基因總覽
TECTB 是蛋白質編碼基因,其產物為 tectorin beta。依相似性推論,tectorin beta 是內耳耳蝸蓋膜中重要的非膠原性成分之一。蓋膜屬於細胞外基質,覆蓋耳蝸的神經上皮,並與特化感覺毛細胞的纖毛束接觸。現有資料未提供此蛋白質的家族分類或更多整體結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000646139 ★ | 112,283,400–112,305,038 | 11 |
| ENST00000643850 | 112,283,400–112,304,684 | 11 |
| ENST00000645243 | 112,283,400–112,304,972 | 11 |
| ENST00001136992 | 112,283,400–112,305,047 | 11 |
| ENST00000369422 | 112,283,656–112,305,047 | 10 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
tectorin beta 是耳蝸蓋膜非膠原性基質的重要成分之一;這項功能註記是依相似性推論,並非此處直接列出的實驗證明。蓋膜是內耳的細胞外基質,覆蓋耳蝸神經上皮,並接觸特化感覺毛細胞的纖毛束。
聲音會使毛細胞相對於蓋膜移動,進而令纖毛偏轉。這種偏轉與毛細胞膜電位的變化相連,將聲音轉換為電訊號。來源描述了蓋膜、毛細胞及纖毛束在此轉換過程中的空間關係與動態,但未進一步說明 tectorin beta 如何在分子層次促成這些變化。
Promoter 與基因調控
>TECTB ENST00000646139 GRCh38 chr10:112282400-112283500 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAATCTACTTATTTATGTACTACTTACAGTTTACAAGAGCCTTTACATCATTGCTCTCCTACTCTGTAAG TTCAGCCCAGAATCACAGCCACCATTTTACACAGAAGGAAACTGAGTTACAGAACTTTTTAATGGCTTGC CACATGGCTATTTCCTTCATTCTTTGATACCATCATTATAAAACATCCCATCAATTTAACAATAGGTTTT GAGGAAATAAGGAAACTGTACTGTATTACTTATGCATGTTGCTTATAAGATACCTCCCAATGTTTTGAAA CATTAAATGATGTGCATTATCAATAATATATCTGGAACCTTCATGGGAGTAGCATGTTATCTGTTGTTTT CAGTGGGATCTTGTCGGGTGACTAAGAATTGAATTATAAGAGAGACTTTCTAAGTTTCTTCTTCCAATGT CATTGCTCTGGGAGACTAATAAAGCTTTAGAAATCTCAAGGGTGTACAATTAAAAGTTGTTCTTCAGGAT GAAGTTCAAGACACTAGAGTTTATTTATTGTTTTTTAATTAGAGGGAAAATCCTTTAAAATGTTTACGTT CACACACACACACACACATATATTTATAGTTATCAGGTGCAACAATGTTAAACCTGAGTTTTCTTATCAA AGTTTAGTTTACCTACATACAAAAATAAGAAAGCAGGAAATAAAGCAAAGAAAGCAAGACAAAAGAATTA AAACTGTCACCTGGAATTGTACAGAAATAGTTTGCCTCCATTCAGAGTTATTTTCTGTACAAAAGGGGAA AAAATCAACTTTTCCTCCCAATCTTGGTTGAAGCAGTTAAAAAAAAGTTTTTCCAACTCTGTAAAGCAAA AGAAATTAGATTCAAGTAACTGAGCTTCCCATCGGATTACTGTGCTAGCCCCCCTTTTTATTCCCCACAC AGTGGATAATGCATGCTCATTGTGACTTATCTGGAGCTGGTTTCTTTTACATCCTCGGGCTATATAAAGT CAAACTAGGACTGGGGCAGCAGATTTGGGGAGCATCCAGCAGCCAGCCTCTACAGTCCGGAGAGGATGAA ACAGTCGGGAACATGAACAACTCCATGTGTCATTGACGCTTCCAACGGTAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 112280343–112280356 · motif
· motif · 112280343–112280356 · motif
· motif · 112280436–112280446 · motif
· motif · 112280684–112280699 · motif
· motif · 112280684–112280699 · motif
· motif · 112280685–112280699 · motif
· motif · 112280830–112280843 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:329 aa
tectorin beta 全長為 329 個胺基酸。序列註解指出其第 1–17 位胺基酸為訊號胜肽;第 19–283 位包含 ZP domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
tectorin beta 被註記位於細胞膜外側,並以 GPI anchor 連結;也可分泌至細胞外空間及細胞外基質。 在耳蝸中,它存在於蓋膜的非膠原性基質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
tectorin beta 可能經自我結合形成同源絲狀結構,也可能與 alpha-tectorin 結合形成異源絲狀結構;此組裝描述標示為可能。此外,依相似性註記,它會與 CEACAM16 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | tectorin beta 依相似性推論是耳蝸蓋膜的重要非膠原性成分之一。蓋膜覆蓋耳蝸神經上皮並接觸特化感覺毛細胞的纖毛束;聲音引起毛細胞相對於蓋膜移動,使纖毛偏轉並改變毛細胞膜電位,將聲音轉換為電訊號。 | 推論支持 | 證據與來源One of the major non-collagenous components of the tectorial membrane (By similarity). The tectorial membrane is an extracellular matrix of the inner ear that covers the neuroepithelium of the cochlea and contacts the stereocilia bundles of specialized sensory hair cells. Sound induces movement of these hair cells relative to the tectorial membrane, deflects the stereocilia and leads to fluctuations in hair-cell membrane potential, transducing sound into electrical signals |
| 交互作用 | tectorin beta 可能在自我結合後形成同源絲狀結構,或與 alpha-tectorin 結合後形成異源絲狀結構;這項組裝關係標示為可能。此外,依相似性註記,tectorin beta 與 CEACAM16 互作。 | 推論支持 | 證據與來源May form homomeric filament after self-association or heteromeric filament after association with alpha-tectorin (Probable). Interacts with CEACAM16 (By similarity) |
| 細胞定位 | tectorin beta 被註記位於細胞膜外側,並以 GPI anchor 連結;亦記載其分泌至細胞外空間及細胞外基質,且存在於蓋膜的非膠原性基質中。 | 推論支持 | 證據與來源Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor / Extracellular side; Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Found in the non-collagenous matrix of the tectorial membrane |
核酸與蛋白質序列
AGATTTGGGGAGCATCCAGCAGCCAGCCTCTACAGTCCGG40AGAGGATGAAACAGTCGGGAACATGAACAACTCCATGTGT80CATTGACGCTTCCAACGAATGATCGAGGCTCAGGCCCTGG120AAGGACCGTAAACATTTGGCCAGCTTGGTTTGGATACCTG160GCAGAGACCAGGTTCTGAGAAGCAATGGTGACGAAGGCCT200TTGTCTTGTTGGCCATCTTTGCAGAAGCCTCTGCAAAATC240GTGTGCTCCAAATAAAGCAGATGTCATTCTTGTGTTTTGC280TATCCCAAAACCATCATCACCAAAATCCCCGAGTGTCCCT320ATGGATGGGAAGTTCATCAGCTGGCCCTCGGAGGGCTGTG360TTACAATGGGGTCCACGAAGGAGGTTACTACCAATTTGTG400ATCCCAGATTTATCACCTAAAAACAAGTCCTATTGTGGAA440CCCAGTCTGAGTACAAGCCACCTATCTATCACTTCTACAG480TCACATCGTTTCCAATGACACCACAGTGATTGTAAAAAAC520CAGCCTGTCAACTACTCCTTCTCCTGCACCTACCACTCCA560CCTACTTGGTGAACCAGGCTGCCTTTGACCAGAGAGTGGC600CACTGTTCACGTGAAGAACGGGAGCATGGGCACATTTGAG640AGCCAACTGTCTCTCAACTTCTACACTAATGCCAAGTTCT680CCATCAAGAAAGAAGCTCCCTTTGTCCTGGAGGCATCCGA720AATCGGTTCAGATCTGTTTGCAGGAGTGGAAGCCAAAGGG760TTAAGCATTAGGTTTAAAGTGGTCTTGAACAGCTGTTGGG800CCACCCCCTCGGCTGACTTCATGTATCCCTTGCAGTGGCA840GCTGATCAACAAGGGCTGCCCCACGGATGAAACCGTCCTC880GTGCATGAGAATGGGAGAGATCACAGGGCAACCTTCCAAT920TCAATGCTTTCCGGTTCCAGAACATCCCCAAACTCTCCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。