演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

TEAD2TEF-4

TEA domain transcription factor 2

TEAD2 是一種轉錄因子,參與 Hippo 訊息傳遞路徑,並可與 YAP1、WWTR1/TAZ 互作,調節細胞增殖、遷移及上皮間質轉化相關的基因表現。

Homo sapiens19q13.33UniProt Q15562
OFFICIAL SYMBOL
TEAD2
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q15562
PDB / ALPHAFOLD
8RXL
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

TEAD2(TEA domain transcription factor 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 TEA domain 轉錄因子。此蛋白質參與 Hippo 訊息傳遞路徑,主要角色是協助調控基因表現,並與細胞增殖、細胞遷移及上皮間質轉化的誘導相關。來源亦指出,TEAD2 可能參與神經發育相關的基因調控;此項描述屬可能性,尚不能據此視為已確立的功能。其名稱所指的 TEA domain 家族身分,與其作為轉錄因子的基本性質相符。

Official symbol
TEAD2
Gene name
TEA domain transcription factor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11715
UniProt
Q15562
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TEF-4ETFTEF4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.33
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25TEAD2pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:49,340,389–49,362,729
Gene span
22,341 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000593945 ★49,340,595–49,362,41613
ENST0000059881049,340,389–49,361,55313
ENST0000060151949,340,389–49,362,41012
ENST0000031122749,340,389–49,362,72912
ENST0000037721449,340,389–49,361,52311
ENST0000053984649,340,389–49,362,44112
ENST0000088991949,340,389–49,362,72913
ENST0000088992049,340,389–49,362,72912
ENST0000088992149,340,389–49,362,72913
ENST0000088992249,340,389–49,362,72912
ENST0000088992349,340,389–49,362,72913
ENST0000088992449,340,389–49,362,72912

顯示 12/104 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

TEAD2 是 Hippo 訊息傳遞路徑中的轉錄因子。此路徑參與器官大小控制及腫瘤抑制,並透過限制細胞增殖、促進細胞凋亡發揮作用。路徑核心包含一連串激酶調控:MST1/MST2 與調節蛋白 SAV1 形成複合體,磷酸化並活化與 MOB1 形成複合體的 LATS1/2;接著 LATS1/2 磷酸化 YAP1 與 WWTR1/TAZ,使兩者失活。

在此脈絡下,TEAD2 透過調節 YAP1 與 WWTR1/TAZ 的基因表現,連結 Hippo 路徑與細胞行為。來源將其作用與細胞增殖、遷移及上皮間質轉化(EMT)的誘導相連,顯示 TEAD2 參與的轉錄調控涉及多種細胞反應。不過,來源未進一步說明各反應的方向或其發生條件,因此不宜將這些關聯延伸為特定情境下的結果。

TEAD2 可辨識 DNA 上的 SPH 與 GT-IIC 增強子序列(enhansons),其中 GT-IIC 序列為 5'-GTGGAATGT-3';來源也記載其可結合 M-CAT motif。這些序列辨識特性提供了 TEAD2 參與基因表現調節的分子層面資訊。另有描述指出,TEAD2 可能參與神經發育相關的基因調控;此項功能仍以可能性表述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 49362416 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>TEAD2 ENST00000593945 GRCh38 chr19:49362316-49363416 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAGCTCTCACTCTAATTGTGTATCTGTTTCGGAACCTTTTCTCCGTGTCCCTTCTGGTTTTCCCGCTCC
CGCTCCACTAAAAAGTCCCGTTGTCTCCGGAAACCCTAAATCCAGTCTTATATTTCATCTTCCAAGGAAC
CCAGAATCAGACTTCCTTTTCCCTGAGGACCTCAGGTCCGGACTCCCGCCCCCTCTAGTCCCGTAATTTT
GAACACGCAGCCTTTCACCCTTAAGGGACCGGGCCCTAAGCCATCTTCCCTCAGGCACCAAAGCTCTCTT
CCCCGTCCCGGGACAGCCGCCAGCCGTCTCCAGTCCACTAGCGCCTGTAGATGAGGAATCTGCACCTACG
TGGGCCTCCAATAAACTCCCGGTGGTCCTGCCCACGACTCTTAACTGTGGTGAGGTCACAAGGAAACCAG
GTCGTCATAGGAATCAGTCAAAACCCATCCCCAGACCCCAATCCTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAA
CAAAAAACAAAAAAACCAAAAACCAAACAGAAAAAAAGAAAAAAAACCTCAGGGCTTAACAGTAAAGACT
CTTTGTATTCGTATCACTTCCGCACCCCCAATACACAAACACGAGGGTAGCCGGGATTCCAGGCGCCTAG
CCCCGTCCCCTCTCAGACCTAGGAGCCCATATCTCTCTCCAGCCGCTTCCTCTCCCAGACCCAGGAGTCC
CAGCCCCCAGACCCAGGAGTCCCAGCCCCCAGCCTCTCCTCCCTCAGATCAGGGGTTTCTGGCTCCTATC
AGCCTTTTCCCTCCGACTTGGAGTCCGAACCCCCAATCCCCCTCCTTTCCCAAGCACCCAAATCCTGAGT
TCCTACCAGCCCCGAGATAGACTAATCTCTCCCAAAGCAAAAATCCTTCCCCAAACTGTCACCGTCGGAT
CCCCCTTCCCGCTGTCCGCCGGCCGGGCCCGCCCCCCCCTCCGGTCCCTCCCACTTTTCCCAAACAAAGC
TCCCGGCAACTTTCTCCCTCGCAGCGCCCCGCCCGCCCGCGGCTCCCCAGCCCCAGGCCGGGAGGTAGGA
AGGCGCCGGCGGGAGTCGGGGATCCTGCTTTGGGGTGTGTGAGTTGGGGTG
TEAD2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
TEAD2_2 ↗19:49,361,517負股49,361,507–49,361,566
TEAD2_1 ↗19:49,362,398負股49,362,388–49,362,447
TEAD2_3 ↗19:49,369,858負股49,369,848–49,369,907

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9PKZK · promoter · 49360428–49360747 · regulatory

ENSR19_9PKZR · enhancer · 49361178–49361484 · regulatory

ENSR19_9PKZT · promoter · 49361485–49361793 · regulatory

ENSR19_BCRHH · enhancer · 49361794–49362396 · regulatory

ENSR19_BCRHK · promoter · 49362397–49362947 · regulatory

ENSR19_9PL2G · promoter · 49363387–49363887 · regulatory

ENSR19_5FLH8H · CTCF_binding_site · 49363438–49363459 · regulatory

ENSR19_9PL2K · enhancer · 49363888–49364198 · regulatory

· motif · 49361523–49361533 · motif

· motif · 49361554–49361564 · motif

· motif · 49361598–49361608 · motif

· motif · 49361603–49361613 · motif

· motif · 49361608–49361618 · motif

· motif · 49363440–49363456 · motif

· motif · 49363499–49363509 · motif

· motif · 49363517–49363527 · motif

· motif · 49363535–49363545 · motif

· motif · 49363555–49363565 · motif

· motif · 49363661–49363671 · motif

· motif · 49363680–49363690 · motif

· motif · 49363719–49363729 · motif

· motif · 49363740–49363750 · motif

· motif · 49363832–49363842 · motif

· motif · 49366263–49366276 · motif

· motif · 49366299–49366312 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:447 aa

1 aa447 aaDNA 結合功能區域
依 Q15562 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

TEAD2 蛋白質長 447 個胺基酸。其 TEA DNA 結合區位於第 38–114 個胺基酸;第 172–447 位註記為轉錄活化區。序列分析亦標示第 1–46 位及第 183–218 位為無序區域。

DNA 結合區TEA38–114 aa
功能區域Disordered1–46 aa
功能區域Transcriptional activation172–447 aa
功能區域Disordered183–218 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8RXL…

PDB · 8RXL

X-ray · 2.29 A · A/B=216-447

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

TEAD2 的細胞內定位記載為細胞核;來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 12 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TEF-4TEAD2BCL2L15USF2YAP1GNG13INPP5ARUNX1SIX6OS1TRIM3VGLL1VGLL3VGLL4WWTR1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

TEAD2 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有互作記錄。來源未進一步說明互作的結合方式,也未指出這些分子與 TEAD2 是否組成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能TEAD2 是 Hippo 訊息傳遞路徑中的轉錄因子;此路徑參與器官大小控制與腫瘤抑制,並限制細胞增殖、促進細胞凋亡。路徑中的激酶級聯可使 YAP1 與 WWTR1/TAZ 磷酸化失活。TEAD2 調節兩者的基因表現,並與細胞增殖、遷移及上皮間質轉化誘導相關;它可結合 SPH、GT-IIC 序列及 M-CAT motif,也可能參與神經發育相關基因調控。含實驗來源
證據與來源

Transcription factor which plays a key role in the Hippo signaling pathway, a pathway involved in organ size control and tumor suppression by restricting proliferation and promoting apoptosis. The core of this pathway is composed of a kinase cascade wherein MST1/MST2, in complex with its regulatory protein SAV1, phosphorylates and activates LATS1/2 in complex with its regulatory protein MOB1, which in turn phosphorylates and inactivates YAP1 oncoprotein and WWTR1/TAZ. Acts by mediating gene expression of YAP1 and WWTR1/TAZ, thereby regulating cell proliferation, migration and epithelial mesenchymal transition (EMT) induction. Binds to the SPH and GT-IIC 'enhansons' (5'-GTGGAATGT-3'). May be involved in the gene regulation of neural development. Binds to the M-CAT motif

PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用TEAD2 與 YAP1 及 WWTR1/TAZ 有互作;此敘述未進一步界定互作方式或複合體組成。含實驗來源
證據與來源

Interacts with YAP1 and WWTR1/TAZ

PMID 18579750 ↗ · PMID 19324877 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位TEAD2 的定位記載於細胞核。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000593945 · 2,175 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGCGCCCCGCCCGCCCGCGGCTCCCCAGCCCCAGGCCG40
41GGAGGTAGGAAGGCGCCGGCGGGAGTCGGGGATCCTGCTT80
81TGGGGCCCAGATGGGGGAACCCCGGGCTGGGGCCGCCCTG120
121GACGATGGCAGCGGCTGGACGGGCAGTGAGGAAGGCAGTG160
161AGGAGGGTACCGGCGGCAGTGAGGGGGCTGGGGGTGACGG200
201GGGCCCGGATGCAGAGGGGGTGTGGAGCCCAGACATTGAG240
241CAGAGCTTCCAGGAGGCCCTGGCCATCTATCCACCCTGCG280
281GCCGCCGGAAAATAATTTTGTCTGATGAAGGCAAGATGTA320
321TGGTCGGAATGAACTGATCGCCCGCTACATCAAGCTGAGA360
361ACGGGGAAGACCCGAACTCGAAAACAGGTTTCTAGTCACA400
401TCCAGGTTTTGGCCCGAAGGAAATCAAGGGAAATCCAGTC440
441CAAGTTGAAGGCTCTGAACGTGGACCAGGTTTCCAAGGAC480
481AAGGCTTTCCAGACAATGGCAACCATGTCCTCTGCCCAGC520
521TCATCTCCGCGCCTTCTCTGCAGGCCAAACTGGGTCCCAC560
561TGGTCCTCAGGCCTCTGAGCTTTTCCAGTTTTGGTCTGGA600
601GGATCTGGGCCCCCCTGGAATGTTCCAGATGTGAAGCCAT640
641TCTCACAGACACCGTTCACCTTGTCACTGACTCCCCCATC680
681TACTGACCTCCCAGGGTACGAGCCCCCCCAAGCCCTCTCA720
721CCCCTGCCCCCACCTACCCCATCGCCCCCAGCCTGGCAGG760
761CTCGGGGCCTGGGCACCGCCCGGTTGCAGCTGGTAGAGTT800
801CTCAGCCTTCGTGGAACCGCCAGATGCAGTTGATTCTTAC840
841CAGAGGCACCTGTTCGTGCACATCAGCCAGCACTGCCCCA880
881GCCCCGGAGCGCCGCCGCTCGAGAGTGTGGACGTCCGGCA920
921GATCTACGACAAATTCCCTGAGAAAAAGGGTGGCCTCCGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。