基因總覽
TEAD3 是蛋白質編碼基因,其產物 TEA domain transcription factor 3 屬於轉錄因子。來源指出,此蛋白與 Hippo 訊息傳遞有關,並可和 YAP1、WWTR1/TAZ 交互作用。其蛋白質序列含有 TEA DNA 結合區域及轉錄活化區域,呈現其作為轉錄調控因子的基本特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338863 ★ | 35,473,597–35,497,079 | 13 |
| ENST00000639578 | 35,473,597–35,497,868 | 13 |
| ENST00001136213 | 35,473,597–35,497,868 | 13 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEAD3 是 Hippo 訊息傳遞途徑中的轉錄因子。此途徑與器官大小控制及腫瘤抑制有關,透過限制細胞增殖並促進細胞凋亡發揮作用。其核心包含一連串激酶調控:MST1/MST2 與調控蛋白 SAV1 形成複合體,磷酸化並活化 LATS1/2;LATS1/2 則與調控蛋白 MOB1 形成複合體,進一步磷酸化並使致癌蛋白 YAP1 及 WWTR1/TAZ 失活。
在這個途徑中,TEAD3 透過調節 YAP1 與 WWTR1/TAZ 的基因表現,參與細胞增殖、細胞遷移及上皮-間質轉化(EMT)的誘導調控。來源亦指出,TEAD3 會結合人類 chorionic somatomammotropin-B 基因增強子的多個功能元件。這些資訊描述了 TEAD3 在轉錄調控中的角色,以及其與 Hippo 途徑所涉生物過程的關聯;來源未進一步說明這些作用的細胞或實驗條件。
Promoter 與基因調控
>TEAD3 ENST00000338863 GRCh38 chr6:35496979-35498079 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGCTCGCCTGCGCCGCTGTGCCCCCCTCCTCCCCGCGCCCCAGTCACTTCCTGTCCGGGAGCAGTAGTCA TTGTTGTTTTAACCTCCCCTCTCCCCGGGACCGCGCTAGGGCTCCGAGGAGCTGGGGCGGGCTAGGAGGA GGGGGTAGGTGATGGGGGACGAGGGCCAGGCACCCACATCCCCAATAAAGCCGCGTCCTTGGCCAAGCGG AGCGGTGGTTCCTCAGCGCGTGCGGAGAACGAGGCGGCAGGAGGCGTCCGAGGCGCGAGCTGGAAGTCTC AACCCCCGTCCCACTCCTGCCCAGGCCCCGGGCGCTCCCGCGTCCCCTCCCCGCGCCCGTCGCGGGTCCT ACCGAAACTCGGCGGCCGCACAGCGTCGAGACGCCCCCCGTGGGGGCCCGGGGAGCCGGGGCGAAAGGGA GGGTCCCGGAGGTCGGGGAAGAGGGAGAAAGGGAGAAGAAATTCGAGAAACTAGCCACGCGGGGAGAACC AGACAAACCGGGTCCCGGCAGGGCGGGCGCAGCCGCCAGGGCGGAGCCGGGTCTGGGGCCCCGGGAGTGG GGGGCAGGCCCGCGAGCTGGAGGGTACGCTCCGCCTTGGCGGCTCGGGACTAGGGTGGAGGGGCCGGGAG CCCCGGGGCCCGTGCGCTCCGGCTCTGCCGGGCTCCTCGTGACGCGGCACCCACGGCCCCCGGCACCGAC GGGAGCCCTGCCCGCGAGGCGAGGGCTCCGCCCTCGGCCCCGCCCCAGGCCGGAGCCCCAAATTCCGGCG GGTGCCCGGGAGCGGGGCGAGGCCCGGAGCGCAGGGGGAGGAAGGCAGCTCCGCACGGGCGGGCGAGGAG CGGGGCGCCCAGGCGCGCGCCAGCCGGGGTGGCCGGGTCGCGAGGCCGCGGGGTAGGCGGCCCGAGCGCG GCTGGACGGCCCCGCCCCTCCCGGCCAGCACCGCCCCCTGCGCGCCCCGCCCCCTCCTTCCCGCAGCCCC CACCCCCGCCCCGGCTCCTCAACACAAACTTTCCGTCCCGCTCGCTCCCTCCTCCGCGCTCGGCGCCTCC CGCTCCAGCCCGGCTCATTCCGCACATTCCGGCCAGCCCCCTCCCCACGAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEAD3_2 ↗ | 6:35,486,735 | 負股 | 35,486,725–35,486,784 |
| TEAD3_1 ↗ | 6:35,497,076 | 負股 | 35,497,066–35,497,125 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_B9376 · enhancer · 35493822–35494691 · regulatory
ENSR6_C5J4P · enhancer · 35495234–35497053 · regulatory
ENSR6_B937L · promoter · 35497054–35497632 · regulatory
ENSR6_C5J4T · enhancer · 35497633–35499240 · regulatory
ENSR6_5BCFPR · CTCF_binding_site · 35497820–35497841 · regulatory
ENSR6_5BCFS9 · CTCF_binding_site · 35498350–35498371 · regulatory
ENSR6_B9385 · enhancer · 35500707–35501229 · regulatory
· motif · 35493118–35493127 · motif
· motif · 35494504–35494519 · motif
· motif · 35494509–35494521 · motif
· motif · 35494512–35494519 · motif
· motif · 35494603–35494618 · motif
· motif · 35496490–35496503 · motif
· motif · 35496490–35496504 · motif
· motif · 35496490–35496505 · motif
· motif · 35497822–35497838 · motif
· motif · 35498026–35498035 · motif
· motif · 35498177–35498190 · motif
· motif · 35498182–35498194 · motif
· motif · 35498205–35498212 · motif
· motif · 35498321–35498333 · motif
· motif · 35498323–35498330 · motif
· motif · 35498352–35498368 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:435 aa
TEAD3 蛋白長 435 個胺基酸。第 28–104 位含 TEA DNA 結合區域;第 1–34 位標註為無序區域,第 173–435 位則標註為轉錄活化區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TEAD3 的細胞內定位記載為細胞核。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- VGLL1Q99990 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- VGLL2Q8N8G2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VGLL3A8MV65-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VGLL4Q14135 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- WWTR1Q9GZV5 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
TEAD3 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用。來源未進一步界定這些關係是否為直接實體結合,亦未說明其複合體組成。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEAD3 是 Hippo 訊息傳遞途徑中的轉錄因子。此途徑藉由限制細胞增殖、促進細胞凋亡,參與器官大小控制與腫瘤抑制。其激酶級聯中,MST1/MST2-SAV1 複合體活化 LATS1/2-MOB1 複合體,後者磷酸化並使 YAP1、WWTR1/TAZ 失活;TEAD3 則調節這些分子的基因表現,影響細胞增殖、遷移及 EMT 誘導,也會結合人類 chorionic somatomammotropin-B 基因增強子的多個功能元件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor which plays a key role in the Hippo signaling pathway, a pathway involved in organ size control and tumor suppression by restricting proliferation and promoting apoptosis. The core of this pathway is composed of a kinase cascade wherein MST1/MST2, in complex with its regulatory protein SAV1, phosphorylates and activates LATS1/2 in complex with its regulatory protein MOB1, which in turn phosphorylates and inactivates YAP1 oncoprotein and WWTR1/TAZ. Acts by mediating gene expression of YAP1 and WWTR1/TAZ, thereby regulating cell proliferation, migration and epithelial mesenchymal transition (EMT) induction. Binds to multiple functional elements of the human chorionic somatomammotropin-B gene enhancer PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗ |
| 交互作用 | TEAD3 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有交互作用;此敘述未進一步說明交互作用的型態或條件。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TEAD3 的細胞內定位記載為細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AACACAAACTTTCCGTCCCGCTCGCTCCCTCCTCCGCGCT40CGGCGCCTCCCGCTCCAGCCCGGCTCATTCCGCACATTCC80GGCCAGCCCCCTCCCCACGACCCCCCTTCCCCGGCCCCCC120TTGCGGCTCCCTCGGGCCCGGCGGAGCGGCCCGGCCGGAG160CGCCCCCGCGAGCTCGGACCAGGCTCAGCCGCCCAGTGGG200CTCAGGCCCAGAGCCCAGAGCAACCAGCACAATAGCGTCC240AACAGCTGGAACGCCAGCAGCAGCCCCGGGGAGGCCCGGG280AGGATGGGCCCGAGGGCCTGGACAAGGGGCTGGACAACGA320TGCGGAGGGCGTGTGGAGCCCGGACATCGAGCAGAGCTTC360CAGGAGGCCCTGGCCATCTACCCGCCCTGCGGCCGGCGGA400AGATCATCCTGTCAGACGAGGGCAAGATGTACGGCCGAAA440TGAGTTGATTGCACGCTATATTAAACTGAGGACGGGGAAG480ACTCGGACGAGAAAACAGGTGTCCAGCCACATACAGGTTC520TAGCTCGGAAGAAGGTGCGGGAGTACCAGGTTGGCATCAA560GGCCATGAACCTGGACCAGGTCTCCAAGGACAAAGCCCTT600CAGAGCATGGCGTCCATGTCCTCTGCCCAGATCGTCTCTG640CCAGTGTCCTGCAGAACAAGTTCAGCCCACCTTCCCCTCT680GCCCCAGGCCGTCTTCTCCACTTCCTCGCGGTTCTGGAGC720AGCCCCCCTCTCCTGGGACAGCAGCCTGGACCCTCTCAGG760ACATCAAGCCCTTTGCACAGCCAGCCTACCCCATCCAGCC800GCCCCTGCCGCCGACGCTCAGCAGTTATGAGCCCCTGGCC840CCGCTCCCCTCAGCTGCTGCCTCTGTGCCTGTGTGGCAGG880ACCGTACCATTGCCTCCTCCCGGCTGCGGCTCCTGGAGTA920TTCAGCCTTCATGGAGGTGCAGCGAGACCCTGACACGTAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。