演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TECTB

tectorin beta

TECTB 編碼 tectorin beta,為耳蝸蓋膜非膠原性基質的重要成分之一;此功能描述屬於相似性推論。

Homo sapiens10q25.2UniProt Q96PL2
OFFICIAL SYMBOL
TECTB
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q96PL2
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TECTB 是蛋白質編碼基因,其產物為 tectorin beta。依相似性推論,tectorin beta 是內耳耳蝸蓋膜中重要的非膠原性成分之一。蓋膜屬於細胞外基質,覆蓋耳蝸的神經上皮,並與特化感覺毛細胞的纖毛束接觸。現有資料未提供此蛋白質的家族分類或更多整體結構描述。

Official symbol
TECTB
Gene name
tectorin beta
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11721
UniProt
Q96PL2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q25.2
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegTECTBpq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:112,283,400–112,305,047
Gene span
21,648 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000646139 ★112,283,400–112,305,03811
ENST00000643850112,283,400–112,304,68411
ENST00000645243112,283,400–112,304,97211
ENST00001136992112,283,400–112,305,04711
ENST00000369422112,283,656–112,305,04710

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tectorin beta 是耳蝸蓋膜非膠原性基質的重要成分之一;這項功能註記是依相似性推論,並非此處直接列出的實驗證明。蓋膜是內耳的細胞外基質,覆蓋耳蝸神經上皮,並接觸特化感覺毛細胞的纖毛束。

聲音會使毛細胞相對於蓋膜移動,進而令纖毛偏轉。這種偏轉與毛細胞膜電位的變化相連,將聲音轉換為電訊號。來源描述了蓋膜、毛細胞及纖毛束在此轉換過程中的空間關係與動態,但未進一步說明 tectorin beta 如何在分子層次促成這些變化。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 112283400 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TECTB ENST00000646139 GRCh38 chr10:112282400-112283500 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAATCTACTTATTTATGTACTACTTACAGTTTACAAGAGCCTTTACATCATTGCTCTCCTACTCTGTAAG
TTCAGCCCAGAATCACAGCCACCATTTTACACAGAAGGAAACTGAGTTACAGAACTTTTTAATGGCTTGC
CACATGGCTATTTCCTTCATTCTTTGATACCATCATTATAAAACATCCCATCAATTTAACAATAGGTTTT
GAGGAAATAAGGAAACTGTACTGTATTACTTATGCATGTTGCTTATAAGATACCTCCCAATGTTTTGAAA
CATTAAATGATGTGCATTATCAATAATATATCTGGAACCTTCATGGGAGTAGCATGTTATCTGTTGTTTT
CAGTGGGATCTTGTCGGGTGACTAAGAATTGAATTATAAGAGAGACTTTCTAAGTTTCTTCTTCCAATGT
CATTGCTCTGGGAGACTAATAAAGCTTTAGAAATCTCAAGGGTGTACAATTAAAAGTTGTTCTTCAGGAT
GAAGTTCAAGACACTAGAGTTTATTTATTGTTTTTTAATTAGAGGGAAAATCCTTTAAAATGTTTACGTT
CACACACACACACACACATATATTTATAGTTATCAGGTGCAACAATGTTAAACCTGAGTTTTCTTATCAA
AGTTTAGTTTACCTACATACAAAAATAAGAAAGCAGGAAATAAAGCAAAGAAAGCAAGACAAAAGAATTA
AAACTGTCACCTGGAATTGTACAGAAATAGTTTGCCTCCATTCAGAGTTATTTTCTGTACAAAAGGGGAA
AAAATCAACTTTTCCTCCCAATCTTGGTTGAAGCAGTTAAAAAAAAGTTTTTCCAACTCTGTAAAGCAAA
AGAAATTAGATTCAAGTAACTGAGCTTCCCATCGGATTACTGTGCTAGCCCCCCTTTTTATTCCCCACAC
AGTGGATAATGCATGCTCATTGTGACTTATCTGGAGCTGGTTTCTTTTACATCCTCGGGCTATATAAAGT
CAAACTAGGACTGGGGCAGCAGATTTGGGGAGCATCCAGCAGCCAGCCTCTACAGTCCGGAGAGGATGAA
ACAGTCGGGAACATGAACAACTCCATGTGTCATTGACGCTTCCAACGGTAT
TECTB 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 112280343–112280356 · motif

· motif · 112280343–112280356 · motif

· motif · 112280436–112280446 · motif

· motif · 112280684–112280699 · motif

· motif · 112280684–112280699 · motif

· motif · 112280685–112280699 · motif

· motif · 112280830–112280843 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:329 aa

1 aa329 aa結構域訊號胜肽
依 Q96PL2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tectorin beta 全長為 329 個胺基酸。序列註解指出其第 1–17 位胺基酸為訊號胜肽;第 19–283 位包含 ZP domain。

訊號胜肽1–17 aa
結構域ZP19–283 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96PL2…

AlphaFold · Q96PL2

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Secreted, extracellular space, extracellular matrix

tectorin beta 被註記位於細胞膜外側,並以 GPI anchor 連結;也可分泌至細胞外空間及細胞外基質。 在耳蝸中,它存在於蓋膜的非膠原性基質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TECTBTECTB
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tectorin beta 可能經自我結合形成同源絲狀結構,也可能與 alpha-tectorin 結合形成異源絲狀結構;此組裝描述標示為可能。此外,依相似性註記,它會與 CEACAM16 互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tectorin beta 依相似性推論是耳蝸蓋膜的重要非膠原性成分之一。蓋膜覆蓋耳蝸神經上皮並接觸特化感覺毛細胞的纖毛束;聲音引起毛細胞相對於蓋膜移動,使纖毛偏轉並改變毛細胞膜電位,將聲音轉換為電訊號。推論支持
證據與來源

One of the major non-collagenous components of the tectorial membrane (By similarity). The tectorial membrane is an extracellular matrix of the inner ear that covers the neuroepithelium of the cochlea and contacts the stereocilia bundles of specialized sensory hair cells. Sound induces movement of these hair cells relative to the tectorial membrane, deflects the stereocilia and leads to fluctuations in hair-cell membrane potential, transducing sound into electrical signals

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tectorin beta 可能在自我結合後形成同源絲狀結構,或與 alpha-tectorin 結合後形成異源絲狀結構;這項組裝關係標示為可能。此外,依相似性註記,tectorin beta 與 CEACAM16 互作。推論支持
證據與來源

May form homomeric filament after self-association or heteromeric filament after association with alpha-tectorin (Probable). Interacts with CEACAM16 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tectorin beta 被註記位於細胞膜外側,並以 GPI anchor 連結;亦記載其分泌至細胞外空間及細胞外基質,且存在於蓋膜的非膠原性基質中。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor / Extracellular side; Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Found in the non-collagenous matrix of the tectorial membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000646139 · 2,900 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGATTTGGGGAGCATCCAGCAGCCAGCCTCTACAGTCCGG40
41AGAGGATGAAACAGTCGGGAACATGAACAACTCCATGTGT80
81CATTGACGCTTCCAACGAATGATCGAGGCTCAGGCCCTGG120
121AAGGACCGTAAACATTTGGCCAGCTTGGTTTGGATACCTG160
161GCAGAGACCAGGTTCTGAGAAGCAATGGTGACGAAGGCCT200
201TTGTCTTGTTGGCCATCTTTGCAGAAGCCTCTGCAAAATC240
241GTGTGCTCCAAATAAAGCAGATGTCATTCTTGTGTTTTGC280
281TATCCCAAAACCATCATCACCAAAATCCCCGAGTGTCCCT320
321ATGGATGGGAAGTTCATCAGCTGGCCCTCGGAGGGCTGTG360
361TTACAATGGGGTCCACGAAGGAGGTTACTACCAATTTGTG400
401ATCCCAGATTTATCACCTAAAAACAAGTCCTATTGTGGAA440
441CCCAGTCTGAGTACAAGCCACCTATCTATCACTTCTACAG480
481TCACATCGTTTCCAATGACACCACAGTGATTGTAAAAAAC520
521CAGCCTGTCAACTACTCCTTCTCCTGCACCTACCACTCCA560
561CCTACTTGGTGAACCAGGCTGCCTTTGACCAGAGAGTGGC600
601CACTGTTCACGTGAAGAACGGGAGCATGGGCACATTTGAG640
641AGCCAACTGTCTCTCAACTTCTACACTAATGCCAAGTTCT680
681CCATCAAGAAAGAAGCTCCCTTTGTCCTGGAGGCATCCGA720
721AATCGGTTCAGATCTGTTTGCAGGAGTGGAAGCCAAAGGG760
761TTAAGCATTAGGTTTAAAGTGGTCTTGAACAGCTGTTGGG800
801CCACCCCCTCGGCTGACTTCATGTATCCCTTGCAGTGGCA840
841GCTGATCAACAAGGGCTGCCCCACGGATGAAACCGTCCTC880
881GTGCATGAGAATGGGAGAGATCACAGGGCAACCTTCCAAT920
921TCAATGCTTTCCGGTTCCAGAACATCCCCAAACTCTCCAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。