基因總覽
TEF transcription factor, PAR bZIP family member 是蛋白質編碼基因，產物屬於 bZIP 家族的 PAR 子家族。其蛋白質長 303 個胺基酸，具有 bZIP 結構域；此結構特色與其作為 DNA 結合型轉錄因子的身分相符。現有資料指出，TEF 可結合 DNA，並能活化 TSHB 啟動子。關於其蛋白質的基本家族歸屬與角色，來源提供了上述資訊；其他未列出的性質不作推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000266304 ★ | 41,381,942–41,399,326 | 4 |
| ENST00000406644 | 41,367,333–41,399,326 | 4 |
| ENST00001110626 | 41,381,921–41,387,870 | 2 |
| ENST00000958295 | 41,381,942–41,399,326 | 4 |
| ENST00000413942 | 41,382,935–41,394,274 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEF 是轉錄因子，能結合 DNA，並促進 TSHB 啟動子的轉錄活化。這表示來源所述的功能包含對特定啟動子區域的辨識，以及與轉錄促進相關的作用；資料未進一步說明其活化程度、作用條件或下游生理結果，因此不延伸推論。
其 DNA 結合具有序列選擇性。來源列出的最小 DNA 結合序列為 5'-[TC][AG][AG]TTA[TC][AG]-3'；方括號中的字母表示該位置可由所列核苷酸之一構成。此序列資訊界定了來源記載的最小辨識模式，但未提供更多靶位點、結合親和力或其他基因調控結果。
Promoter 與基因調控
>TEF ENST00000266304 GRCh38 chr22:41380942-41382042 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCCAACCTCTTAATTTTATGGCCGAGGAAACAAGCTCCAGTGAAGCAACCGGACTTTCCCAAGGTCATA AGCTAGTAAGTGGGAGGGCGGAAACATGTACTCGGGCCCTGGCTCAGGTCAGAGCTTCAGGAATGCTCCC TCCACGCTAGTGTTGATCTGGATGCGTGGGCAACCCGACACCCCGCTCTAGGGCGGCCAAGCCTGCTCAG GCCATCCCTACGACTTGGCAGGTCGCGGTCCCCGGCCCTGCCCTCAGGCGACCTCTGGGTCGCGTGGGAG CAGAAGTGCGGGCTAAGCTCAGCGTCCCTGCCCCGCGACCCTGGGCAGAGTCCCCAGAACAAAAAGACCC GTCCCTCCCTTCCCCTCCCGCCCCGCCACAGCCCCGCACGTGCGGCGCCTCGTGCACCGCCCCGGGCCCC GCCCCCGCCCTCCATTGGCTGTTCCCGCGCCTTCCTCCTCTGCCCCCTCCCCCCGCGACCAGACTCGGCT GCGGCTCCACGTGACCCGCGGGGGGTGGACACGCCGCGCGAGCAGGAGCTCGGATAGGTCGCTTTGGCCG GCCTGGCCGCTCCGAGCTCCGCCCCTCTTCGGTGGCGCGTCGGGAAGGTTGCAAGTCGGGGACAAGAGGG AGAGGCTGCGGTGGTTGGGGAGGGCGGGGGTTATGAAGAGGGCGGTGAAGGGGGAACACTGGTAGGAGGG AAGGGACCGCGCCGAGGAAGGCCCACCACAAAGACTCCAGCAGGCGCCAATCAGGGGACACAGGGGCGGC GGGGCGGGGCCTCCGCGAGGGTCCTCACCTGGCCCCGCACGTGTCTATCTTATCCCGGCTGCCCGACCAA TCACGGCCCGAGGATCTGCGCCTGCCCCTCTCGCAGGCTGGACCAATCCAGAGCAACGATCCGGGGAAGC TGGCCTGGCCTCATGAATAATTAATGTGCCAGAGCCGGTCCGCAGGCGGGGTAGCGATGGAAGGAGGCGG GGGCGCCATTGGGCGCCTGCGCAGTAGCTGCCCGTGTCGGCAGCTGCAGCGGGTCGCACGGCTCCGGCCC ATCTCGGGGGGCGGGCGGGGGAGGCGAGGTGCGCGAGCCGAGTCCGGGGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEF_1 ↗ | 22:41,381,942 | 正股 | 41,381,893–41,381,952 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_BB7PR · enhancer · 41380341–41381270 · regulatory
ENSR22_BB7PW · promoter · 41381271–41381952 · regulatory
· motif · 41380550–41380560 · motif
· motif · 41380695–41380709 · motif
· motif · 41380695–41380710 · motif
· motif · 41380695–41380710 · motif
· motif · 41380819–41380830 · motif
· motif · 41381001–41381013 · motif
· motif · 41381326–41381335 · motif
· motif · 41381326–41381335 · motif
· motif · 41381357–41381367 · motif
· motif · 41381363–41381373 · motif
· motif · 41381404–41381414 · motif
· motif · 41381591–41381601 · motif
· motif · 41381711–41381721 · motif
· motif · 41381729–41381742 · motif
· motif · 41381747–41381756 · motif
· motif · 41381747–41381756 · motif
· motif · 41381747–41381756 · motif
· motif · 41381747–41381756 · motif
· motif · 41381798–41381809 · motif
· motif · 41381863–41381876 · motif
· motif · 41381863–41381876 · motif
· motif · 41381915–41381928 · motif
· motif · 41381933–41381944 · motif
· motif · 41381933–41381944 · motif
· motif · 41382003–41382016 · motif
· motif · 41382365–41382380 · motif
· motif · 41382371–41382383 · motif
· motif · 41382433–41382444 · motif
TEF 的累積量會依穩健的晝夜節律變化。來源未提供造成此變化的調控因子或具體時相，因此不據此推定其調控機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：303 aa
TEF 蛋白質長 303 個胺基酸，屬於 bZIP 家族的 PAR 子家族。其 bZIP 結構域位於第 233–296 位胺基酸；其中第 235–255 位為 basic motif，第 256–263 位為 leucine-zipper。另有兩段被註記為無序區，分別位於第 1–63 位及第 132–176 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未描述定位隨條件或異構型而改變的情形。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- DNM2P50570-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MRPL28Q13084 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFE2L2Q16236 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
TEF 可形成同源二聚體或異源二聚體與 DNA 結合；來源亦指出，TEF 能與 DBP 形成異源二聚體。此處記載的是二聚體形成及其 DNA 結合形式，未提供其他複合體或互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEF 是能結合 DNA 的轉錄因子，並可活化 TSHB 啟動子。其最小 DNA 結合序列記為 5'-[TC][AG][AG]TTA[TC][AG]-3'；方括號表示該位置可由所列核苷酸之一構成。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Transcription factor that binds to and transactivates the TSHB promoter. Binds to a minimal DNA-binding sequence 5'-[TC][AG][AG]TTA[TC][AG]-3' |
| 交互作用 | TEF 可作為同源二聚體或異源二聚體結合 DNA，並能與 DBP 形成異源二聚體。來源未進一步列出其他二聚體成員或相關條件。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | 來源將 TEF 的細胞內定位記載為細胞核，未提供定位改變的條件或其他位置資訊。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | TEF 的累積量依穩健的晝夜節律變化。來源未說明此變化的調控因素或具體時相。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCAGTAGCTGCCCGTGTCGGCAGCTGCAGCGGGTCGCACG40GCTCCGGCCCATCTCGGGGGGCGGGCGGGGGAGGCGAGGT80GCGCGAGCCGAGTCCGGGGCACGATGTCCGACGCGGGCGG120CGGAAAGAAGCCGCCTGTGGACCCGCAGGCAGGACCCGGT160CCGGGGCCGGGGCGCGCAGCTGGGGAAAGGGGCCTGTCGG200GGTCCTTCCCCCTGGTCCTGAAGAAGCTGATGGAGAACCC240CCCGCGCGAGGCGCGCCTCGATAAGGAAAAGGGGAAGGAA280AAGCTGGAGGAGGACGAGGCCGCAGCCGCCAGCACCATGG320CTGTCTCAGCCTCCCTCATGCCACCCATCTGGGACAAGAC360CATCCCATATGATGGCGAATCTTTCCACCTGGAGTACATG400GACCTGGATGAGTTCCTGCTGGAGAATGGCATCCCCGCCA440GCCCCACCCACCTGGCCCACAACCTGCTGCTGCCTGTAGC480AGAGCTAGAAGGGAAGGAGTCTGCCAGCTCTTCCACAGCA520TCCCCACCATCCTCCTCCACTGCCATCTTTCAGCCCTCTG560AAACCGTGTCCAGCACAGAATCTTCCCTGGAGAAGGAGAG600GGAGACTCCCAGTCCCATCGACCCCAATTGTGTGGAAGTG640GATGTGAACTTCAATCCGGACCCCGCCGACCTGGTGCTCT680CCAGTGTGCCAGGCGGGGAGCTCTTCAACCCTCGGAAGCA720CAAGTTTGCTGAGGAGGACCTGAAGCCCCAGCCTATGATC760AAAAAGGCCAAGAAGGTCTTTGTCCCCGACGAGCAGAAGG800ATGAAAAGTACTGGACAAGACGCAAGAAGAACAACGTGGC840AGCTAAACGGTCACGGGATGCCCGGCGCCTGAAAGAGAAT880CAGATCACCATCCGGGCAGCCTTCCTGGAGAAGGAGAACA920CAGCCCTGCGGACGGAGGTGGCCGAGCTACGCAAGGAGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。