演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TEAD4TEF-3

TEA domain transcription factor 4

TEAD4 是一種轉錄因子,參與 Hippo 訊息傳遞,並透過辨識特定 DNA 序列調控基因轉錄。

Homo sapiens12p13.33UniProt Q15561
OFFICIAL SYMBOL
TEAD4
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q15561
PDB / ALPHAFOLD
6GE3
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TEAD4(TEA domain transcription factor 4)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 TEA domain transcription factor 家族。蛋白質長 434 個胺基酸,含有 TEA DNA 結合區,並具有兩段被註記為無序的區域。TEAD4 是轉錄因子,能辨識特定 DNA 調控序列並活化轉錄;其功能與 Hippo 訊息傳遞相關。

Official symbol
TEAD4
Gene name
TEA domain transcription factor 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11717
UniProt
Q15561
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TEF-3TEFR-1EFTR-2RTEF-1TCF13L1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212p13.33
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegTEAD4pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:2,959,031–3,040,676
Gene span
81,646 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000359864 ★2,959,397–3,040,67613
ENST000003584092,959,031–3,040,67612
ENST000011339262,959,031–3,040,67613
ENST000005403142,959,406–2,994,8333
ENST000005368262,959,407–2,994,9833
ENST000005430352,959,796–3,018,5886
ENST000003971222,959,917–3,040,67611
ENST000005446663,011,044–3,021,9208

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TEAD4 是 Hippo 訊息傳遞中的轉錄因子。此訊息傳遞路徑與器官大小控制及腫瘤抑制有關,透過限制細胞增殖並促進細胞凋亡,參與調節組織生長。路徑核心包含一連串激酶反應:MST1/MST2 與調節蛋白 SAV1 形成複合體後,磷酸化並活化與 MOB1 結合的 LATS1/2;接著 LATS1/2 磷酸化 YAP1 與 WWTR1/TAZ,使其失活。

TEAD4 也透過介導 YAP1 和 WWTR1/TAZ 的基因表現,參與調節細胞增殖、細胞遷移及上皮間質轉化(EMT)的誘導。來源指出這些細胞過程與 TEAD4 的轉錄調控作用相關,但未進一步說明各過程中的具體作用機制。

在 DNA 辨識方面,TEAD4 可特異性、非協同性地結合 Sph 與 GT-IIC enhanson 序列(5'-GTGGAATGT-3'),並活化轉錄;它也能結合 M-CAT motif。這些序列辨識特性支持 TEAD4 參與特定基因的轉錄調控。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2959397 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TEAD4 ENST00000359864 GRCh38 chr12:2958397-2959497 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGCCAGGTAGATGATGGCGCTACCTGCCAGCACACTGCTTTAAGCCCGTTTGTCCTAAGCGTCTCCAAA
CAAGGAGCCCAGCGTGTTTCCAGCACCTCCTGCCCCAATAAGAGACTCCTGGGCATGTGTGTCTGAAGTC
CAGACTCTCACCGATGGCAGTATACACCGAGGCCTCCCCAGCTAAACTCTGAGCTCTTTGAGGGCAGGTG
CTGACGGCTGATCCTGATCTTCACAGTATCTGGACTCATCACACATCTTAGATGAATATTCATTGAGTCA
CTGAGCCCAGAAGGCGTCCCATGGCATGCCACATGGACTTCAAACCGAGTGCCCTTTCTCCCATGTGGTT
TACTCGTAGTGGCGGTTTTACAGATGCCCAAGGGGCAGGAGAGAAAAACGGAAAGAGCTAAAGCCGGGGA
GGGCAAGCGAGGGGGCACTGGCAGCGGATCTGGGAATGGAGCCCGCGAGTTCCTGCTTCCTGGTTCCCCG
GAGCAAGTGTCCTTTGGTGGGAGCCGCAGGAAGGGAGCAGCCCTTCCTGCGCGCCGGGAGCCCGCCCCTT
CCCCGGCCTCCCAGGGACTCGTGCGGAGGGACGCCGGGTGGCGGGGCGGGAGTCTGGGCCCCGTCCACCC
CCCCGCCCCCGGGACAGCCCCACCCCGGCGAAGAGGAAGGCTCTCGGCTCCTGGGAAAGGGAGTCGGGAC
CCCGCCAGGAGGGGAGGGCGCGGGGCGCGCAACGAGCAGCCAAACAGTCGGAGCGGAGAGATCGAAGGGC
TAGTGGGCGTGGGGGCCGCAGCCGAGGCCCGGGTGGAGGGGTCCCCGCCGTCCCTCGGCCCCCTCCCCCG
CCGCCCGCCCCGGCCCGGCCCGGCCCCGCCCCGCCCCGGCGGCCCGGCCCCTCGCCCGCCCGCGCGCGGC
GCAGTCTCCTCCCCGAGGTGCCGGTGGCCCCGCCGCCACTCCCTCCGGCTCCCTCCCTCCCGCCGCGGCG
CGCATCTCATTCCAGCCCTCATTCCGCGCATTCCAGCGTCCTCCTCGCACACTCGAGGCCAGGGGGCGGG
AGGGCCGCAGCTCCGGCGCCGCCGCGTCCCGCCAGGTGAGAGGCGCCCGCG
TEAD4 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TEAD4_1 ↗12:2,959,397正股2,959,348–2,959,407
TEAD4_2 ↗12:2,959,944正股2,959,895–2,959,954

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_BKT2 · enhancer · 2958047–2958967 · regulatory

ENSR12_5NRC9 · CTCF_binding_site · 2958817–2958838 · regulatory

ENSR12_936P8 · promoter · 2958968–2959407 · regulatory

ENSR12_5NRD3 · CTCF_binding_site · 2958983–2959004 · regulatory

ENSR12_936PD · promoter · 2959427–2959927 · regulatory

ENSR12_5NRJ7 · CTCF_binding_site · 2959882–2959903 · regulatory

ENSR12_C9X6 · enhancer · 2959928–2961663 · regulatory

ENSR12_C9XD · enhancer · 2962866–2964416 · regulatory

· motif · 2958738–2958754 · motif

· motif · 2958738–2958754 · motif

· motif · 2958819–2958835 · motif

· motif · 2958985–2959001 · motif

· motif · 2959403–2959412 · motif

· motif · 2959884–2959900 · motif

· motif · 2960141–2960150 · motif

· motif · 2960143–2960159 · motif

· motif · 2960143–2960159 · motif

· motif · 2964063–2964073 · motif

· motif · 2964097–2964107 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:434 aa

1 aa434 aaDNA 結合功能區域
依 Q15561 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TEAD4 蛋白質長 434 個胺基酸。第 36–112 位含有 TEA DNA 結合區;第 1–42 位及第 188–215 位則被註記為無序區域。

DNA 結合區TEA36–112 aa
功能區域Disordered1–42 aa
功能區域Disordered188–215 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6GE3…

PDB · 6GE3

X-ray · 1.85 A · A=216-434

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

TEAD4 的細胞內定位註記為細胞核。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 37 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TEF-3TEAD4CCDC125CCDC172CDR2CEP55DYDC1GOLGA2GOLGA6L9HAUS1HOMEZINCA1KRT27KRT31KRT40LDOC1LZTS2MTUS2PNMA1PRDM14PRKAR1BRASSF10RUNDC3ARUNX1SAT1SESTD1SORBS3TLE5TRAF1TRIM27TRIM54VGLL1VGLL3VGLL4VPS52VTA1WWTR1YAP1Vgll4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 37 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TEAD4 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用;來源未進一步說明這些交互作用是否構成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TEAD4 是 Hippo 訊息傳遞中的轉錄因子;該路徑與器官大小控制及腫瘤抑制相關,藉由限制增殖、促進凋亡發揮作用。TEAD4 介導 YAP1 和 WWTR1/TAZ 的基因表現,參與調節增殖、遷移與 EMT 誘導,並辨識特定 enhancer 序列以活化轉錄。含實驗來源
證據與來源

Transcription factor which plays a key role in the Hippo signaling pathway, a pathway involved in organ size control and tumor suppression by restricting proliferation and promoting apoptosis. The core of this pathway is composed of a kinase cascade wherein MST1/MST2, in complex with its regulatory protein SAV1, phosphorylates and activates LATS1/2 in complex with its regulatory protein MOB1, which in turn phosphorylates and inactivates YAP1 oncoprotein and WWTR1/TAZ. Acts by mediating gene expression of YAP1 and WWTR1/TAZ, thereby regulating cell proliferation, migration and epithelial mesenchymal transition (EMT) induction. Binds specifically and non-cooperatively to the Sph and GT-IIC 'enhansons' (5'-GTGGAATGT-3') and activates transcription. Binds to the M-CAT motif

PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TEAD4 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用。含實驗來源
證據與來源

Interacts with YAP1 and WWTR1/TAZ

PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗ · PMID 20123908 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TEAD4 定位於細胞核。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000359864 · 1,710 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTCCGCGCATTCCAGCGTCCTCCTCGCACACTCGAGGCC40
41AGGGGGCGGGAGGGCCGCAGCTCCGGCGCCGCCGCGTCCC80
81GCCAGAACGATCGCCGCGGCCGGAAGAGTTGGCGCTCGGG120
121GCGGACTCCTTGGAACTGGCTTAGCGCACCCATCCCACCT160
161TCCCGCACCCTGGGACCGGTCCAACGAGCGCTCCTCCAAG200
201CGGAGCCTTGGAGGGCACGGCCGGCACCATTACCTCCAAC240
241GAGTGGAGCTCTCCCACCTCCCCTGAGGGGAGCACCGCCT280
281CTGGGGGCAGTCAGGCACTGGACAAGCCCATCGACAATGA320
321CGCAGAGGGCGTGTGGAGCCCGGATATTGAGCAGAGTTTC360
361CAGGAGGCCCTCGCCATCTACCCGCCCTGTGGCAGGCGCA400
401AAATCATCCTGTCGGACGAGGGCAAGATGTATGGTCGGAA440
441CGAGCTGATTGCCCGCTACATCAAGCTCCGGACAGGGAAG480
481ACCCGCACCAGGAAGCAGGTCTCCAGCCACATCCAGGTGC520
521TGGCTCGTCGCAAAGCTCGCGAGATCCAGGCCAAGCTAAA560
561GGACCAGGCAGCTAAGGACAAGGCCCTGCAGAGCATGGCT600
601GCCATGTCGTCTGCACAGATCATCTCCGCCACGGCCTTCC640
641ACAGTAGCATGGCCCTCGCCCGGGGCCCCGGCCGCCCAGC680
681AGTCTCAGGGTTTTGGCAAGGAGCTTTGCCAGGCCAAGCC720
721GGAACGTCCCATGATGTGAAGCCTTTCTCTCAGCAAACCT760
761ATGCTGTCCAGCCTCCGCTGCCTCTGCCAGGGTTTGAGTC800
801TCCTGCAGGGCCCGCCCCATCGCCCTCTGCGCCCCCGGCA840
841CCCCCATGGCAGGGCCGCAGCGTGGCCAGCTCCAAGCTCT880
881GGATGTTGGAGTTCTCTGCCTTCCTGGAGCAGCAGCAGGA920
921CCCGGACACGTACAACAAGCACCTGTTCGTGCACATTGGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。