基因總覽
TEAD4(TEA domain transcription factor 4)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 TEA domain transcription factor 家族。蛋白質長 434 個胺基酸,含有 TEA DNA 結合區,並具有兩段被註記為無序的區域。TEAD4 是轉錄因子,能辨識特定 DNA 調控序列並活化轉錄;其功能與 Hippo 訊息傳遞相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000359864 ★ | 2,959,397–3,040,676 | 13 |
| ENST00000358409 | 2,959,031–3,040,676 | 12 |
| ENST00001133926 | 2,959,031–3,040,676 | 13 |
| ENST00000540314 | 2,959,406–2,994,833 | 3 |
| ENST00000536826 | 2,959,407–2,994,983 | 3 |
| ENST00000543035 | 2,959,796–3,018,588 | 6 |
| ENST00000397122 | 2,959,917–3,040,676 | 11 |
| ENST00000544666 | 3,011,044–3,021,920 | 8 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEAD4 是 Hippo 訊息傳遞中的轉錄因子。此訊息傳遞路徑與器官大小控制及腫瘤抑制有關,透過限制細胞增殖並促進細胞凋亡,參與調節組織生長。路徑核心包含一連串激酶反應:MST1/MST2 與調節蛋白 SAV1 形成複合體後,磷酸化並活化與 MOB1 結合的 LATS1/2;接著 LATS1/2 磷酸化 YAP1 與 WWTR1/TAZ,使其失活。
TEAD4 也透過介導 YAP1 和 WWTR1/TAZ 的基因表現,參與調節細胞增殖、細胞遷移及上皮間質轉化(EMT)的誘導。來源指出這些細胞過程與 TEAD4 的轉錄調控作用相關,但未進一步說明各過程中的具體作用機制。
在 DNA 辨識方面,TEAD4 可特異性、非協同性地結合 Sph 與 GT-IIC enhanson 序列(5'-GTGGAATGT-3'),並活化轉錄;它也能結合 M-CAT motif。這些序列辨識特性支持 TEAD4 參與特定基因的轉錄調控。
Promoter 與基因調控
>TEAD4 ENST00000359864 GRCh38 chr12:2958397-2959497 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGCCAGGTAGATGATGGCGCTACCTGCCAGCACACTGCTTTAAGCCCGTTTGTCCTAAGCGTCTCCAAA CAAGGAGCCCAGCGTGTTTCCAGCACCTCCTGCCCCAATAAGAGACTCCTGGGCATGTGTGTCTGAAGTC CAGACTCTCACCGATGGCAGTATACACCGAGGCCTCCCCAGCTAAACTCTGAGCTCTTTGAGGGCAGGTG CTGACGGCTGATCCTGATCTTCACAGTATCTGGACTCATCACACATCTTAGATGAATATTCATTGAGTCA CTGAGCCCAGAAGGCGTCCCATGGCATGCCACATGGACTTCAAACCGAGTGCCCTTTCTCCCATGTGGTT TACTCGTAGTGGCGGTTTTACAGATGCCCAAGGGGCAGGAGAGAAAAACGGAAAGAGCTAAAGCCGGGGA GGGCAAGCGAGGGGGCACTGGCAGCGGATCTGGGAATGGAGCCCGCGAGTTCCTGCTTCCTGGTTCCCCG GAGCAAGTGTCCTTTGGTGGGAGCCGCAGGAAGGGAGCAGCCCTTCCTGCGCGCCGGGAGCCCGCCCCTT CCCCGGCCTCCCAGGGACTCGTGCGGAGGGACGCCGGGTGGCGGGGCGGGAGTCTGGGCCCCGTCCACCC CCCCGCCCCCGGGACAGCCCCACCCCGGCGAAGAGGAAGGCTCTCGGCTCCTGGGAAAGGGAGTCGGGAC CCCGCCAGGAGGGGAGGGCGCGGGGCGCGCAACGAGCAGCCAAACAGTCGGAGCGGAGAGATCGAAGGGC TAGTGGGCGTGGGGGCCGCAGCCGAGGCCCGGGTGGAGGGGTCCCCGCCGTCCCTCGGCCCCCTCCCCCG CCGCCCGCCCCGGCCCGGCCCGGCCCCGCCCCGCCCCGGCGGCCCGGCCCCTCGCCCGCCCGCGCGCGGC GCAGTCTCCTCCCCGAGGTGCCGGTGGCCCCGCCGCCACTCCCTCCGGCTCCCTCCCTCCCGCCGCGGCG CGCATCTCATTCCAGCCCTCATTCCGCGCATTCCAGCGTCCTCCTCGCACACTCGAGGCCAGGGGGCGGG AGGGCCGCAGCTCCGGCGCCGCCGCGTCCCGCCAGGTGAGAGGCGCCCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEAD4_1 ↗ | 12:2,959,397 | 正股 | 2,959,348–2,959,407 |
| TEAD4_2 ↗ | 12:2,959,944 | 正股 | 2,959,895–2,959,954 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_BKT2 · enhancer · 2958047–2958967 · regulatory
ENSR12_5NRC9 · CTCF_binding_site · 2958817–2958838 · regulatory
ENSR12_936P8 · promoter · 2958968–2959407 · regulatory
ENSR12_5NRD3 · CTCF_binding_site · 2958983–2959004 · regulatory
ENSR12_936PD · promoter · 2959427–2959927 · regulatory
ENSR12_5NRJ7 · CTCF_binding_site · 2959882–2959903 · regulatory
ENSR12_C9X6 · enhancer · 2959928–2961663 · regulatory
ENSR12_C9XD · enhancer · 2962866–2964416 · regulatory
· motif · 2958738–2958754 · motif
· motif · 2958738–2958754 · motif
· motif · 2958819–2958835 · motif
· motif · 2958985–2959001 · motif
· motif · 2959403–2959412 · motif
· motif · 2959884–2959900 · motif
· motif · 2960141–2960150 · motif
· motif · 2960143–2960159 · motif
· motif · 2960143–2960159 · motif
· motif · 2964063–2964073 · motif
· motif · 2964097–2964107 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:434 aa
TEAD4 蛋白質長 434 個胺基酸。第 36–112 位含有 TEA DNA 結合區;第 1–42 位及第 188–215 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TEAD4 的細胞內定位註記為細胞核。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 37 個夥伴
- CCDC125Q86Z20 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC172P0C7W6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2Q01850 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP55Q53EZ4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- DYDC1Q8WWB3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HAUS1Q96CS2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOMEZQ8IX15-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT27Q7Z3Y8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- LDOC1O95751 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LZTS2Q9BRK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRDM14Q9GZV8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAR1BP31321 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RASSF10A6NK89 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RUNDC3AQ59EK9-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RUNX1Q01196-8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SAT1P21673 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SESTD1Q86VW0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SORBS3O60504 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TEAD4 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用;來源未進一步說明這些交互作用是否構成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEAD4 是 Hippo 訊息傳遞中的轉錄因子;該路徑與器官大小控制及腫瘤抑制相關,藉由限制增殖、促進凋亡發揮作用。TEAD4 介導 YAP1 和 WWTR1/TAZ 的基因表現,參與調節增殖、遷移與 EMT 誘導,並辨識特定 enhancer 序列以活化轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor which plays a key role in the Hippo signaling pathway, a pathway involved in organ size control and tumor suppression by restricting proliferation and promoting apoptosis. The core of this pathway is composed of a kinase cascade wherein MST1/MST2, in complex with its regulatory protein SAV1, phosphorylates and activates LATS1/2 in complex with its regulatory protein MOB1, which in turn phosphorylates and inactivates YAP1 oncoprotein and WWTR1/TAZ. Acts by mediating gene expression of YAP1 and WWTR1/TAZ, thereby regulating cell proliferation, migration and epithelial mesenchymal transition (EMT) induction. Binds specifically and non-cooperatively to the Sph and GT-IIC 'enhansons' (5'-GTGGAATGT-3') and activates transcription. Binds to the M-CAT motif PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗ |
| 交互作用 | TEAD4 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TEAD4 定位於細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATTCCGCGCATTCCAGCGTCCTCCTCGCACACTCGAGGCC40AGGGGGCGGGAGGGCCGCAGCTCCGGCGCCGCCGCGTCCC80GCCAGAACGATCGCCGCGGCCGGAAGAGTTGGCGCTCGGG120GCGGACTCCTTGGAACTGGCTTAGCGCACCCATCCCACCT160TCCCGCACCCTGGGACCGGTCCAACGAGCGCTCCTCCAAG200CGGAGCCTTGGAGGGCACGGCCGGCACCATTACCTCCAAC240GAGTGGAGCTCTCCCACCTCCCCTGAGGGGAGCACCGCCT280CTGGGGGCAGTCAGGCACTGGACAAGCCCATCGACAATGA320CGCAGAGGGCGTGTGGAGCCCGGATATTGAGCAGAGTTTC360CAGGAGGCCCTCGCCATCTACCCGCCCTGTGGCAGGCGCA400AAATCATCCTGTCGGACGAGGGCAAGATGTATGGTCGGAA440CGAGCTGATTGCCCGCTACATCAAGCTCCGGACAGGGAAG480ACCCGCACCAGGAAGCAGGTCTCCAGCCACATCCAGGTGC520TGGCTCGTCGCAAAGCTCGCGAGATCCAGGCCAAGCTAAA560GGACCAGGCAGCTAAGGACAAGGCCCTGCAGAGCATGGCT600GCCATGTCGTCTGCACAGATCATCTCCGCCACGGCCTTCC640ACAGTAGCATGGCCCTCGCCCGGGGCCCCGGCCGCCCAGC680AGTCTCAGGGTTTTGGCAAGGAGCTTTGCCAGGCCAAGCC720GGAACGTCCCATGATGTGAAGCCTTTCTCTCAGCAAACCT760ATGCTGTCCAGCCTCCGCTGCCTCTGCCAGGGTTTGAGTC800TCCTGCAGGGCCCGCCCCATCGCCCTCTGCGCCCCCGGCA840CCCCCATGGCAGGGCCGCAGCGTGGCCAGCTCCAAGCTCT880GGATGTTGGAGTTCTCTGCCTTCCTGGAGCAGCAGCAGGA920CCCGGACACGTACAACAAGCACCTGTTCGTGCACATTGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。