基因總覽
TEK 是蛋白質編碼基因,產物為細胞表面的受體型酪胺酸蛋白激酶,屬於 protein kinase superfamily、Tyr protein kinase family 的 Tie subfamily。其蛋白質具有單次穿膜結構:大型胞外區域由 Ig-like C2-type、EGF-like 與 Fibronectin type-III 等結構域組成,跨膜區連接胞質端的 Protein kinase domain。TEK 可作為 ANGPT1、ANGPT2 與 ANGPT4 的受體,並依血管內皮細胞所處情境,參與調節血管生成及血管穩定。這些結構與受體特性構成其接收細胞外訊號並在細胞內傳遞訊息的基本條件。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380036 ★ | 27,109,225–27,230,174 | 23 |
| ENST00000519097 | 27,109,030–27,232,092 | 21 |
| ENST00000615002 | 27,109,030–27,230,173 | 23 |
| ENST00000406359 | 27,109,030–27,232,092 | 22 |
| ENST00000856712 | 27,109,030–27,232,092 | 23 |
| ENST00000856713 | 27,109,030–27,232,092 | 22 |
| ENST00000856714 | 27,109,030–27,232,092 | 22 |
| ENST00000856715 | 27,109,030–27,232,092 | 21 |
| ENST00000856716 | 27,109,030–27,232,092 | 22 |
| ENST00000856717 | 27,109,030–27,232,092 | 21 |
| ENST00000856718 | 27,109,030–27,232,092 | 21 |
| ENST00000856719 | 27,109,030–27,232,092 | 18 |
顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEK 是 ANGPT1、ANGPT2 與 ANGPT4 的細胞表面受體,具有酪胺酸蛋白激酶活性。受體受到 ANGPT1 訊號後會形成二聚體,並在特定酪胺酸位置自體磷酸化;這些磷酸化位置可供支架蛋白與效應分子結合。TEK 也能磷酸化 DOK2、GRB7、GRB14、PIK3R1、SHC1 與 TIE1。其訊號參與血管生成、內皮細胞存活、增殖、遷移、黏附與細胞展開,也涉及肌動蛋白細胞骨架重整及血管靜止狀態的維持。
TEK 的作用會隨內皮細胞接觸狀態而異。在細胞間接觸緊密、處於靜止狀態的血管中,ANGPT1 寡聚體會將 TEK 招募至細胞接觸處,使相鄰細胞的 TEK 形成複合體,並優先活化 phosphatidylinositol 3-kinase 與 AKT1 訊號級聯。此情境下,TEK 抑制血管生成並促進血管穩定。相對地,在缺少細胞間黏附的遷移中內皮細胞中,ANGPT1 會將 TEK 招募至細胞與細胞外基質的接觸處,促成 focal adhesion complexes 形成,活化 PTK2/FAK 及下游 MAPK1/ERK2、MAPK3/ERK1,最終刺激萌芽式血管生成。
ANGPT2 以低於 ANGPT1 的親和力結合 TEK;沒有 ANGPT1 時,ANGPT2 仍可促進 TEK 自體磷酸化,但也會競爭相同結合位置,抑制 ANGPT1 介導的訊號。TEK 與 TIE1 形成異源二聚體,以及蛋白水解產生可溶性胞外區域,也會調節訊號;該可溶性區域可作為 angiopoietin 的誘餌受體。此外,TEK 有助於限制促發炎血漿蛋白與白血球由血管滲漏,具有抗發炎作用。胚胎發育期間,TEK 是正常血管生成與心臟發育所必需;出生後也需要 TEK 參與造血,而其促進或抑制血管生成的方向則取決於情境。
Promoter 與基因調控
>TEK ENST00000380036 GRCh38 chr9:27108225-27109325 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCTACACATGTGGCTGAGCCAGTATTTGAACCCAGTTCTGTTTGCAGACAGAACCTGGGCTTTTTCACAC CTGCAAACTGGAAACATTAATTGGTTCTTAAGATCATCATCGATGTGATAAAACCTGGGACAGAAATTAG TCAAGACTAGCTGCATCTGCCTTTTCCTCTGGTGGGTAGGAAAAGGAGGAGTATAATGATTTCCTCAGGC ATGAAGGTCGATGATGAGCAAAGTGTATACTCTCTAATCTAATGTCATAATTCATATTGTGGAGTAATTA TCTGGATAAGTGTAGGGTCTCTGACCTCATTCTAGATATTGTACATTCCATGGCTATTTTCATTTTGGTC CATGAACTCTCTTTGCTCTCATGAGCACCATTTTTATCCCAATCTAATCCTGTATGTTTGTGTTTTTACA CAGATTAGTTTTTAAATGTTATATATAATTTGCTTCTGAAACACCATTGCTCAATGACTACCAAATCTTT CTCATTACCAAAATCCTTCTATGCCAACTTCTTCAAGAAATTTGATCACCTTTAGATGAATTGTTAATGA AAATTAAAGCTATAGCCGGCAACATGGGTATCTTTGGGCTAATGGCCAACCAACAGGCCATCTGTGTGAA AGAAAACAGGCTAACAATTTTGGACTCTGGTCTCTTGGGGCTACATTGAGCATTGACCTCACCGGTGCTC ACTGAAATTAATTGCTTTTCAGGTTGTATTTTCTCATCACGGAAACCTTCTTCTCCCAATTCAAACCATG TGGGTTAAAATGAGAAAACAAAAGCCAAAACGGCTTCCCACACCCAAAAGCTCCTTCTGTCAGAGATCCC AGTAGCCCCGGGAGAGCTGTTAGAAGTCTGAGAAGGATTGGTCATCATCGCATACCATACATAGGTGGAG GGCTTGTTATTCTCAGTTTCCCGCCTATGAGAGGATACCCCTATTGTTTCTGAAAATGCTGACCGGGACC CACACTTCCAACAAAAATTCCTCTGCCCCTACAGCAGCAGCAAAAGCAGCAGCAGAAGCAACAGCAACAG ATAAGTGTTTTGATGAATTGCGAGATGGATAGGGCTTGAGTGCCCCCAGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEK_2 ↗ | 9:27,109,243 | 正股 | 27,109,194–27,109,253 |
| TEK_1 ↗ | 9:27,109,450 | 正股 | 27,109,401–27,109,460 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_B7D93 · promoter · 27108817–27109426 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1124 aa
TEK receptor tyrosine kinase 長 1124 個胺基酸,含 22 個胺基酸的訊號胜肽、胞外區、單次螺旋跨膜區及胞質區。胞外區具有 Ig-like C2-type、EGF-like 與 Fibronectin type-III 結構域;胞質區包含 Protein kinase domain。此蛋白屬於 protein kinase superfamily 的 Tyr protein kinase family、Tie subfamily。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TEK 是細胞膜上的單次穿膜蛋白,也可位於細胞接合處、focal adhesion 與細胞骨架相關區域。 靜止的內皮細胞中,TEK 會被招募至細胞間接觸處;細胞展開時則與肌動蛋白細胞骨架及 actin stress fibers 共定位。 遷移細胞中,TEK 會移至細胞底面,尤其是後端。 蛋白水解可產生並分泌可溶性胞外區域。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
未繪示構造:Cell junction;Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
- ANGPT1Q15389 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANGPT2O15123 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- CYP1B1Q16678 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PTPN12Q05209 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PTPRBP23467 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPRCP08575 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPRJQ12913 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PTPRKQ15262 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PTPROQ16827 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
TEK 可形成同源二聚體,也能與 TIE1 形成異源二聚體,並與 ANGPT1、ANGPT2、ANGPT4 結合。靜止細胞的細胞間接觸處,可形成由 ANGPT1 與相鄰細胞的 TEK 分子組成的訊號複合體;缺少內皮細胞間接觸時,TEK 與 ANGPT1 的互作則與細胞外基質接觸相關。TEK 另與 PTPRB 互作,該互作可促進內皮細胞間黏附;也與 DOK2、GRB2、GRB7、GRB14、PIK3R1、PTPN11/SHP2、TNIP2 及 SHC1 互作。磷酸化的 TEK 可與 SHC1 的 SH2 domain 結合;遷移細胞中,TEK 與 DOK2 在細胞外基質接觸處共定位。
疾病與遺傳關聯
TEK 變異與顯性遺傳的靜脈畸形相關;此病屬血管形態發生異常,可見擴張、迂曲的血管通道。TEK 體細胞突變也與單發及多發的散發性靜脈畸形相關。另有資料指出,TEK 可能參與具有血管成分的疾病,包括腫瘤新生血管、乾癬與發炎,但此處屬可能作用的描述。TEK 變異也與常染色體顯性的先天性青光眼相關;該病可伴隨出生時或幼年眼壓顯著升高、眼球增大與角膜水腫,並涉及小梁網及眼前房角發育缺陷,影響房水引流。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 8 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEK 是 ANGPT1、ANGPT2 與 ANGPT4 的受體型酪胺酸蛋白激酶,參與血管生成、內皮細胞存活與活動、肌動蛋白細胞骨架重整及血管靜止。其效應依細胞接觸狀態而變:靜止血管中促進穩定,遷移內皮細胞中可刺激萌芽式血管生成;另有抗發炎作用,並參與胚胎血管與心臟發育及出生後造血。 | 含實驗來源 | 證據與來源Tyrosine-protein kinase that acts as a cell-surface receptor for ANGPT1, ANGPT2 and ANGPT4 and regulates angiogenesis, endothelial cell survival, proliferation, migration, adhesion and cell spreading, reorganization of the actin cytoskeleton, but also maintenance of vascular quiescence. Has anti-inflammatory effects by preventing the leakage of pro-inflammatory plasma proteins and leukocytes from blood vessels. Required for normal angiogenesis and heart development during embryogenesis. Required for post-natal hematopoiesis. After birth, activates or inhibits angiogenesis, depending on the context. Inhibits angiogenesis and promotes vascular stability in quiescent vessels, where endothelial cells have tight contacts. In quiescent vessels, ANGPT1 oligomers recruit TEK to cell-cell contacts, forming complexes with TEK molecules from adjoining cells, and this leads to preferential activation of phosphatidylinositol 3-kinase and the AKT1 signaling cascades. In migrating endothelial cells that lack cell-cell adhesions, ANGT1 recruits TEK to contacts with the extracellular matrix, leading to the formation of focal adhesion complexes, activation of PTK2/FAK and of the downstream kinases MAPK1/ERK2 and MAPK3/ERK1, and ultimately to the stimulation of sprouting angiogenesis. ANGPT1 signaling triggers receptor dimerization and autophosphorylation at specific tyrosine residues that then serve as binding sites for scaffold proteins and effectors. Signaling is modulated by ANGPT2 that has lower affinity for TEK, can promote TEK autophosphorylation in the absence of ANGPT1, but inhibits ANGPT1-mediated signaling by competing for the same binding site. Signaling is also modulated by formation of heterodimers with TIE1, and by proteolytic processing that gives rise to a soluble TEK extracellular domain. The soluble extracellular domain modulates signaling by functioning as decoy receptor for angiopoietins. TEK phosphorylates DOK2, GRB7, GRB14, PIK3R1; SHC1 and TIE1 PMID 12816861 ↗ · PMID 14665640 ↗ · PMID 15284220 ↗ · PMID 15851516 ↗ · PMID 18366015 ↗ · PMID 18425119 ↗ · PMID 18425120 ↗ · PMID 19223473 ↗ · PMID 20651738 ↗ · PMID 9204896 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 11513602 ↗ · PMID 12609966 ↗ · PMID 14665640 ↗ · PMID 15851516 ↗ · PMID 19223473 ↗ · PMID 8382358 ↗ |
| 交互作用 | TEK 可形成同源二聚體或與 TIE1 形成異源二聚體,並與多種 angiopoietin 及訊號蛋白互作。靜止細胞的細胞間接觸處可形成含 ANGPT1 與相鄰細胞 TEK 的訊號複合體;缺少內皮細胞間接觸時,ANGPT1 互作與細胞外基質接觸相關。TEK 與 PTPRB 的互作可促進內皮細胞間黏附。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Heterodimer with TIE1. Interacts with ANGPT1, ANGPT2 and ANGPT4. At cell-cell contacts in quiescent cells, forms a signaling complex composed of ANGPT1 plus TEK molecules from two adjoining cells. In the absence of endothelial cell-cell contacts, interaction with ANGPT1 mediates contacts with the extracellular matrix. Interacts with PTPRB; this promotes endothelial cell-cell adhesion. Interacts with DOK2, GRB2, GRB7, GRB14, PIK3R1 and PTPN11/SHP2. Colocalizes with DOK2 at contacts with the extracellular matrix in migrating cells. Interacts (tyrosine phosphorylated) with TNIP2. Interacts (tyrosine phosphorylated) with SHC1 (via SH2 domain) PMID 12609966 ↗ · PMID 14665640 ↗ · PMID 15284220 ↗ · PMID 15851516 ↗ · PMID 16732286 ↗ · PMID 17253678 ↗ · PMID 17350837 ↗ · PMID 18425119 ↗ · PMID 19451274 ↗ · PMID 19689429 ↗ · PMID 19854647 ↗ · PMID 32908006 ↗ · PMID 9204896 ↗ |
| 細胞定位 | TEK 位於細胞膜、細胞接合處及細胞骨架相關位置。靜止內皮細胞中會被招募至細胞間接觸處;細胞展開時與肌動蛋白細胞骨架及 actin stress fibers 共定位。遷移細胞中,TEK 會移至細胞底面,尤其是細胞後端;蛋白水解則可產生並分泌可溶性胞外區域。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Cell junction; Cell junction, focal adhesion; Cytoplasm, cytoskeleton; Secreted; Recruited to cell-cell contacts in quiescent endothelial cells. Colocalizes with the actin cytoskeleton and at actin stress fibers during cell spreading. Recruited to the lower surface of migrating cells, especially the rear end of the cell. Proteolytic processing gives rise to a soluble extracellular domain that is secreted PMID 18425119 ↗ · PMID 18425120 ↗ · PMID 19079259 ↗ · PMID 27270174 ↗ · PMID 19293632 ↗ · PMID 11806244 ↗ |
| 疾病關聯 | TEK 變異可造成顯性遺傳的靜脈畸形,屬於血管形態發生異常,特徵為出現擴張且迂曲的血管通道。 | 含實驗來源 | 證據與來源Dominantly inherited venous malformations VMCM An error of vascular morphogenesis characterized by dilated, serpiginous channels. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 600195 PMID 10369874 ↗ · PMID 19079259 ↗ · PMID 19888299 ↗ · PMID 8980225 ↗ |
| 疾病關聯 | TEK 的體細胞突變與單發及多發的散發性靜脈畸形相關;此描述指出疾病關聯,未進一步提供突變作用機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Somatic mutations of TEK are associated with solitary and multiple sporadic venous malformations PMID 19079259 ↗ |
| 疾病關聯 | TEK 可能參與具有血管成分的多種疾病,包括腫瘤新生血管、乾癬與發炎;此項描述保留可能性,未指出確定的因果關係或機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May play a role in a range of diseases with a vascular component, including neovascularization of tumors, psoriasis and inflammation |
| 疾病關聯 | TEK 變異與常染色體顯性的先天性青光眼相關。患者可在出生時或幼年出現眼壓顯著升高、眼球增大及角膜水腫;疾病涉及小梁網與眼前房角發育缺陷,導致房水引流不足。 | 含實驗來源 | 證據與來源Glaucoma 3, primary congenital, E GLC3E An autosomal dominant form of primary congenital glaucoma (PCG). PCG is characterized by marked increase of intraocular pressure at birth or early childhood, large ocular globes (buphthalmos) and corneal edema. It results from developmental defects of the trabecular meshwork and anterior chamber angle of the eye that prevent adequate drainage of aqueous humor. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617272 PMID 27270174 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTCTGCCCCTACAGCAGCAGCAAAAGCAGCAGCAGAAGCA40ACAGCAACAGATAAGTGTTTTGATGAATTGCGAGATGGAT80AGGGCTTGAGTGCCCCCAGCCCTGCTGATACCAAATGCCT120TTAAGATACAGCCTTTCCCATCCTAATCTACAAAGGAAAC160AGGAAAAAGGAACTTAAAACTCCCTGTGCTCAGACAGAAA200TGAGACTGTTACAGCCTGCTTCTGTGCTGTTCCTTCTTGC240CTCTAACTTGTAAACAAGACGTAGTAGGACGATGCTAATG280GAAAGTCACAAACCGCTGGGTTTTTGAAAGGATCCTTGGG320ACCTCATGCACATTTGTGGAAACTGGATGGAGAGATTTGG360GGAAGCATGGACTCTTTAGCCAGCTTAGTTCTCTGTGGAG400TCAGCTTGCTCCTTTCTGGAACTGTGGAAGGTGCCATGGA440CTTGATCTTGATCAATTCCCTACCTCTTGTATCTGATGCT480GAAACATCTCTCACCTGCATTGCCTCTGGGTGGCGCCCCC520ATGAGCCCATCACCATAGGAAGGGACTTTGAAGCCTTAAT560GAACCAGCACCAGGATCCGCTGGAAGTTACTCAAGATGTG600ACCAGAGAATGGGCTAAAAAAGTTGTTTGGAAGAGAGAAA640AGGCTAGTAAGATCAATGGTGCTTATTTCTGTGAAGGGCG680AGTTCGAGGAGAGGCAATCAGGATACGAACCATGAAGATG720CGTCAACAAGCTTCCTTCCTACCAGCTACTTTAACTATGA760CTGTGGACAAGGGAGATAACGTGAACATATCTTTCAAAAA800GGTATTGATTAAAGAAGAAGATGCAGTGATTTACAAAAAT840GGTTCCTTCATCCATTCAGTGCCCCGGCATGAAGTACCTG880ATATTCTAGAAGTACACCTGCCTCATGCTCAGCCCCAGGA920TGCTGGAGTGTACTCGGCCAGGTATATAGGAGGAAACCTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。