演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TEKT3FLJ32828

tektin 3

TEKT3 編碼 tektin 3,屬於 tektin 家族。此蛋白是纖毛與精子鞭毛微管內部蛋白,參與雙聯微管結構,並與正常精子活動力有關。

Homo sapiens17p12UniProt Q9BXF9
OFFICIAL SYMBOL
TEKT3
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9BXF9
PDB / ALPHAFOLD
7UNG
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TEKT3 是蛋白質編碼基因,其產物 tektin 3 屬於 tektin 家族。此蛋白被描述為微管內部蛋白,存在於纖毛與鞭毛的軸絲結構中,也是精子鞭毛雙聯微管的組成成分。這些特性將 TEKT3 置於纖毛與鞭毛微管相關蛋白的脈絡中;來源並指出其可在微管壁形成絲狀聚合物。

Official symbol
TEKT3
Gene name
tektin 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14293
UniProt
Q9BXF9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ32828

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegTEKT3pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:15,303,811–15,341,632
Gene span
37,822 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000395930 ★15,303,812–15,341,5979
ENST0000033869615,303,812–15,331,6207
ENST0000053924515,312,282–15,341,5978
ENST0000053614615,331,143–15,338,5562
ENST0000053931615,331,166–15,341,6322
ENST0000054389615,331,340–15,341,5934

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TEKT3 產生的 tektin 3 是纖毛與鞭毛軸絲雙聯微管中的微管內部蛋白。纖毛與鞭毛的微管結構為其提供所在位置;在人類資料中,tektin 3 被列為纖毛及鞭毛中由 dynein 裝飾的雙聯微管成分。此描述將它定位在軸絲微管內部結構,而非僅泛稱與微管相關。

依據相似性推定,tektin 3 可在纖毛與鞭毛微管壁形成絲狀聚合物。此項結構特性提示它參與微管壁的組織,但現有來源沒有進一步說明聚合物的組成方式或分子作用細節,因此不宜延伸推論其具體組裝機制。

在精子中,tektin 3 被認為是鞭毛雙聯微管的一部分;依據相似性資料,它對正常精子活動力具有必要性。這項功能描述連結了鞭毛微管結構與精子運動,但來源未提供更細的生理測量或作用步驟。整體而言,TEKT3 的已知功能重點在於纖毛與鞭毛微管內部結構,以及其與正常精子活動力的關聯;其中微管壁聚合與活動力必要性的描述屬於依據相似性推定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 15341597 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TEKT3 ENST00000395930 GRCh38 chr17:15341497-15342597 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTCTGAATTGGCAAAGCTGAGGACCAGCCCCCGACTTGAAGTCACTTCATTGAGGTCTCCTAGGGGCTG
GGCAGCCTGCCTTATCCTGGCAAGTCCCTCCGCCTCGTCCTTGGGTGGAGTGCCACACAGTGATTCCCAG
AAAAGCCAAAAATAATTAACTGAGGGCTTTATTTTCTTTAGCATTACTAGTTACCAAAGTAACTCGGTGA
ATTCTCTTGCTGCTCACACGGTTAGACTGCTGCCTCATGGAAAGATGCCTTGAAGTTTGACTGATTTGAG
TTTTAGTGTTAGCTCTGCCACTGAGTCACATTGTCTAAGTCAATTAACTTCTCGAACTTCAGTTTCTTCA
TCTGTACAATATAAACCCCTCTTACAGGTTTGGAAAGAGGTTGCATGGATGAGCAATGATGTATGTATGT
AAAAATGTGGGCCAGCACCTGGAAGAAACAGTACGGGCTGCTGTTTACGGAAATATTTGCTGAAGAGAGA
GAGGGAAAGCCCAAACCATTTTCTTAGAGTGAGGAAGCAGGGAAGGAACACTAGATAATTCTGTCACAGG
AGAAGCTCTGCTGGAGAGAAGAGAGGCTGGTCAGGAAAGGTGGGGGCTTGTCAACACCTAGGCAGGTGTT
AGGGTTCCAGGCAGCCCTGATGTGCCTTAGAATCGGCCAAGTTCTTCGCAGCTGGAAGAGTTCCGAATCA
GGCTTCACAGGAGAGGTCGGGAAATCACCGAGGCCTCTCCCTTGGGCTACTCTTCACCCCTTTCACCTCC
CAAACCAAGGAGGTCTCCCGGAGGGCGGGGAGCCTCGGTTACTAAGCGTGAGCGCGTCCATAGTAACCGC
CGCCCGACGGGTTTCCCTCCTGGCCTGACAGCTCCCGCCTCTCCTATAACTGGCCAGTCAGCTCCGGCGA
GCCGGCCGGGGCGGCCGCTGAGTGGCCCTCAGGCGCTGCTATCGTCACAGATAGGAAAGGCGGGGCCAGG
GCCAGACTGGTCTGGGCCCCAGTCGAGGGCTGCAGGTGGTAGGCTGCGACCCCTTCCTCCCACAGCCCCT
TCCCGCCCCTCGCCGGGCATCCGCCGACAGGTGAGTGGTCTCGCTGACTCT
TEKT3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TEKT3_1 ↗17:15,341,597負股15,341,587–15,341,646

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_8G6RW · promoter · 15340961–15341119 · regulatory

ENSR17_984F3 · enhancer · 15341120–15341586 · regulatory

ENSR17_984F7 · promoter · 15341587–15342087 · regulatory

ENSR17_8G6TL · enhancer · 15343872–15344113 · regulatory

· motif · 15340034–15340045 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:490 aa

tektin 3 屬於 tektin 家族。來源未提供可進一步描述的結構域、功能區域或序列註解,因此目前僅能確認其家族歸屬。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7UNG…

PDB · 7UNG

EM · 3.60 A · C0/C1/C2/C3/C4=1-490

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme;Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme;Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome outer membrane

精子中,tektin 3 優先位於鞭毛,也可在頭部觀察到。 依據相似性資料,其鞭毛定位偏向軸絲周邊,並與粒線體鞘及外緻密纖維相關;中央軸絲區則未檢出。 頭部位置的報告不一致,且定位會隨精子活化及頂體反應而改變:活化後可由頂體後區移至赤道區,頂體反應後則留在頂體後區而非赤道區。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 33 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ32828TEKT3AJUBAARID5AASPGATN1CALCOCO2CNOT2DDI1GORASP2HNRNPH1IKZF3INSCKRT34KRTAP15-1KRTAP19-5KRTAP26-1KRTAP3-1KRTAP6-1KRTAP6-2KRTAP8-1LASP1LMO2METTL27OIP5PLAGL2PLEKHG4RAMACRFX6SAXO5SPAG8TNS2TRAF2TRIB3WWOX
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 33 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tektin 3 是精子鞭毛雙聯微管的組成成分,此組成關係依據相似性推定。來源另報告它與 TEKT1、TEKT2、TEKT4、TEKT5 及 CCDC38 互作;其中與前四者的互作有 PubMed 文獻支持,與 CCDC38 的互作則依據相似性推定。來源未進一步界定這些互作是否形成同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Spermatogenic failure 81(SPGF81)是一種男性不孕症,與 oligoasthenoteratozoospermia 有關,特徵包括精子前向活動力降低。患者精子可見頂體發育不全,以及頂體與精子頭部分離。來源指出,此疾病可能由影響 TEKT3 的變異所致;此為可能的致病關聯,並非將所有相關病例都歸因於 TEKT3。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tektin 3 是纖毛與鞭毛軸絲中由 dynein 裝飾的雙聯微管之微管內部蛋白。依據相似性推定,它可在纖毛與鞭毛微管壁形成絲狀聚合物,且對正常精子活動力具有必要性;後兩項功能描述帶有相似性推定的證據限制。含實驗來源
證據與來源

Microtubule inner protein (MIP) part of the dynein-decorated doublet microtubules (DMTs) in cilia and flagellar axoneme. Forms filamentous polymers in the walls of ciliary and flagellar microtubules (By similarity). Required for normal sperm mobility (By similarity)

PMID 36191189 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tektin 3 依據相似性推定為精子鞭毛雙聯微管的組成成分。來源報告它與 TEKT1、TEKT2、TEKT4 及 TEKT5 互作,並依據相似性推定它也與 CCDC38 互作。含實驗來源
證據與來源

Microtubule inner protein component of sperm flagellar doublet microtubules (By similarity). Interacts with TEKT1, TEKT2, TEKT4 and TEKT5. Interacts with CCDC38 (By similarity)

PMID 36708031 ↗

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細胞定位精子中的 tektin 3 優先位於鞭毛,也見於頭部;依據相似性資料,它在鞭毛位於軸絲周邊並與粒線體鞘、外緻密纖維相關,中央軸絲區未檢出。頭部定位報告有差異,包括頂體赤道區、頂體後區及前端帽區;精子活化後可由頂體後區移至赤道區,頂體反應後則留在頂體後區而非赤道區。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome outer membrane / Peripheral membrane protein; In spermatozoa, preferentially localizes to the flagella, but also found in the head. In the sperm flagellum, localizes to the periaxonemal region where it associates with the mitochondrial sheath and outer dense fibers (By similarity). Not detected in the central axonemal region of the flagellum (By similarity). Associates with the acrosome membrane in the equatorial segment of the sperm head (By similarity). Also detected just below the plasma membrane in the post-acrosomal region where it might localize to the postacrosomal dense lamina (By similarity). However, other studies report little or no expression in the postacrosomal region (By similarity). Translocates from the postacrosomal region to the equatorial segment after sperm activation (By similarity). Retained in the postacromal region, but not the equatorial segment, following the acrosome reaction (By similarity). Some studies report strong expression in the anterior cap region (By similarity). However, other studies report little or no expression in the acrosomal cap (By similarity)

PMID 36191189 ↗ · PMID 36708031 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Spermatogenic failure 81(SPGF81)是一種男性不孕症,與 oligoasthenoteratozoospermia 相關,特徵為精子前向活動力降低;患者精子可有頂體發育不全及頂體從精子頭部分離。來源指出此疾病可能由影響 TEKT3 的變異造成,保留其可能性而非確定因果的表述。含實驗來源
證據與來源

Spermatogenic failure 81 SPGF81 A male infertility disorder due to oligoasthenoteratozoospermia and characterized by reduced progressive sperm motility. Patient spermatozoa exhibit acrosomal hypoplasia and detachment of the acrosome from the sperm head. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620277

PMID 36708031 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000395930 · 1,740 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTCGAGGGCTGCAGGTGGTAGGCTGCGACCCCTTCCTCC40
41CACAGCCCCTTCCCGCCCCTCGCCGGGCATCCGCCGACAG80
81GTACATACCAAGAAATTGAATTGCTGAGTCACAGGAGAGA120
121TTTACAAATAGTGTTTTGGCATCATGGAACGTGTAGGTTG160
161TACTTTAACGACAACTTACGCCCACCCTAGACCAACACCA200
201ACCAACTTTCTACCAGCCATCAGTACCATGGCCTCAAGCT240
241ACAGGGACCGCTTTCCCCACTCCAATTTGACCCATAGCCT280
281GAGCCTTCCTTGGAGACCCAGCACATACTACAAAGTCGCC320
321TCCAATTCCCCAAGCGTGGCCCCGTACTGCACCAGATCAC360
361AGAGGGTGTCCGAGAATACCATGCTTCCCTTTGTTTCCAA400
401CAGAACCACTTTCTTCACAAGATACACACCGGATGACTGG440
441TACAGGTCCAATTTAACCAACTATCAAGAGTCCAACACTT480
481CCCGACATAATTCGGAGAAACTAAGAGTGGATACATCTCG520
521CCTGATTCAAGACAAATATCAACAAACAAGAAAAACTCAG560
561GCAGACACAACCCAAAATCTGGGAGAACGTGTCAATGACA600
601TAGGGTTTTGGAAATCTGAAATCATTCATGAGTTGGATGA640
641AATGATTGGAGAGACAAATGCACTTACTGATGTGAAGAAA680
681AGACTGGAGCGGGCTTTGATGGAGACTGAAGCCCCTCTTC720
721AGGTAGCCCGAGAATGTCTATTTCATCGAGAAAAGAGAAT760
761GGGAATCGACCTAGTTCACGATGAAGTTGAAGCACAACTG800
801CTGACGGAAGTTGATACTATTCTGTGTTGTCAAGAAAGAA840
841TGAAGCTACATTTGGATAAGGCTATTGCCCAACTTGCAGC880
881CAACAGAGCGTCCCAGCATGAGCTGGAAAAGGACCTGAGT920
921GACAAACAGACGGCTTACCGGATCGACGACAAATGCCACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。