂體後區移至赤道區,頂體反應後則留在頂體後區而非赤道區。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome outer membrane / Peripheral membrane protein; In spermatozoa, preferentially localizes to the flagella, but also found in the head. In the sperm flagellum, localizes to the periaxonemal region where it associates with the mitochondrial sheath and outer dense fibers (By similarity). Not detected in the central axonemal region of the flagellum (By similarity). Associates with the acrosome membrane in the equatorial segment of the sperm head (By similarity). Also detected just below the plasma membrane in the post-acrosomal region where it might localize to the postacrosomal dense lamina (By similarity). However, other studies report little or no expression in the postacrosomal region (By similarity). Translocates from the postacrosomal region to the equatorial segment after sperm activation (By similarity). Retained in the postacromal region, but not the equatorial segment, following the acrosome reaction (By similarity). Some studies report strong expression in the anterior cap region (By similarity). However, other studies report little or no expression in the acrosomal cap (By similarity) PMID 36191189 ↗ · PMID 36708031 ↗ |
| 疾病關聯 | Spermatogenic failure 81(SPGF81)是一種男性不孕症,與 oligoasthenoteratozoospermia 相關,特徵為精子前向活動力降低;患者精子可有頂體發育不全及頂體從精子頭部分離。來源指出此疾病可能由影響 TEKT3 的變異造成,保留其可能性而非確定因果的表述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spermatogenic failure 81 SPGF81 A male infertility disorder due to oligoasthenoteratozoospermia and characterized by reduced progressive sperm motility. Patient spermatozoa exhibit acrosomal hypoplasia and detachment of the acrosome from the sperm head. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620277 PMID 36708031 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCGAGGGCTGCAGGTGGTAGGCTGCGACCCCTTCCTCC40CACAGCCCCTTCCCGCCCCTCGCCGGGCATCCGCCGACAG80GTACATACCAAGAAATTGAATTGCTGAGTCACAGGAGAGA120TTTACAAATAGTGTTTTGGCATCATGGAACGTGTAGGTTG160TACTTTAACGACAACTTACGCCCACCCTAGACCAACACCA200ACCAACTTTCTACCAGCCATCAGTACCATGGCCTCAAGCT240ACAGGGACCGCTTTCCCCACTCCAATTTGACCCATAGCCT280GAGCCTTCCTTGGAGACCCAGCACATACTACAAAGTCGCC320TCCAATTCCCCAAGCGTGGCCCCGTACTGCACCAGATCAC360AGAGGGTGTCCGAGAATACCATGCTTCCCTTTGTTTCCAA400CAGAACCACTTTCTTCACAAGATACACACCGGATGACTGG440TACAGGTCCAATTTAACCAACTATCAAGAGTCCAACACTT480CCCGACATAATTCGGAGAAACTAAGAGTGGATACATCTCG520CCTGATTCAAGACAAATATCAACAAACAAGAAAAACTCAG560GCAGACACAACCCAAAATCTGGGAGAACGTGTCAATGACA600TAGGGTTTTGGAAATCTGAAATCATTCATGAGTTGGATGA640AATGATTGGAGAGACAAATGCACTTACTGATGTGAAGAAA680AGACTGGAGCGGGCTTTGATGGAGACTGAAGCCCCTCTTC720AGGTAGCCCGAGAATGTCTATTTCATCGAGAAAAGAGAAT760GGGAATCGACCTAGTTCACGATGAAGTTGAAGCACAACTG800CTGACGGAAGTTGATACTATTCTGTGTTGTCAAGAAAGAA840TGAAGCTACATTTGGATAAGGCTATTGCCCAACTTGCAGC880CAACAGAGCGTCCCAGCATGAGCTGGAAAAGGACCTGAGT920GACAAACAGACGGCTTACCGGATCGACGACAAATGCCACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。