基因總覽
TEAD2(TEA domain transcription factor 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 TEA domain 轉錄因子。此蛋白質參與 Hippo 訊息傳遞路徑,主要角色是協助調控基因表現,並與細胞增殖、細胞遷移及上皮間質轉化的誘導相關。來源亦指出,TEAD2 可能參與神經發育相關的基因調控;此項描述屬可能性,尚不能據此視為已確立的功能。其名稱所指的 TEA domain 家族身分,與其作為轉錄因子的基本性質相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000593945 ★ | 49,340,595–49,362,416 | 13 |
| ENST00000598810 | 49,340,389–49,361,553 | 13 |
| ENST00000601519 | 49,340,389–49,362,410 | 12 |
| ENST00000311227 | 49,340,389–49,362,729 | 12 |
| ENST00000377214 | 49,340,389–49,361,523 | 11 |
| ENST00000539846 | 49,340,389–49,362,441 | 12 |
| ENST00000889919 | 49,340,389–49,362,729 | 13 |
| ENST00000889920 | 49,340,389–49,362,729 | 12 |
| ENST00000889921 | 49,340,389–49,362,729 | 13 |
| ENST00000889922 | 49,340,389–49,362,729 | 12 |
| ENST00000889923 | 49,340,389–49,362,729 | 13 |
| ENST00000889924 | 49,340,389–49,362,729 | 12 |
顯示 12/104 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TEAD2 是 Hippo 訊息傳遞路徑中的轉錄因子。此路徑參與器官大小控制及腫瘤抑制,並透過限制細胞增殖、促進細胞凋亡發揮作用。路徑核心包含一連串激酶調控:MST1/MST2 與調節蛋白 SAV1 形成複合體,磷酸化並活化與 MOB1 形成複合體的 LATS1/2;接著 LATS1/2 磷酸化 YAP1 與 WWTR1/TAZ,使兩者失活。
在此脈絡下,TEAD2 透過調節 YAP1 與 WWTR1/TAZ 的基因表現,連結 Hippo 路徑與細胞行為。來源將其作用與細胞增殖、遷移及上皮間質轉化(EMT)的誘導相連,顯示 TEAD2 參與的轉錄調控涉及多種細胞反應。不過,來源未進一步說明各反應的方向或其發生條件,因此不宜將這些關聯延伸為特定情境下的結果。
TEAD2 可辨識 DNA 上的 SPH 與 GT-IIC 增強子序列(enhansons),其中 GT-IIC 序列為 5'-GTGGAATGT-3';來源也記載其可結合 M-CAT motif。這些序列辨識特性提供了 TEAD2 參與基因表現調節的分子層面資訊。另有描述指出,TEAD2 可能參與神經發育相關的基因調控;此項功能仍以可能性表述。
Promoter 與基因調控
>TEAD2 ENST00000593945 GRCh38 chr19:49362316-49363416 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTAGCTCTCACTCTAATTGTGTATCTGTTTCGGAACCTTTTCTCCGTGTCCCTTCTGGTTTTCCCGCTCC CGCTCCACTAAAAAGTCCCGTTGTCTCCGGAAACCCTAAATCCAGTCTTATATTTCATCTTCCAAGGAAC CCAGAATCAGACTTCCTTTTCCCTGAGGACCTCAGGTCCGGACTCCCGCCCCCTCTAGTCCCGTAATTTT GAACACGCAGCCTTTCACCCTTAAGGGACCGGGCCCTAAGCCATCTTCCCTCAGGCACCAAAGCTCTCTT CCCCGTCCCGGGACAGCCGCCAGCCGTCTCCAGTCCACTAGCGCCTGTAGATGAGGAATCTGCACCTACG TGGGCCTCCAATAAACTCCCGGTGGTCCTGCCCACGACTCTTAACTGTGGTGAGGTCACAAGGAAACCAG GTCGTCATAGGAATCAGTCAAAACCCATCCCCAGACCCCAATCCTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAA CAAAAAACAAAAAAACCAAAAACCAAACAGAAAAAAAGAAAAAAAACCTCAGGGCTTAACAGTAAAGACT CTTTGTATTCGTATCACTTCCGCACCCCCAATACACAAACACGAGGGTAGCCGGGATTCCAGGCGCCTAG CCCCGTCCCCTCTCAGACCTAGGAGCCCATATCTCTCTCCAGCCGCTTCCTCTCCCAGACCCAGGAGTCC CAGCCCCCAGACCCAGGAGTCCCAGCCCCCAGCCTCTCCTCCCTCAGATCAGGGGTTTCTGGCTCCTATC AGCCTTTTCCCTCCGACTTGGAGTCCGAACCCCCAATCCCCCTCCTTTCCCAAGCACCCAAATCCTGAGT TCCTACCAGCCCCGAGATAGACTAATCTCTCCCAAAGCAAAAATCCTTCCCCAAACTGTCACCGTCGGAT CCCCCTTCCCGCTGTCCGCCGGCCGGGCCCGCCCCCCCCTCCGGTCCCTCCCACTTTTCCCAAACAAAGC TCCCGGCAACTTTCTCCCTCGCAGCGCCCCGCCCGCCCGCGGCTCCCCAGCCCCAGGCCGGGAGGTAGGA AGGCGCCGGCGGGAGTCGGGGATCCTGCTTTGGGGTGTGTGAGTTGGGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TEAD2_2 ↗ | 19:49,361,517 | 負股 | 49,361,507–49,361,566 |
| TEAD2_1 ↗ | 19:49,362,398 | 負股 | 49,362,388–49,362,447 |
| TEAD2_3 ↗ | 19:49,369,858 | 負股 | 49,369,848–49,369,907 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9PKZK · promoter · 49360428–49360747 · regulatory
ENSR19_9PKZR · enhancer · 49361178–49361484 · regulatory
ENSR19_9PKZT · promoter · 49361485–49361793 · regulatory
ENSR19_BCRHH · enhancer · 49361794–49362396 · regulatory
ENSR19_BCRHK · promoter · 49362397–49362947 · regulatory
ENSR19_9PL2G · promoter · 49363387–49363887 · regulatory
ENSR19_5FLH8H · CTCF_binding_site · 49363438–49363459 · regulatory
ENSR19_9PL2K · enhancer · 49363888–49364198 · regulatory
· motif · 49361523–49361533 · motif
· motif · 49361554–49361564 · motif
· motif · 49361598–49361608 · motif
· motif · 49361603–49361613 · motif
· motif · 49361608–49361618 · motif
· motif · 49363440–49363456 · motif
· motif · 49363499–49363509 · motif
· motif · 49363517–49363527 · motif
· motif · 49363535–49363545 · motif
· motif · 49363555–49363565 · motif
· motif · 49363661–49363671 · motif
· motif · 49363680–49363690 · motif
· motif · 49363719–49363729 · motif
· motif · 49363740–49363750 · motif
· motif · 49363832–49363842 · motif
· motif · 49366263–49366276 · motif
· motif · 49366299–49366312 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:447 aa
TEAD2 蛋白質長 447 個胺基酸。其 TEA DNA 結合區位於第 38–114 個胺基酸;第 172–447 位註記為轉錄活化區。序列分析亦標示第 1–46 位及第 183–218 位為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
TEAD2 的細胞內定位記載為細胞核;來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- BCL2L15Q5TBC7 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- USF2Q15853 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YAP1P46937 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
- GNG13Q9P2W3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INPP5AQ14642 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RUNX1Q01196-8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SIX6OS1Q8N1H7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM3O75382 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VGLL1Q99990 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VGLL3A8MV65-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VGLL4Q14135 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WWTR1Q9GZV5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TEAD2 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有互作記錄。來源未進一步說明互作的結合方式,也未指出這些分子與 TEAD2 是否組成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TEAD2 是 Hippo 訊息傳遞路徑中的轉錄因子;此路徑參與器官大小控制與腫瘤抑制,並限制細胞增殖、促進細胞凋亡。路徑中的激酶級聯可使 YAP1 與 WWTR1/TAZ 磷酸化失活。TEAD2 調節兩者的基因表現,並與細胞增殖、遷移及上皮間質轉化誘導相關;它可結合 SPH、GT-IIC 序列及 M-CAT motif,也可能參與神經發育相關基因調控。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor which plays a key role in the Hippo signaling pathway, a pathway involved in organ size control and tumor suppression by restricting proliferation and promoting apoptosis. The core of this pathway is composed of a kinase cascade wherein MST1/MST2, in complex with its regulatory protein SAV1, phosphorylates and activates LATS1/2 in complex with its regulatory protein MOB1, which in turn phosphorylates and inactivates YAP1 oncoprotein and WWTR1/TAZ. Acts by mediating gene expression of YAP1 and WWTR1/TAZ, thereby regulating cell proliferation, migration and epithelial mesenchymal transition (EMT) induction. Binds to the SPH and GT-IIC 'enhansons' (5'-GTGGAATGT-3'). May be involved in the gene regulation of neural development. Binds to the M-CAT motif PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗ |
| 交互作用 | TEAD2 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有互作;此敘述未進一步界定互作方式或複合體組成。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | TEAD2 的定位記載於細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCAGCGCCCCGCCCGCCCGCGGCTCCCCAGCCCCAGGCCG40GGAGGTAGGAAGGCGCCGGCGGGAGTCGGGGATCCTGCTT80TGGGGCCCAGATGGGGGAACCCCGGGCTGGGGCCGCCCTG120GACGATGGCAGCGGCTGGACGGGCAGTGAGGAAGGCAGTG160AGGAGGGTACCGGCGGCAGTGAGGGGGCTGGGGGTGACGG200GGGCCCGGATGCAGAGGGGGTGTGGAGCCCAGACATTGAG240CAGAGCTTCCAGGAGGCCCTGGCCATCTATCCACCCTGCG280GCCGCCGGAAAATAATTTTGTCTGATGAAGGCAAGATGTA320TGGTCGGAATGAACTGATCGCCCGCTACATCAAGCTGAGA360ACGGGGAAGACCCGAACTCGAAAACAGGTTTCTAGTCACA400TCCAGGTTTTGGCCCGAAGGAAATCAAGGGAAATCCAGTC440CAAGTTGAAGGCTCTGAACGTGGACCAGGTTTCCAAGGAC480AAGGCTTTCCAGACAATGGCAACCATGTCCTCTGCCCAGC520TCATCTCCGCGCCTTCTCTGCAGGCCAAACTGGGTCCCAC560TGGTCCTCAGGCCTCTGAGCTTTTCCAGTTTTGGTCTGGA600GGATCTGGGCCCCCCTGGAATGTTCCAGATGTGAAGCCAT640TCTCACAGACACCGTTCACCTTGTCACTGACTCCCCCATC680TACTGACCTCCCAGGGTACGAGCCCCCCCAAGCCCTCTCA720CCCCTGCCCCCACCTACCCCATCGCCCCCAGCCTGGCAGG760CTCGGGGCCTGGGCACCGCCCGGTTGCAGCTGGTAGAGTT800CTCAGCCTTCGTGGAACCGCCAGATGCAGTTGATTCTTAC840CAGAGGCACCTGTTCGTGCACATCAGCCAGCACTGCCCCA880GCCCCGGAGCGCCGCCGCTCGAGAGTGTGGACGTCCGGCA920GATCTACGACAAATTCCCTGAGAAAAAGGGTGGCCTCCGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。