演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TECTADFNA12

tectorin alpha

TECTA 編碼 tectorin alpha,是內耳蓋膜非膠原性細胞外基質的重要成分,與聲音刺激下的聽覺感受過程相關。

Homo sapiens11q23.3UniProt O75443
OFFICIAL SYMBOL
TECTA
CHROMOSOME
11
UNIPROT
O75443
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TECTA 是蛋白質編碼基因,其產物 tectorin alpha 是內耳細胞外基質蛋白,屬於耳蝸蓋膜的非膠原性成分。蓋膜覆蓋耳蝸神經上皮,並與特化感覺毛細胞的靜纖毛束接觸;tectorin alpha 因而位於聽覺感覺結構所依賴的基質環境中。蛋白質序列註解包含 NIDO、VWFC、四個 VWFD、三個 TIL 及 ZP 結構域,呈現多個不同結構區域組成的特徵。其主要角色與蓋膜的基質組成及聲音感受相關;具體的力學傳遞過程見功能說明。

Official symbol
TECTA
Gene name
tectorin alpha
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11720
UniProt
O75443
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DFNA12DFNA8DFNB21

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q23.3
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegTECTApq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:121,101,243–121,191,490
Gene span
90,248 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000392793 ★121,101,243–121,191,49024
ENST00000642222121,101,243–121,191,49024
ENST00000264037121,102,666–121,190,80623
ENST00000645008121,129,964–121,191,46215

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

tectorin alpha 被描述為耳蝸蓋膜的重要非膠原性成分之一,但此功能註記標示為相似性推論(By similarity)。蓋膜是內耳的細胞外基質,覆蓋耳蝸神經上皮,並接觸特化感覺毛細胞的靜纖毛束;tectorin alpha 因此是聲音感受相關結構基質的一部分。

聲音刺激會使感覺毛細胞相對於蓋膜移動,帶動靜纖毛偏轉。其後,毛細胞膜電位發生波動,將聲音刺激轉換為電訊號。來源所述的功能脈絡,將蓋膜與毛細胞之間的相對運動、靜纖毛偏轉及膜電位變化串連起來;tectorin alpha 作為蓋膜的主要非膠原性成分之一,參與這個聽覺感受結構的基質組成。資料未進一步說明它在上述轉換各步驟中的分子作用方式,因此不宜將其描述為直接驅動纖毛偏轉或產生電訊號的分子。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 121101243 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TECTA ENST00000392793 GRCh38 chr11:121100243-121101343 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAAAAAAATTTAGCTCGCCAAGCACTCTTGTCCATTTTAAGACAACATGCTTAAACCCAGAATTATATTT
CTTTTGTACAGTTGGCATTTAAATGTCTGGTCAGAGAAAATTTGCAGTAATTTTTAAATTCCCATTGATG
TGCAGAAGAGTTTTTTTTTCCTGCTACAGTCAAGTTACTTCTTTCTTAATAAATTCCATTTAAACATTTT
GAATAGTAGATTTAGCTTATGCCTTAGCCAGTTTTGCTCATTCCACATCTACTGGATGCTTGGAAGCATC
TAACCGAGCACGTTTTCCTCTTATTCACATGCCTTTTAAACTATTTACTTACTGCAAATTTTTTATCAGA
AGGGGTTTATCTCCCCCCTCTGCCTCCAGTGACCCTCACTGGGTGTTAGGGAAGGTTTCCAGGCCACAGT
TTGAGATTTCCCTTGTGGAAGATCGTGTCTAGCGCTAGGTCCCTTGTTAGATTTTGCCTGGAAAGTGCCC
TGTCCTATCTCCTGCAGAGCGGTGCATCAGAGAGAAAAGAGAGGGCATAAAACCTAAAAAGTTTGGAAAT
TTTCTTTAAATACTTCATGCATACCTGTGAAAAAATAGAGTAGAGCCTATCTGTGGCGACTGTTGAAAAC
CAGAGAAACAAAAAAAGACTTTAATAGAAAACCAACTTCATTTAAATGTTGGAGGCAGCTGCTTTGTTTG
GAGTTTTAATCCCATGCTGGTGGATGCTAATTCTGTAACATTATACAGTTGCCTTCTTTTGGGTACAAAG
GTAGAAGGGGGGTTTTCTTTTGTGTTTTTCAGTGCAAAGTGATTCTGATCAGAAAGGCCCAAGGTTTCAG
CTCCAAGTACCTGACATTTCCATCTGAATCTACTTTTTTTTTCAAAGGGGAAAAAAAAAGGTCTAGTTTT
TCAGGAAAAGAACCTCTCTACGCAATCCTGAAACTGATCTTTAGATTTACTTTTCCTTAATCAATAGAAA
AAAACTTGATTGCAGCTCAACACTTACCTGTCTCTAGTGCAGGACTAACTTAATTTTTGGTTTTAAGAGT
ACGAGATTCAGACATTATTTCAGGAATCAGAAATTATTGGCAACAAGTTGA
TECTA 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_85K5L4 · enhancer · 121099995–121100222 · regulatory

ENSR11_85K5NK · enhancer · 121104307–121104497 · regulatory

ENSR11_533H4HH · CTCF_binding_site · 121104383–121104404 · regulatory

ENSR11_BW2X2 · enhancer · 121104983–121105557 · regulatory

ENSR11_533H4PX · CTCF_binding_site · 121105780–121105801 · regulatory

· motif · 121099553–121099567 · motif

· motif · 121099553–121099567 · motif

· motif · 121104385–121104401 · motif

· motif · 121105202–121105215 · motif

· motif · 121105782–121105798 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2155 aa

1 aa2155 aa結構域訊號胜肽
依 O75443 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

tectorin alpha 全長 2,155 個胺基酸,序列起始處具有訊號肽(第 1–22 位)。註解列出 NIDO、VWFC、VWFD 1–4、TIL 1–3 與 ZP 結構域;其中 VWFD 及 ZP 結構域依序列註解資料標示。

訊號胜肽1–22 aa
結構域NIDO98–252 aa
結構域VWFC260–314 aa
結構域VWFD 1320–500 aa
結構域TIL 1597–650 aa
結構域VWFD 2711–886 aa
結構域TIL 2984–1036 aa
結構域VWFD 31098–1278 aa
結構域TIL 31372–1425 aa
結構域VWFD 41485–1666 aa
結構域ZP1805–2059 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O75443…

AlphaFold · O75443

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Secreted, extracellular space, extracellular matrix

tectorin alpha 位於蓋膜的非膠原性基質中,也註記為分泌至細胞外空間及細胞外基質。 另有細胞膜外側定位,並標示脂質錨定與 GPI 錨定。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DFNA12TECTA
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

tectorin alpha 與 CEACAM16 有交互作用。資料另以可能性描述其自我結合後形成同源絲狀結構,或與 beta-tectorin 結合後形成異源絲狀結構;這些絲狀結構的形成並非以確定語氣記載。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

TECTA 變異與常染色體顯性耳聾 12(DFNA12)及常染色體隱性耳聾 21(DFNB21)相關。兩者均屬非症候群性感音神經性聽力損失;資料將其描述為影響 TECTA 的變異所致,並未在此提供特定變異或機制細節。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能tectorin alpha 被描述為耳蝸蓋膜的重要非膠原性成分之一,但此功能為相似性推論。蓋膜是覆蓋耳蝸神經上皮的內耳細胞外基質,並接觸特化感覺毛細胞的靜纖毛束;聲音刺激使毛細胞相對蓋膜移動,造成靜纖毛偏轉及毛細胞膜電位波動,將聲音轉換為電訊號。推論支持
證據與來源

One of the major non-collagenous components of the tectorial membrane (By similarity). The tectorial membrane is an extracellular matrix of the inner ear that covers the neuroepithelium of the cochlea and contacts the stereocilia bundles of specialized sensory hair cells. Sound induces movement of these hair cells relative to the tectorial membrane, deflects the stereocilia and leads to fluctuations in hair-cell membrane potential, transducing sound into electrical signals

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用tectorin alpha 與 CEACAM16 有交互作用。資料以可能性描述,tectorin alpha 可經自我結合形成同源絲狀結構,或與 beta-tectorin 結合形成異源絲狀結構;絲狀結構形成的確定程度有限。含實驗來源
證據與來源

May form homomeric filament after self-association or heteromeric filament after association with beta-tectorin (Probable). Interacts with CEACAM16

PMID 21368133 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位tectorin alpha 註記為位於細胞膜外側,並具有脂質錨定與 GPI 錨定;也可分泌至細胞外空間及細胞外基質。它另被記錄為蓋膜非膠原性基質的一部分。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor / Extracellular side; Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Found in the non-collagenous matrix of the tectorial membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯TECTA 變異與常染色體顯性耳聾 12(DFNA12)相關。此病屬非症候群性感音神經性聽力損失;感音神經性耳聾可涉及內耳神經受器、通往腦部的神經路徑,或接收聲音資訊的腦區受損。資料指出此病由影響 TECTA 的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Deafness, autosomal dominant, 12 DFNA12 A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601543

PMID 12746400 ↗ · PMID 9949200 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯TECTA 變異與常染色體隱性耳聾 21(DFNB21)相關。此病屬非症候群性感音神經性聽力損失;感音神經性耳聾可涉及內耳神經受器、通往腦部的神經路徑,或接收聲音資訊的腦區受損。資料指出此病由影響 TECTA 的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Deafness, autosomal recessive, 21 DFNB21 A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 603629

PMID 12746400 ↗ · PMID 9949200 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000392793 · 7,353 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CACTTACCTGTCTCTAGTGCAGGACTAACTTAATTTTTGG40
41TTTTAAGAGTACGAGATTCAGACATTATTTCAGGAATCAG80
81AAATTATTGGCAACAAGTTGAGGAGAACTGACATGAATTC120
121TTGTTTTACCTAATTTTTTCTGGCTTACCAAGATTTGGCT160
161TAATATTTCTGACTCAGTTCCTCCAGCCTCTACAGAACAG200
201GATGAATTATTCATCATTCCTTAGAATTTGGGTCTCTTTC240
241ATCTTCGCACTTGTACAGCACCAAGCTCAGCCCAGGGAGC280
281TCATGTATCCATTTTGGCAGAATGACACCAAAACCCCTAA320
321AGTAGATGATGGAAGCTCATCTGAGATTAAGTTGGCCATC360
361CCAGTTTTCTTCTTTGGCGTTCCTTACCGCACTGTCTATG400
401TCAATAACAACGGAGTTGTTTCCTTCAATGTGCTAGTGAG440
441CCAGTTCACGCCAGAATCCTTTCCCCTGACAGATGGGAGA480
481GCCTTCGTCGCCCCATTTTGGGCAGATGTGCACAATGGAA520
521TTCGAGGCGAGATCTATTACAGAGAGACCATGGAGCCTGC560
561CATCTTGAAAAGAGCCACCAAGGACATCAGGAAGTACTTC600
601AAAGACATGGCAACCTTCTCTGCCACTTGGGTTTTCATTG640
641TGACATGGGAGGAAGTCACGTTTTATGGAGGCAGCAGCAC680
681CACACCTGTGAACACCTTCCAGGCCGTCCTAGTGTCCGAT720
721GGCTCCTATACATTCACCCTCTTCAATTATTACGAAATCA760
761ACTGGACCACGGGGACGGCGAGTGGCGGCGACCCCCTGAC800
801AGGTCTTGGTGGAGTGATGGCACAGGCAGGATTTAATGGT840
841GGAAACCTCACCAATTTCTTCAGCCTCCCGGGGTCAAGAA880
881CCCCCGAGATCGTGAATATCCAGGAGACCACAAACGTCAA920
921TGTTCCAGGCCGCTGGGCATTTAAAGTTGATGGAAAGGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。